MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27502	NC_006576	GCCT	2	8	1677743	1677750	0 %	25 %	25 %	50 %	56751559
27503	NC_006576	AG	3	6	1677752	1677757	50 %	0 %	50 %	0 %	56751559
27504	NC_006576	GA	3	6	1677763	1677768	50 %	0 %	50 %	0 %	56751559
27505	NC_006576	GCC	2	6	1677773	1677778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751559
27506	NC_006576	CCA	2	6	1677784	1677789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751559
27507	NC_006576	TGGC	2	8	1677943	1677950	0 %	25 %	50 %	25 %	56751559
27508	NC_006576	GCGATC	2	12	1678069	1678080	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56751559
27509	NC_006576	CAG	2	6	1678081	1678086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751559
27510	NC_006576	GCG	2	6	1678101	1678106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751559
27511	NC_006576	GCT	2	6	1678115	1678120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751559
27512	NC_006576	AGC	2	6	1678147	1678152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751559
27513	NC_006576	TCA	2	6	1678225	1678230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751559
27514	NC_006576	GGCA	2	8	1678257	1678264	25 %	0 %	50 %	25 %	56751559
27515	NC_006576	GGT	2	6	1678271	1678276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751559
27516	NC_006576	CTT	2	6	1678693	1678698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751560
27517	NC_006576	GTG	2	6	1678731	1678736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751560
27518	NC_006576	CCG	2	6	1678756	1678761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751560
27519	NC_006576	TGG	2	6	1678782	1678787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751560
27520	NC_006576	AAG	2	6	1678794	1678799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56751560
27521	NC_006576	TCGC	2	8	1678806	1678813	0 %	25 %	25 %	50 %	56751560
27522	NC_006576	AAG	2	6	1678850	1678855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56751560
27523	NC_006576	AAG	2	6	1678935	1678940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56751560
27524	NC_006576	CGC	2	6	1678946	1678951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751560
27525	NC_006576	CTG	2	6	1679022	1679027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751560
27526	NC_006576	T	6	6	1679108	1679113	0 %	100 %	0 %	0 %	56751561
27527	NC_006576	CAGT	2	8	1679254	1679261	25 %	25 %	25 %	25 %	56751561
27528	NC_006576	GAC	2	6	1679341	1679346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751561
27529	NC_006576	CCG	2	6	1679421	1679426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751561
27530	NC_006576	GTT	2	6	1679488	1679493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751561
27531	NC_006576	GCG	2	6	1679593	1679598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751561
27532	NC_006576	ACC	2	6	1679745	1679750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751561
27533	NC_006576	TGC	2	6	1679777	1679782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751561
27534	NC_006576	GTT	2	6	1679807	1679812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751561
27535	NC_006576	GGC	2	6	1679813	1679818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751561
27536	NC_006576	GCC	2	6	1679856	1679861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751561
27537	NC_006576	ACA	2	6	1679947	1679952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751561
27538	NC_006576	TTG	2	6	1680033	1680038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751561
27539	NC_006576	CGC	2	6	1680049	1680054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751561
27540	NC_006576	A	6	6	1680058	1680063	100 %	0 %	0 %	0 %	56751561
27541	NC_006576	CGG	4	12	1680121	1680132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751561
27542	NC_006576	ACC	2	6	1680207	1680212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751561
27543	NC_006576	GTG	2	6	1680228	1680233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751561
27544	NC_006576	AAAT	2	8	1680246	1680253	75 %	25 %	0 %	0 %	56751561
27545	NC_006576	CAG	2	6	1680405	1680410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751562
27546	NC_006576	TGTC	2	8	1680433	1680440	0 %	50 %	25 %	25 %	56751562
27547	NC_006576	TGA	2	6	1680455	1680460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751562
27548	NC_006576	GCTG	2	8	1680467	1680474	0 %	25 %	50 %	25 %	56751562
27549	NC_006576	TGC	2	6	1680493	1680498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751562
27550	NC_006576	ATTCCG	2	12	1680519	1680530	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	56751562
27551	NC_006576	GTGA	2	8	1680552	1680559	25 %	25 %	50 %	0 %	56751562
27552	NC_006576	GTC	2	6	1680571	1680576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751562
27553	NC_006576	CGT	2	6	1680581	1680586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751562
27554	NC_006576	TGG	2	6	1680646	1680651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751562
27555	NC_006576	CCG	2	6	1680683	1680688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751562
27556	NC_006576	T	6	6	1680705	1680710	0 %	100 %	0 %	0 %	56751562
27557	NC_006576	TG	3	6	1680738	1680743	0 %	50 %	50 %	0 %	56751562
27558	NC_006576	CTT	2	6	1680848	1680853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751562
27559	NC_006576	TG	3	6	1680891	1680896	0 %	50 %	50 %	0 %	56751562
27560	NC_006576	TTG	2	6	1680964	1680969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751562
27561	NC_006576	TGCC	2	8	1681031	1681038	0 %	25 %	25 %	50 %	56751562
27562	NC_006576	GCG	2	6	1681130	1681135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751562
27563	NC_006576	TGGC	2	8	1681163	1681170	0 %	25 %	50 %	25 %	56751563
27564	NC_006576	GTC	2	6	1681244	1681249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751563
