MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_006576	GCA	2	6	2481206	2481211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752333
41002	NC_006576	GCACT	2	10	2481245	2481254	20 %	20 %	20 %	40 %	56752333
41003	NC_006576	CTG	2	6	2481269	2481274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752333
41004	NC_006576	CT	3	6	2481613	2481618	0 %	50 %	0 %	50 %	56752334
41005	NC_006576	GAC	2	6	2481671	2481676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752334
41006	NC_006576	TTG	2	6	2481700	2481705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752334
41007	NC_006576	TAC	2	6	2481738	2481743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752334
41008	NC_006576	CGCT	2	8	2481749	2481756	0 %	25 %	25 %	50 %	56752334
41009	NC_006576	T	6	6	2481867	2481872	0 %	100 %	0 %	0 %	56752334
41010	NC_006576	AGGC	2	8	2481916	2481923	25 %	0 %	50 %	25 %	56752334
41011	NC_006576	TGT	2	6	2481937	2481942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752334
41012	NC_006576	GCC	2	6	2481959	2481964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752334
41013	NC_006576	GAT	2	6	2481986	2481991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752334
41014	NC_006576	TC	3	6	2482010	2482015	0 %	50 %	0 %	50 %	56752334
41015	NC_006576	GGC	2	6	2482031	2482036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752334
41016	NC_006576	CGG	2	6	2482057	2482062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752334
41017	NC_006576	ACT	2	6	2482099	2482104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752334
41018	NC_006576	TGG	2	6	2482129	2482134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752334
41019	NC_006576	TGG	2	6	2482183	2482188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752334
41020	NC_006576	TC	3	6	2482259	2482264	0 %	50 %	0 %	50 %	56752334
41021	NC_006576	GATTGC	2	12	2482271	2482282	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	56752334
41022	NC_006576	GGTC	2	8	2482298	2482305	0 %	25 %	50 %	25 %	56752334
41023	NC_006576	GCG	2	6	2482312	2482317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752334
41024	NC_006576	CGA	2	6	2482339	2482344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752334
41025	NC_006576	CTTGG	2	10	2482409	2482418	0 %	40 %	40 %	20 %	56752334
41026	NC_006576	AACC	2	8	2482436	2482443	50 %	0 %	0 %	50 %	56752334
41027	NC_006576	GCTGG	2	10	2482469	2482478	0 %	20 %	60 %	20 %	56752334
41028	NC_006576	TGG	2	6	2482555	2482560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752334
41029	NC_006576	TGT	2	6	2482621	2482626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752334
41030	NC_006576	GTTG	2	8	2482669	2482676	0 %	50 %	50 %	0 %	56752334
41031	NC_006576	CTC	2	6	2482699	2482704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56752334
41032	NC_006576	GTCG	2	8	2482746	2482753	0 %	25 %	50 %	25 %	56752334
41033	NC_006576	TGGT	2	8	2482761	2482768	0 %	50 %	50 %	0 %	56752334
41034	NC_006576	TCA	2	6	2482827	2482832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752334
41035	NC_006576	TGC	2	6	2482846	2482851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752334
41036	NC_006576	T	6	6	2482881	2482886	0 %	100 %	0 %	0 %	56752334
41037	NC_006576	GCG	2	6	2482889	2482894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752334
41038	NC_006576	TGC	2	6	2483032	2483037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752335
41039	NC_006576	GGTTT	2	10	2483051	2483060	0 %	60 %	40 %	0 %	56752335
41040	NC_006576	GTC	2	6	2483091	2483096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752335
41041	NC_006576	TC	3	6	2483126	2483131	0 %	50 %	0 %	50 %	56752335
41042	NC_006576	CGC	2	6	2483154	2483159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752335
41043	NC_006576	TGA	2	6	2483167	2483172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752335
41044	NC_006576	T	7	7	2483290	2483296	0 %	100 %	0 %	0 %	56752335
41045	NC_006576	GAT	2	6	2483297	2483302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752335
41046	NC_006576	TTC	2	6	2483314	2483319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752335
41047	NC_006576	GGC	2	6	2483460	2483465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752335
41048	NC_006576	G	6	6	2483576	2483581	0 %	0 %	100 %	0 %	56752335
41049	NC_006576	CCA	2	6	2483620	2483625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752335
41050	NC_006576	GCGATC	2	12	2483643	2483654	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56752335
41051	NC_006576	ATTT	2	8	2483804	2483811	25 %	75 %	0 %	0 %	56752335
41052	NC_006576	GCT	2	6	2483901	2483906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752335
41053	NC_006576	TGT	2	6	2483965	2483970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752335
41054	NC_006576	GCC	2	6	2484153	2484158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752336
41055	NC_006576	GTCT	2	8	2484204	2484211	0 %	50 %	25 %	25 %	56752336
41056	NC_006576	TCG	2	6	2484262	2484267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752336
41057	NC_006576	TTG	2	6	2484324	2484329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752336
41058	NC_006576	GCTA	2	8	2484334	2484341	25 %	25 %	25 %	25 %	56752336
41059	NC_006576	TGA	2	6	2484351	2484356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752336
41060	NC_006576	CAA	2	6	2484365	2484370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752336
41061	NC_006576	TTC	2	6	2484535	2484540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752336
