MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40501	NC_006576	A	6	6	2451714	2451719	100 %	0 %	0 %	0 %	161621811
40502	NC_006576	GTC	2	6	2451739	2451744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161621811
40503	NC_006576	CGT	2	6	2451837	2451842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161621811
40504	NC_006576	TC	3	6	2451857	2451862	0 %	50 %	0 %	50 %	161621811
40505	NC_006576	GGGA	2	8	2451890	2451897	25 %	0 %	75 %	0 %	161621811
40506	NC_006576	GAGCA	2	10	2451912	2451921	40 %	0 %	40 %	20 %	161621811
40507	NC_006576	AGC	2	6	2451982	2451987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161621811
40508	NC_006576	GCC	2	6	2452039	2452044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161621811
40509	NC_006576	GCA	2	6	2452076	2452081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161621811
40510	NC_006576	GCAG	2	8	2452144	2452151	25 %	0 %	50 %	25 %	161621811
40511	NC_006576	GAG	2	6	2452156	2452161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161621811
40512	NC_006576	AACAGC	2	12	2452370	2452381	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	56752309
40513	NC_006576	GGC	2	6	2452474	2452479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752309
40514	NC_006576	CGA	2	6	2452536	2452541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752309
40515	NC_006576	CTG	2	6	2452579	2452584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752309
40516	NC_006576	TGC	2	6	2452600	2452605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752309
40517	NC_006576	CAGCCC	2	12	2452831	2452842	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	56752310
40518	NC_006576	TGC	2	6	2452901	2452906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752310
40519	NC_006576	GCG	2	6	2452944	2452949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752310
40520	NC_006576	GCG	2	6	2453099	2453104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752310
40521	NC_006576	CCG	2	6	2453128	2453133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752310
40522	NC_006576	GTA	2	6	2453150	2453155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752310
40523	NC_006576	CAT	2	6	2453249	2453254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752310
40524	NC_006576	ATG	2	6	2453268	2453273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752310
40525	NC_006576	GCA	2	6	2453311	2453316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752310
40526	NC_006576	GA	3	6	2453349	2453354	50 %	0 %	50 %	0 %	56752310
40527	NC_006576	CAGG	2	8	2453402	2453409	25 %	0 %	50 %	25 %	56752310
40528	NC_006576	CAA	2	6	2453419	2453424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752310
40529	NC_006576	CTT	2	6	2453440	2453445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752310
40530	NC_006576	CCT	2	6	2453563	2453568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56752310
40531	NC_006576	TCGA	2	8	2453589	2453596	25 %	25 %	25 %	25 %	56752310
40532	NC_006576	CGT	2	6	2453690	2453695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752310
40533	NC_006576	GCT	2	6	2454000	2454005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752311
40534	NC_006576	CCT	2	6	2454058	2454063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56752311
40535	NC_006576	CCA	2	6	2454066	2454071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752311
40536	NC_006576	TGGCT	2	10	2454196	2454205	0 %	40 %	40 %	20 %	56752311
40537	NC_006576	CCG	2	6	2454298	2454303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752311
40538	NC_006576	GCT	2	6	2454390	2454395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752311
40539	NC_006576	GGCT	2	8	2454520	2454527	0 %	25 %	50 %	25 %	56752311
40540	NC_006576	TTA	2	6	2454546	2454551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56752311
40541	NC_006576	CTG	2	6	2454676	2454681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752311
40542	NC_006576	GTG	2	6	2454808	2454813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752311
40543	NC_006576	GCG	2	6	2455138	2455143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752311
40544	NC_006576	CGA	2	6	2455195	2455200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752311
40545	NC_006576	GGGCT	2	10	2455279	2455288	0 %	20 %	60 %	20 %	56752312
40546	NC_006576	ACCGG	2	10	2455398	2455407	20 %	0 %	40 %	40 %	56752312
40547	NC_006576	ATC	2	6	2455442	2455447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752312
40548	NC_006576	G	7	7	2455493	2455499	0 %	0 %	100 %	0 %	56752312
40549	NC_006576	AGATC	2	10	2455507	2455516	40 %	20 %	20 %	20 %	56752312
40550	NC_006576	TTGC	2	8	2455517	2455524	0 %	50 %	25 %	25 %	56752312
40551	NC_006576	ACT	2	6	2455527	2455532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752312
40552	NC_006576	TAG	2	6	2455761	2455766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752312
40553	NC_006576	CTG	2	6	2455817	2455822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752312
40554	NC_006576	CAG	2	6	2456159	2456164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752313
40555	NC_006576	CCGCAG	2	12	2456201	2456212	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	56752313
40556	NC_006576	CCGG	2	8	2456232	2456239	0 %	0 %	50 %	50 %	56752313
40557	NC_006576	GCT	2	6	2456295	2456300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752313
40558	NC_006576	CGC	2	6	2456392	2456397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752313
40559	NC_006576	ATG	2	6	2456415	2456420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752313
40560	NC_006576	TTGCCC	2	12	2456421	2456432	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	56752313
40561	NC_006576	GCT	2	6	2456506	2456511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752313
40562	NC_006576	GCTGAG	2	12	2456534	2456545	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56752313
40563	NC_006576	CAG	2	6	2456587	2456592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752313