27565	NC_006576	TTGC	2	8	1681260	1681267	0 %	50 %	25 %	25 %	56751563
27566	NC_006576	GCT	2	6	1681342	1681347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751563
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27569	NC_006576	GCT	2	6	1681451	1681456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751563
27570	NC_006576	ACG	2	6	1681490	1681495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751563
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27572	NC_006576	GCT	2	6	1681531	1681536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751563
27573	NC_006576	TGG	2	6	1681563	1681568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751563
27574	NC_006576	CCG	2	6	1681595	1681600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751563
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27576	NC_006576	CTG	2	6	1681622	1681627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751563
27577	NC_006576	GCT	2	6	1681633	1681638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751563
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27579	NC_006576	CGT	2	6	1681804	1681809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751564
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27584	NC_006576	CTG	2	6	1682051	1682056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751564
27585	NC_006576	TGC	2	6	1682101	1682106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751564
27586	NC_006576	CAG	2	6	1682153	1682158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751564
27587	NC_006576	G	7	7	1682173	1682179	0 %	0 %	100 %	0 %	56751564
27588	NC_006576	CGGG	2	8	1682208	1682215	0 %	0 %	75 %	25 %	56751564
27589	NC_006576	TCT	2	6	1682224	1682229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751564
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27592	NC_006576	TGG	2	6	1682382	1682387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751564
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27599	NC_006576	CCA	2	6	1682845	1682850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751564
27600	NC_006576	GCT	2	6	1683015	1683020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751564
27601	NC_006576	G	6	6	1683093	1683098	0 %	0 %	100 %	0 %	56751564
27602	NC_006576	TGA	2	6	1683177	1683182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751565
27603	NC_006576	TCGC	2	8	1683212	1683219	0 %	25 %	25 %	50 %	56751565
27604	NC_006576	ACG	2	6	1683229	1683234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751565
27605	NC_006576	TCA	2	6	1683252	1683257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751565
27606	NC_006576	CGC	2	6	1683324	1683329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751565
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27608	NC_006576	GCG	2	6	1683357	1683362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751565
27609	NC_006576	TG	3	6	1683431	1683436	0 %	50 %	50 %	0 %	56751565
27610	NC_006576	GCA	2	6	1683537	1683542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751565
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27612	NC_006576	GCA	2	6	1683653	1683658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751566
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27615	NC_006576	GCA	2	6	1683878	1683883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751566
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27617	NC_006576	GGT	2	6	1683914	1683919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751566
27618	NC_006576	TG	3	6	1683925	1683930	0 %	50 %	50 %	0 %	56751567
27619	NC_006576	GTC	2	6	1684088	1684093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751567
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27624	NC_006576	CGAT	2	8	1684309	1684316	25 %	25 %	25 %	25 %	56751567
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27704	NC_006576	GCT	2	6	1688978	1688983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751571
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27722	NC_006576	TTC	2	6	1690049	1690054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751573
27723	NC_006576	CTG	2	6	1690061	1690066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751573
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27727	NC_006576	ACCG	2	8	1690280	1690287	25 %	0 %	25 %	50 %	56751573
27728	NC_006576	GTT	2	6	1690306	1690311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751573
27729	NC_006576	CGT	2	6	1690437	1690442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751573
27730	NC_006576	CAGT	2	8	1690696	1690703	25 %	25 %	25 %	25 %	56751574
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27733	NC_006576	TCGAG	2	10	1690799	1690808	20 %	20 %	40 %	20 %	56751574
27734	NC_006576	CGC	2	6	1690906	1690911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751574
27735	NC_006576	CAGC	2	8	1690922	1690929	25 %	0 %	25 %	50 %	56751574
27736	NC_006576	CA	3	6	1690938	1690943	50 %	0 %	0 %	50 %	56751574
27737	NC_006576	GCA	4	12	1691026	1691037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751574
27738	NC_006576	GCTC	2	8	1691042	1691049	0 %	25 %	25 %	50 %	56751574
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27837	NC_006576	ACT	2	6	1697081	1697086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751582
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27841	NC_006576	C	7	7	1697377	1697383	0 %	0 %	0 %	100 %	56751583
27842	NC_006576	CTG	2	6	1697439	1697444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751583
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27846	NC_006576	CAA	2	6	1697571	1697576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751583
27847	NC_006576	GC	3	6	1697610	1697615	0 %	0 %	50 %	50 %	56751583
27848	NC_006576	CAA	2	6	1697643	1697648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751583
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