MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
37001	NC_006576	CTGGG	2	10	2242901	2242910	0 %	20 %	60 %	20 %	56752099
37002	NC_006576	CGG	2	6	2242963	2242968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752099
37003	NC_006576	ATG	2	6	2243002	2243007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752099
37004	NC_006576	GAC	2	6	2243031	2243036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752099
37005	NC_006576	GCC	2	6	2243038	2243043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752099
37006	NC_006576	GAA	2	6	2243117	2243122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752099
37007	NC_006576	CTG	2	6	2243159	2243164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752099
37008	NC_006576	CGG	2	6	2243180	2243185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752099
37009	NC_006576	CGG	2	6	2243214	2243219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752099
37010	NC_006576	TCG	2	6	2243317	2243322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752099
37011	NC_006576	CTCAG	2	10	2243411	2243420	20 %	20 %	20 %	40 %	56752100
37012	NC_006576	ATC	2	6	2243421	2243426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752100
37013	NC_006576	CGG	2	6	2243458	2243463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752100
37014	NC_006576	GTA	2	6	2243532	2243537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752100
37015	NC_006576	TTG	3	9	2243553	2243561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752100
37016	NC_006576	TCC	2	6	2243638	2243643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56752100
37017	NC_006576	CTT	2	6	2243648	2243653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752100
37018	NC_006576	ATCG	2	8	2243711	2243718	25 %	25 %	25 %	25 %	56752100
37019	NC_006576	AGACC	2	10	2243876	2243885	40 %	0 %	20 %	40 %	56752100
37020	NC_006576	TCG	2	6	2243956	2243961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752100
37021	NC_006576	CGC	3	9	2244256	2244264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752101
37022	NC_006576	GTG	2	6	2244273	2244278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752101
37023	NC_006576	TGCT	2	8	2244311	2244318	0 %	50 %	25 %	25 %	56752101
37024	NC_006576	GAC	2	6	2244383	2244388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752101
37025	NC_006576	GTTGGG	2	12	2244455	2244466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752101
37026	NC_006576	CACC	2	8	2244559	2244566	25 %	0 %	0 %	75 %	56752101
37027	NC_006576	CG	3	6	2244607	2244612	0 %	0 %	50 %	50 %	56752101
37028	NC_006576	CGT	2	6	2244800	2244805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752101
37029	NC_006576	GCGATC	2	12	2244840	2244851	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56752101
37030	NC_006576	A	6	6	2244885	2244890	100 %	0 %	0 %	0 %	56752101
37031	NC_006576	CGA	2	6	2245025	2245030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752102
37032	NC_006576	CAG	2	6	2245051	2245056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752102
37033	NC_006576	CAA	2	6	2245065	2245070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752102
37034	NC_006576	CCA	2	6	2245111	2245116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752102
37035	NC_006576	GGCT	2	8	2245171	2245178	0 %	25 %	50 %	25 %	56752102
37036	NC_006576	AGT	2	6	2245371	2245376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752102
37037	NC_006576	GCT	2	6	2245392	2245397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752102
37038	NC_006576	GCT	2	6	2245401	2245406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752102
37039	NC_006576	GCG	2	6	2245579	2245584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752103
37040	NC_006576	GCA	2	6	2245616	2245621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752103
37041	NC_006576	GAC	2	6	2245656	2245661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752103
37042	NC_006576	ATGG	2	8	2245694	2245701	25 %	25 %	50 %	0 %	56752103
37043	NC_006576	GGC	2	6	2245731	2245736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752103
37044	NC_006576	ATCC	2	8	2245817	2245824	25 %	25 %	0 %	50 %	56752103
37045	NC_006576	CT	3	6	2245844	2245849	0 %	50 %	0 %	50 %	56752103
37046	NC_006576	AGG	2	6	2245898	2245903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56752104
37047	NC_006576	CTG	3	9	2245952	2245960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752104
37048	NC_006576	TGG	2	6	2246008	2246013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752104
37049	NC_006576	AAG	2	6	2246045	2246050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752104
37050	NC_006576	CAA	2	6	2246095	2246100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752104
37051	NC_006576	TGC	2	6	2246102	2246107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752104
37052	NC_006576	GAGCT	2	10	2246135	2246144	20 %	20 %	40 %	20 %	56752104
37053	NC_006576	CAG	2	6	2246200	2246205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752104
37054	NC_006576	GCCGC	2	10	2246350	2246359	0 %	0 %	40 %	60 %	56752104
37055	NC_006576	TGG	2	6	2246420	2246425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752104
37056	NC_006576	GCA	3	9	2246441	2246449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752104
37057	NC_006576	GGC	2	6	2246550	2246555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752104
37058	NC_006576	AGC	2	6	2246604	2246609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752104
37059	NC_006576	TGAT	2	8	2246633	2246640	25 %	50 %	25 %	0 %	56752104
37060	NC_006576	CGC	2	6	2246656	2246661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752104
37061	NC_006576	CACC	2	8	2246872	2246879	25 %	0 %	0 %	75 %	56752105
37062	NC_006576	TGACTC	2	12	2246951	2246962	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	56752105
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37064	NC_006576	GCT	2	6	2247011	2247016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752105
37065	NC_006576	GCC	2	6	2247175	2247180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752105
37066	NC_006576	CCA	2	6	2247228	2247233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752105
37067	NC_006576	GCT	2	6	2247254	2247259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752105
37068	NC_006576	CTC	3	9	2247271	2247279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56752105
37069	NC_006576	GCGATC	2	12	2247333	2247344	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56752105
37070	NC_006576	AGT	2	6	2247450	2247455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752105
37071	NC_006576	ACGGC	2	10	2247562	2247571	20 %	0 %	40 %	40 %	56752105
37072	NC_006576	CAG	2	6	2247633	2247638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752105
37073	NC_006576	T	7	7	2247729	2247735	0 %	100 %	0 %	0 %	56752105
