MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_006576	CGA	2	6	2638351	2638356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752485
43502	NC_006576	TGC	2	6	2638359	2638364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752485
43503	NC_006576	AGA	2	6	2638378	2638383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752485
43504	NC_006576	GAA	2	6	2638400	2638405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752485
43505	NC_006576	TGG	2	6	2638416	2638421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752485
43506	NC_006576	AAC	2	6	2638473	2638478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752485
43507	NC_006576	TGC	2	6	2638518	2638523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752485
43508	NC_006576	CG	3	6	2638560	2638565	0 %	0 %	50 %	50 %	56752485
43509	NC_006576	TCACG	2	10	2638606	2638615	20 %	20 %	20 %	40 %	56752485
43510	NC_006576	TGA	2	6	2638639	2638644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752485
43511	NC_006576	CTA	2	6	2638768	2638773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752485
43512	NC_006576	ATC	2	6	2638790	2638795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752485
43513	NC_006576	TGG	3	9	2638923	2638931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752485
43514	NC_006576	CTT	2	6	2638945	2638950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752485
43515	NC_006576	GA	3	6	2638986	2638991	50 %	0 %	50 %	0 %	56752485
43516	NC_006576	TGC	2	6	2639208	2639213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752485
43517	NC_006576	GCA	2	6	2639214	2639219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752485
43518	NC_006576	AGC	2	6	2639229	2639234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752485
43519	NC_006576	CAT	2	6	2639236	2639241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752485
43520	NC_006576	TCCA	2	8	2639250	2639257	25 %	25 %	0 %	50 %	56752485
43521	NC_006576	CTGG	2	8	2639287	2639294	0 %	25 %	50 %	25 %	56752485
43522	NC_006576	TGG	2	6	2639355	2639360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752485
43523	NC_006576	CGAT	2	8	2639379	2639386	25 %	25 %	25 %	25 %	56752485
43524	NC_006576	GCT	2	6	2639554	2639559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752485
43525	NC_006576	CGC	2	6	2639624	2639629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752485
43526	NC_006576	CGA	2	6	2639677	2639682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752485
43527	NC_006576	GAT	2	6	2639752	2639757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752485
43528	NC_006576	CCG	2	6	2639847	2639852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752485
43529	NC_006576	GTC	2	6	2639876	2639881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752485
43530	NC_006576	GCA	2	6	2639892	2639897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752485
43531	NC_006576	CCCG	2	8	2640012	2640019	0 %	0 %	25 %	75 %	56752485
43532	NC_006576	CAG	2	6	2640077	2640082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752486
43533	NC_006576	TTCC	2	8	2640090	2640097	0 %	50 %	0 %	50 %	56752486
43534	NC_006576	TGGA	2	8	2640177	2640184	25 %	25 %	50 %	0 %	56752486
43535	NC_006576	TCAA	2	8	2640276	2640283	50 %	25 %	0 %	25 %	56752486
43536	NC_006576	CCGGC	2	10	2640325	2640334	0 %	0 %	40 %	60 %	56752486
43537	NC_006576	TGG	2	6	2640345	2640350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752486
43538	NC_006576	TGGT	2	8	2640477	2640484	0 %	50 %	50 %	0 %	56752486
43539	NC_006576	GCC	2	6	2640494	2640499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752486
43540	NC_006576	A	7	7	2640503	2640509	100 %	0 %	0 %	0 %	56752486
43541	NC_006576	G	7	7	2640523	2640529	0 %	0 %	100 %	0 %	56752486
43542	NC_006576	ATC	2	6	2640663	2640668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752486
43543	NC_006576	TGA	2	6	2640681	2640686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752486
43544	NC_006576	TGA	2	6	2640700	2640705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752486
43545	NC_006576	GTT	2	6	2640709	2640714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752486
43546	NC_006576	TGA	3	9	2640732	2640740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752486
43547	NC_006576	CGG	2	6	2640750	2640755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752486
43548	NC_006576	TTCCC	2	10	2640780	2640789	0 %	40 %	0 %	60 %	56752486
43549	NC_006576	CG	3	6	2640795	2640800	0 %	0 %	50 %	50 %	56752486
43550	NC_006576	TAC	2	6	2640830	2640835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752486
43551	NC_006576	ACG	3	9	2640882	2640890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752486
43552	NC_006576	GGCA	2	8	2641219	2641226	25 %	0 %	50 %	25 %	56752487
43553	NC_006576	GCTG	2	8	2641227	2641234	0 %	25 %	50 %	25 %	56752487
43554	NC_006576	TGT	2	6	2641461	2641466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752487
43555	NC_006576	GCGATC	2	12	2641487	2641498	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56752487
43556	NC_006576	TCAG	2	8	2641536	2641543	25 %	25 %	25 %	25 %	56752487
43557	NC_006576	GTC	2	6	2641572	2641577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752487
43558	NC_006576	TTC	2	6	2641717	2641722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752487
43559	NC_006576	T	7	7	2641750	2641756	0 %	100 %	0 %	0 %	56752488
43560	NC_006576	TGG	2	6	2641818	2641823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752488
43561	NC_006576	CTG	3	9	2641973	2641981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752488
43562	NC_006576	GTG	2	6	2641985	2641990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752488
43563	NC_006576	CGT	2	6	2642069	2642074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752488
43564	NC_006576	GCAA	2	8	2642134	2642141	50 %	0 %	25 %	25 %	56752488
43565	NC_006576	GCC	2	6	2642249	2642254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752488
43566	NC_006576	GAA	2	6	2642303	2642308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752488
43567	NC_006576	GCG	2	6	2642340	2642345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752488
43568	NC_006576	CTG	2	6	2642378	2642383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752488
43569	NC_006576	GCC	2	6	2642483	2642488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752488
43570	NC_006576	ATC	2	6	2642668	2642673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752489
