MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_006576	ACTTCC	2	12	2512438	2512449	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	56752366
41502	NC_006576	TTGT	2	8	2512452	2512459	0 %	75 %	25 %	0 %	56752366
41503	NC_006576	GCG	2	6	2512486	2512491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752366
41504	NC_006576	CAC	2	6	2512527	2512532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752366
41505	NC_006576	CCGCT	2	10	2512567	2512576	0 %	20 %	20 %	60 %	56752366
41506	NC_006576	GCTGG	2	10	2512633	2512642	0 %	20 %	60 %	20 %	56752366
41507	NC_006576	C	6	6	2512834	2512839	0 %	0 %	0 %	100 %	56752367
41508	NC_006576	AAG	2	6	2512859	2512864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752367
41509	NC_006576	CTG	2	6	2512904	2512909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752367
41510	NC_006576	TTGA	2	8	2512981	2512988	25 %	50 %	25 %	0 %	56752367
41511	NC_006576	GGT	2	6	2512998	2513003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752367
41512	NC_006576	TC	3	6	2513106	2513111	0 %	50 %	0 %	50 %	56752367
41513	NC_006576	TGC	2	6	2513117	2513122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752367
41514	NC_006576	CCG	2	6	2513181	2513186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752367
41515	NC_006576	GCA	2	6	2513220	2513225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752367
41516	NC_006576	TCCA	2	8	2513267	2513274	25 %	25 %	0 %	50 %	56752367
41517	NC_006576	GCCC	2	8	2513288	2513295	0 %	0 %	25 %	75 %	56752367
41518	NC_006576	CTG	2	6	2513476	2513481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752368
41519	NC_006576	GGC	2	6	2513570	2513575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752368
41520	NC_006576	GCT	2	6	2513604	2513609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752368
41521	NC_006576	CGC	2	6	2513627	2513632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752368
41522	NC_006576	CAA	2	6	2513697	2513702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752368
41523	NC_006576	AGC	2	6	2513777	2513782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752368
41524	NC_006576	GGC	2	6	2513789	2513794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752368
41525	NC_006576	GAC	2	6	2513819	2513824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752368
41526	NC_006576	TGGC	2	8	2513903	2513910	0 %	25 %	50 %	25 %	56752369
41527	NC_006576	GCA	2	6	2513968	2513973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752369
41528	NC_006576	CTG	2	6	2514152	2514157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752369
41529	NC_006576	TGA	2	6	2514160	2514165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752369
41530	NC_006576	TGG	2	6	2514168	2514173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752369
41531	NC_006576	GCA	2	6	2514190	2514195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752369
41532	NC_006576	CAA	2	6	2514212	2514217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752369
41533	NC_006576	TAG	2	6	2514265	2514270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752369
41534	NC_006576	TGC	2	6	2514289	2514294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752369
41535	NC_006576	CTGA	2	8	2514302	2514309	25 %	25 %	25 %	25 %	56752369
41536	NC_006576	GTA	2	6	2514428	2514433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752370
41537	NC_006576	GCG	2	6	2514605	2514610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752370
41538	NC_006576	GAA	2	6	2514626	2514631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752370
41539	NC_006576	GCG	2	6	2514645	2514650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752370
41540	NC_006576	GCT	2	6	2514730	2514735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752370
41541	NC_006576	TTC	2	6	2514824	2514829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752370
41542	NC_006576	CAT	2	6	2514995	2515000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752370
41543	NC_006576	TCA	2	6	2515049	2515054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752371
41544	NC_006576	TGA	2	6	2515086	2515091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752371
41545	NC_006576	GCA	2	6	2515125	2515130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752371
41546	NC_006576	CCA	3	9	2515153	2515161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752371
41547	NC_006576	CAC	2	6	2515192	2515197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752371
41548	NC_006576	TG	3	6	2515199	2515204	0 %	50 %	50 %	0 %	56752371
41549	NC_006576	A	6	6	2515265	2515270	100 %	0 %	0 %	0 %	56752371
41550	NC_006576	GGA	2	6	2515410	2515415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56752371
41551	NC_006576	GA	3	6	2515439	2515444	50 %	0 %	50 %	0 %	56752371
41552	NC_006576	GCC	2	6	2515560	2515565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752371
41553	NC_006576	GAA	2	6	2515567	2515572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752371
41554	NC_006576	TTC	2	6	2515630	2515635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752371
41555	NC_006576	ACC	2	6	2515658	2515663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752371
41556	NC_006576	TCC	2	6	2515679	2515684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56752371
41557	NC_006576	TTCG	2	8	2515701	2515708	0 %	50 %	25 %	25 %	56752371
41558	NC_006576	CCA	2	6	2515734	2515739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752371
41559	NC_006576	CGC	2	6	2515795	2515800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752371
