MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_006576	TGC	2	6	2605200	2605205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752452
43002	NC_006576	AAT	2	6	2605261	2605266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56752452
43003	NC_006576	GT	4	8	2605274	2605281	0 %	50 %	50 %	0 %	56752452
43004	NC_006576	AGA	2	6	2605395	2605400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752452
43005	NC_006576	AGC	2	6	2605414	2605419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752452
43006	NC_006576	CCG	2	6	2605435	2605440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752452
43007	NC_006576	CAA	2	6	2605448	2605453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752452
43008	NC_006576	TCA	2	6	2605630	2605635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752452
43009	NC_006576	CGA	2	6	2605642	2605647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752452
43010	NC_006576	GT	3	6	2605664	2605669	0 %	50 %	50 %	0 %	56752452
43011	NC_006576	TCA	2	6	2605783	2605788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752452
43012	NC_006576	TGA	2	6	2605798	2605803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752452
43013	NC_006576	GCT	2	6	2605806	2605811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752452
43014	NC_006576	TTG	2	6	2605941	2605946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752452
43015	NC_006576	CTG	2	6	2605953	2605958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752452
43016	NC_006576	TGGA	2	8	2605984	2605991	25 %	25 %	50 %	0 %	56752452
43017	NC_006576	GCA	2	6	2606104	2606109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752452
43018	NC_006576	GCC	2	6	2606159	2606164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752452
43019	NC_006576	CGC	2	6	2606212	2606217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752452
43020	NC_006576	GGC	2	6	2606240	2606245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752452
43021	NC_006576	TCT	2	6	2606443	2606448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752452
43022	NC_006576	ATG	2	6	2606471	2606476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752452
43023	NC_006576	GCGATC	2	12	2606529	2606540	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56752452
43024	NC_006576	CGC	2	6	2606577	2606582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752452
43025	NC_006576	TCA	2	6	2606599	2606604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752452
43026	NC_006576	GCG	2	6	2606618	2606623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752452
43027	NC_006576	GCT	2	6	2606660	2606665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752452
43028	NC_006576	GCA	2	6	2606690	2606695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752452
43029	NC_006576	GA	3	6	2606816	2606821	50 %	0 %	50 %	0 %	56752453
43030	NC_006576	TAA	2	6	2606850	2606855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56752453
43031	NC_006576	CTG	2	6	2606901	2606906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752453
43032	NC_006576	TCT	2	6	2607052	2607057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752453
43033	NC_006576	ACT	2	6	2607067	2607072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752453
43034	NC_006576	GCT	2	6	2607088	2607093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752453
43035	NC_006576	AAT	2	6	2607216	2607221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56752453
43036	NC_006576	AGGA	2	8	2607247	2607254	50 %	0 %	50 %	0 %	56752453
43037	NC_006576	GCC	2	6	2607255	2607260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752453
43038	NC_006576	GA	3	6	2607270	2607275	50 %	0 %	50 %	0 %	56752453
43039	NC_006576	CAC	2	6	2607297	2607302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752453
43040	NC_006576	GCG	2	6	2607308	2607313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752453
43041	NC_006576	GCC	2	6	2607480	2607485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752453
43042	NC_006576	GAT	2	6	2607486	2607491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752453
43043	NC_006576	GAG	2	6	2607534	2607539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56752453
43044	NC_006576	CAA	2	6	2607614	2607619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752453
43045	NC_006576	AAT	2	6	2607630	2607635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56752453
43046	NC_006576	CGC	2	6	2607639	2607644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752453
43047	NC_006576	AGC	2	6	2607688	2607693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752453
43048	NC_006576	TAG	2	6	2607700	2607705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752453
43049	NC_006576	TCG	2	6	2607819	2607824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752453
43050	NC_006576	GCC	2	6	2607842	2607847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752453
43051	NC_006576	GCC	2	6	2608646	2608651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752454
43052	NC_006576	GCC	2	6	2608664	2608669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752454
43053	NC_006576	ATC	2	6	2608677	2608682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752454
43054	NC_006576	TTGAA	2	10	2608749	2608758	40 %	40 %	20 %	0 %	56752454
43055	NC_006576	TGG	2	6	2608841	2608846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752454
43056	NC_006576	CAA	2	6	2608847	2608852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752454
43057	NC_006576	TA	3	6	2608908	2608913	50 %	50 %	0 %	0 %	56752454
43058	NC_006576	GAC	2	6	2608947	2608952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752454
43059	NC_006576	GCT	2	6	2608955	2608960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752454
43060	NC_006576	ACA	2	6	2609011	2609016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752454
43061	NC_006576	GCT	2	6	2609077	2609082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752454
43062	NC_006576	AGC	2	6	2609152	2609157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752454
43063	NC_006576	GGA	2	6	2609174	2609179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56752454
43064	NC_006576	ACTT	2	8	2609185	2609192	25 %	50 %	0 %	25 %	56752454
43065	NC_006576	CGG	2	6	2609356	2609361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752455
43066	NC_006576	TTC	2	6	2609369	2609374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752455
43067	NC_006576	AG	3	6	2609392	2609397	50 %	0 %	50 %	0 %	56752455
43068	NC_006576	TTG	2	6	2609423	2609428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752455
43069	NC_006576	GCGA	2	8	2609507	2609514	25 %	0 %	50 %	25 %	56752455
43070	NC_006576	ACC	2	6	2609546	2609551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752455
43071	NC_006576	GCC	2	6	2609569	2609574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752455
