MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27001	NC_006576	CGGTGG	2	12	1647233	1647244	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	56751535
27002	NC_006576	TGGA	2	8	1647249	1647256	25 %	25 %	50 %	0 %	56751535
27003	NC_006576	GCC	2	6	1647281	1647286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751535
27004	NC_006576	TGC	2	6	1647380	1647385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751535
27005	NC_006576	GCA	2	6	1647494	1647499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751535
27006	NC_006576	GACT	2	8	1647509	1647516	25 %	25 %	25 %	25 %	56751535
27007	NC_006576	GCT	2	6	1647601	1647606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751535
27008	NC_006576	CTG	3	9	1647614	1647622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751535
27009	NC_006576	ATC	2	6	1647636	1647641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751535
27010	NC_006576	CTG	2	6	1647681	1647686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751535
27011	NC_006576	GCT	2	6	1647726	1647731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751535
27012	NC_006576	AGC	2	6	1647834	1647839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751535
27013	NC_006576	AG	3	6	1647858	1647863	50 %	0 %	50 %	0 %	56751536
27014	NC_006576	CAG	2	6	1647927	1647932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751536
27015	NC_006576	CCG	2	6	1647940	1647945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751536
27016	NC_006576	CGT	2	6	1647996	1648001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751536
27017	NC_006576	CAG	2	6	1648148	1648153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751536
27018	NC_006576	CGT	2	6	1648184	1648189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751536
27019	NC_006576	GACG	2	8	1648244	1648251	25 %	0 %	50 %	25 %	56751536
27020	NC_006576	AAC	2	6	1648270	1648275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751536
27021	NC_006576	CTC	2	6	1648305	1648310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56751536
27022	NC_006576	GGC	2	6	1648443	1648448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751536
27023	NC_006576	AGC	2	6	1648476	1648481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751536
27024	NC_006576	CTCAG	2	10	1648615	1648624	20 %	20 %	20 %	40 %	56751537
27025	NC_006576	CCGC	2	8	1648702	1648709	0 %	0 %	25 %	75 %	56751537
27026	NC_006576	CAC	2	6	1648722	1648727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751537
27027	NC_006576	GCT	2	6	1648810	1648815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751537
27028	NC_006576	CGT	2	6	1648825	1648830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751537
27029	NC_006576	GTT	2	6	1648872	1648877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751537
27030	NC_006576	TTGG	2	8	1648958	1648965	0 %	50 %	50 %	0 %	56751537
27031	NC_006576	AGC	2	6	1648992	1648997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751537
27032	NC_006576	AGA	2	6	1649027	1649032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56751537
27033	NC_006576	AGC	2	6	1649059	1649064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751537
27034	NC_006576	TGG	2	6	1649105	1649110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751537
27035	NC_006576	CTG	2	6	1649145	1649150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751537
27036	NC_006576	CGC	2	6	1649156	1649161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751537
27037	NC_006576	TTC	2	6	1649172	1649177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751537
27038	NC_006576	CAG	2	6	1649256	1649261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751537
27039	NC_006576	CTG	2	6	1649327	1649332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751537
27040	NC_006576	GCA	2	6	1649462	1649467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751538
27041	NC_006576	CTTCGT	2	12	1649474	1649485	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	56751538
27042	NC_006576	CGC	2	6	1649594	1649599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751538
27043	NC_006576	CGG	2	6	1649672	1649677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751538
27044	NC_006576	CTC	2	6	1649718	1649723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56751538
27045	NC_006576	ACG	2	6	1650107	1650112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751539
27046	NC_006576	GGC	2	6	1650137	1650142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751539
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27048	NC_006576	CGT	2	6	1650190	1650195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751539
27049	NC_006576	GCGA	2	8	1650213	1650220	25 %	0 %	50 %	25 %	56751539
27050	NC_006576	TGG	2	6	1650222	1650227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751539
27051	NC_006576	CGC	2	6	1650239	1650244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751539
27052	NC_006576	CGA	2	6	1650319	1650324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751539
27053	NC_006576	GAA	2	6	1650413	1650418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56751539
27054	NC_006576	GCG	2	6	1650422	1650427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751539
27055	NC_006576	GAA	2	6	1650449	1650454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56751539
27056	NC_006576	CGGTG	2	10	1650484	1650493	0 %	20 %	60 %	20 %	56751539
27057	NC_006576	CGG	2	6	1650594	1650599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751539
27058	NC_006576	GGC	2	6	1650662	1650667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751539
27059	NC_006576	GGT	2	6	1650743	1650748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751539
27060	NC_006576	CGC	2	6	1650761	1650766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751539
