MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40002	NC_006576	CCG	2	6	2421612	2421617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752279
40003	NC_006576	TGA	2	6	2421715	2421720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752279
40004	NC_006576	GGC	2	6	2421764	2421769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752279
40005	NC_006576	CT	3	6	2421810	2421815	0 %	50 %	0 %	50 %	56752279
40006	NC_006576	GGT	2	6	2421827	2421832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752279
40007	NC_006576	CGG	2	6	2421898	2421903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752280
40008	NC_006576	CTT	2	6	2421915	2421920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752280
40009	NC_006576	AATT	2	8	2421994	2422001	50 %	50 %	0 %	0 %	56752280
40010	NC_006576	GCCGCT	2	12	2422143	2422154	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	56752280
40011	NC_006576	CGC	2	6	2422275	2422280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752280
40012	NC_006576	CTG	2	6	2422290	2422295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752280
40013	NC_006576	GCG	2	6	2422299	2422304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752280
40014	NC_006576	GCG	2	6	2422335	2422340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752280
40015	NC_006576	CGC	2	6	2422343	2422348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752280
40016	NC_006576	GAT	2	6	2422404	2422409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752280
40017	NC_006576	GGC	2	6	2422472	2422477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752280
40018	NC_006576	GCTGCC	2	12	2422515	2422526	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	56752280
40019	NC_006576	CTG	2	6	2422571	2422576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752281
40020	NC_006576	GAGC	2	8	2422795	2422802	25 %	0 %	50 %	25 %	56752282
40021	NC_006576	TGC	2	6	2422806	2422811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752282
40022	NC_006576	GTT	2	6	2422931	2422936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752282
40023	NC_006576	CAA	2	6	2423102	2423107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752282
40024	NC_006576	GCA	2	6	2423292	2423297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752283
40025	NC_006576	GA	3	6	2423304	2423309	50 %	0 %	50 %	0 %	56752283
40026	NC_006576	TTC	2	6	2423310	2423315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752283
40027	NC_006576	TGCCC	2	10	2423396	2423405	0 %	20 %	20 %	60 %	56752283
40028	NC_006576	GTG	2	6	2423413	2423418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752283
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40031	NC_006576	TTG	2	6	2423533	2423538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752283
40032	NC_006576	CG	3	6	2423554	2423559	0 %	0 %	50 %	50 %	56752283
40033	NC_006576	TTA	2	6	2423629	2423634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56752283
40034	NC_006576	GGC	2	6	2423817	2423822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752283
40035	NC_006576	TGCTGG	2	12	2423864	2423875	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	56752283
40036	NC_006576	CGA	2	6	2423936	2423941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752283
40037	NC_006576	TTCATC	2	12	2423991	2424002	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	56752283
40038	NC_006576	GAT	2	6	2424153	2424158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752284
40039	NC_006576	GCA	2	6	2424168	2424173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752284
40040	NC_006576	AG	3	6	2424237	2424242	50 %	0 %	50 %	0 %	56752284
40041	NC_006576	GCT	2	6	2424302	2424307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752284
40042	NC_006576	TGC	2	6	2424314	2424319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752284
40043	NC_006576	CCG	3	9	2424329	2424337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752284
40044	NC_006576	TGC	2	6	2424362	2424367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752284
40045	NC_006576	GCTG	2	8	2424372	2424379	0 %	25 %	50 %	25 %	56752284
40046	NC_006576	CTG	2	6	2424423	2424428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752284
40047	NC_006576	A	6	6	2424447	2424452	100 %	0 %	0 %	0 %	56752284
40048	NC_006576	GTC	2	6	2424478	2424483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752284
40049	NC_006576	CGC	2	6	2424650	2424655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752284
40050	NC_006576	GCA	2	6	2424851	2424856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752285
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40054	NC_006576	TTA	2	6	2425095	2425100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56752285
40055	NC_006576	GCA	2	6	2425112	2425117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752285
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40057	NC_006576	CACT	2	8	2425136	2425143	25 %	25 %	0 %	50 %	56752285
40058	NC_006576	CTG	2	6	2425144	2425149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752285
40059	NC_006576	TTG	2	6	2425275	2425280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752286
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40061	NC_006576	TGT	2	6	2425309	2425314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752286