43072	NC_006576	GCT	2	6	2609598	2609603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752455
43073	NC_006576	CTTGAG	2	12	2609623	2609634	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	56752455
43074	NC_006576	TGA	2	6	2609700	2609705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752455
43075	NC_006576	GCA	2	6	2609788	2609793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752455
43076	NC_006576	GGA	2	6	2609869	2609874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56752455
43077	NC_006576	CTT	2	6	2610200	2610205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752456
43078	NC_006576	TGGC	2	8	2610242	2610249	0 %	25 %	50 %	25 %	56752456
43079	NC_006576	GCC	2	6	2610282	2610287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752456
43080	NC_006576	GCTTCT	2	12	2610294	2610305	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	56752456
43081	NC_006576	AGCGG	2	10	2610591	2610600	20 %	0 %	60 %	20 %	56752457
43082	NC_006576	CGA	2	6	2610618	2610623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752457
43083	NC_006576	TGC	2	6	2610668	2610673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752457
43084	NC_006576	GGT	2	6	2610704	2610709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752457
43085	NC_006576	CGT	2	6	2610731	2610736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752457
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43087	NC_006576	TGC	2	6	2610833	2610838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752457
43088	NC_006576	TGC	2	6	2610941	2610946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752457
43089	NC_006576	TGG	2	6	2610968	2610973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752457
43090	NC_006576	CGTC	2	8	2610975	2610982	0 %	25 %	25 %	50 %	56752457
43091	NC_006576	TTC	2	6	2611066	2611071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752457
43092	NC_006576	TGT	2	6	2611109	2611114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752457
43093	NC_006576	ATG	2	6	2611156	2611161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752457
43094	NC_006576	TGGG	2	8	2611178	2611185	0 %	25 %	75 %	0 %	56752457
43095	NC_006576	GAA	2	6	2611512	2611517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752457
43096	NC_006576	TTG	2	6	2611522	2611527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752457
43097	NC_006576	CT	3	6	2611616	2611621	0 %	50 %	0 %	50 %	56752457
43098	NC_006576	CTT	2	6	2612287	2612292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752458
43099	NC_006576	TGG	2	6	2612301	2612306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752458
43100	NC_006576	TCA	2	6	2612361	2612366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752458
43101	NC_006576	GACC	2	8	2612398	2612405	25 %	0 %	25 %	50 %	56752458
43102	NC_006576	GTAA	2	8	2612536	2612543	50 %	25 %	25 %	0 %	56752459
43103	NC_006576	TGGC	2	8	2612606	2612613	0 %	25 %	50 %	25 %	56752459
43104	NC_006576	CTGC	2	8	2612710	2612717	0 %	25 %	25 %	50 %	56752459
43105	NC_006576	ACCG	2	8	2612757	2612764	25 %	0 %	25 %	50 %	56752459
43106	NC_006576	TACC	2	8	2612832	2612839	25 %	25 %	0 %	50 %	56752459
43107	NC_006576	GCT	2	6	2612872	2612877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752459
43108	NC_006576	AAG	2	6	2612944	2612949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752459
43109	NC_006576	CCA	4	12	2613044	2613055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752459
43110	NC_006576	CCT	2	6	2613122	2613127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56752459
43111	NC_006576	TGG	2	6	2613237	2613242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752459
43112	NC_006576	CAT	2	6	2613258	2613263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752459
43113	NC_006576	CTG	3	9	2613269	2613277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752459
43114	NC_006576	CCA	2	6	2613296	2613301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752459
43115	NC_006576	TTC	2	6	2613319	2613324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752459
43116	NC_006576	CGA	2	6	2613410	2613415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752459
43117	NC_006576	CTT	2	6	2613447	2613452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752459
43118	NC_006576	ACC	2	6	2613490	2613495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752459
43119	NC_006576	CTG	2	6	2613500	2613505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752459
43120	NC_006576	TGC	2	6	2613549	2613554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752459
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43123	NC_006576	CTT	2	6	2613735	2613740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752459
43124	NC_006576	TGG	2	6	2613753	2613758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752459
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43133	NC_006576	GGT	2	6	2614150	2614155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752459
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43137	NC_006576	GACT	2	8	2614637	2614644	25 %	25 %	25 %	25 %	56752460
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43141	NC_006576	GCA	2	6	2614749	2614754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752460
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43143	NC_006576	GACT	2	8	2614825	2614832	25 %	25 %	25 %	25 %	56752460
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43147	NC_006576	CTG	2	6	2614978	2614983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752460
43148	NC_006576	AACG	2	8	2614986	2614993	50 %	0 %	25 %	25 %	56752460
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43154	NC_006576	CTG	2	6	2615458	2615463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752460
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43218	NC_006576	GCTG	2	8	2619646	2619653	0 %	25 %	50 %	25 %	56752465
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43226	NC_006576	ATC	2	6	2620314	2620319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752467
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43230	NC_006576	ATC	2	6	2620406	2620411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752467
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43232	NC_006576	TAA	2	6	2620898	2620903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56752468
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43460	NC_006576	CCAA	2	8	2636347	2636354	50 %	0 %	0 %	50 %	56752483
43461	NC_006576	CGAT	2	8	2636464	2636471	25 %	25 %	25 %	25 %	56752483
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43465	NC_006576	TCAAA	2	10	2636759	2636768	60 %	20 %	0 %	20 %	56752483
43466	NC_006576	CAA	2	6	2636792	2636797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752483
43467	NC_006576	CG	3	6	2636830	2636835	0 %	0 %	50 %	50 %	56752483
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