MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_006576	CCA	2	6	1878331	1878336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751743
31003	NC_006576	TGGT	2	8	1878361	1878368	0 %	50 %	50 %	0 %	56751743
31004	NC_006576	CGG	2	6	1878372	1878377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751743
31005	NC_006576	CGATCG	2	12	1878389	1878400	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56751743
31006	NC_006576	TCGC	2	8	1878463	1878470	0 %	25 %	25 %	50 %	56751743
31007	NC_006576	CGG	2	6	1878475	1878480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751743
31008	NC_006576	CAC	2	6	1878490	1878495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751743
31009	NC_006576	CAG	2	6	1878521	1878526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751743
31010	NC_006576	CTA	2	6	1878813	1878818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751744
31011	NC_006576	CTT	2	6	1878858	1878863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751744
31012	NC_006576	GAC	2	6	1878957	1878962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751744
31013	NC_006576	GCG	2	6	1878985	1878990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751744
31014	NC_006576	AAG	2	6	1879018	1879023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56751744
31015	NC_006576	CGC	2	6	1879074	1879079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751744
31016	NC_006576	CAA	2	6	1879136	1879141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751744
31017	NC_006576	AAGCC	2	10	1879160	1879169	40 %	0 %	20 %	40 %	56751744
31018	NC_006576	CAG	2	6	1879266	1879271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751744
31019	NC_006576	GCC	2	6	1879306	1879311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751744
31020	NC_006576	GAC	2	6	1879323	1879328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751744
31021	NC_006576	CAC	2	6	1879329	1879334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751744
31022	NC_006576	CTT	2	6	1879376	1879381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751744
31023	NC_006576	ACCA	2	8	1879392	1879399	50 %	0 %	0 %	50 %	56751744
31024	NC_006576	TGACC	2	10	1879457	1879466	20 %	20 %	20 %	40 %	56751744
31025	NC_006576	TCGA	2	8	1879501	1879508	25 %	25 %	25 %	25 %	56751744
31026	NC_006576	AGTG	2	8	1879523	1879530	25 %	25 %	50 %	0 %	56751744
31027	NC_006576	CTG	2	6	1879548	1879553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751744
31028	NC_006576	AG	3	6	1879572	1879577	50 %	0 %	50 %	0 %	56751744
31029	NC_006576	CGAG	2	8	1879855	1879862	25 %	0 %	50 %	25 %	56751744
31030	NC_006576	TTG	2	6	1879873	1879878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751744
31031	NC_006576	AG	3	6	1879902	1879907	50 %	0 %	50 %	0 %	56751744
31032	NC_006576	CGC	2	6	1879910	1879915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751744
31033	NC_006576	TGA	2	6	1879928	1879933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751744
31034	NC_006576	CCG	2	6	1879945	1879950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751744
31035	NC_006576	T	6	6	1880198	1880203	0 %	100 %	0 %	0 %	56751744
31036	NC_006576	G	6	6	1880228	1880233	0 %	0 %	100 %	0 %	56751744
31037	NC_006576	TCT	2	6	1880275	1880280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751744
31038	NC_006576	AAC	2	6	1880311	1880316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751744
31039	NC_006576	GCG	2	6	1880338	1880343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751744
31040	NC_006576	CGAT	2	8	1880371	1880378	25 %	25 %	25 %	25 %	56751744
31041	NC_006576	CAAC	2	8	1880451	1880458	50 %	0 %	0 %	50 %	56751744
31042	NC_006576	CTG	3	9	1880460	1880468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751744
31043	NC_006576	GGCC	2	8	1880472	1880479	0 %	0 %	50 %	50 %	56751744
31044	NC_006576	AGC	2	6	1880482	1880487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751744
31045	NC_006576	CTG	2	6	1880565	1880570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751744
31046	NC_006576	A	6	6	1880596	1880601	100 %	0 %	0 %	0 %	56751744
31047	NC_006576	T	6	6	1880711	1880716	0 %	100 %	0 %	0 %	56751744
31048	NC_006576	ACC	2	6	1880731	1880736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751744
31049	NC_006576	CGT	2	6	1880744	1880749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751744
31050	NC_006576	CCA	3	9	1880750	1880758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751744
31051	NC_006576	ACCA	2	8	1880835	1880842	50 %	0 %	0 %	50 %	56751744
31052	NC_006576	GTG	2	6	1880875	1880880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751744
31053	NC_006576	AAAGAT	2	12	1880895	1880906	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	56751744
31054	NC_006576	CTTCC	2	10	1880997	1881006	0 %	40 %	0 %	60 %	56751744
31055	NC_006576	TGG	2	6	1881012	1881017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751744
31056	NC_006576	CTG	2	6	1881021	1881026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751744
