MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42002	NC_006576	CGC	2	6	2541218	2541223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752393
42003	NC_006576	GTG	2	6	2541316	2541321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752393
42004	NC_006576	TGC	2	6	2541332	2541337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752393
42005	NC_006576	CTG	2	6	2541345	2541350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752393
42006	NC_006576	TCC	3	9	2541630	2541638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56752394
42007	NC_006576	TTG	2	6	2541687	2541692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752394
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42009	NC_006576	AAG	2	6	2541805	2541810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752394
42010	NC_006576	CGA	2	6	2541857	2541862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752394
42011	NC_006576	AAG	2	6	2541937	2541942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752394
42012	NC_006576	TCAG	2	8	2542225	2542232	25 %	25 %	25 %	25 %	56752394
42013	NC_006576	GGT	2	6	2542293	2542298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752394
42014	NC_006576	CTG	2	6	2542365	2542370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752394
42015	NC_006576	GCG	2	6	2542401	2542406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752394
42016	NC_006576	CGATAG	2	12	2542411	2542422	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	56752394
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42019	NC_006576	GA	4	8	2542680	2542687	50 %	0 %	50 %	0 %	56752394
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42024	NC_006576	TGGG	2	8	2543056	2543063	0 %	25 %	75 %	0 %	56752394
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42032	NC_006576	GACT	2	8	2543612	2543619	25 %	25 %	25 %	25 %	56752394
42033	NC_006576	GTC	2	6	2543636	2543641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752394
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42038	NC_006576	CCGGG	2	10	2544015	2544024	0 %	0 %	60 %	40 %	56752395
42039	NC_006576	CGAAGA	2	12	2544041	2544052	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	56752395
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42044	NC_006576	GTGG	2	8	2544315	2544322	0 %	25 %	75 %	0 %	56752396
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42056	NC_006576	CGC	2	6	2544693	2544698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752396
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42100	NC_006576	GCA	2	6	2547717	2547722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752397
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42103	NC_006576	GCTG	2	8	2547926	2547933	0 %	25 %	50 %	25 %	56752397
42104	NC_006576	AAC	2	6	2548025	2548030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752397
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42114	NC_006576	TCT	2	6	2548923	2548928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752398
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42117	NC_006576	TCG	2	6	2549081	2549086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752398
42118	NC_006576	TCTT	2	8	2549206	2549213	0 %	75 %	0 %	25 %	56752399
42119	NC_006576	TGG	2	6	2549244	2549249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752399
42120	NC_006576	GCAG	2	8	2549272	2549279	25 %	0 %	50 %	25 %	56752399
42121	NC_006576	T	6	6	2549351	2549356	0 %	100 %	0 %	0 %	56752399
42122	NC_006576	GCA	3	9	2549387	2549395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752399
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42124	NC_006576	GCT	2	6	2549506	2549511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752399
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42137	NC_006576	TGA	2	6	2550298	2550303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752400
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42141	NC_006576	TGC	2	6	2550484	2550489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752400
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42148	NC_006576	ATC	2	6	2550966	2550971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752400
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42153	NC_006576	CG	3	6	2551206	2551211	0 %	0 %	50 %	50 %	56752400
42154	NC_006576	TCG	2	6	2551213	2551218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752400
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42162	NC_006576	GCA	2	6	2551675	2551680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752401
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42166	NC_006576	TGG	2	6	2552419	2552424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752402
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42175	NC_006576	CGAT	2	8	2553094	2553101	25 %	25 %	25 %	25 %	56752403
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42179	NC_006576	GCCAAG	2	12	2553268	2553279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752403
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42187	NC_006576	AGGA	2	8	2553960	2553967	50 %	0 %	50 %	0 %	56752404
42188	NC_006576	GTCC	2	8	2554071	2554078	0 %	25 %	25 %	50 %	56752404
42189	NC_006576	TCAA	2	8	2554128	2554135	50 %	25 %	0 %	25 %	56752404
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42202	NC_006576	GAT	2	6	2555042	2555047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752405
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42206	NC_006576	GCA	2	6	2555146	2555151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752405
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42209	NC_006576	GCCG	2	8	2555540	2555547	0 %	0 %	50 %	50 %	56752405
