MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 83544

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_006905	ATTA	2	8	624280	624287	50 %	50 %	0 %	0 %	62179128
11002	NC_006905	ATG	2	6	624323	624328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179128
11003	NC_006905	TCA	2	6	624571	624576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179129
11004	NC_006905	CAT	2	6	624673	624678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179129
11005	NC_006905	CGC	2	6	624699	624704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179129
11006	NC_006905	TCG	2	6	624768	624773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179129
11007	NC_006905	CGG	2	6	624907	624912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179129
11008	NC_006905	A	6	6	624961	624966	100 %	0 %	0 %	0 %	62179129
11009	NC_006905	TGG	2	6	624975	624980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62179129
11010	NC_006905	ATT	2	6	625022	625027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62179129
11011	NC_006905	TCA	2	6	625204	625209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179129
11012	NC_006905	TTGCA	2	10	625224	625233	20 %	40 %	20 %	20 %	62179129
11013	NC_006905	GCGCTG	2	12	625244	625255	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	62179129
11014	NC_006905	ATT	2	6	625285	625290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62179129
11015	NC_006905	A	6	6	625459	625464	100 %	0 %	0 %	0 %	62179130
11016	NC_006905	GATT	2	8	625470	625477	25 %	50 %	25 %	0 %	62179130
11017	NC_006905	TTG	2	6	625490	625495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62179130
11018	NC_006905	CTGGG	2	10	625507	625516	0 %	20 %	60 %	20 %	62179130
11019	NC_006905	GTAA	2	8	625585	625592	50 %	25 %	25 %	0 %	62179130
11020	NC_006905	T	6	6	625624	625629	0 %	100 %	0 %	0 %	62179130
11021	NC_006905	A	6	6	625682	625687	100 %	0 %	0 %	0 %	62179130
11022	NC_006905	TAT	2	6	625716	625721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62179130
11023	NC_006905	TGGCC	2	10	625749	625758	0 %	20 %	40 %	40 %	62179130
11024	NC_006905	GGA	2	6	625789	625794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62179130
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11026	NC_006905	CT	3	6	625825	625830	0 %	50 %	0 %	50 %	62179130
11027	NC_006905	A	6	6	625935	625940	100 %	0 %	0 %	0 %	62179130
11028	NC_006905	CAAACC	2	12	626062	626073	50 %	0 %	0 %	50 %	62179130
11029	NC_006905	CG	3	6	626092	626097	0 %	0 %	50 %	50 %	62179130
11030	NC_006905	TTA	2	6	626157	626162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62179130
11031	NC_006905	CTT	2	6	626183	626188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62179130
11032	NC_006905	GGT	2	6	626250	626255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62179130
11033	NC_006905	T	6	6	626275	626280	0 %	100 %	0 %	0 %	62179130
11034	NC_006905	GGC	2	6	626343	626348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179130
11035	NC_006905	CTT	2	6	626514	626519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62179130
11036	NC_006905	ATTT	2	8	626559	626566	25 %	75 %	0 %	0 %	62179130
11037	NC_006905	GTC	2	6	626644	626649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179130
11038	NC_006905	TA	3	6	626654	626659	50 %	50 %	0 %	0 %	62179130
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11040	NC_006905	AG	3	6	626802	626807	50 %	0 %	50 %	0 %	62179131
11041	NC_006905	CAG	2	6	626814	626819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179131
11042	NC_006905	TTA	2	6	626838	626843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62179131
11043	NC_006905	ATGG	2	8	626894	626901	25 %	25 %	50 %	0 %	62179131
11044	NC_006905	CGG	2	6	626936	626941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179131
11045	NC_006905	T	7	7	626942	626948	0 %	100 %	0 %	0 %	62179131
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11047	NC_006905	ATT	2	6	626999	627004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62179131
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11049	NC_006905	GGCA	2	8	627035	627042	25 %	0 %	50 %	25 %	62179131
11050	NC_006905	GC	3	6	627097	627102	0 %	0 %	50 %	50 %	62179131
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11054	NC_006905	ATT	2	6	627288	627293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62179131
11055	NC_006905	GGT	2	6	627315	627320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62179131
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11057	NC_006905	GGC	2	6	627375	627380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179131
11058	NC_006905	TGG	2	6	627478	627483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62179131
