MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35501	NC_006576	GCA	2	6	2154236	2154241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752020
35502	NC_006576	CGC	2	6	2154276	2154281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752020
35503	NC_006576	CTT	2	6	2154323	2154328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752020
35504	NC_006576	GAT	2	6	2154428	2154433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752020
35505	NC_006576	GCA	2	6	2154455	2154460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752020
35506	NC_006576	CTTGG	2	10	2154522	2154531	0 %	40 %	40 %	20 %	56752020
35507	NC_006576	GCG	2	6	2154602	2154607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752020
35508	NC_006576	TGA	2	6	2154611	2154616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752020
35509	NC_006576	CGT	2	6	2154639	2154644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752020
35510	NC_006576	AAG	3	9	2154649	2154657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752020
35511	NC_006576	CA	3	6	2154779	2154784	50 %	0 %	0 %	50 %	56752020
35512	NC_006576	CGG	2	6	2154860	2154865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752020
35513	NC_006576	GCTTCC	2	12	2154922	2154933	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	56752020
35514	NC_006576	GTG	2	6	2154954	2154959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752020
35515	NC_006576	GGCA	2	8	2155102	2155109	25 %	0 %	50 %	25 %	56752020
35516	NC_006576	GCA	2	6	2155140	2155145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752020
35517	NC_006576	GCT	2	6	2155151	2155156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752020
35518	NC_006576	CCT	2	6	2155204	2155209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56752020
35519	NC_006576	TGC	2	6	2155213	2155218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752020
35520	NC_006576	CTT	2	6	2155364	2155369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752020
35521	NC_006576	GGC	2	6	2155375	2155380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752020
35522	NC_006576	GCA	2	6	2155412	2155417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752020
35523	NC_006576	T	6	6	2155531	2155536	0 %	100 %	0 %	0 %	56752021
35524	NC_006576	CGT	2	6	2155539	2155544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752021
35525	NC_006576	CGT	2	6	2155561	2155566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752021
35526	NC_006576	AGC	3	9	2155598	2155606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752021
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35528	NC_006576	TGA	2	6	2155653	2155658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752021
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35530	NC_006576	ATC	2	6	2155736	2155741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752021
35531	NC_006576	ATC	2	6	2155795	2155800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752021
35532	NC_006576	TGG	2	6	2155817	2155822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752021
35533	NC_006576	CGC	2	6	2155826	2155831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752021
35534	NC_006576	GCT	2	6	2155892	2155897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752021
35535	NC_006576	GGA	2	6	2156067	2156072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56752021
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35537	NC_006576	TGA	2	6	2156258	2156263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752021
35538	NC_006576	CGG	2	6	2156310	2156315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752021
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35543	NC_006576	CGAT	2	8	2156638	2156645	25 %	25 %	25 %	25 %	56752022
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35545	NC_006576	CGAT	2	8	2156737	2156744	25 %	25 %	25 %	25 %	56752022
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35550	NC_006576	GAC	2	6	2157081	2157086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752022
35551	NC_006576	TTGC	2	8	2157133	2157140	0 %	50 %	25 %	25 %	56752022
35552	NC_006576	AGC	2	6	2157177	2157182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752022
35553	NC_006576	TTTG	2	8	2157212	2157219	0 %	75 %	25 %	0 %	56752022
35554	NC_006576	TGC	2	6	2157248	2157253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752022
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35556	NC_006576	TAGA	2	8	2157300	2157307	50 %	25 %	25 %	0 %	56752022
35557	NC_006576	GAG	2	6	2157400	2157405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56752022
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35559	NC_006576	AATC	2	8	2157494	2157501	50 %	25 %	0 %	25 %	56752022
35560	NC_006576	A	6	6	2157528	2157533	100 %	0 %	0 %	0 %	56752022
35561	NC_006576	GT	3	6	2157580	2157585	0 %	50 %	50 %	0 %	56752022
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35564	NC_006576	CCAG	2	8	2157659	2157666	25 %	0 %	25 %	50 %	56752022
35565	NC_006576	GCC	2	6	2157876	2157881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752022
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35567	NC_006576	TTC	2	6	2157972	2157977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752022
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35569	NC_006576	CAG	2	6	2158005	2158010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752022
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35571	NC_006576	GCA	2	6	2158127	2158132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752022
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35573	NC_006576	CGA	2	6	2158265	2158270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752022
35574	NC_006576	CGTAGC	2	12	2158280	2158291	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56752022
35575	NC_006576	AAAC	2	8	2158296	2158303	75 %	0 %	0 %	25 %	56752022
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35585	NC_006576	GCA	2	6	2158862	2158867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752022
