MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 plasmid pSC138

Total Repeats: 2310

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_006856	TCC	2	6	84623	84628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	60115620
1502	NC_006856	CAG	2	6	84636	84641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115620
1503	NC_006856	GCA	2	6	84646	84651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115620
1504	NC_006856	ATC	2	6	84652	84657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60115620
1505	NC_006856	ACA	2	6	84706	84711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	60115620
1506	NC_006856	TTC	2	6	84739	84744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60115620
1507	NC_006856	TCT	2	6	84752	84757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60115620
1508	NC_006856	CTC	2	6	84775	84780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	60115620
1509	NC_006856	TGT	2	6	84806	84811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	60115620
1510	NC_006856	AGC	2	6	84844	84849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115620
1511	NC_006856	TTC	2	6	84901	84906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60115620
1512	NC_006856	ATA	2	6	84909	84914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60115620
1513	NC_006856	TCA	2	6	84956	84961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60115620
1514	NC_006856	TGAA	2	8	85031	85038	50 %	25 %	25 %	0 %	60115620
1515	NC_006856	T	6	6	85062	85067	0 %	100 %	0 %	0 %	60115620
1516	NC_006856	GC	3	6	85208	85213	0 %	0 %	50 %	50 %	60115621
1517	NC_006856	CGG	2	6	85418	85423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	60115621
1518	NC_006856	T	7	7	85536	85542	0 %	100 %	0 %	0 %	60115622
1519	NC_006856	GCG	2	6	85554	85559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	60115622
1520	NC_006856	TAA	2	6	85741	85746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60115622
1521	NC_006856	CGG	2	6	85784	85789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	60115622
1522	NC_006856	CTG	2	6	85848	85853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60115622
1523	NC_006856	A	6	6	85946	85951	100 %	0 %	0 %	0 %	60115622
1524	NC_006856	TGC	2	6	85961	85966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60115622
1525	NC_006856	CGTC	2	8	86100	86107	0 %	25 %	25 %	50 %	60115623
1526	NC_006856	T	6	6	86147	86152	0 %	100 %	0 %	0 %	60115623
1527	NC_006856	CTG	2	6	86201	86206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60115623
1528	NC_006856	GGC	2	6	86268	86273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	60115623
1529	NC_006856	AC	3	6	86310	86315	50 %	0 %	0 %	50 %	60115623
1530	NC_006856	GCG	2	6	86356	86361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	60115623
1531	NC_006856	CAGC	2	8	86809	86816	25 %	0 %	25 %	50 %	60115624
1532	NC_006856	CCT	2	6	86851	86856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	60115624
1533	NC_006856	CCA	2	6	86873	86878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	60115624
1534	NC_006856	ATC	2	6	86915	86920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60115624
1535	NC_006856	CGG	2	6	86964	86969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	60115624
1536	NC_006856	GGC	2	6	87086	87091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	60115624
1537	NC_006856	TCA	3	9	87105	87113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60115624
1538	NC_006856	GGTCA	2	10	87119	87128	20 %	20 %	40 %	20 %	60115624
1539	NC_006856	CAG	2	6	87184	87189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115624
1540	NC_006856	CAA	2	6	87193	87198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	60115624
1541	NC_006856	TCC	2	6	87213	87218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	60115624
1542	NC_006856	GTGCC	2	10	87247	87256	0 %	20 %	40 %	40 %	60115624
1543	NC_006856	ACGA	2	8	87365	87372	50 %	0 %	25 %	25 %	60115624
1544	NC_006856	AGG	2	6	87396	87401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	60115624
1545	NC_006856	GCG	2	6	87417	87422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	60115624
1546	NC_006856	GGCAC	2	10	87463	87472	20 %	0 %	40 %	40 %	60115624
1547	NC_006856	ACG	2	6	87482	87487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115624
1548	NC_006856	GCC	2	6	87548	87553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	60115624
1549	NC_006856	CGC	2	6	87588	87593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	60115624
1550	NC_006856	CAC	2	6	87730	87735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	60115625
1551	NC_006856	GAT	2	6	87764	87769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60115625
1552	NC_006856	CGG	2	6	87826	87831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	60115625
1553	NC_006856	GGC	2	6	87895	87900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	60115625
1554	NC_006856	TCGC	2	8	87958	87965	0 %	25 %	25 %	50 %	60115625
1555	NC_006856	CTT	2	6	88020	88025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60115625
1556	NC_006856	GCA	2	6	88083	88088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115625
1557	NC_006856	ACA	2	6	88130	88135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	60115625
1558	NC_006856	CAG	2	6	88165	88170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115625
1559	NC_006856	TTC	2	6	88171	88176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60115625
1560	NC_006856	C	6	6	88186	88191	0 %	0 %	0 %	100 %	60115625
1561	NC_006856	TCA	2	6	88257	88262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60115625
1562	NC_006856	ATC	2	6	88288	88293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60115626
1563	NC_006856	CAC	2	6	88325	88330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	60115626
1564	NC_006856	GCC	2	6	88358	88363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	60115626
1565	NC_006856	TCC	2	6	88372	88377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	60115626
1566	NC_006856	ATG	2	6	88397	88402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60115626
