MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
36001	NC_006576	CGA	2	6	2184661	2184666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752048
36002	NC_006576	GCG	2	6	2184701	2184706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752048
36003	NC_006576	CGACTC	2	12	2184714	2184725	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	56752048
36004	NC_006576	CCA	2	6	2184745	2184750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752048
36005	NC_006576	AGC	2	6	2184883	2184888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752049
36006	NC_006576	CAGG	2	8	2184933	2184940	25 %	0 %	50 %	25 %	56752049
36007	NC_006576	GCG	2	6	2184956	2184961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752049
36008	NC_006576	CTGC	2	8	2184972	2184979	0 %	25 %	25 %	50 %	56752049
36009	NC_006576	GAA	2	6	2185012	2185017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752049
36010	NC_006576	GCT	2	6	2185035	2185040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752049
36011	NC_006576	GTG	2	6	2185045	2185050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752049
36012	NC_006576	TCGC	2	8	2185060	2185067	0 %	25 %	25 %	50 %	56752049
36013	NC_006576	CCG	2	6	2185077	2185082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752049
36014	NC_006576	GCTC	2	8	2185177	2185184	0 %	25 %	25 %	50 %	56752049
36015	NC_006576	GCC	2	6	2185231	2185236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752049
36016	NC_006576	ACC	2	6	2185243	2185248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752049
36017	NC_006576	GCG	2	6	2185307	2185312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752049
36018	NC_006576	GGC	2	6	2185365	2185370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752049
36019	NC_006576	CCG	2	6	2185385	2185390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752049
36020	NC_006576	AAGGCT	2	12	2185441	2185452	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	56752049
36021	NC_006576	GCC	2	6	2185474	2185479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752049
36022	NC_006576	GCG	2	6	2185497	2185502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752049
36023	NC_006576	ATT	2	6	2185534	2185539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56752049
36024	NC_006576	CGG	2	6	2185540	2185545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752049
36025	NC_006576	GA	3	6	2185607	2185612	50 %	0 %	50 %	0 %	56752049
36026	NC_006576	AGCTGG	2	12	2185632	2185643	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56752049
36027	NC_006576	CTG	2	6	2185667	2185672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752049
36028	NC_006576	TAAA	2	8	2185719	2185726	75 %	25 %	0 %	0 %	56752049
36029	NC_006576	TGCCC	2	10	2185826	2185835	0 %	20 %	20 %	60 %	56752049
36030	NC_006576	ATCG	2	8	2185864	2185871	25 %	25 %	25 %	25 %	56752049
36031	NC_006576	CCA	2	6	2185972	2185977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752049
36032	NC_006576	GCT	2	6	2185978	2185983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752049
36033	NC_006576	CCT	2	6	2186051	2186056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56752049
36034	NC_006576	GCG	2	6	2186067	2186072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752049
36035	NC_006576	CCAC	2	8	2186103	2186110	25 %	0 %	0 %	75 %	56752049
36036	NC_006576	AGCCA	2	10	2186153	2186162	40 %	0 %	20 %	40 %	56752049
36037	NC_006576	GCG	2	6	2186187	2186192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752049
36038	NC_006576	ATCG	2	8	2186269	2186276	25 %	25 %	25 %	25 %	56752049
36039	NC_006576	CGGT	2	8	2186287	2186294	0 %	25 %	50 %	25 %	56752049
36040	NC_006576	CGAT	2	8	2186330	2186337	25 %	25 %	25 %	25 %	56752049
36041	NC_006576	GCC	3	9	2186467	2186475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752049
36042	NC_006576	AGTT	2	8	2186515	2186522	25 %	50 %	25 %	0 %	56752049
36043	NC_006576	CTGTC	2	10	2186530	2186539	0 %	40 %	20 %	40 %	56752049
36044	NC_006576	CCAG	2	8	2186589	2186596	25 %	0 %	25 %	50 %	56752049
36045	NC_006576	ATC	2	6	2186699	2186704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752049
36046	NC_006576	GCG	2	6	2186902	2186907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752050
36047	NC_006576	CAC	2	6	2186966	2186971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752050
36048	NC_006576	GGCT	2	8	2186986	2186993	0 %	25 %	50 %	25 %	56752050
36049	NC_006576	CCAT	2	8	2187023	2187030	25 %	25 %	0 %	50 %	56752050
36050	NC_006576	GCA	2	6	2187045	2187050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752050
36051	NC_006576	GAGTTT	2	12	2187141	2187152	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	56752050
36052	NC_006576	T	7	7	2187218	2187224	0 %	100 %	0 %	0 %	56752050
36053	NC_006576	CTG	3	9	2187253	2187261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752050
36054	NC_006576	TGG	2	6	2187281	2187286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752050
36055	NC_006576	GGC	2	6	2187396	2187401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752050
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36057	NC_006576	GGCA	2	8	2187581	2187588	25 %	0 %	50 %	25 %	56752050
36058	NC_006576	TGG	2	6	2187613	2187618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752050
36059	NC_006576	TCG	2	6	2187653	2187658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752050
36060	NC_006576	GCT	2	6	2187669	2187674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752050
36061	NC_006576	GCG	2	6	2187708	2187713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752050
36062	NC_006576	GCG	2	6	2187772	2187777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752051
36063	NC_006576	CAG	2	6	2187806	2187811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752051
36064	NC_006576	CGT	2	6	2187845	2187850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752051
36065	NC_006576	CGC	2	6	2187919	2187924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752051
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36067	NC_006576	CTG	2	6	2188103	2188108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752051
36068	NC_006576	GCT	3	9	2188171	2188179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752051
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36070	NC_006576	GGC	2	6	2188243	2188248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752051
36071	NC_006576	CAG	2	6	2188271	2188276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752051
36072	NC_006576	TCA	2	6	2188290	2188295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752051
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36074	NC_006576	CGG	2	6	2188473	2188478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752051
36075	NC_006576	GCA	2	6	2188510	2188515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752051
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36077	NC_006576	GATCTC	2	12	2188613	2188624	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	56752051
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36082	NC_006576	GCG	2	6	2188801	2188806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752051
36083	NC_006576	TGC	3	9	2188896	2188904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752051