31057	NC_006576	GCT	2	6	1881041	1881046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751744
31058	NC_006576	CGAC	2	8	1881169	1881176	25 %	0 %	25 %	50 %	56751744
31059	NC_006576	ACG	2	6	1881220	1881225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751744
31060	NC_006576	AG	3	6	1881246	1881251	50 %	0 %	50 %	0 %	56751744
31061	NC_006576	TTGCCC	2	12	1881252	1881263	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	56751744
31062	NC_006576	AATG	2	8	1881276	1881283	50 %	25 %	25 %	0 %	56751744
31063	NC_006576	TCT	2	6	1881370	1881375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751744
31064	NC_006576	GCTG	2	8	1881484	1881491	0 %	25 %	50 %	25 %	56751744
31065	NC_006576	TAA	2	6	1881515	1881520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56751744
31066	NC_006576	GAA	2	6	1881547	1881552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56751744
31067	NC_006576	CTG	2	6	1881603	1881608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751744
31068	NC_006576	TTA	2	6	1881652	1881657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56751744
31069	NC_006576	TGGA	2	8	1881706	1881713	25 %	25 %	50 %	0 %	56751744
31070	NC_006576	TGGGG	2	10	1881850	1881859	0 %	20 %	80 %	0 %	56751744
31071	NC_006576	GCC	2	6	1881906	1881911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751744
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31074	NC_006576	TGT	2	6	1882152	1882157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751745
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31078	NC_006576	TGC	2	6	1882362	1882367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751745
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31083	NC_006576	GACC	2	8	1882855	1882862	25 %	0 %	25 %	50 %	56751745
31084	NC_006576	GGTCA	2	10	1882964	1882973	20 %	20 %	40 %	20 %	56751745
31085	NC_006576	TGG	2	6	1883018	1883023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751745
31086	NC_006576	ACG	2	6	1883076	1883081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751745
31087	NC_006576	C	6	6	1883089	1883094	0 %	0 %	0 %	100 %	56751745
31088	NC_006576	AAT	2	6	1883569	1883574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56751746
31089	NC_006576	CTG	2	6	1883629	1883634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751746
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31091	NC_006576	GCCTTG	2	12	1883684	1883695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751746
31092	NC_006576	GCG	2	6	1883729	1883734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751746
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31094	NC_006576	GCT	2	6	1883929	1883934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751746
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31096	NC_006576	GCAGTT	2	12	1884565	1884576	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	56751747
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31100	NC_006576	GCC	2	6	1884813	1884818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751747
31101	NC_006576	CTT	2	6	1884871	1884876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751747
31102	NC_006576	GGGGTT	2	12	1884920	1884931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751747
31103	NC_006576	CGT	2	6	1884973	1884978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751747
31104	NC_006576	CAT	2	6	1885063	1885068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751747
31105	NC_006576	GCT	2	6	1885283	1885288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751747
31106	NC_006576	GCG	2	6	1885289	1885294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751747
31107	NC_006576	AAGA	2	8	1885331	1885338	75 %	0 %	25 %	0 %	56751747
31108	NC_006576	GCT	2	6	1885459	1885464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751747
31109	NC_006576	GGT	2	6	1885517	1885522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751747
31110	NC_006576	TTG	2	6	1885571	1885576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751747
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31112	NC_006576	CAG	2	6	1885673	1885678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751747
31113	NC_006576	TTG	2	6	1885710	1885715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751747
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31116	NC_006576	GCA	2	6	1885912	1885917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751747
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31118	NC_006576	CAA	2	6	1886036	1886041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751747
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31233	NC_006576	GCTTC	2	10	1892605	1892614	0 %	40 %	20 %	40 %	56751755
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31470	NC_006576	TGC	2	6	1907564	1907569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751771
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