MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_006576	CTG	2	6	2669269	2669274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752513
44002	NC_006576	CGC	2	6	2669370	2669375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752513
44003	NC_006576	CGCT	2	8	2669406	2669413	0 %	25 %	25 %	50 %	56752513
44004	NC_006576	GAC	2	6	2669422	2669427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752513
44005	NC_006576	CAT	3	9	2669430	2669438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752513
44006	NC_006576	GCA	2	6	2669499	2669504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752513
44007	NC_006576	CAA	2	6	2669770	2669775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752514
44008	NC_006576	CAG	2	6	2669787	2669792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752514
44009	NC_006576	GAAC	2	8	2669872	2669879	50 %	0 %	25 %	25 %	56752514
44010	NC_006576	CGG	2	6	2669886	2669891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752514
44011	NC_006576	GCG	2	6	2669922	2669927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752514
44012	NC_006576	A	6	6	2669954	2669959	100 %	0 %	0 %	0 %	56752514
44013	NC_006576	TCG	2	6	2670081	2670086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752515
44014	NC_006576	CGG	2	6	2670195	2670200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752515
44015	NC_006576	CGC	2	6	2670400	2670405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752515
44016	NC_006576	CG	3	6	2670427	2670432	0 %	0 %	50 %	50 %	56752515
44017	NC_006576	GGC	2	6	2670469	2670474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752515
44018	NC_006576	GCC	2	6	2670476	2670481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752515
44019	NC_006576	GGC	2	6	2670484	2670489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752515
44020	NC_006576	GCA	2	6	2670502	2670507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752515
44021	NC_006576	GGC	2	6	2670548	2670553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752515
44022	NC_006576	GGA	2	6	2670559	2670564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56752515
44023	NC_006576	GGC	2	6	2670757	2670762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752515
44024	NC_006576	ACC	3	9	2670809	2670817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752515
44025	NC_006576	ACCG	2	8	2670844	2670851	25 %	0 %	25 %	50 %	56752515
44026	NC_006576	AGA	2	6	2671040	2671045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752516
44027	NC_006576	GAG	2	6	2671056	2671061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56752516
44028	NC_006576	ACG	2	6	2671150	2671155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752516
44029	NC_006576	TGA	2	6	2671157	2671162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752516
44030	NC_006576	ATGT	2	8	2671197	2671204	25 %	50 %	25 %	0 %	56752516
44031	NC_006576	CAA	2	6	2671220	2671225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752516
44032	NC_006576	TGA	2	6	2671276	2671281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752516
44033	NC_006576	TCA	3	9	2671297	2671305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752516
44034	NC_006576	CTA	2	6	2671355	2671360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752516
44035	NC_006576	CTG	2	6	2671506	2671511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752516
44036	NC_006576	AGA	2	6	2671573	2671578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752516
44037	NC_006576	AAG	2	6	2671588	2671593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752516
44038	NC_006576	TCCG	2	8	2671639	2671646	0 %	25 %	25 %	50 %	56752516
44039	NC_006576	TTC	2	6	2671695	2671700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752516
44040	NC_006576	AAG	2	6	2671749	2671754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752516
44041	NC_006576	GGC	2	6	2671808	2671813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752516
44042	NC_006576	ACC	2	6	2671873	2671878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752516
44043	NC_006576	GCT	2	6	2671910	2671915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752516
44044	NC_006576	TGG	2	6	2672029	2672034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752516
44045	NC_006576	ACCAA	2	10	2672083	2672092	60 %	0 %	0 %	40 %	56752516
44046	NC_006576	ACG	2	6	2672117	2672122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752516
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44048	NC_006576	TGCGG	2	10	2672171	2672180	0 %	20 %	60 %	20 %	56752516
44049	NC_006576	GAA	2	6	2672319	2672324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752516
44050	NC_006576	CTG	2	6	2672362	2672367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752516
44051	NC_006576	CAC	3	9	2672468	2672476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752516
44052	NC_006576	CGT	2	6	2672536	2672541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752516
44053	NC_006576	TGA	2	6	2672581	2672586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752516
44054	NC_006576	CCAC	2	8	2672728	2672735	25 %	0 %	0 %	75 %	56752516
44055	NC_006576	CCAA	2	8	2672797	2672804	50 %	0 %	0 %	50 %	56752516
44056	NC_006576	TCG	2	6	2672923	2672928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752516
44057	NC_006576	AGCG	2	8	2672976	2672983	25 %	0 %	50 %	25 %	56752516
44058	NC_006576	GAC	2	6	2672994	2672999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752516
