MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35002	NC_006576	GCA	2	6	2123684	2123689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751989
35003	NC_006576	GTT	2	6	2123719	2123724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751989
35004	NC_006576	TGG	2	6	2123794	2123799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751989
35005	NC_006576	TGG	2	6	2123839	2123844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751989
35006	NC_006576	CAA	2	6	2123853	2123858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751989
35007	NC_006576	TCAA	2	8	2123887	2123894	50 %	25 %	0 %	25 %	56751989
35008	NC_006576	ACTG	2	8	2123936	2123943	25 %	25 %	25 %	25 %	56751989
35009	NC_006576	AGC	2	6	2123975	2123980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751989
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35011	NC_006576	GGC	2	6	2124002	2124007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751989
35012	NC_006576	TAG	2	6	2124069	2124074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751989
35013	NC_006576	CGA	2	6	2124219	2124224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751990
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35015	NC_006576	AAG	2	6	2124249	2124254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56751990
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35017	NC_006576	AAT	2	6	2124287	2124292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56751990
35018	NC_006576	AGCG	2	8	2124335	2124342	25 %	0 %	50 %	25 %	56751990
35019	NC_006576	CTG	3	9	2124529	2124537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751990
35020	NC_006576	CGCCC	2	10	2124578	2124587	0 %	0 %	20 %	80 %	56751990
35021	NC_006576	CCAG	2	8	2124640	2124647	25 %	0 %	25 %	50 %	56751990
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35024	NC_006576	CTG	2	6	2124917	2124922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751990
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35036	NC_006576	AGCTG	2	10	2125765	2125774	20 %	20 %	40 %	20 %	56751991
35037	NC_006576	CGG	2	6	2125900	2125905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751991
35038	NC_006576	CAG	2	6	2125939	2125944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751991
35039	NC_006576	TAC	4	12	2126014	2126025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751991
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35051	NC_006576	CCGT	2	8	2127048	2127055	0 %	25 %	25 %	50 %	56751992
35052	NC_006576	TTCCA	2	10	2127063	2127072	20 %	40 %	0 %	40 %	56751992
35053	NC_006576	CGA	2	6	2127154	2127159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751992
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35122	NC_006576	CTG	2	6	2131518	2131523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751997
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35219	NC_006576	CG	3	6	2136995	2137000	0 %	0 %	50 %	50 %	56752005
35220	NC_006576	TTC	2	6	2137037	2137042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752005
35221	NC_006576	GCG	2	6	2137050	2137055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752005
35222	NC_006576	CAG	2	6	2137151	2137156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752005
35223	NC_006576	CAG	2	6	2137163	2137168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752005
35224	NC_006576	GCA	2	6	2137178	2137183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752005
35225	NC_006576	GCG	2	6	2137201	2137206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752005
35226	NC_006576	AAG	2	6	2137266	2137271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752005
35227	NC_006576	CCAC	2	8	2137319	2137326	25 %	0 %	0 %	75 %	56752005
35228	NC_006576	CGATCG	2	12	2137396	2137407	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56752005
35229	NC_006576	GCT	2	6	2137413	2137418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752005
35230	NC_006576	GGC	2	6	2137420	2137425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752005
35231	NC_006576	GCC	2	6	2137469	2137474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752005
35232	NC_006576	TCG	2	6	2137479	2137484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752005
35233	NC_006576	CGT	2	6	2137574	2137579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752006
35234	NC_006576	C	6	6	2137596	2137601	0 %	0 %	0 %	100 %	56752006
35235	NC_006576	AAAC	2	8	2137602	2137609	75 %	0 %	0 %	25 %	56752006
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35332	NC_006576	GTT	2	6	2143296	2143301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752010
35333	NC_006576	C	7	7	2143304	2143310	0 %	0 %	0 %	100 %	56752010
35334	NC_006576	AGG	2	6	2143322	2143327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56752010
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35337	NC_006576	GCC	2	6	2143409	2143414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752010
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35340	NC_006576	GAGG	2	8	2143552	2143559	25 %	0 %	75 %	0 %	56752010
35341	NC_006576	CAA	2	6	2143618	2143623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752010
35342	NC_006576	GCT	2	6	2143652	2143657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752010
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35345	NC_006576	GAA	2	6	2143809	2143814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752011
35346	NC_006576	GCG	2	6	2144004	2144009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752011
35347	NC_006576	AAG	2	6	2144041	2144046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752011
35348	NC_006576	CCAA	2	8	2144125	2144132	50 %	0 %	0 %	50 %	56752011
35349	NC_006576	AGTGT	2	10	2144207	2144216	20 %	40 %	40 %	0 %	56752011
35350	NC_006576	CCAG	2	8	2144221	2144228	25 %	0 %	25 %	50 %	56752011
35351	NC_006576	GCA	2	6	2144240	2144245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752011
35352	NC_006576	CCG	2	6	2144264	2144269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752011
35353	NC_006576	GCC	2	6	2144295	2144300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752011
