MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_006576	CGA	2	6	257285	257290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750231
4002	NC_006576	GCG	2	6	257305	257310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750231
4003	NC_006576	TGG	2	6	257369	257374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750232
4004	NC_006576	A	6	6	257377	257382	100 %	0 %	0 %	0 %	56750232
4005	NC_006576	CAG	3	9	257386	257394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750232
4006	NC_006576	TGC	2	6	257766	257771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750233
4007	NC_006576	AGA	2	6	257830	257835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750233
4008	NC_006576	GCCC	2	8	257863	257870	0 %	0 %	25 %	75 %	56750233
4009	NC_006576	GGA	2	6	257875	257880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56750233
4010	NC_006576	GCT	2	6	257911	257916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750233
4011	NC_006576	TTGA	2	8	257987	257994	25 %	50 %	25 %	0 %	56750233
4012	NC_006576	ACC	2	6	258063	258068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750233
4013	NC_006576	TCC	2	6	258084	258089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56750233
4014	NC_006576	ACT	2	6	258107	258112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750233
4015	NC_006576	CAT	2	6	258229	258234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750233
4016	NC_006576	TGC	2	6	258250	258255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750233
4017	NC_006576	CAA	2	6	258280	258285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750233
4018	NC_006576	AGT	2	6	258309	258314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750234
4019	NC_006576	CAC	2	6	258358	258363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750234
4020	NC_006576	TTC	2	6	258385	258390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750234
4021	NC_006576	TTC	2	6	258394	258399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750234
4022	NC_006576	GTG	2	6	258428	258433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750234
4023	NC_006576	ACG	2	6	258440	258445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750234
4024	NC_006576	TCG	2	6	258554	258559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750234
4025	NC_006576	TGG	2	6	258567	258572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750234
4026	NC_006576	GCC	2	6	258596	258601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750234
4027	NC_006576	ATCG	2	8	258718	258725	25 %	25 %	25 %	25 %	56750234
4028	NC_006576	GC	3	6	259261	259266	0 %	0 %	50 %	50 %	56750235
4029	NC_006576	CTCCAT	2	12	259292	259303	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	56750235
4030	NC_006576	A	7	7	259316	259322	100 %	0 %	0 %	0 %	56750235
4031	NC_006576	AGC	2	6	259362	259367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750235
4032	NC_006576	TGG	2	6	259387	259392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750235
4033	NC_006576	CCAAGG	2	12	259423	259434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750235
4034	NC_006576	AGCC	2	8	259437	259444	25 %	0 %	25 %	50 %	56750235
4035	NC_006576	CAG	2	6	259529	259534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750235
4036	NC_006576	CCA	2	6	259540	259545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750235
4037	NC_006576	CA	3	6	259544	259549	50 %	0 %	0 %	50 %	56750235
4038	NC_006576	GAG	2	6	260145	260150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56750236
4039	NC_006576	GC	3	6	260341	260346	0 %	0 %	50 %	50 %	56750236
4040	NC_006576	GCA	2	6	260388	260393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750236
4041	NC_006576	TGC	2	6	260396	260401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750236
4042	NC_006576	GCA	2	6	260441	260446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750236
4043	NC_006576	GCA	2	6	260451	260456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750236
4044	NC_006576	GCA	2	6	260619	260624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750236
4045	NC_006576	TCGC	2	8	260760	260767	0 %	25 %	25 %	50 %	56750236
4046	NC_006576	AAC	2	6	260813	260818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750236
4047	NC_006576	GCCC	2	8	260840	260847	0 %	0 %	25 %	75 %	56750236
4048	NC_006576	TCAA	2	8	260900	260907	50 %	25 %	0 %	25 %	56750236
4049	NC_006576	GAT	2	6	260944	260949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750236
4050	NC_006576	ATC	2	6	260960	260965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750236
4051	NC_006576	GTT	3	9	260977	260985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750236
4052	NC_006576	GCA	2	6	261057	261062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750236
4053	NC_006576	GGC	3	9	261215	261223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750236
4054	NC_006576	GTG	2	6	261224	261229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750236
4055	NC_006576	T	6	6	261333	261338	0 %	100 %	0 %	0 %	56750236
4056	NC_006576	GCT	2	6	261360	261365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750236
4057	NC_006576	CGA	2	6	261372	261377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750236
4058	NC_006576	ACCA	2	8	261430	261437	50 %	0 %	0 %	50 %	56750236
4059	NC_006576	TGC	2	6	261563	261568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750236
4060	NC_006576	CCG	2	6	261612	261617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750236
4061	NC_006576	CGC	2	6	261672	261677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750236
4062	NC_006576	CGG	2	6	261747	261752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750236
4063	NC_006576	CTG	2	6	261784	261789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750236
