MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38002	NC_006576	GATT	2	8	2304120	2304127	25 %	50 %	25 %	0 %	56752164
38003	NC_006576	GTG	2	6	2304151	2304156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752164
38004	NC_006576	AGTT	2	8	2304215	2304222	25 %	50 %	25 %	0 %	56752164
38005	NC_006576	AAG	2	6	2304227	2304232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752164
38006	NC_006576	TCG	2	6	2304271	2304276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752164
38007	NC_006576	CTT	2	6	2304302	2304307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752164
38008	NC_006576	GTC	2	6	2304370	2304375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752164
38009	NC_006576	CG	3	6	2304509	2304514	0 %	0 %	50 %	50 %	56752164
38010	NC_006576	CTGG	2	8	2304525	2304532	0 %	25 %	50 %	25 %	56752164
38011	NC_006576	CAA	2	6	2304543	2304548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752164
38012	NC_006576	GCA	3	9	2304556	2304564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752164
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38014	NC_006576	GCA	2	6	2304626	2304631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752164
38015	NC_006576	ACT	2	6	2304697	2304702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752164
38016	NC_006576	C	6	6	2304784	2304789	0 %	0 %	0 %	100 %	56752165
38017	NC_006576	GCGATC	2	12	2304828	2304839	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56752165
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38019	NC_006576	GTCGAT	2	12	2304963	2304974	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	56752165
38020	NC_006576	CTG	2	6	2305065	2305070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752165
38021	NC_006576	GTC	3	9	2305179	2305187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752165
38022	NC_006576	GCT	2	6	2305325	2305330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752165
38023	NC_006576	TAG	2	6	2305366	2305371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752165
38024	NC_006576	GCT	3	9	2305460	2305468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752165
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38028	NC_006576	TGC	2	6	2305552	2305557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752165
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38032	NC_006576	CTG	2	6	2305630	2305635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752165
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38043	NC_006576	CA	3	6	2306314	2306319	50 %	0 %	0 %	50 %	56752166
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38051	NC_006576	CGGGG	2	10	2306920	2306929	0 %	0 %	80 %	20 %	56752167
38052	NC_006576	TGC	2	6	2306959	2306964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752167
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38054	NC_006576	CAT	2	6	2307013	2307018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752168
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38103	NC_006576	GC	3	6	2309549	2309554	0 %	0 %	50 %	50 %	56752170
38104	NC_006576	ACGGT	2	10	2309632	2309641	20 %	20 %	40 %	20 %	56752170
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38113	NC_006576	AGTTG	2	10	2310034	2310043	20 %	40 %	40 %	0 %	56752170
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38117	NC_006576	CGA	2	6	2310230	2310235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752170
38118	NC_006576	CAG	2	6	2310239	2310244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752170
38119	NC_006576	GTC	2	6	2310348	2310353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752170
38120	NC_006576	GAC	2	6	2310420	2310425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752170
38121	NC_006576	GCC	2	6	2310490	2310495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752171
38122	NC_006576	GTTG	2	8	2310575	2310582	0 %	50 %	50 %	0 %	56752171
38123	NC_006576	TGA	2	6	2310600	2310605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752171
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38125	NC_006576	GAT	2	6	2310742	2310747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752171
38126	NC_006576	ATC	2	6	2310818	2310823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752171
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38128	NC_006576	GATC	2	8	2310936	2310943	25 %	25 %	25 %	25 %	56752171
38129	NC_006576	GAC	2	6	2310963	2310968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752171
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38131	NC_006576	AGCC	2	8	2311378	2311385	25 %	0 %	25 %	50 %	56752172
38132	NC_006576	GCT	2	6	2311435	2311440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752172
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38137	NC_006576	TAGA	2	8	2311632	2311639	50 %	25 %	25 %	0 %	56752172
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38143	NC_006576	AAT	2	6	2311959	2311964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56752172
38144	NC_006576	GTC	2	6	2311967	2311972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752172
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38146	NC_006576	GGC	2	6	2312229	2312234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752173
38147	NC_006576	GTA	2	6	2312253	2312258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752173
38148	NC_006576	GCCAAT	2	12	2312310	2312321	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	56752173
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38153	NC_006576	GCT	2	6	2312458	2312463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752173