43571	NC_006576	ACT	2	6	2642775	2642780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752489
43572	NC_006576	GCTGG	2	10	2642784	2642793	0 %	20 %	60 %	20 %	56752489
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43576	NC_006576	TTTCG	2	10	2643033	2643042	0 %	60 %	20 %	20 %	56752489
43577	NC_006576	CCA	2	6	2643075	2643080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752489
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43582	NC_006576	AGCA	2	8	2643283	2643290	50 %	0 %	25 %	25 %	56752489
43583	NC_006576	GAC	2	6	2643305	2643310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752489
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43585	NC_006576	TGCC	2	8	2643504	2643511	0 %	25 %	25 %	50 %	56752490
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43588	NC_006576	GCC	2	6	2643679	2643684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752490
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43590	NC_006576	CGC	2	6	2643819	2643824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752490
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43592	NC_006576	CAG	3	9	2643950	2643958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752491
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43595	NC_006576	GA	3	6	2644010	2644015	50 %	0 %	50 %	0 %	56752491
43596	NC_006576	ACA	2	6	2644022	2644027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752491
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43600	NC_006576	GAC	2	6	2644375	2644380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752491
43601	NC_006576	CA	3	6	2644598	2644603	50 %	0 %	0 %	50 %	56752491
43602	NC_006576	AAG	2	6	2644608	2644613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752491
43603	NC_006576	CTTC	2	8	2644633	2644640	0 %	50 %	0 %	50 %	56752491
43604	NC_006576	GCC	2	6	2644664	2644669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752491
43605	NC_006576	GAC	3	9	2644676	2644684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752491
43606	NC_006576	CTG	2	6	2644700	2644705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752491
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43609	NC_006576	TGGGT	2	10	2644829	2644838	0 %	40 %	60 %	0 %	56752492
43610	NC_006576	TTTC	2	8	2644889	2644896	0 %	75 %	0 %	25 %	56752492
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43618	NC_006576	CTG	2	6	2645933	2645938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752493
43619	NC_006576	GTC	2	6	2645946	2645951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752493
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43840	NC_006576	CCAG	2	8	2660251	2660258	25 %	0 %	25 %	50 %	56752506
43841	NC_006576	TGG	2	6	2660269	2660274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752506
43842	NC_006576	GAA	2	6	2660276	2660281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752506
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43849	NC_006576	CGG	2	6	2660895	2660900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752507
43850	NC_006576	CAGCT	2	10	2660932	2660941	20 %	20 %	20 %	40 %	56752507
43851	NC_006576	GCG	2	6	2660955	2660960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752507
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43853	NC_006576	TTG	2	6	2661043	2661048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752507
43854	NC_006576	CGC	2	6	2661089	2661094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752507
43855	NC_006576	CAA	2	6	2661125	2661130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752507
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43957	NC_006576	CTG	2	6	2666761	2666766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752512
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43969	NC_006576	GCG	2	6	2667393	2667398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752512
43970	NC_006576	ATC	2	6	2667403	2667408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752512
43971	NC_006576	GCA	2	6	2667514	2667519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752512
43972	NC_006576	AGC	2	6	2667527	2667532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752512
43973	NC_006576	CGA	2	6	2667543	2667548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752512
43974	NC_006576	GCG	2	6	2667554	2667559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752512
43975	NC_006576	CTG	2	6	2667565	2667570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752512
43976	NC_006576	GAA	2	6	2667730	2667735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752512
43977	NC_006576	CAA	2	6	2667774	2667779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752512
43978	NC_006576	TCT	2	6	2667790	2667795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752512
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43980	NC_006576	AAG	2	6	2667824	2667829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752512
43981	NC_006576	CAA	2	6	2667892	2667897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752512
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43983	NC_006576	ATTG	2	8	2668148	2668155	25 %	50 %	25 %	0 %	56752512
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43985	NC_006576	GGA	2	6	2668330	2668335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56752513
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43990	NC_006576	TGC	2	6	2668699	2668704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752513
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43992	NC_006576	CCA	2	6	2668980	2668985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752513
43993	NC_006576	GGC	2	6	2669018	2669023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752513
43994	NC_006576	GTG	2	6	2669024	2669029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752513
43995	NC_006576	TCA	2	6	2669073	2669078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752513
43996	NC_006576	AGC	2	6	2669095	2669100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752513
43997	NC_006576	GC	3	6	2669099	2669104	0 %	0 %	50 %	50 %	56752513
43998	NC_006576	C	7	7	2669104	2669110	0 %	0 %	0 %	100 %	56752513
43999	NC_006576	TGG	2	6	2669228	2669233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752513
44000	NC_006576	GAG	2	6	2669251	2669256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56752513

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