11059	NC_006905	CATT	2	8	627552	627559	25 %	50 %	0 %	25 %	62179131
11060	NC_006905	TA	3	6	627603	627608	50 %	50 %	0 %	0 %	62179131
11061	NC_006905	ATT	2	6	627633	627638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62179131
11062	NC_006905	TATGG	2	10	627657	627666	20 %	40 %	40 %	0 %	62179131
11063	NC_006905	TGA	2	6	627742	627747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179131
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11065	NC_006905	GCG	2	6	627801	627806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179131
11066	NC_006905	TAT	2	6	627854	627859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62179131
11067	NC_006905	CGG	2	6	627929	627934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179131
11068	NC_006905	ATT	2	6	627970	627975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62179131
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11071	NC_006905	CGTT	2	8	628171	628178	0 %	50 %	25 %	25 %	62179131
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11082	NC_006905	GC	3	6	628837	628842	0 %	0 %	50 %	50 %	62179132
11083	NC_006905	GAA	2	6	628914	628919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62179132
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11090	NC_006905	AGTC	2	8	629549	629556	25 %	25 %	25 %	25 %	62179132
11091	NC_006905	GC	3	6	629578	629583	0 %	0 %	50 %	50 %	62179132
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11093	NC_006905	TTAT	2	8	629614	629621	25 %	75 %	0 %	0 %	62179132
11094	NC_006905	GCC	2	6	629645	629650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179132
11095	NC_006905	CAG	2	6	629676	629681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179132
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11105	NC_006905	CGG	2	6	630134	630139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179133
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11121	NC_006905	GGTTT	2	10	630826	630835	0 %	60 %	40 %	0 %	62179133
11122	NC_006905	CG	3	6	630858	630863	0 %	0 %	50 %	50 %	62179133
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11124	NC_006905	TCC	2	6	630918	630923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62179133
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11129	NC_006905	TGG	2	6	631192	631197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62179134
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11147	NC_006905	GTT	2	6	632424	632429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62179135
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11154	NC_006905	GCTG	2	8	632693	632700	0 %	25 %	50 %	25 %	62179135
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11231	NC_006905	TGA	2	6	636140	636145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179138
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11244	NC_006905	GCT	2	6	636750	636755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179138
11245	NC_006905	ATG	2	6	636802	636807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179138
11246	NC_006905	CCA	2	6	636822	636827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62179138
11247	NC_006905	GAT	2	6	636876	636881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179138
11248	NC_006905	TTA	2	6	636943	636948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62179138
11249	NC_006905	CGT	2	6	636954	636959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179138
11250	NC_006905	CCG	2	6	636977	636982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179138
11251	NC_006905	CGC	2	6	636987	636992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179138
11252	NC_006905	CGGAA	2	10	637071	637080	40 %	0 %	40 %	20 %	62179138
11253	NC_006905	CAA	2	6	637102	637107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62179138
11254	NC_006905	CGC	2	6	637110	637115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179138
11255	NC_006905	CT	4	8	637193	637200	0 %	50 %	0 %	50 %	62179138
11256	NC_006905	CATC	2	8	637207	637214	25 %	25 %	0 %	50 %	62179138
11257	NC_006905	AGCGGT	2	12	637233	637244	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	62179138
11258	NC_006905	GTG	2	6	637300	637305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62179138
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11261	NC_006905	TCG	2	6	637431	637436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179139
11262	NC_006905	CTGG	2	8	637449	637456	0 %	25 %	50 %	25 %	62179139
11263	NC_006905	CTT	2	6	637469	637474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62179139
11264	NC_006905	ATTA	2	8	637476	637483	50 %	50 %	0 %	0 %	62179139
11265	NC_006905	CTT	2	6	637507	637512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62179139