40564	NC_006576	CCG	2	6	2456610	2456615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752313
40565	NC_006576	CGC	3	9	2456668	2456676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752313
40566	NC_006576	TGA	2	6	2456698	2456703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752313
40567	NC_006576	TCA	2	6	2456706	2456711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752313
40568	NC_006576	CCA	2	6	2456778	2456783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752313
40569	NC_006576	GCG	2	6	2456819	2456824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752313
40570	NC_006576	GGT	2	6	2456911	2456916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752313
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40572	NC_006576	GCA	2	6	2456964	2456969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752313
40573	NC_006576	GTA	2	6	2456990	2456995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752313
40574	NC_006576	GTTG	2	8	2457149	2457156	0 %	50 %	50 %	0 %	56752314
40575	NC_006576	TTG	2	6	2457175	2457180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752314
40576	NC_006576	GTT	2	6	2457193	2457198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752314
40577	NC_006576	GCA	2	6	2457272	2457277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752314
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40582	NC_006576	GCC	2	6	2457531	2457536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752314
40583	NC_006576	GCT	2	6	2457576	2457581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752314
40584	NC_006576	TGC	2	6	2457593	2457598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752314
40585	NC_006576	GGAT	2	8	2457672	2457679	25 %	25 %	50 %	0 %	56752314
40586	NC_006576	CCGG	2	8	2457791	2457798	0 %	0 %	50 %	50 %	56752314
40587	NC_006576	GCT	2	6	2457807	2457812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752314
40588	NC_006576	CTT	2	6	2457977	2457982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752314
40589	NC_006576	CAGG	2	8	2458013	2458020	25 %	0 %	50 %	25 %	56752314
40590	NC_006576	TTGA	2	8	2458089	2458096	25 %	50 %	25 %	0 %	56752314
40591	NC_006576	GGCA	2	8	2458242	2458249	25 %	0 %	50 %	25 %	56752314
40592	NC_006576	CCG	2	6	2458291	2458296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752314
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40597	NC_006576	GTT	2	6	2458533	2458538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752314
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40599	NC_006576	TGGC	2	8	2458576	2458583	0 %	25 %	50 %	25 %	56752314
40600	NC_006576	ATC	2	6	2458635	2458640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752314
40601	NC_006576	GAC	2	6	2458667	2458672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752314
40602	NC_006576	GGC	2	6	2458772	2458777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752314
40603	NC_006576	TTG	2	6	2458836	2458841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752314
40604	NC_006576	TTTG	2	8	2458964	2458971	0 %	75 %	25 %	0 %	56752314
40605	NC_006576	AGT	2	6	2458984	2458989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752314
40606	NC_006576	TAC	2	6	2459024	2459029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752314
40607	NC_006576	CAGT	2	8	2459048	2459055	25 %	25 %	25 %	25 %	56752314
40608	NC_006576	ACCC	2	8	2459069	2459076	25 %	0 %	0 %	75 %	56752314
40609	NC_006576	TAG	2	6	2459117	2459122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752314
40610	NC_006576	TGT	2	6	2459140	2459145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752314
40611	NC_006576	AG	3	6	2459203	2459208	50 %	0 %	50 %	0 %	56752314
40612	NC_006576	GTC	2	6	2459217	2459222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752314
40613	NC_006576	GCA	2	6	2459248	2459253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752314
40614	NC_006576	GTT	2	6	2459267	2459272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752314
40615	NC_006576	CAGC	2	8	2459442	2459449	25 %	0 %	25 %	50 %	56752314
40616	NC_006576	CGAGG	2	10	2459498	2459507	20 %	0 %	60 %	20 %	56752314
40617	NC_006576	GCA	2	6	2459510	2459515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752314
40618	NC_006576	GA	3	6	2459518	2459523	50 %	0 %	50 %	0 %	56752314
40619	NC_006576	CGC	2	6	2459687	2459692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752314
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40621	NC_006576	GCT	2	6	2459763	2459768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752314
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40729	NC_006576	GGC	3	9	2466315	2466323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752319
40730	NC_006576	TGC	2	6	2466351	2466356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752319
40731	NC_006576	AAT	2	6	2466357	2466362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56752319
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40733	NC_006576	CGAT	2	8	2466406	2466413	25 %	25 %	25 %	25 %	56752319
40734	NC_006576	GTA	2	6	2466432	2466437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752319
40735	NC_006576	TGC	2	6	2466448	2466453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752319
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40838	NC_006576	GACT	2	8	2472249	2472256	25 %	25 %	25 %	25 %	56752323
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40841	NC_006576	AG	3	6	2472490	2472495	50 %	0 %	50 %	0 %	56752323
40842	NC_006576	GCGATC	2	12	2472550	2472561	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56752323
40843	NC_006576	CGA	2	6	2472569	2472574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752323
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40845	NC_006576	CAA	2	6	2472729	2472734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752323
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