4064	NC_006576	TGC	2	6	261824	261829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750236
4065	NC_006576	ACGG	2	8	261871	261878	25 %	0 %	50 %	25 %	56750236
4066	NC_006576	GCCTTG	2	12	261887	261898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750236
4067	NC_006576	TGC	2	6	261924	261929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750236
4068	NC_006576	GCA	2	6	261999	262004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750236
4069	NC_006576	CTGAGG	2	12	262049	262060	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56750236
4070	NC_006576	CAC	2	6	262102	262107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750236
4071	NC_006576	GCGATC	2	12	262126	262137	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56750236
4072	NC_006576	GCC	2	6	262151	262156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750236
4073	NC_006576	CGC	3	9	262157	262165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750236
4074	NC_006576	CGAT	2	8	262316	262323	25 %	25 %	25 %	25 %	56750236
4075	NC_006576	GCA	2	6	262377	262382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750236
4076	NC_006576	CCA	2	6	262386	262391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750236
4077	NC_006576	TGG	2	6	262472	262477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750236
4078	NC_006576	CGC	2	6	262498	262503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750236
4079	NC_006576	CTG	2	6	262532	262537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750236
4080	NC_006576	TTC	2	6	262579	262584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750236
4081	NC_006576	AGC	2	6	262588	262593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750236
4082	NC_006576	ATCG	2	8	262699	262706	25 %	25 %	25 %	25 %	56750236
4083	NC_006576	CAG	2	6	262735	262740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750236
4084	NC_006576	GCG	2	6	262774	262779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750236
4085	NC_006576	TTCC	2	8	262782	262789	0 %	50 %	0 %	50 %	56750236
4086	NC_006576	TGG	2	6	262887	262892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750236
4087	NC_006576	AAT	2	6	262976	262981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56750236
4088	NC_006576	CGC	2	6	263031	263036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750236
4089	NC_006576	CCT	2	6	263124	263129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56750236
4090	NC_006576	GGC	2	6	263174	263179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750236
4091	NC_006576	CAG	2	6	263236	263241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750236
4092	NC_006576	CTT	2	6	263379	263384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750236
4093	NC_006576	CAG	2	6	263509	263514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750236
4094	NC_006576	AGC	2	6	263710	263715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750237
4095	NC_006576	AAT	2	6	263754	263759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56750237
4096	NC_006576	GTA	2	6	263793	263798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750237
4097	NC_006576	ATC	2	6	263812	263817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750237
4098	NC_006576	CAT	2	6	263868	263873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750237
4099	NC_006576	TCAA	2	8	264034	264041	50 %	25 %	0 %	25 %	56750237
4100	NC_006576	TCG	2	6	264078	264083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750237
4101	NC_006576	TCA	2	6	264124	264129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750237
4102	NC_006576	GGC	2	6	264212	264217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750237
4103	NC_006576	ACA	2	6	264242	264247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750237
4104	NC_006576	GCT	2	6	264260	264265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750237
4105	NC_006576	AC	3	6	264287	264292	50 %	0 %	0 %	50 %	56750237
4106	NC_006576	GAC	2	6	264365	264370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750237
4107	NC_006576	CAA	2	6	264374	264379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750237
4108	NC_006576	GTA	2	6	264426	264431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750237
4109	NC_006576	GCT	2	6	264508	264513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750237
4110	NC_006576	CAA	2	6	264516	264521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750237
4111	NC_006576	GCC	2	6	264647	264652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750237
4112	NC_006576	CGT	2	6	264699	264704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750237
4113	NC_006576	CCG	2	6	264742	264747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750237
4114	NC_006576	GGAG	2	8	264773	264780	25 %	0 %	75 %	0 %	56750237
4115	NC_006576	TCGG	2	8	264799	264806	0 %	25 %	50 %	25 %	56750237
4116	NC_006576	CAG	2	6	264830	264835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750237
4117	NC_006576	GGT	2	6	264851	264856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750237
4118	NC_006576	GGC	2	6	264964	264969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750237
4119	NC_006576	CGAAG	2	10	264992	265001	40 %	0 %	40 %	20 %	56750237
4120	NC_006576	GAT	2	6	265329	265334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750238
4121	NC_006576	CGT	3	9	265376	265384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750238
4122	NC_006576	T	6	6	265462	265467	0 %	100 %	0 %	0 %	56750238
4123	NC_006576	CGC	2	6	265474	265479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750238
4124	NC_006576	CTG	2	6	265545	265550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750238
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4126	NC_006576	GAC	2	6	265595	265600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750238