35586	NC_006576	TAAA	2	8	2158881	2158888	75 %	25 %	0 %	0 %	56752022
35587	NC_006576	GGC	2	6	2158911	2158916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752022
35588	NC_006576	CCA	2	6	2158920	2158925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56752022
35589	NC_006576	ATCG	2	8	2158929	2158936	25 %	25 %	25 %	25 %	56752022
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35591	NC_006576	GCTTG	2	10	2159460	2159469	0 %	40 %	40 %	20 %	56752023
35592	NC_006576	CGG	2	6	2159509	2159514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752023
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35599	NC_006576	TCA	2	6	2159798	2159803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752023
35600	NC_006576	CT	4	8	2159840	2159847	0 %	50 %	0 %	50 %	56752023
35601	NC_006576	GGC	2	6	2159894	2159899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752023
35602	NC_006576	TCAGC	2	10	2160035	2160044	20 %	20 %	20 %	40 %	56752023
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35604	NC_006576	GTTAGC	2	12	2160146	2160157	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	56752023
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35608	NC_006576	CCG	2	6	2160545	2160550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752024
35609	NC_006576	GCA	2	6	2160565	2160570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752024
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35612	NC_006576	GCCT	2	8	2160799	2160806	0 %	25 %	25 %	50 %	56752024
35613	NC_006576	C	6	6	2160812	2160817	0 %	0 %	0 %	100 %	56752024
35614	NC_006576	GGT	2	6	2160835	2160840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752024
35615	NC_006576	TTG	2	6	2160906	2160911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752024
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35617	NC_006576	GATC	2	8	2160958	2160965	25 %	25 %	25 %	25 %	56752024
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35731	NC_006576	CAAGC	2	10	2168058	2168067	40 %	0 %	20 %	40 %	56752031
35732	NC_006576	GAG	2	6	2168085	2168090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56752031
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35734	NC_006576	GAT	2	6	2168169	2168174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752031
35735	NC_006576	CTG	2	6	2168205	2168210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752031
35736	NC_006576	TGCGAC	2	12	2168272	2168283	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56752031
35737	NC_006576	A	7	7	2168322	2168328	100 %	0 %	0 %	0 %	56752031
35738	NC_006576	GCG	2	6	2168384	2168389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752031
35739	NC_006576	TGA	2	6	2168540	2168545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752031
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35956	NC_006576	GCCA	2	8	2181832	2181839	25 %	0 %	25 %	50 %	56752045
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35960	NC_006576	TGGGTC	2	12	2181906	2181917	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	56752045
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35964	NC_006576	TTC	2	6	2182193	2182198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752046
35965	NC_006576	GGGAA	2	10	2182266	2182275	40 %	0 %	60 %	0 %	56752046
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35968	NC_006576	GCG	2	6	2182728	2182733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752047
35969	NC_006576	C	6	6	2182801	2182806	0 %	0 %	0 %	100 %	56752047
35970	NC_006576	GCA	2	6	2182815	2182820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752047
35971	NC_006576	GCG	2	6	2182863	2182868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752047
35972	NC_006576	GCG	2	6	2182896	2182901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752047
35973	NC_006576	GTT	2	6	2182952	2182957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752047
35974	NC_006576	TGT	2	6	2182990	2182995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752047
35975	NC_006576	CCG	2	6	2183160	2183165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752047
35976	NC_006576	CTG	2	6	2183232	2183237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752047
35977	NC_006576	GAG	2	6	2183256	2183261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56752047
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35979	NC_006576	AGT	2	6	2183296	2183301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752047
35980	NC_006576	CAG	2	6	2183361	2183366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752047
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35986	NC_006576	CGA	2	6	2183694	2183699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752047
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35988	NC_006576	TCC	2	6	2183889	2183894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56752048
35989	NC_006576	CG	3	6	2183917	2183922	0 %	0 %	50 %	50 %	56752048
35990	NC_006576	CGAT	2	8	2183933	2183940	25 %	25 %	25 %	25 %	56752048
35991	NC_006576	GGCC	2	8	2183976	2183983	0 %	0 %	50 %	50 %	56752048
35992	NC_006576	CTA	2	6	2184085	2184090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752048
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35994	NC_006576	GGC	2	6	2184157	2184162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752048
35995	NC_006576	AGC	2	6	2184337	2184342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752048
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35997	NC_006576	AGC	2	6	2184514	2184519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752048
35998	NC_006576	TGC	2	6	2184549	2184554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752048
35999	NC_006576	CGG	2	6	2184559	2184564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752048
36000	NC_006576	GCT	2	6	2184634	2184639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752048

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