11266	NC_006905	CCG	2	6	637522	637527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179139
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11268	NC_006905	CG	3	6	637747	637752	0 %	0 %	50 %	50 %	62179139
11269	NC_006905	AGCGC	2	10	637861	637870	20 %	0 %	40 %	40 %	62179139
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11276	NC_006905	GC	3	6	638114	638119	0 %	0 %	50 %	50 %	62179139
11277	NC_006905	T	6	6	638239	638244	0 %	100 %	0 %	0 %	62179139
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11283	NC_006905	CCGT	2	8	638573	638580	0 %	25 %	25 %	50 %	62179139
11284	NC_006905	AG	3	6	638643	638648	50 %	0 %	50 %	0 %	62179139
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11310	NC_006905	GTC	2	6	639927	639932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179141
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11319	NC_006905	TTTA	2	8	640401	640408	25 %	75 %	0 %	0 %	62179142
11320	NC_006905	GA	3	6	640461	640466	50 %	0 %	50 %	0 %	62179142
11321	NC_006905	TCAGAT	2	12	640509	640520	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	62179142
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11324	NC_006905	CG	3	6	640743	640748	0 %	0 %	50 %	50 %	62179142
11325	NC_006905	CGCCTG	2	12	640852	640863	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	62179142
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11333	NC_006905	CAG	2	6	641170	641175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179142
11334	NC_006905	GAT	2	6	641239	641244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62179142
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11336	NC_006905	CTG	2	6	641341	641346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179142
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11340	NC_006905	GCG	2	6	641587	641592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179143
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11345	NC_006905	AAT	2	6	641775	641780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62179143
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11350	NC_006905	CCG	2	6	642215	642220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179144
11351	NC_006905	GGTG	2	8	642224	642231	0 %	25 %	75 %	0 %	62179144
11352	NC_006905	CGA	2	6	642275	642280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179144
11353	NC_006905	ATA	2	6	642301	642306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62179144
11354	NC_006905	TGC	2	6	642317	642322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179144
11355	NC_006905	GGC	2	6	642327	642332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179144
11356	NC_006905	GC	3	6	642343	642348	0 %	0 %	50 %	50 %	62179144
11357	NC_006905	GGC	2	6	642354	642359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179144
11358	NC_006905	CGG	3	9	642364	642372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179144
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11360	NC_006905	AAG	2	6	642592	642597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62179144
11361	NC_006905	GTC	3	9	642663	642671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179144
11362	NC_006905	A	6	6	642739	642744	100 %	0 %	0 %	0 %	62179144
11363	NC_006905	CGA	2	6	642758	642763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179144
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11487	NC_006905	TGG	2	6	651808	651813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62179155
11488	NC_006905	CGG	2	6	651868	651873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179155
11489	NC_006905	ATC	2	6	651916	651921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62179155
11490	NC_006905	GCC	2	6	651923	651928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179155
11491	NC_006905	ACG	2	6	651958	651963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62179155
11492	NC_006905	GGCG	2	8	651995	652002	0 %	0 %	75 %	25 %	62179155
11493	NC_006905	CGG	2	6	652025	652030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62179155
11494	NC_006905	GC	3	6	652222	652227	0 %	0 %	50 %	50 %	62179155
11495	NC_006905	CCG	2	6	652239	652244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179155
11496	NC_006905	CGC	2	6	652268	652273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62179155
11497	NC_006905	ATTA	2	8	652278	652285	50 %	50 %	0 %	0 %	62179155
11498	NC_006905	ACAG	2	8	652308	652315	50 %	0 %	25 %	25 %	62179155
11499	NC_006905	T	6	6	652325	652330	0 %	100 %	0 %	0 %	62179155
11500	NC_006905	CTG	2	6	652335	652340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62179155

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