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4243	NC_006576	CCAG	2	8	272352	272359	25 %	0 %	25 %	50 %	56750244
4244	NC_006576	CGC	2	6	272377	272382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750244
4245	NC_006576	AGT	2	6	272403	272408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750244
4246	NC_006576	TGC	2	6	272460	272465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750244
4247	NC_006576	AGC	2	6	272555	272560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750244
4248	NC_006576	A	6	6	272572	272577	100 %	0 %	0 %	0 %	56750244
4249	NC_006576	CAG	2	6	272641	272646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750244
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4252	NC_006576	A	6	6	272839	272844	100 %	0 %	0 %	0 %	56750244
4253	NC_006576	CAA	2	6	272874	272879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750244
4254	NC_006576	AGCA	2	8	272892	272899	50 %	0 %	25 %	25 %	56750245
4255	NC_006576	GC	3	6	272935	272940	0 %	0 %	50 %	50 %	56750245
4256	NC_006576	TGC	2	6	272951	272956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750245
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4260	NC_006576	CTG	2	6	273085	273090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750245
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4264	NC_006576	GCT	3	9	273210	273218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750245
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4272	NC_006576	GCT	2	6	273585	273590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750245
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4274	NC_006576	GCT	2	6	273745	273750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750246
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4279	NC_006576	GC	3	6	273922	273927	0 %	0 %	50 %	50 %	56750246
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4332	NC_006576	CTG	2	6	277043	277048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750248
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4334	NC_006576	TCG	2	6	277107	277112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750248
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4350	NC_006576	GCT	2	6	277858	277863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750248
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4352	NC_006576	ATC	2	6	277886	277891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750248
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4355	NC_006576	CAC	2	6	277960	277965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750248
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4357	NC_006576	CGG	2	6	278054	278059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750248
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4360	NC_006576	AATCGC	2	12	278144	278155	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	56750248
4361	NC_006576	CGA	2	6	278209	278214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750248
4362	NC_006576	CTC	2	6	278225	278230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56750248
4363	NC_006576	CAGC	2	8	278255	278262	25 %	0 %	25 %	50 %	56750248
4364	NC_006576	CGG	2	6	278385	278390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750249
4365	NC_006576	ACAG	2	8	278459	278466	50 %	0 %	25 %	25 %	56750249
4366	NC_006576	TGC	2	6	278473	278478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750249
4367	NC_006576	TTC	2	6	278511	278516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750249
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4438	NC_006576	AG	3	6	282996	283001	50 %	0 %	50 %	0 %	56750252
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4441	NC_006576	ATC	2	6	283293	283298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750252
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4445	NC_006576	GCT	2	6	283601	283606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750252
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4463	NC_006576	GCA	2	6	284610	284615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750253
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4470	NC_006576	TCAA	2	8	285076	285083	50 %	25 %	0 %	25 %	56750254
4471	NC_006576	TCGGA	2	10	285122	285131	20 %	20 %	40 %	20 %	56750254
4472	NC_006576	TCA	2	6	285164	285169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750254
4473	NC_006576	TCA	2	6	285223	285228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750254
4474	NC_006576	TGAT	2	8	285241	285248	25 %	50 %	25 %	0 %	56750254
4475	NC_006576	CTG	2	6	285335	285340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750254
4476	NC_006576	ATC	2	6	285415	285420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750254
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4478	NC_006576	TGG	2	6	285503	285508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750254
4479	NC_006576	AGC	2	6	285509	285514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750254
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4481	NC_006576	CA	3	6	285615	285620	50 %	0 %	0 %	50 %	56750254
4482	NC_006576	CTG	2	6	285636	285641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750254
4483	NC_006576	CGGT	2	8	285698	285705	0 %	25 %	50 %	25 %	56750254
4484	NC_006576	GCTG	2	8	285812	285819	0 %	25 %	50 %	25 %	56750255
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4487	NC_006576	AAG	2	6	285997	286002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750255
4488	NC_006576	AAG	2	6	286012	286017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750255
4489	NC_006576	AAG	2	6	286033	286038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750255
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