41062	NC_006576	CAGT	2	8	2484661	2484668	25 %	25 %	25 %	25 %	56752336
41063	NC_006576	GTC	2	6	2484675	2484680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752336
41064	NC_006576	GCA	2	6	2484879	2484884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752337
41065	NC_006576	GCC	2	6	2484891	2484896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752337
41066	NC_006576	TTC	2	6	2484917	2484922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752337
41067	NC_006576	GGC	3	9	2484971	2484979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752337
41068	NC_006576	CTG	2	6	2484995	2485000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752337
41069	NC_006576	AAC	2	6	2485049	2485054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752337
41070	NC_006576	AGC	2	6	2485071	2485076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752337
41071	NC_006576	AAC	2	6	2485136	2485141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752337
41072	NC_006576	TGC	2	6	2485220	2485225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752338
41073	NC_006576	CTT	2	6	2485240	2485245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752338
41074	NC_006576	GCA	2	6	2485507	2485512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752338
41075	NC_006576	TGA	2	6	2485584	2485589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752338
41076	NC_006576	TGG	2	6	2485750	2485755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752338
41077	NC_006576	ACC	2	6	2485773	2485778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752338
41078	NC_006576	CCA	2	6	2485794	2485799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752338
41079	NC_006576	CGG	3	9	2485888	2485896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752338
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41082	NC_006576	TCA	2	6	2486020	2486025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752338
41083	NC_006576	GGC	2	6	2486170	2486175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752339
41084	NC_006576	CAG	2	6	2486181	2486186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752339
41085	NC_006576	GAT	2	6	2486334	2486339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752339
41086	NC_006576	CAA	2	6	2486394	2486399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752339
41087	NC_006576	CGC	2	6	2486421	2486426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752339
41088	NC_006576	CAGA	2	8	2486433	2486440	50 %	0 %	25 %	25 %	56752339
41089	NC_006576	CAC	2	6	2486499	2486504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752339
41090	NC_006576	CCT	2	6	2486621	2486626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56752339
41091	NC_006576	GAA	3	9	2486664	2486672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752339
41092	NC_006576	CAG	2	6	2486796	2486801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752339
41093	NC_006576	CAC	2	6	2486826	2486831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752339
41094	NC_006576	GCT	2	6	2486840	2486845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752339
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41096	NC_006576	CGT	2	6	2486907	2486912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752339
41097	NC_006576	CCG	2	6	2486917	2486922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752339
41098	NC_006576	CCA	2	6	2486933	2486938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752339
41099	NC_006576	CCA	2	6	2486996	2487001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752339
41100	NC_006576	GGC	2	6	2487120	2487125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752339
41101	NC_006576	CCAG	2	8	2487182	2487189	25 %	0 %	25 %	50 %	56752339
41102	NC_006576	GGC	2	6	2487424	2487429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752339
41103	NC_006576	TGG	2	6	2487449	2487454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752339
41104	NC_006576	C	6	6	2487524	2487529	0 %	0 %	0 %	100 %	56752340
41105	NC_006576	TTG	2	6	2487542	2487547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752340
41106	NC_006576	AATC	2	8	2487645	2487652	50 %	25 %	0 %	25 %	56752340
41107	NC_006576	CGTC	2	8	2487789	2487796	0 %	25 %	25 %	50 %	56752340
41108	NC_006576	ACCAA	2	10	2487908	2487917	60 %	0 %	0 %	40 %	56752340
41109	NC_006576	GCT	2	6	2487931	2487936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752340
41110	NC_006576	GCA	2	6	2488095	2488100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752340
41111	NC_006576	CCG	2	6	2488191	2488196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752340
41112	NC_006576	GCG	2	6	2488243	2488248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752340
41113	NC_006576	TTG	2	6	2488285	2488290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752340
41114	NC_006576	GACT	2	8	2488393	2488400	25 %	25 %	25 %	25 %	56752340
41115	NC_006576	C	6	6	2488539	2488544	0 %	0 %	0 %	100 %	56752340
41116	NC_006576	TTGAGG	2	12	2488568	2488579	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	56752340
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41118	NC_006576	TTG	2	6	2488675	2488680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752340
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41235	NC_006576	AGGT	2	8	2495968	2495975	25 %	25 %	50 %	0 %	56752348
41236	NC_006576	GCA	2	6	2496008	2496013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752348