42210	NC_006576	AGC	2	6	2555600	2555605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752405
42211	NC_006576	GTGCG	2	10	2555637	2555646	0 %	20 %	60 %	20 %	56752405
42212	NC_006576	TCTT	2	8	2555679	2555686	0 %	75 %	0 %	25 %	56752405
42213	NC_006576	TTG	2	6	2555738	2555743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752405
42214	NC_006576	GCC	2	6	2555757	2555762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752405
42215	NC_006576	CTG	2	6	2555765	2555770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752405
42216	NC_006576	TCG	2	6	2555798	2555803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752405
42217	NC_006576	TTCA	2	8	2555837	2555844	25 %	50 %	0 %	25 %	56752405
42218	NC_006576	GC	3	6	2555864	2555869	0 %	0 %	50 %	50 %	56752405
42219	NC_006576	GCA	2	6	2555938	2555943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752405
42220	NC_006576	ATC	2	6	2555955	2555960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752405
42221	NC_006576	GCG	2	6	2555963	2555968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752405
42222	NC_006576	GCG	3	9	2555996	2556004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752405
42223	NC_006576	TTCC	2	8	2556010	2556017	0 %	50 %	0 %	50 %	56752405
42224	NC_006576	CAG	2	6	2556038	2556043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752405
42225	NC_006576	CGA	2	6	2556076	2556081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752405
42226	NC_006576	GCT	2	6	2556133	2556138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752405
42227	NC_006576	CAATT	2	10	2556170	2556179	40 %	40 %	0 %	20 %	56752405
42228	NC_006576	ACC	2	6	2556180	2556185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752405
42229	NC_006576	GAT	2	6	2556311	2556316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752405
42230	NC_006576	GGC	2	6	2556331	2556336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752405
42231	NC_006576	TTC	2	6	2556353	2556358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752405
42232	NC_006576	GCA	2	6	2556475	2556480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752405
42233	NC_006576	CGAT	2	8	2556504	2556511	25 %	25 %	25 %	25 %	56752405
42234	NC_006576	GTTG	2	8	2556560	2556567	0 %	50 %	50 %	0 %	56752405
42235	NC_006576	CAG	3	9	2556599	2556607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752405
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42337	NC_006576	CCAAG	2	10	2562758	2562767	40 %	0 %	20 %	40 %	56752412
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42342	NC_006576	CTG	2	6	2563102	2563107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752413
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42345	NC_006576	ATCA	2	8	2563261	2563268	50 %	25 %	0 %	25 %	56752413
42346	NC_006576	AAC	2	6	2563306	2563311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752413
42347	NC_006576	TC	3	6	2563322	2563327	0 %	50 %	0 %	50 %	56752413
42348	NC_006576	GC	3	6	2563531	2563536	0 %	0 %	50 %	50 %	56752413
42349	NC_006576	T	7	7	2563608	2563614	0 %	100 %	0 %	0 %	56752413
42350	NC_006576	GTG	2	6	2563719	2563724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752413
42351	NC_006576	CCG	2	6	2563769	2563774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752413
42352	NC_006576	GCA	2	6	2563956	2563961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752413
42353	NC_006576	TCC	2	6	2564260	2564265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56752414
42354	NC_006576	TGC	2	6	2564275	2564280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752414
42355	NC_006576	GA	3	6	2564288	2564293	50 %	0 %	50 %	0 %	56752414
42356	NC_006576	CTT	2	6	2564316	2564321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752414
42357	NC_006576	CAA	2	6	2564322	2564327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752414
42358	NC_006576	GGGTTT	2	12	2564337	2564348	0 %	50 %	50 %	0 %	56752414
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42360	NC_006576	GGC	2	6	2564500	2564505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752414
42361	NC_006576	TTC	2	6	2564527	2564532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752414
42362	NC_006576	TGG	2	6	2564580	2564585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752414
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42364	NC_006576	CAG	2	6	2564635	2564640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752414
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42366	NC_006576	ATC	2	6	2564678	2564683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752414
42367	NC_006576	CAG	2	6	2564734	2564739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752414
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42373	NC_006576	GA	3	6	2564989	2564994	50 %	0 %	50 %	0 %	56752414
42374	NC_006576	CGCT	2	8	2565087	2565094	0 %	25 %	25 %	50 %	56752415
42375	NC_006576	AG	3	6	2565100	2565105	50 %	0 %	50 %	0 %	56752415
42376	NC_006576	CG	3	6	2565107	2565112	0 %	0 %	50 %	50 %	56752415
42377	NC_006576	CCAG	2	8	2565280	2565287	25 %	0 %	25 %	50 %	56752415
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42380	NC_006576	CGC	2	6	2565632	2565637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752415
42381	NC_006576	GTA	2	6	2565684	2565689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752415
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42384	NC_006576	GC	3	6	2566043	2566048	0 %	0 %	50 %	50 %	56752417
42385	NC_006576	CAG	2	6	2566077	2566082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752417
42386	NC_006576	GAT	2	6	2566185	2566190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752417
