MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38502	NC_006576	TGA	2	6	2333217	2333222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752197
38503	NC_006576	TTG	2	6	2333250	2333255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752197
38504	NC_006576	CTT	2	6	2333272	2333277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752197
38505	NC_006576	CTG	2	6	2333279	2333284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752197
38506	NC_006576	ATC	2	6	2333433	2333438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752197
38507	NC_006576	CAA	3	9	2333473	2333481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752197
38508	NC_006576	CAA	2	6	2333502	2333507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752197
38509	NC_006576	TGC	2	6	2333529	2333534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752197
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38511	NC_006576	TCT	2	6	2333808	2333813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752198
38512	NC_006576	TGG	2	6	2333833	2333838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752198
38513	NC_006576	AGC	2	6	2333867	2333872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752198
38514	NC_006576	GCA	3	9	2334035	2334043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752198
38515	NC_006576	TGCGCC	2	12	2334085	2334096	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	56752198
38516	NC_006576	TGC	2	6	2334472	2334477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752198
38517	NC_006576	TGA	2	6	2334488	2334493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752198
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38519	NC_006576	AGC	2	6	2334693	2334698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752199
38520	NC_006576	AGT	2	6	2334848	2334853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752199
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38523	NC_006576	TGT	2	6	2335098	2335103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752199
38524	NC_006576	GCTT	2	8	2335212	2335219	0 %	50 %	25 %	25 %	56752199
38525	NC_006576	ACC	2	6	2335260	2335265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752199
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38530	NC_006576	GTGA	2	8	2335439	2335446	25 %	25 %	50 %	0 %	56752199
38531	NC_006576	GCCT	2	8	2335454	2335461	0 %	25 %	25 %	50 %	56752199
38532	NC_006576	CG	3	6	2335471	2335476	0 %	0 %	50 %	50 %	56752199
38533	NC_006576	CGC	2	6	2335496	2335501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752199
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38538	NC_006576	CAG	2	6	2335760	2335765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752199
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38550	NC_006576	TTG	2	6	2336415	2336420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752199
38551	NC_006576	GCG	2	6	2336543	2336548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752199
38552	NC_006576	TCAC	2	8	2336552	2336559	25 %	25 %	0 %	50 %	56752199
38553	NC_006576	TGGG	2	8	2336597	2336604	0 %	25 %	75 %	0 %	56752199
38554	NC_006576	TAT	2	6	2336659	2336664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56752199
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38588	NC_006576	A	6	6	2338287	2338292	100 %	0 %	0 %	0 %	56752200
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38591	NC_006576	TCGT	2	8	2338466	2338473	0 %	50 %	25 %	25 %	56752200
38592	NC_006576	CTC	2	6	2338475	2338480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56752200
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38598	NC_006576	CCAAT	2	10	2338804	2338813	40 %	20 %	0 %	40 %	56752200
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38601	NC_006576	GTA	2	6	2338889	2338894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752200
38602	NC_006576	TAA	3	9	2338941	2338949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56752201
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38604	NC_006576	CAA	2	6	2339030	2339035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752201
38605	NC_006576	ATCA	2	8	2339076	2339083	50 %	25 %	0 %	25 %	56752201
38606	NC_006576	TGC	2	6	2339085	2339090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752201
38607	NC_006576	GGA	2	6	2339103	2339108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56752201
38608	NC_006576	A	6	6	2339158	2339163	100 %	0 %	0 %	0 %	56752201
38609	NC_006576	ATC	2	6	2339336	2339341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752201
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38613	NC_006576	TTG	2	6	2339837	2339842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752201
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38615	NC_006576	TGCA	2	8	2340126	2340133	25 %	25 %	25 %	25 %	56752202
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38848	NC_006576	G	6	6	2352821	2352826	0 %	0 %	100 %	0 %	56752214
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38850	NC_006576	CGA	2	6	2352878	2352883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752214
38851	NC_006576	ATC	2	6	2352910	2352915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752214
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38853	NC_006576	CTGA	2	8	2352973	2352980	25 %	25 %	25 %	25 %	56752214
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38889	NC_006576	GGCT	2	8	2354982	2354989	0 %	25 %	50 %	25 %	56752215
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38951	NC_006576	TTGG	2	8	2358583	2358590	0 %	50 %	50 %	0 %	56752218
38952	NC_006576	GGT	2	6	2358637	2358642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752218
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38958	NC_006576	GAGCG	2	10	2358847	2358856	20 %	0 %	60 %	20 %	56752218
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38964	NC_006576	GGC	2	6	2359114	2359119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752218
38965	NC_006576	CAC	2	6	2359141	2359146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752218
38966	NC_006576	AGT	2	6	2359262	2359267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752218
38967	NC_006576	CGC	2	6	2359302	2359307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752218
38968	NC_006576	CGC	2	6	2359323	2359328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752218
38969	NC_006576	AGC	3	9	2359346	2359354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752218
38970	NC_006576	CGA	2	6	2359362	2359367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752218
38971	NC_006576	TGC	2	6	2359403	2359408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752218
38972	NC_006576	GGC	2	6	2359481	2359486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752218
38973	NC_006576	TGCC	2	8	2359639	2359646	0 %	25 %	25 %	50 %	56752219
38974	NC_006576	TCAA	2	8	2359717	2359724	50 %	25 %	0 %	25 %	56752219
38975	NC_006576	CTG	2	6	2359779	2359784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752219
38976	NC_006576	CGC	2	6	2359886	2359891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752219
38977	NC_006576	TGC	2	6	2359960	2359965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752219
38978	NC_006576	CCA	4	12	2360002	2360013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752219
38979	NC_006576	CTG	2	6	2360034	2360039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752219
38980	NC_006576	GAG	2	6	2360055	2360060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56752219
38981	NC_006576	TGC	2	6	2360075	2360080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752219
38982	NC_006576	A	6	6	2360109	2360114	100 %	0 %	0 %	0 %	56752219
38983	NC_006576	GCT	2	6	2360193	2360198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752219
38984	NC_006576	TAC	2	6	2360250	2360255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752219
38985	NC_006576	GAA	3	9	2360310	2360318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752219
38986	NC_006576	GCCA	2	8	2360391	2360398	25 %	0 %	25 %	50 %	56752219
38987	NC_006576	AGC	2	6	2360434	2360439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752220
38988	NC_006576	CGG	2	6	2360445	2360450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752220
38989	NC_006576	GCT	2	6	2360487	2360492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752220
38990	NC_006576	GCAG	2	8	2360527	2360534	25 %	0 %	50 %	25 %	56752220
38991	NC_006576	CCGCC	2	10	2360618	2360627	0 %	0 %	20 %	80 %	56752220
38992	NC_006576	GCC	2	6	2360663	2360668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752220
38993	NC_006576	TGA	2	6	2360921	2360926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752220
38994	NC_006576	AGG	2	6	2361257	2361262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56752221
38995	NC_006576	CTA	2	6	2361330	2361335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752221
38996	NC_006576	ACCA	2	8	2361568	2361575	50 %	0 %	0 %	50 %	56752221
38997	NC_006576	GCT	2	6	2361603	2361608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752221
38998	NC_006576	AAC	2	6	2361829	2361834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752222
38999	NC_006576	GGC	2	6	2361987	2361992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752222
39000	NC_006576	CAA	2	6	2362004	2362009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752222

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