1567	NC_006856	CAC	2	6	88423	88428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	60115626
1568	NC_006856	CTC	2	6	88455	88460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	60115626
1569	NC_006856	AAC	2	6	88461	88466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	60115626
1570	NC_006856	ACCAG	2	10	88467	88476	40 %	0 %	20 %	40 %	60115626
1571	NC_006856	CGT	2	6	88564	88569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60115626
1572	NC_006856	GGC	2	6	88589	88594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	60115626
1573	NC_006856	GAC	3	9	88625	88633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115626
1574	NC_006856	ACGG	2	8	88654	88661	25 %	0 %	50 %	25 %	60115626
1575	NC_006856	GAA	2	6	88694	88699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60115626
1576	NC_006856	CAGC	2	8	88739	88746	25 %	0 %	25 %	50 %	60115626
1577	NC_006856	TCC	2	6	88771	88776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	60115626
1578	NC_006856	A	6	6	88794	88799	100 %	0 %	0 %	0 %	60115626
1579	NC_006856	GAAA	2	8	88844	88851	75 %	0 %	25 %	0 %	60115626
1580	NC_006856	GAC	3	9	88889	88897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115626
1581	NC_006856	GTT	2	6	88898	88903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	60115626
1582	NC_006856	GGC	2	6	88926	88931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	60115626
1583	NC_006856	TGT	2	6	88933	88938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	60115626
1584	NC_006856	CCT	2	6	88986	88991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	60115627
1585	NC_006856	GAT	2	6	89009	89014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60115627
1586	NC_006856	ACG	2	6	89106	89111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115627
1587	NC_006856	CCA	3	9	89124	89132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	60115627
1588	NC_006856	GA	3	6	89158	89163	50 %	0 %	50 %	0 %	60115627
1589	NC_006856	TCA	2	6	89266	89271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60115627
1590	NC_006856	GTGA	2	8	89309	89316	25 %	25 %	50 %	0 %	60115627
1591	NC_006856	GCA	2	6	89340	89345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60115627
1592	NC_006856	TTC	2	6	89351	89356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60115627
1593	NC_006856	TCAGT	2	10	89395	89404	20 %	40 %	20 %	20 %	60115627
1594	NC_006856	TCA	2	6	89407	89412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60115627
1595	NC_006856	GGC	2	6	89466	89471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162139493
1596	NC_006856	GTG	2	6	89516	89521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162139493
1597	NC_006856	CCAG	2	8	89529	89536	25 %	0 %	25 %	50 %	162139493
1598	NC_006856	TCT	2	6	89597	89602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162139493
1599	NC_006856	CAT	2	6	89633	89638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162139493
1600	NC_006856	GAA	2	6	89676	89681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162139493
1601	NC_006856	TCG	2	6	89690	89695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162139493
1602	NC_006856	CCA	2	6	89700	89705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162139493
1603	NC_006856	CCT	2	6	89834	89839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162139493
1604	NC_006856	CGT	2	6	89856	89861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162139493
1605	NC_006856	CCTT	2	8	89938	89945	0 %	50 %	0 %	50 %	162139493
1606	NC_006856	AAT	2	6	89972	89977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162139493
1607	NC_006856	TGC	2	6	90079	90084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162139493
1608	NC_006856	TGC	2	6	90090	90095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162139493
1609	NC_006856	GCGT	2	8	90107	90114	0 %	25 %	50 %	25 %	162139493
1610	NC_006856	TCA	2	6	90196	90201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162139493
1611	NC_006856	CAC	2	6	90230	90235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162139493
1612	NC_006856	AC	4	8	90241	90248	50 %	0 %	0 %	50 %	162139493
1613	NC_006856	ACC	2	6	90268	90273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162139493
1614	NC_006856	CAG	2	6	90351	90356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162139493
1615	NC_006856	CGT	2	6	90386	90391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162139493
1616	NC_006856	GTTC	2	8	90404	90411	0 %	50 %	25 %	25 %	162139493
1617	NC_006856	TTC	3	9	90417	90425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162139493
1618	NC_006856	TCCGGC	2	12	90445	90456	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	162139493
1619	NC_006856	CAG	2	6	90573	90578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162139493
1620	NC_006856	GGC	2	6	90579	90584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162139493
1621	NC_006856	TCG	3	9	90616	90624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162139493
1622	NC_006856	CGCCAC	2	12	90696	90707	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	162139493
1623	NC_006856	CG	3	6	90799	90804	0 %	0 %	50 %	50 %	162139493
1624	NC_006856	CCAGCG	2	12	90815	90826	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	162139493
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1626	NC_006856	TCT	2	6	90853	90858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162139493
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1883	NC_006856	CTAC	2	8	106555	106562	25 %	25 %	0 %	50 %	60115650
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1995	NC_006856	TGA	2	6	115409	115414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60115659
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1997	NC_006856	ATA	2	6	117393	117398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60115660
1998	NC_006856	GTT	2	6	117443	117448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	60115660
1999	NC_006856	GAG	2	6	117575	117580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	60115660
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