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38157	NC_006576	CGG	2	6	2312657	2312662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752173
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38163	NC_006576	CTT	2	6	2312869	2312874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752174
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38173	NC_006576	ATCG	2	8	2313350	2313357	25 %	25 %	25 %	25 %	56752174
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38183	NC_006576	ATCG	2	8	2314134	2314141	25 %	25 %	25 %	25 %	56752175
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38202	NC_006576	GTG	2	6	2315487	2315492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752178
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38217	NC_006576	GCA	2	6	2316487	2316492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752179
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38220	NC_006576	TCG	2	6	2316591	2316596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752179
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38225	NC_006576	TCG	2	6	2316740	2316745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752179
38226	NC_006576	GGTC	2	8	2316760	2316767	0 %	25 %	50 %	25 %	56752179
38227	NC_006576	GCCA	2	8	2316774	2316781	25 %	0 %	25 %	50 %	56752179
38228	NC_006576	CGA	2	6	2316823	2316828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752179
38229	NC_006576	GCCT	3	12	2316832	2316843	0 %	25 %	25 %	50 %	56752179
38230	NC_006576	TGC	2	6	2317235	2317240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752180
38231	NC_006576	GCG	2	6	2317287	2317292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752180
38232	NC_006576	GGCT	2	8	2317426	2317433	0 %	25 %	50 %	25 %	56752180
38233	NC_006576	ACG	2	6	2317460	2317465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752180
38234	NC_006576	GCG	3	9	2317470	2317478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752180
38235	NC_006576	C	6	6	2317511	2317516	0 %	0 %	0 %	100 %	56752180
38236	NC_006576	GCAG	2	8	2317560	2317567	25 %	0 %	50 %	25 %	56752180
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38238	NC_006576	GCG	2	6	2317611	2317616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752180
38239	NC_006576	CAC	2	6	2317647	2317652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752180
38240	NC_006576	TGC	2	6	2317658	2317663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752180
38241	NC_006576	TGC	2	6	2317695	2317700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752180
38242	NC_006576	TC	3	6	2317714	2317719	0 %	50 %	0 %	50 %	56752180
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38254	NC_006576	C	6	6	2318449	2318454	0 %	0 %	0 %	100 %	56752182
38255	NC_006576	CAG	2	6	2318536	2318541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752182
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38258	NC_006576	CTG	2	6	2318823	2318828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752182
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38260	NC_006576	TGC	2	6	2319109	2319114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752183
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38263	NC_006576	ACT	2	6	2319283	2319288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752183
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38266	NC_006576	GAAG	2	8	2319344	2319351	50 %	0 %	50 %	0 %	56752183
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38332	NC_006576	GC	3	6	2323296	2323301	0 %	0 %	50 %	50 %	56752185
38333	NC_006576	GCA	2	6	2323360	2323365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752185
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38339	NC_006576	GCCA	2	8	2323887	2323894	25 %	0 %	25 %	50 %	56752186
38340	NC_006576	TGC	2	6	2323911	2323916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752186
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38343	NC_006576	CAGC	2	8	2324099	2324106	25 %	0 %	25 %	50 %	56752186
38344	NC_006576	CCAA	2	8	2324142	2324149	50 %	0 %	0 %	50 %	56752186
38345	NC_006576	TAA	2	6	2324195	2324200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56752186
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38347	NC_006576	CAG	2	6	2324300	2324305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752186
38348	NC_006576	CCA	2	6	2324404	2324409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752186
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38350	NC_006576	CAGC	2	8	2324476	2324483	25 %	0 %	25 %	50 %	56752186
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38467	NC_006576	GGC	2	6	2331526	2331531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752195
38468	NC_006576	CGG	2	6	2331546	2331551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752195
38469	NC_006576	CGA	2	6	2331575	2331580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752195
38470	NC_006576	G	6	6	2331614	2331619	0 %	0 %	100 %	0 %	56752195
38471	NC_006576	CAA	3	9	2331620	2331628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752195
38472	NC_006576	CTG	2	6	2331642	2331647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752195
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38475	NC_006576	TGAT	2	8	2331765	2331772	25 %	50 %	25 %	0 %	56752195
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38499	NC_006576	ACCT	2	8	2333066	2333073	25 %	25 %	0 %	50 %	56752197
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