41560	NC_006576	GTC	2	6	2516001	2516006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752371
41561	NC_006576	AGA	2	6	2516018	2516023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752371
41562	NC_006576	GCT	2	6	2516055	2516060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752371
41563	NC_006576	CCT	2	6	2516064	2516069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56752371
41564	NC_006576	GGC	2	6	2516124	2516129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752371
41565	NC_006576	CGG	2	6	2516132	2516137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752371
41566	NC_006576	CCAT	2	8	2516195	2516202	25 %	25 %	0 %	50 %	56752371
41567	NC_006576	CAG	2	6	2516225	2516230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752372
41568	NC_006576	CGA	2	6	2516309	2516314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752372
41569	NC_006576	CAGC	2	8	2516328	2516335	25 %	0 %	25 %	50 %	56752372
41570	NC_006576	GGA	2	6	2516347	2516352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56752372
41571	NC_006576	CTGCA	2	10	2516353	2516362	20 %	20 %	20 %	40 %	56752372
41572	NC_006576	ACCA	2	8	2516388	2516395	50 %	0 %	0 %	50 %	56752372
41573	NC_006576	CCA	2	6	2516458	2516463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752372
41574	NC_006576	CAG	2	6	2516499	2516504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752372
41575	NC_006576	AGA	2	6	2516539	2516544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752372
41576	NC_006576	GCC	2	6	2516549	2516554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752372
41577	NC_006576	C	6	6	2516596	2516601	0 %	0 %	0 %	100 %	56752372
41578	NC_006576	TTG	2	6	2516655	2516660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752372
41579	NC_006576	AGAGC	2	10	2516663	2516672	40 %	0 %	40 %	20 %	56752372
41580	NC_006576	ATC	2	6	2516674	2516679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752372
41581	NC_006576	AAG	2	6	2516925	2516930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752373
41582	NC_006576	GGT	2	6	2516940	2516945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752373
41583	NC_006576	GCA	2	6	2516978	2516983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752373
41584	NC_006576	TGC	2	6	2516985	2516990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752373
41585	NC_006576	GCG	2	6	2517006	2517011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752373
41586	NC_006576	GGCTTT	2	12	2517113	2517124	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	56752373
41587	NC_006576	CTG	2	6	2517212	2517217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752373
41588	NC_006576	T	6	6	2517236	2517241	0 %	100 %	0 %	0 %	56752373
41589	NC_006576	CTAT	2	8	2517246	2517253	25 %	50 %	0 %	25 %	56752373
41590	NC_006576	ACA	2	6	2517324	2517329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752373
41591	NC_006576	CTA	2	6	2517406	2517411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752373
41592	NC_006576	GAT	2	6	2517439	2517444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752374
41593	NC_006576	GGC	2	6	2517482	2517487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752374
41594	NC_006576	GGT	2	6	2517517	2517522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752374
41595	NC_006576	TGC	2	6	2517598	2517603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752374
41596	NC_006576	GTA	2	6	2517624	2517629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752374
41597	NC_006576	GCTG	2	8	2517639	2517646	0 %	25 %	50 %	25 %	56752374
41598	NC_006576	CGT	2	6	2517781	2517786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752374
41599	NC_006576	TGCC	2	8	2517859	2517866	0 %	25 %	25 %	50 %	56752374
41600	NC_006576	TGA	2	6	2518035	2518040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752375
41601	NC_006576	CGGA	2	8	2518096	2518103	25 %	0 %	50 %	25 %	56752375
41602	NC_006576	ATG	2	6	2518125	2518130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752375
41603	NC_006576	GGC	2	6	2518179	2518184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752375
41604	NC_006576	ACC	2	6	2518205	2518210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752375
41605	NC_006576	AAT	2	6	2518243	2518248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56752375
41606	NC_006576	TGA	2	6	2518284	2518289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752375
41607	NC_006576	CCA	2	6	2518323	2518328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752375
41608	NC_006576	GCT	2	6	2518396	2518401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752375
41609	NC_006576	ACC	2	6	2518428	2518433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752375
41610	NC_006576	TTAC	2	8	2518464	2518471	25 %	50 %	0 %	25 %	56752375
41611	NC_006576	GAC	2	6	2518525	2518530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752375
41612	NC_006576	AAG	2	6	2518592	2518597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752375
41613	NC_006576	AAT	2	6	2518601	2518606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56752375
41614	NC_006576	CTT	3	9	2518610	2518618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752375
41615	NC_006576	CTT	2	6	2518699	2518704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752375
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41617	NC_006576	GCC	2	6	2518927	2518932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752375
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