37074	NC_006576	GCT	2	6	2247749	2247754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752105
37075	NC_006576	ACCT	2	8	2247759	2247766	25 %	25 %	0 %	50 %	56752105
37076	NC_006576	TC	3	6	2247842	2247847	0 %	50 %	0 %	50 %	56752105
37077	NC_006576	GCG	2	6	2247858	2247863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752105
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37082	NC_006576	CGGCG	2	10	2247997	2248006	0 %	0 %	60 %	40 %	56752105
37083	NC_006576	CAG	2	6	2248043	2248048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752105
37084	NC_006576	TAC	2	6	2248068	2248073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752105
37085	NC_006576	GAA	2	6	2248122	2248127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752105
37086	NC_006576	TCG	2	6	2248273	2248278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752105
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37088	NC_006576	GAC	2	6	2248396	2248401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752105
37089	NC_006576	GCA	2	6	2248456	2248461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752105
37090	NC_006576	GCA	2	6	2248465	2248470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752105
37091	NC_006576	TGC	2	6	2248655	2248660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752105
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37096	NC_006576	CGC	2	6	2248785	2248790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752105
37097	NC_006576	TGC	2	6	2248837	2248842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752105
37098	NC_006576	AGT	2	6	2248854	2248859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752105
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37100	NC_006576	ACG	2	6	2248911	2248916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752105
37101	NC_006576	ATG	2	6	2248918	2248923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752105
37102	NC_006576	ACG	2	6	2248990	2248995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752105
37103	NC_006576	AGC	2	6	2249019	2249024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752105
37104	NC_006576	CG	3	6	2249325	2249330	0 %	0 %	50 %	50 %	56752106
37105	NC_006576	GCCT	2	8	2249386	2249393	0 %	25 %	25 %	50 %	56752106
37106	NC_006576	GAA	2	6	2249442	2249447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752106
37107	NC_006576	TGC	2	6	2249462	2249467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752106
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37112	NC_006576	CCA	2	6	2249934	2249939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752107
37113	NC_006576	CTG	2	6	2249941	2249946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752107
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37116	NC_006576	GCA	2	6	2250072	2250077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752107
37117	NC_006576	AGT	2	6	2250187	2250192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752107
37118	NC_006576	CTGG	2	8	2250255	2250262	0 %	25 %	50 %	25 %	56752107
37119	NC_006576	CTGC	2	8	2250329	2250336	0 %	25 %	25 %	50 %	56752107
37120	NC_006576	GCA	2	6	2250383	2250388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752107
37121	NC_006576	CGG	2	6	2250441	2250446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752107
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37123	NC_006576	GTC	2	6	2250691	2250696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752108
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37141	NC_006576	CTG	3	9	2251730	2251738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752110
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37152	NC_006576	TGC	2	6	2252320	2252325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752111
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37224	NC_006576	ATC	2	6	2256420	2256425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752116
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37227	NC_006576	G	6	6	2256507	2256512	0 %	0 %	100 %	0 %	56752116
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37232	NC_006576	GTA	2	6	2256792	2256797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752116
37233	NC_006576	TGG	2	6	2256831	2256836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752116
37234	NC_006576	GTG	2	6	2256872	2256877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752116
37235	NC_006576	GGT	2	6	2256892	2256897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752116
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37341	NC_006576	ATC	2	6	2263796	2263801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752122
37342	NC_006576	A	6	6	2263876	2263881	100 %	0 %	0 %	0 %	56752122
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37346	NC_006576	CGT	2	6	2264409	2264414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752123
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37348	NC_006576	GCT	2	6	2264576	2264581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752124
37349	NC_006576	ATCGCG	2	12	2264604	2264615	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56752124
37350	NC_006576	GGTCT	2	10	2264624	2264633	0 %	40 %	40 %	20 %	56752124
37351	NC_006576	CCTTGG	2	12	2264678	2264689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752124
37352	NC_006576	GTTTT	2	10	2264706	2264715	0 %	80 %	20 %	0 %	56752124
37353	NC_006576	TGT	2	6	2264767	2264772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752124
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37366	NC_006576	TCGA	2	8	2265419	2265426	25 %	25 %	25 %	25 %	56752125
37367	NC_006576	TTGA	2	8	2265507	2265514	25 %	50 %	25 %	0 %	56752125
37368	NC_006576	TTG	2	6	2265568	2265573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752125
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37379	NC_006576	TGC	3	9	2266340	2266348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752126
37380	NC_006576	TGGCT	2	10	2266368	2266377	0 %	40 %	40 %	20 %	56752126
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37449	NC_006576	ATCT	2	8	2270933	2270940	25 %	50 %	0 %	25 %	56752129
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37453	NC_006576	TGCT	2	8	2271044	2271051	0 %	50 %	25 %	25 %	56752129
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37465	NC_006576	CAG	2	6	2271508	2271513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752130
37466	NC_006576	GCA	2	6	2271570	2271575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752130
37467	NC_006576	GCT	2	6	2271579	2271584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752130
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37492	NC_006576	CTTT	2	8	2273027	2273034	0 %	75 %	0 %	25 %	56752132
37493	NC_006576	GAT	2	6	2273035	2273040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752132
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