44059	NC_006576	GAG	2	6	2673063	2673068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56752516
44060	NC_006576	CGA	2	6	2673116	2673121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752516
44061	NC_006576	TTGG	2	8	2673168	2673175	0 %	50 %	50 %	0 %	56752516
44062	NC_006576	GCC	2	6	2673206	2673211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752516
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44067	NC_006576	GCC	2	6	2673347	2673352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752516
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44070	NC_006576	GCTGG	2	10	2673569	2673578	0 %	20 %	60 %	20 %	56752516
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44074	NC_006576	CGA	2	6	2673821	2673826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752516
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44085	NC_006576	AGT	2	6	2674473	2674478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752517
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44098	NC_006576	CAA	2	6	2675349	2675354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752517
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44100	NC_006576	CGGT	3	12	2675442	2675453	0 %	25 %	50 %	25 %	56752517
44101	NC_006576	TCG	3	9	2675456	2675464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752517
44102	NC_006576	CAA	2	6	2675565	2675570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752517
44103	NC_006576	A	6	6	2675584	2675589	100 %	0 %	0 %	0 %	56752517
44104	NC_006576	AGA	2	6	2675597	2675602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752517
44105	NC_006576	ATGCTG	2	12	2675836	2675847	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	56752517
44106	NC_006576	GCT	2	6	2675918	2675923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752517
44107	NC_006576	ACT	2	6	2675924	2675929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752517
44108	NC_006576	CCG	2	6	2675933	2675938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752517
44109	NC_006576	CTGGGT	2	12	2676033	2676044	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	56752517
44110	NC_006576	CGA	2	6	2676081	2676086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752517
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44113	NC_006576	CCG	2	6	2676141	2676146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752517
44114	NC_006576	TC	3	6	2676174	2676179	0 %	50 %	0 %	50 %	56752517
44115	NC_006576	CAA	2	6	2676216	2676221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752517
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44117	NC_006576	AAG	2	6	2676367	2676372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752518
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44122	NC_006576	CTG	2	6	2676542	2676547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752518
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44225	NC_006576	CGGGG	2	10	2681707	2681716	0 %	0 %	80 %	20 %	56752519
44226	NC_006576	GATG	2	8	2681842	2681849	25 %	25 %	50 %	0 %	56752520
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44231	NC_006576	TTG	2	6	2682195	2682200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752520
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44233	NC_006576	CTG	2	6	2682356	2682361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752520
44234	NC_006576	GAA	2	6	2682403	2682408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752520
44235	NC_006576	GGC	2	6	2682513	2682518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752521
44236	NC_006576	TAT	2	6	2682519	2682524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56752521
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44260	NC_006576	CAG	2	6	2683740	2683745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752522
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44262	NC_006576	GCA	2	6	2683851	2683856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752522
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44310	NC_006576	ACT	2	6	2686693	2686698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752524
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44320	NC_006576	TTGTAG	2	12	2687570	2687581	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	56752525
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44323	NC_006576	TGAC	2	8	2687736	2687743	25 %	25 %	25 %	25 %	56752525
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44331	NC_006576	TCGA	2	8	2688730	2688737	25 %	25 %	25 %	25 %	56752526
44332	NC_006576	CAAGC	2	10	2688752	2688761	40 %	0 %	20 %	40 %	56752526
44333	NC_006576	GCAG	2	8	2688793	2688800	25 %	0 %	50 %	25 %	56752526
44334	NC_006576	GCT	2	6	2688830	2688835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752526
44335	NC_006576	C	6	6	2688860	2688865	0 %	0 %	0 %	100 %	56752527
44336	NC_006576	CT	3	6	2688887	2688892	0 %	50 %	0 %	50 %	56752527
44337	NC_006576	GCGATC	2	12	2688957	2688968	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56752527
44338	NC_006576	GTT	2	6	2688980	2688985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752527
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44345	NC_006576	TGGA	2	8	2689214	2689221	25 %	25 %	50 %	0 %	56752527
44346	NC_006576	GCCTG	2	10	2689264	2689273	0 %	20 %	40 %	40 %	56752527
44347	NC_006576	AAG	2	6	2689415	2689420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752527
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