35354	NC_006576	CGAG	2	8	2144320	2144327	25 %	0 %	50 %	25 %	56752011
35355	NC_006576	CAG	2	6	2144339	2144344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752011
35356	NC_006576	CAG	2	6	2144445	2144450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752011
35357	NC_006576	GAC	2	6	2144489	2144494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752011
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35359	NC_006576	TCA	3	9	2144561	2144569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752011
35360	NC_006576	GAC	2	6	2144736	2144741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752011
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35362	NC_006576	CTG	2	6	2144777	2144782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752011
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35371	NC_006576	GACG	2	8	2145487	2145494	25 %	0 %	50 %	25 %	56752011
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35377	NC_006576	GTCT	2	8	2145985	2145992	0 %	50 %	25 %	25 %	56752012
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35380	NC_006576	CAG	2	6	2146147	2146152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752012
35381	NC_006576	GATCGC	2	12	2146164	2146175	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56752012
35382	NC_006576	CAG	2	6	2146191	2146196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752012
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35389	NC_006576	CTG	2	6	2146551	2146556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752012
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35451	NC_006576	GTGTG	2	10	2151540	2151549	0 %	40 %	60 %	0 %	56752018
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35454	NC_006576	ACTG	2	8	2151634	2151641	25 %	25 %	25 %	25 %	56752018
35455	NC_006576	ACT	2	6	2151663	2151668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752018
35456	NC_006576	TCCG	2	8	2151712	2151719	0 %	25 %	25 %	50 %	56752018
35457	NC_006576	TAT	2	6	2151762	2151767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56752018
35458	NC_006576	ATC	2	6	2151824	2151829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752018
35459	NC_006576	CGG	2	6	2151844	2151849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752018
35460	NC_006576	TCCGC	2	10	2151872	2151881	0 %	20 %	20 %	60 %	56752018
35461	NC_006576	CAAA	2	8	2151892	2151899	75 %	0 %	0 %	25 %	56752018
35462	NC_006576	TGG	2	6	2151950	2151955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752018
35463	NC_006576	GTC	2	6	2151998	2152003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752018
35464	NC_006576	TGT	2	6	2152039	2152044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752018
35465	NC_006576	TGA	2	6	2152140	2152145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752018
35466	NC_006576	GGC	2	6	2152162	2152167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56752018
35467	NC_006576	TGC	2	6	2152218	2152223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752018
35468	NC_006576	ATG	2	6	2152281	2152286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752018
35469	NC_006576	TGAAC	2	10	2152501	2152510	40 %	20 %	20 %	20 %	56752019
35470	NC_006576	GTTG	2	8	2152655	2152662	0 %	50 %	50 %	0 %	56752019
35471	NC_006576	A	6	6	2152746	2152751	100 %	0 %	0 %	0 %	56752019
35472	NC_006576	CGA	2	6	2152773	2152778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752019
35473	NC_006576	TTGG	2	8	2152811	2152818	0 %	50 %	50 %	0 %	56752019
35474	NC_006576	CAG	2	6	2152856	2152861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752019
35475	NC_006576	ATG	2	6	2152866	2152871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752019
35476	NC_006576	CCG	2	6	2152872	2152877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752019
35477	NC_006576	GAA	2	6	2152907	2152912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752019
35478	NC_006576	CAG	2	6	2152934	2152939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752019
35479	NC_006576	AG	3	6	2152978	2152983	50 %	0 %	50 %	0 %	56752019
35480	NC_006576	TGA	2	6	2153026	2153031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56752019
35481	NC_006576	AG	3	6	2153068	2153073	50 %	0 %	50 %	0 %	56752019
35482	NC_006576	CGC	2	6	2153478	2153483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56752020
35483	NC_006576	CTG	2	6	2153538	2153543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752020
35484	NC_006576	CAAT	2	8	2153557	2153564	50 %	25 %	0 %	25 %	56752020
35485	NC_006576	CTT	2	6	2153672	2153677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56752020
35486	NC_006576	CAG	2	6	2153703	2153708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752020
35487	NC_006576	TTG	2	6	2153746	2153751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56752020
35488	NC_006576	CCGATC	2	12	2153761	2153772	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	56752020
35489	NC_006576	CAA	2	6	2153840	2153845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56752020
35490	NC_006576	GCT	2	6	2153899	2153904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752020
35491	NC_006576	TGG	2	6	2153917	2153922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56752020
35492	NC_006576	GCA	2	6	2153924	2153929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752020
35493	NC_006576	GATCT	2	10	2153970	2153979	20 %	40 %	20 %	20 %	56752020
35494	NC_006576	GCT	2	6	2154053	2154058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56752020
35495	NC_006576	ACG	2	6	2154076	2154081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752020
35496	NC_006576	ACT	2	6	2154098	2154103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56752020
35497	NC_006576	GAA	2	6	2154105	2154110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752020
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35499	NC_006576	GAA	2	6	2154126	2154131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56752020
35500	NC_006576	AGC	2	6	2154227	2154232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56752020

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