MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_006576	TCGC	2	8	2059344	2059351	0 %	25 %	25 %	50 %	56751927
34002	NC_006576	CAC	2	6	2059420	2059425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751927
34003	NC_006576	GAG	2	6	2059426	2059431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56751927
34004	NC_006576	AAATCA	2	12	2059512	2059523	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	56751927
34005	NC_006576	GAT	2	6	2059561	2059566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751927
34006	NC_006576	GTG	3	9	2059571	2059579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751927
34007	NC_006576	GCC	2	6	2059590	2059595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751927
34008	NC_006576	AGCA	2	8	2059625	2059632	50 %	0 %	25 %	25 %	56751927
34009	NC_006576	TCG	2	6	2059641	2059646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751927
34010	NC_006576	GCCA	2	8	2059667	2059674	25 %	0 %	25 %	50 %	56751927
34011	NC_006576	CAAC	2	8	2059698	2059705	50 %	0 %	0 %	50 %	56751927
34012	NC_006576	AGG	2	6	2059802	2059807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56751927
34013	NC_006576	TCC	2	6	2059890	2059895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56751927
34014	NC_006576	ATC	2	6	2059903	2059908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751927
34015	NC_006576	CAGA	2	8	2059915	2059922	50 %	0 %	25 %	25 %	56751927
34016	NC_006576	GGCA	2	8	2059923	2059930	25 %	0 %	50 %	25 %	56751927
34017	NC_006576	CAG	2	6	2060027	2060032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751928
34018	NC_006576	GCCA	2	8	2060036	2060043	25 %	0 %	25 %	50 %	56751928
34019	NC_006576	AG	3	6	2060116	2060121	50 %	0 %	50 %	0 %	56751928
34020	NC_006576	ATTGCG	2	12	2060213	2060224	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	56751928
34021	NC_006576	CCG	2	6	2060252	2060257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751928
34022	NC_006576	GCTG	2	8	2060299	2060306	0 %	25 %	50 %	25 %	56751928
34023	NC_006576	GTG	2	6	2060363	2060368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751928
34024	NC_006576	GGA	2	6	2060399	2060404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56751928
34025	NC_006576	CTG	2	6	2060410	2060415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751928
34026	NC_006576	TCGTC	2	10	2060476	2060485	0 %	40 %	20 %	40 %	56751928
34027	NC_006576	CGC	2	6	2060574	2060579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751928
34028	NC_006576	ACA	2	6	2060620	2060625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751928
34029	NC_006576	AGC	2	6	2060640	2060645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751928
34030	NC_006576	GGCC	2	8	2060647	2060654	0 %	0 %	50 %	50 %	56751928
34031	NC_006576	ATC	2	6	2060673	2060678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751928
34032	NC_006576	CGC	2	6	2060732	2060737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751928
34033	NC_006576	GTC	2	6	2060757	2060762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751928
34034	NC_006576	CGG	2	6	2060841	2060846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751928
34035	NC_006576	CTG	2	6	2060875	2060880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751928
34036	NC_006576	CTCG	2	8	2060987	2060994	0 %	25 %	25 %	50 %	56751928
34037	NC_006576	GTC	2	6	2061229	2061234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751929
34038	NC_006576	TTG	2	6	2061243	2061248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751929
34039	NC_006576	GCT	2	6	2061315	2061320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751929
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34041	NC_006576	A	6	6	2061391	2061396	100 %	0 %	0 %	0 %	56751929
34042	NC_006576	GCAGCC	2	12	2061463	2061474	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	56751929
34043	NC_006576	CTAC	2	8	2061685	2061692	25 %	25 %	0 %	50 %	56751929
34044	NC_006576	GAT	2	6	2061776	2061781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751929
34045	NC_006576	TGC	2	6	2061782	2061787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751929
34046	NC_006576	CT	3	6	2061899	2061904	0 %	50 %	0 %	50 %	56751929
34047	NC_006576	CTA	2	6	2061920	2061925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751929
34048	NC_006576	A	6	6	2061948	2061953	100 %	0 %	0 %	0 %	56751929
34049	NC_006576	AGA	2	6	2061956	2061961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56751929
34050	NC_006576	AAGA	2	8	2061974	2061981	75 %	0 %	25 %	0 %	56751929
34051	NC_006576	TCT	2	6	2061988	2061993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751929
34052	NC_006576	CCAA	2	8	2061997	2062004	50 %	0 %	0 %	50 %	56751929
34053	NC_006576	GCT	2	6	2062071	2062076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751929
34054	NC_006576	AAT	2	6	2062236	2062241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56751929
34055	NC_006576	GCTG	2	8	2062269	2062276	0 %	25 %	50 %	25 %	56751929
34056	NC_006576	CAG	2	6	2062574	2062579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751930