40062	NC_006576	ACGGC	2	10	2425380	2425389	20 %	0 %	40 %	40 %	56752286
40063	NC_006576	GATG	2	8	2425433	2425440	25 %	25 %	50 %	0 %	56752286
40064	NC_006576	ACTG	2	8	2425502	2425509	25 %	25 %	25 %	25 %	56752286
40065	NC_006576	CGC	2	6	2425544	2425549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752286
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40068	NC_006576	AG	3	6	2425820	2425825	50 %	0 %	50 %	0 %	56752287
40069	NC_006576	TCGA	2	8	2425869	2425876	25 %	25 %	25 %	25 %	56752287
40070	NC_006576	CGG	2	6	2425928	2425933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752287
40071	NC_006576	GGC	2	6	2426100	2426105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752287
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40077	NC_006576	GGGCA	2	10	2426454	2426463	20 %	0 %	60 %	20 %	56752287
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40088	NC_006576	CAT	2	6	2427158	2427163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752287
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40093	NC_006576	A	7	7	2427391	2427397	100 %	0 %	0 %	0 %	56752287
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40100	NC_006576	GATC	2	8	2427602	2427609	25 %	25 %	25 %	25 %	56752287
40101	NC_006576	GAT	2	6	2427636	2427641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752287
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40104	NC_006576	CCG	2	6	2427786	2427791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752287
40105	NC_006576	CTGA	2	8	2427819	2427826	25 %	25 %	25 %	25 %	56752287
40106	NC_006576	GAT	2	6	2427888	2427893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752287
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40109	NC_006576	CGT	2	6	2427947	2427952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752287
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40111	NC_006576	AGCG	2	8	2427982	2427989	25 %	0 %	50 %	25 %	56752287
40112	NC_006576	GCCCT	2	10	2428000	2428009	0 %	20 %	20 %	60 %	56752287
40113	NC_006576	TGA	2	6	2428024	2428029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752287
40114	NC_006576	TGGT	2	8	2428043	2428050	0 %	50 %	50 %	0 %	56752287
40115	NC_006576	GTG	2	6	2428098	2428103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752287
40116	NC_006576	TGG	2	6	2428114	2428119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752287
40117	NC_006576	GCG	2	6	2428190	2428195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752287
40118	NC_006576	ACCC	2	8	2428212	2428219	25 %	0 %	0 %	75 %	56752287
40119	NC_006576	GAC	2	6	2428251	2428256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752287
40120	NC_006576	GCT	2	6	2428271	2428276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752287
40121	NC_006576	TGGC	2	8	2428298	2428305	0 %	25 %	50 %	25 %	56752287
40122	NC_006576	CCAA	2	8	2428318	2428325	50 %	0 %	0 %	50 %	56752287
40123	NC_006576	CAA	2	6	2428329	2428334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752287
40124	NC_006576	AGC	2	6	2428360	2428365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752287
40125	NC_006576	TGA	2	6	2428390	2428395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752287
40126	NC_006576	GATG	2	8	2428403	2428410	25 %	25 %	50 %	0 %	56752287
40127	NC_006576	TCG	2	6	2428420	2428425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752287
40128	NC_006576	CGAT	2	8	2428555	2428562	25 %	25 %	25 %	25 %	56752287
40129	NC_006576	GCTC	2	8	2428629	2428636	0 %	25 %	25 %	50 %	56752288
40130	NC_006576	CTG	3	9	2428690	2428698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752288
40131	NC_006576	GGCA	2	8	2428707	2428714	25 %	0 %	50 %	25 %	56752288
40132	NC_006576	CAG	2	6	2428797	2428802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752288
40133	NC_006576	GCT	3	9	2428890	2428898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752288
40134	NC_006576	AAC	2	6	2428976	2428981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752288
40135	NC_006576	TGGAGG	2	12	2429045	2429056	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	56752288
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40137	NC_006576	GTTG	2	8	2429124	2429131	0 %	50 %	50 %	0 %	56752288
40138	NC_006576	CGT	2	6	2429167	2429172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752288
40139	NC_006576	CGT	2	6	2429176	2429181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752288
40140	NC_006576	CGT	2	6	2429193	2429198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752288
40141	NC_006576	AAG	2	6	2429216	2429221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752288
40142	NC_006576	TGA	2	6	2429270	2429275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752288
40143	NC_006576	TGC	2	6	2429300	2429305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752288
40144	NC_006576	AGC	2	6	2429306	2429311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752288
40145	NC_006576	AGCTG	2	10	2429331	2429340	20 %	20 %	40 %	20 %	56752288
40146	NC_006576	TGA	2	6	2429348	2429353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752288
40147	NC_006576	GACT	2	8	2429406	2429413	25 %	25 %	25 %	25 %	56752288