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42399	NC_006576	TG	3	6	2566681	2566686	0 %	50 %	50 %	0 %	56752417
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42404	NC_006576	GCC	3	9	2566961	2566969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752418
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42423	NC_006576	GTTTT	2	10	2568421	2568430	0 %	80 %	20 %	0 %	56752419
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42433	NC_006576	TGA	2	6	2568877	2568882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752419
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42436	NC_006576	TTGGG	2	10	2569047	2569056	0 %	40 %	60 %	0 %	56752419
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42443	NC_006576	ACG	2	6	2569752	2569757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752420
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42445	NC_006576	CTAGA	2	10	2569928	2569937	40 %	20 %	20 %	20 %	56752421
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42449	NC_006576	GCG	2	6	2570057	2570062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752421
42450	NC_006576	TGC	2	6	2570178	2570183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752421
42451	NC_006576	CTG	2	6	2570294	2570299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752421
42452	NC_006576	GAT	2	6	2570338	2570343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752421
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42455	NC_006576	ATC	3	9	2570471	2570479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752422
42456	NC_006576	GCTT	2	8	2570498	2570505	0 %	50 %	25 %	25 %	56752422
42457	NC_006576	GGC	2	6	2570557	2570562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752422
42458	NC_006576	TGC	2	6	2570587	2570592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752422
42459	NC_006576	GCG	2	6	2570699	2570704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752422
42460	NC_006576	CTA	2	6	2570735	2570740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752422
42461	NC_006576	CGG	2	6	2570757	2570762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752422
42462	NC_006576	AGC	2	6	2570778	2570783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752422
42463	NC_006576	CAG	2	6	2570801	2570806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752422
42464	NC_006576	GTG	2	6	2570861	2570866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752422
42465	NC_006576	GCA	2	6	2570953	2570958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752422
42466	NC_006576	G	6	6	2570961	2570966	0 %	0 %	100 %	0 %	56752422
42467	NC_006576	GTC	2	6	2571026	2571031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752422
42468	NC_006576	CCA	2	6	2571254	2571259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752422
42469	NC_006576	CGC	2	6	2571276	2571281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752422
42470	NC_006576	TGC	2	6	2571300	2571305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752422
42471	NC_006576	CAAG	2	8	2571337	2571344	50 %	0 %	25 %	25 %	56752422
42472	NC_006576	TGC	2	6	2571351	2571356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752422
42473	NC_006576	CGCCCA	2	12	2571374	2571385	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	56752422
42474	NC_006576	GCT	2	6	2571634	2571639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752423
42475	NC_006576	TTA	2	6	2571732	2571737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56752423
42476	NC_006576	CTGG	2	8	2571803	2571810	0 %	25 %	50 %	25 %	56752423
42477	NC_006576	GGC	3	9	2571856	2571864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752423
42478	NC_006576	GCT	2	6	2571923	2571928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752423
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42480	NC_006576	GCG	2	6	2572022	2572027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752423
42481	NC_006576	GAC	2	6	2572042	2572047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752423
42482	NC_006576	GTC	2	6	2572056	2572061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752423
42483	NC_006576	CCT	2	6	2572080	2572085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56752423
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42485	NC_006576	AGCG	2	8	2572327	2572334	25 %	0 %	50 %	25 %	56752424
42486	NC_006576	CG	3	6	2572337	2572342	0 %	0 %	50 %	50 %	56752424
42487	NC_006576	CAG	2	6	2572371	2572376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752424
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42489	NC_006576	CAC	2	6	2572565	2572570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752424
42490	NC_006576	CCT	3	9	2572619	2572627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56752424
42491	NC_006576	ACGGCA	2	12	2572691	2572702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752424
42492	NC_006576	GATC	2	8	2572727	2572734	25 %	25 %	25 %	25 %	56752424
42493	NC_006576	ACT	2	6	2572908	2572913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752425
42494	NC_006576	GCA	2	6	2572929	2572934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752425
42495	NC_006576	GAA	2	6	2572941	2572946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752425
42496	NC_006576	CAGCC	2	10	2572960	2572969	20 %	0 %	20 %	60 %	56752425
42497	NC_006576	GCG	2	6	2573222	2573227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752426
42498	NC_006576	G	6	6	2573253	2573258	0 %	0 %	100 %	0 %	56752426
42499	NC_006576	GTT	2	6	2573261	2573266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752426
42500	NC_006576	GGAG	2	8	2573411	2573418	25 %	0 %	75 %	0 %	56752426

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