MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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39002	NC_006576	CTC	2	6	2362174	2362179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56752222
39003	NC_006576	CAA	2	6	2362214	2362219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752222
39004	NC_006576	ACG	2	6	2362363	2362368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752223
39005	NC_006576	ATC	2	6	2362371	2362376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752223
39006	NC_006576	CGGTGC	2	12	2362379	2362390	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56752223
39007	NC_006576	CTGC	2	8	2362412	2362419	0 %	25 %	25 %	50 %	56752223
39008	NC_006576	G	6	6	2362487	2362492	0 %	0 %	100 %	0 %	56752223
39009	NC_006576	GGC	2	6	2362496	2362501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752223
39010	NC_006576	GAT	2	6	2362515	2362520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752223
39011	NC_006576	TG	3	6	2362614	2362619	0 %	50 %	50 %	0 %	56752223
39012	NC_006576	GCT	2	6	2362625	2362630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752223
39013	NC_006576	ACGA	2	8	2362656	2362663	50 %	0 %	25 %	25 %	56752223
39014	NC_006576	GGGC	2	8	2362731	2362738	0 %	0 %	75 %	25 %	56752223
39015	NC_006576	GAC	2	6	2362745	2362750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752223
39016	NC_006576	GCT	2	6	2362751	2362756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752223
39017	NC_006576	CTG	2	6	2362838	2362843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752223
39018	NC_006576	CAG	2	6	2362866	2362871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752223
39019	NC_006576	G	6	6	2362917	2362922	0 %	0 %	100 %	0 %	56752223
39020	NC_006576	TCT	2	6	2362927	2362932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752223
39021	NC_006576	GAC	2	6	2362937	2362942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752223
39022	NC_006576	TGG	2	6	2363104	2363109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752223
39023	NC_006576	ACG	2	6	2363140	2363145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752223
39024	NC_006576	CGC	2	6	2363295	2363300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752223
39025	NC_006576	CTG	2	6	2363341	2363346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752223
39026	NC_006576	ACT	2	6	2363350	2363355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752223
39027	NC_006576	CTG	2	6	2363472	2363477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752223
39028	NC_006576	GTC	2	6	2363494	2363499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752223
39029	NC_006576	CTG	2	6	2363521	2363526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752223
39030	NC_006576	CGC	2	6	2363531	2363536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752223
39031	NC_006576	GCGATC	2	12	2363578	2363589	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56752223
39032	NC_006576	GGC	2	6	2363669	2363674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752223
39033	NC_006576	CAG	2	6	2363760	2363765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752223
39034	NC_006576	GGT	2	6	2363874	2363879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752223
39035	NC_006576	ATCCA	2	10	2363903	2363912	40 %	20 %	0 %	40 %	56752223
39036	NC_006576	TGC	2	6	2364529	2364534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752224
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39038	NC_006576	CTG	2	6	2364591	2364596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752224
39039	NC_006576	TGT	2	6	2364628	2364633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752224
39040	NC_006576	CGG	2	6	2364669	2364674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752224
39041	NC_006576	AGC	2	6	2364730	2364735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752224
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39043	NC_006576	AATC	2	8	2364797	2364804	50 %	25 %	0 %	25 %	56752224
39044	NC_006576	CGCTGC	2	12	2364883	2364894	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	56752224
39045	NC_006576	T	6	6	2364897	2364902	0 %	100 %	0 %	0 %	56752224
39046	NC_006576	CATC	2	8	2365066	2365073	25 %	25 %	0 %	50 %	56752224
39047	NC_006576	GGC	3	9	2365229	2365237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752224
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39050	NC_006576	GCC	2	6	2365465	2365470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752225
39051	NC_006576	ATCTTT	2	12	2365502	2365513	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	56752225
39052	NC_006576	CAGT	2	8	2365516	2365523	25 %	25 %	25 %	25 %	56752225
39053	NC_006576	TTG	2	6	2365595	2365600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752225
39054	NC_006576	TGC	2	6	2365611	2365616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752225
39055	NC_006576	GCCC	2	8	2365684	2365691	0 %	0 %	25 %	75 %	56752225
39056	NC_006576	CGC	2	6	2365746	2365751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752225
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39062	NC_006576	GCA	2	6	2366176	2366181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752225
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39064	NC_006576	CAGGA	2	10	2366208	2366217	40 %	0 %	40 %	20 %	56752225
39065	NC_006576	CAGC	2	8	2366326	2366333	25 %	0 %	25 %	50 %	56752225
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39069	NC_006576	CTG	2	6	2366458	2366463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752226
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39083	NC_006576	GCCGA	2	10	2367217	2367226	20 %	0 %	40 %	40 %	56752226
39084	NC_006576	CAGC	2	8	2367324	2367331	25 %	0 %	25 %	50 %	56752226
39085	NC_006576	GC	3	6	2367388	2367393	0 %	0 %	50 %	50 %	56752226
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39089	NC_006576	GCC	2	6	2367549	2367554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752226
39090	NC_006576	GCT	2	6	2367555	2367560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752226
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39094	NC_006576	CAG	2	6	2367627	2367632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752226
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39101	NC_006576	CAG	2	6	2367997	2368002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752226
39102	NC_006576	TC	3	6	2368048	2368053	0 %	50 %	0 %	50 %	56752226
39103	NC_006576	TCG	2	6	2368058	2368063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752226
39104	NC_006576	CGC	2	6	2368077	2368082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752226
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39110	NC_006576	TCAG	2	8	2368265	2368272	25 %	25 %	25 %	25 %	56752226
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39113	NC_006576	TGCC	2	8	2368316	2368323	0 %	25 %	25 %	50 %	56752226
39114	NC_006576	CGG	2	6	2368354	2368359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752226
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39117	NC_006576	ACG	2	6	2368567	2368572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752227
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39226	NC_006576	GAA	2	6	2375719	2375724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752234
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39235	NC_006576	GAG	2	6	2376079	2376084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56752234
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39344	NC_006576	ACCA	2	8	2382805	2382812	50 %	0 %	0 %	50 %	56752240
39345	NC_006576	CGCGAT	2	12	2382939	2382950	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56752240
39346	NC_006576	GAT	2	6	2383032	2383037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752240
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39349	NC_006576	GGA	2	6	2383253	2383258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56752240
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39351	NC_006576	TGC	2	6	2383297	2383302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752240
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39466	NC_006576	CAA	2	6	2389590	2389595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752245
39467	NC_006576	CGG	2	6	2389602	2389607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752245
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39470	NC_006576	TGCC	2	8	2389701	2389708	0 %	25 %	25 %	50 %	56752245
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