34057	NC_006576	TGAT	2	8	2062623	2062630	25 %	50 %	25 %	0 %	56751930
34058	NC_006576	CG	3	6	2062648	2062653	0 %	0 %	50 %	50 %	56751930
34059	NC_006576	CGAAT	2	10	2062729	2062738	40 %	20 %	20 %	20 %	56751930
34060	NC_006576	AGG	2	6	2062752	2062757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56751930
34061	NC_006576	GCA	2	6	2062759	2062764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751930
34062	NC_006576	GGC	2	6	2062765	2062770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751930
34063	NC_006576	GAG	2	6	2062799	2062804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56751930
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34065	NC_006576	TCCC	2	8	2063107	2063114	0 %	25 %	0 %	75 %	56751930
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34068	NC_006576	GC	3	6	2063461	2063466	0 %	0 %	50 %	50 %	56751931
34069	NC_006576	G	6	6	2063522	2063527	0 %	0 %	100 %	0 %	56751931
34070	NC_006576	CAG	2	6	2063557	2063562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751931
34071	NC_006576	G	6	6	2063594	2063599	0 %	0 %	100 %	0 %	56751931
34072	NC_006576	CTG	2	6	2063621	2063626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751931
34073	NC_006576	TGT	2	6	2063746	2063751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751931
34074	NC_006576	GTT	2	6	2063814	2063819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751932
34075	NC_006576	CAG	2	6	2063843	2063848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751932
34076	NC_006576	GCG	2	6	2063925	2063930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751932
34077	NC_006576	TGGC	2	8	2063950	2063957	0 %	25 %	50 %	25 %	56751932
34078	NC_006576	GGT	2	6	2063997	2064002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751932
34079	NC_006576	GTCGAG	2	12	2064025	2064036	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56751932
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34083	NC_006576	GCTGA	2	10	2064595	2064604	20 %	20 %	40 %	20 %	56751933
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34089	NC_006576	CTT	2	6	2064801	2064806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751933
34090	NC_006576	TAG	2	6	2065034	2065039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751934
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34094	NC_006576	GCAG	2	8	2065167	2065174	25 %	0 %	50 %	25 %	56751934
34095	NC_006576	GGT	2	6	2065179	2065184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751934
34096	NC_006576	GCAGC	2	10	2065240	2065249	20 %	0 %	40 %	40 %	56751934
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34099	NC_006576	CTGC	2	8	2065419	2065426	0 %	25 %	25 %	50 %	56751934
34100	NC_006576	CAA	2	6	2065551	2065556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751935
34101	NC_006576	GTTA	2	8	2065562	2065569	25 %	50 %	25 %	0 %	56751935
34102	NC_006576	CAG	2	6	2065580	2065585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751935
34103	NC_006576	TC	3	6	2065611	2065616	0 %	50 %	0 %	50 %	56751935
34104	NC_006576	TGCAGT	2	12	2065731	2065742	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	56751935
34105	NC_006576	CAG	2	6	2065748	2065753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751935
34106	NC_006576	TTC	2	6	2065800	2065805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751935
34107	NC_006576	GCG	2	6	2065841	2065846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751935
34108	NC_006576	CGC	2	6	2066021	2066026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751936
34109	NC_006576	TTG	2	6	2066148	2066153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751936
34110	NC_006576	GGCGC	2	10	2066193	2066202	0 %	0 %	60 %	40 %	56751936
34111	NC_006576	GAC	2	6	2066240	2066245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751936
34112	NC_006576	GTGA	2	8	2066255	2066262	25 %	25 %	50 %	0 %	56751936
34113	NC_006576	GGA	2	6	2066301	2066306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56751936
34114	NC_006576	GAC	2	6	2066336	2066341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751936
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34116	NC_006576	TCT	2	6	2066410	2066415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751936
34117	NC_006576	GC	3	6	2066422	2066427	0 %	0 %	50 %	50 %	56751936
34118	NC_006576	TCG	2	6	2066431	2066436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751936
34119	NC_006576	AAC	2	6	2066484	2066489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751936
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34121	NC_006576	TCA	2	6	2066608	2066613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751936
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34235	NC_006576	GCA	2	6	2074122	2074127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751943
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34468	NC_006576	CGT	2	6	2089487	2089492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751957
34469	NC_006576	CTG	2	6	2089555	2089560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751957
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