40148	NC_006576	ACT	2	6	2429501	2429506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752288
40149	NC_006576	GCG	2	6	2429533	2429538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752288
40150	NC_006576	CGATCG	2	12	2429562	2429573	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56752288
40151	NC_006576	ATT	2	6	2429750	2429755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56752288
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40153	NC_006576	TTC	2	6	2429808	2429813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752288
40154	NC_006576	AAG	2	6	2429943	2429948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752289
40155	NC_006576	CAG	3	9	2429970	2429978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752289
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40160	NC_006576	CAG	2	6	2430176	2430181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752289
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40164	NC_006576	GCA	2	6	2430388	2430393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752289
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40200	NC_006576	TAATGG	2	12	2433103	2433114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752291
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40203	NC_006576	TGCT	2	8	2433185	2433192	0 %	50 %	25 %	25 %	56752291
40204	NC_006576	C	8	8	2433229	2433236	0 %	0 %	0 %	100 %	56752291
40205	NC_006576	TTG	2	6	2433269	2433274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752291
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40209	NC_006576	TGC	2	6	2433483	2433488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752291
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40213	NC_006576	ATAG	2	8	2433572	2433579	50 %	25 %	25 %	0 %	56752291
40214	NC_006576	TTC	2	6	2433638	2433643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752291
40215	NC_006576	TAA	2	6	2433686	2433691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56752291
40216	NC_006576	GAAAAA	2	12	2433710	2433721	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	56752291
40217	NC_006576	ATC	2	6	2433722	2433727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752291
40218	NC_006576	TTC	2	6	2433740	2433745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752291
40219	NC_006576	CAA	2	6	2433757	2433762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752291
40220	NC_006576	CTA	2	6	2433865	2433870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752291
40221	NC_006576	CTT	2	6	2433874	2433879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752291
40222	NC_006576	GTT	3	9	2433883	2433891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752291
40223	NC_006576	TC	3	6	2433899	2433904	0 %	50 %	0 %	50 %	56752291
40224	NC_006576	ATC	2	6	2433953	2433958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752291
40225	NC_006576	A	7	7	2433959	2433965	100 %	0 %	0 %	0 %	56752291
40226	NC_006576	TGGA	2	8	2434000	2434007	25 %	25 %	50 %	0 %	56752291
40227	NC_006576	ATC	2	6	2434014	2434019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752291
40228	NC_006576	AGATC	2	10	2434086	2434095	40 %	20 %	20 %	20 %	56752291
40229	NC_006576	GCTG	2	8	2434133	2434140	0 %	25 %	50 %	25 %	56752291
40230	NC_006576	G	7	7	2434147	2434153	0 %	0 %	100 %	0 %	56752291
40231	NC_006576	TTGA	2	8	2434181	2434188	25 %	50 %	25 %	0 %	56752291
40232	NC_006576	CTC	2	6	2434370	2434375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56752291
40233	NC_006576	GAC	2	6	2434402	2434407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752291
40234	NC_006576	TTGTG	2	10	2434434	2434443	0 %	60 %	40 %	0 %	56752291
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40346	NC_006576	GATC	2	8	2441104	2441111	25 %	25 %	25 %	25 %	56752295
40347	NC_006576	ACC	2	6	2441114	2441119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752295
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40349	NC_006576	CAGCC	2	10	2441228	2441237	20 %	0 %	20 %	60 %	56752295
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40351	NC_006576	CG	3	6	2441350	2441355	0 %	0 %	50 %	50 %	56752296
40352	NC_006576	CAT	2	6	2441427	2441432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752296
40353	NC_006576	AAC	2	6	2441586	2441591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752296
40354	NC_006576	GTC	2	6	2441661	2441666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752296
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40469	NC_006576	GTAG	2	8	2449941	2449948	25 %	25 %	50 %	0 %	56752305
40470	NC_006576	CCG	2	6	2449988	2449993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752305
40471	NC_006576	CAG	2	6	2450005	2450010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752305
40472	NC_006576	GCC	2	6	2450020	2450025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752305
40473	NC_006576	ATC	2	6	2450051	2450056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752305
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40499	NC_006576	TGT	2	6	2451551	2451556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161621811
40500	NC_006576	CTG	2	6	2451588	2451593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161621811

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