41237	NC_006576	TCAT	2	8	2496297	2496304	25 %	50 %	0 %	25 %	56752349
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41340	NC_006576	GCA	2	6	2502283	2502288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752357
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41342	NC_006576	CCG	2	6	2502350	2502355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752357
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41344	NC_006576	GTAGG	2	10	2502449	2502458	20 %	20 %	60 %	0 %	56752357
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41348	NC_006576	TGT	2	6	2502490	2502495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752357
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41350	NC_006576	AAG	2	6	2502594	2502599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752357
41351	NC_006576	CGC	2	6	2502737	2502742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752357
41352	NC_006576	CCAT	2	8	2503317	2503324	25 %	25 %	0 %	50 %	56752358
41353	NC_006576	TGA	2	6	2503408	2503413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752358
41354	NC_006576	TCG	2	6	2503423	2503428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752358
41355	NC_006576	TCG	2	6	2503471	2503476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752358
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41357	NC_006576	GACA	2	8	2503505	2503512	50 %	0 %	25 %	25 %	56752358
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41383	NC_006576	ACT	2	6	2505116	2505121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752359
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41453	NC_006576	TCAA	2	8	2509413	2509420	50 %	25 %	0 %	25 %	56752363
41454	NC_006576	GGCT	2	8	2509428	2509435	0 %	25 %	50 %	25 %	56752363
41455	NC_006576	TGC	3	9	2509453	2509461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752363
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41459	NC_006576	GA	3	6	2509641	2509646	50 %	0 %	50 %	0 %	56752363
41460	NC_006576	AGC	2	6	2509739	2509744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752363
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41463	NC_006576	TGC	2	6	2509893	2509898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752363
41464	NC_006576	GCT	2	6	2509912	2509917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752363
41465	NC_006576	GCG	2	6	2509935	2509940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752363
41466	NC_006576	TCCAGC	2	12	2510027	2510038	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	56752364
41467	NC_006576	GCC	2	6	2510050	2510055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752364
41468	NC_006576	GAT	2	6	2510062	2510067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752364
41469	NC_006576	CGC	2	6	2510289	2510294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752364
41470	NC_006576	CCGA	2	8	2510317	2510324	25 %	0 %	25 %	50 %	56752364
41471	NC_006576	TTC	2	6	2510395	2510400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752364
41472	NC_006576	TCC	2	6	2510699	2510704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56752364
41473	NC_006576	ATCAC	2	10	2510735	2510744	40 %	20 %	0 %	40 %	56752364
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41475	NC_006576	GCG	2	6	2511050	2511055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752365
41476	NC_006576	GC	3	6	2511094	2511099	0 %	0 %	50 %	50 %	56752365
41477	NC_006576	TGC	2	6	2511183	2511188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752365
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41479	NC_006576	TGT	2	6	2511279	2511284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752365
41480	NC_006576	CACC	2	8	2511285	2511292	25 %	0 %	0 %	75 %	56752365
41481	NC_006576	CAT	2	6	2511468	2511473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752365
41482	NC_006576	CCA	2	6	2511480	2511485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752365
41483	NC_006576	ACC	2	6	2511491	2511496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752365
41484	NC_006576	GTTG	2	8	2511507	2511514	0 %	50 %	50 %	0 %	56752365
41485	NC_006576	CGGTG	2	10	2511526	2511535	0 %	20 %	60 %	20 %	56752365
41486	NC_006576	CCG	2	6	2511693	2511698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752365
41487	NC_006576	AGT	2	6	2511714	2511719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752365
41488	NC_006576	CAC	2	6	2511733	2511738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752365
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41491	NC_006576	GGT	2	6	2511835	2511840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752365
41492	NC_006576	CAG	2	6	2511934	2511939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752365
41493	NC_006576	CTT	2	6	2511967	2511972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752365
41494	NC_006576	GTA	2	6	2511997	2512002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752365
41495	NC_006576	ATCG	2	8	2512018	2512025	25 %	25 %	25 %	25 %	56752365
41496	NC_006576	CCG	2	6	2512038	2512043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752365
41497	NC_006576	CTC	2	6	2512054	2512059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56752365
41498	NC_006576	CAAC	2	8	2512066	2512073	50 %	0 %	0 %	50 %	56752365
41499	NC_006576	CTT	2	6	2512116	2512121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752365
41500	NC_006576	T	6	6	2512170	2512175	0 %	100 %	0 %	0 %	56752365

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