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36086	NC_006576	TCGA	2	8	2189034	2189041	25 %	25 %	25 %	25 %	56752051
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36088	NC_006576	TGC	2	6	2189134	2189139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752051
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36099	NC_006576	A	6	6	2190424	2190429	100 %	0 %	0 %	0 %	56752052
36100	NC_006576	CTC	2	6	2190527	2190532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56752052
36101	NC_006576	TC	3	6	2190615	2190620	0 %	50 %	0 %	50 %	56752052
36102	NC_006576	CTT	2	6	2191061	2191066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752053
36103	NC_006576	GCG	2	6	2191256	2191261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752053
36104	NC_006576	GGCT	2	8	2191297	2191304	0 %	25 %	50 %	25 %	56752053
36105	NC_006576	GCTG	2	8	2191516	2191523	0 %	25 %	50 %	25 %	56752053
36106	NC_006576	AGC	2	6	2191539	2191544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752053
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36109	NC_006576	CAA	2	6	2191662	2191667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752053
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36115	NC_006576	CAT	2	6	2192118	2192123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752053
36116	NC_006576	CAC	2	6	2192131	2192136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752053
36117	NC_006576	TCCGTA	2	12	2192151	2192162	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	56752053
36118	NC_006576	CGAC	2	8	2192168	2192175	25 %	0 %	25 %	50 %	56752053
36119	NC_006576	CGA	2	6	2192180	2192185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752053
36120	NC_006576	CAC	2	6	2192203	2192208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752053
36121	NC_006576	TGG	2	6	2192217	2192222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752053
36122	NC_006576	TCG	2	6	2192231	2192236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752053
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36124	NC_006576	ATC	2	6	2192335	2192340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752053
36125	NC_006576	TGCG	2	8	2192411	2192418	0 %	25 %	50 %	25 %	56752053
36126	NC_006576	TGG	2	6	2192556	2192561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752053
36127	NC_006576	CGG	2	6	2192577	2192582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752053
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36131	NC_006576	GGC	2	6	2192767	2192772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752053
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36138	NC_006576	TCTT	2	8	2193250	2193257	0 %	75 %	0 %	25 %	56752053
36139	NC_006576	CAT	2	6	2193267	2193272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752053
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36143	NC_006576	TGG	2	6	2193671	2193676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752054
36144	NC_006576	ACC	2	6	2193831	2193836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752054
36145	NC_006576	TTC	2	6	2193977	2193982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752054
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36153	NC_006576	TCT	2	6	2194479	2194484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752054
36154	NC_006576	CAAA	2	8	2194509	2194516	75 %	0 %	0 %	25 %	56752054
36155	NC_006576	AAC	2	6	2194517	2194522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752054
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36219	NC_006576	CCG	2	6	2198406	2198411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752055
36220	NC_006576	TCT	2	6	2198420	2198425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752055
36221	NC_006576	CGGC	2	8	2198466	2198473	0 %	0 %	50 %	50 %	56752055
36222	NC_006576	ACC	2	6	2198665	2198670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752056
36223	NC_006576	GAT	2	6	2198732	2198737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752056
36224	NC_006576	CGATCG	2	12	2198806	2198817	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56752056
36225	NC_006576	TGC	2	6	2198818	2198823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752056
36226	NC_006576	GGT	2	6	2199392	2199397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752057
36227	NC_006576	GCT	2	6	2199440	2199445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752057
36228	NC_006576	CGCAGC	2	12	2199525	2199536	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	56752057
36229	NC_006576	GGTCAC	2	12	2199551	2199562	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56752057
36230	NC_006576	CCGAAG	2	12	2199586	2199597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752057
36231	NC_006576	AGG	2	6	2199604	2199609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56752057
36232	NC_006576	GCA	2	6	2199728	2199733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752057
36233	NC_006576	CAT	2	6	2199809	2199814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752057
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36337	NC_006576	TCCA	2	8	2204592	2204599	25 %	25 %	0 %	50 %	56752059
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36345	NC_006576	GGCT	2	8	2205221	2205228	0 %	25 %	50 %	25 %	56752061
36346	NC_006576	CTG	2	6	2205235	2205240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752061
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36348	NC_006576	GCA	2	6	2205253	2205258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752061
36349	NC_006576	GCT	2	6	2205271	2205276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752061
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36379	NC_006576	TGGG	2	8	2207142	2207149	0 %	25 %	75 %	0 %	56752063
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36462	NC_006576	CGC	2	6	2212536	2212541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752069
36463	NC_006576	AGT	2	6	2212544	2212549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752069
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36465	NC_006576	TGA	2	6	2212766	2212771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752070
36466	NC_006576	TTG	2	6	2212772	2212777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752070
36467	NC_006576	CTGC	2	8	2212784	2212791	0 %	25 %	25 %	50 %	56752070
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36470	NC_006576	TGC	2	6	2213009	2213014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752070
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36472	NC_006576	GCT	2	6	2213044	2213049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752070
36473	NC_006576	AGC	2	6	2213095	2213100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752070
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36477	NC_006576	CGCATC	2	12	2213475	2213486	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	56752070
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36488	NC_006576	CAG	2	6	2214110	2214115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752071
36489	NC_006576	GCC	3	9	2214137	2214145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752071
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