27061	NC_006576	CTGG	2	8	1650775	1650782	0 %	25 %	50 %	25 %	56751539
27062	NC_006576	GGC	2	6	1650853	1650858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751539
27063	NC_006576	GCGTCA	2	12	1650885	1650896	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56751539
27064	NC_006576	TCA	2	6	1650915	1650920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751539
27065	NC_006576	GAT	2	6	1651006	1651011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751539
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27067	NC_006576	TGG	2	6	1651077	1651082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751539
27068	NC_006576	GCA	2	6	1651108	1651113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751539
27069	NC_006576	AACCA	2	10	1651140	1651149	60 %	0 %	0 %	40 %	56751539
27070	NC_006576	GGCG	2	8	1651207	1651214	0 %	0 %	75 %	25 %	56751539
27071	NC_006576	CGC	2	6	1651245	1651250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751539
27072	NC_006576	CGG	2	6	1651273	1651278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751539
27073	NC_006576	TGA	2	6	1651281	1651286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751539
27074	NC_006576	GCG	2	6	1651321	1651326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751539
27075	NC_006576	GAA	2	6	1651589	1651594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56751539
27076	NC_006576	GAT	2	6	1651603	1651608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751539
27077	NC_006576	GCC	2	6	1651758	1651763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751539
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27081	NC_006576	CTT	2	6	1651912	1651917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751539
27082	NC_006576	GTC	2	6	1652031	1652036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751539
27083	NC_006576	GTTACG	2	12	1652049	1652060	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	56751539
27084	NC_006576	CGC	2	6	1652066	1652071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751539
27085	NC_006576	GTC	2	6	1652130	1652135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751539
27086	NC_006576	GGC	2	6	1652159	1652164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751539
27087	NC_006576	ACG	2	6	1652194	1652199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751539
27088	NC_006576	CCGA	2	8	1652203	1652210	25 %	0 %	25 %	50 %	56751539
27089	NC_006576	GGA	2	6	1652215	1652220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56751539
27090	NC_006576	AGT	2	6	1652246	1652251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751539
27091	NC_006576	GTC	2	6	1652277	1652282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751539
27092	NC_006576	ATG	2	6	1652289	1652294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751539
27093	NC_006576	GACGAT	2	12	1652300	1652311	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	56751539
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27095	NC_006576	CCT	2	6	1652383	1652388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56751540
27096	NC_006576	CGG	2	6	1652403	1652408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751540
27097	NC_006576	AGC	2	6	1652425	1652430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751540
27098	NC_006576	GAG	2	6	1652489	1652494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56751540
27099	NC_006576	CGC	2	6	1652543	1652548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751540
27100	NC_006576	CAA	2	6	1652579	1652584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751540
27101	NC_006576	TGC	2	6	1652590	1652595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751540
27102	NC_006576	CGT	2	6	1652690	1652695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751540
27103	NC_006576	CGC	2	6	1652702	1652707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751540
27104	NC_006576	TCAGC	2	10	1652789	1652798	20 %	20 %	20 %	40 %	56751540
27105	NC_006576	CTGCGG	2	12	1652864	1652875	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56751540
27106	NC_006576	GTG	2	6	1652892	1652897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751540
27107	NC_006576	TGC	2	6	1652901	1652906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751540
27108	NC_006576	TGGC	2	8	1653081	1653088	0 %	25 %	50 %	25 %	56751540
27109	NC_006576	GTG	2	6	1653108	1653113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751540
27110	NC_006576	GTG	2	6	1653131	1653136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751540
27111	NC_006576	GAA	2	6	1653170	1653175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56751540
27112	NC_006576	AAC	2	6	1653189	1653194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751540
27113	NC_006576	CAT	2	6	1653360	1653365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751541
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27115	NC_006576	GAA	2	6	1653460	1653465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56751541
27116	NC_006576	TGC	2	6	1653548	1653553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751541
27117	NC_006576	GAG	2	6	1653625	1653630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56751541
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27227	NC_006576	CGC	2	6	1664887	1664892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751548
27228	NC_006576	GCCCC	2	10	1664898	1664907	0 %	0 %	20 %	80 %	56751548
27229	NC_006576	TGT	2	6	1664917	1664922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751548
27230	NC_006576	CCAA	2	8	1664932	1664939	50 %	0 %	0 %	50 %	56751548
27231	NC_006576	TCA	2	6	1664988	1664993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751548
27232	NC_006576	TGT	2	6	1664996	1665001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751548
27233	NC_006576	GCCA	2	8	1665011	1665018	25 %	0 %	25 %	50 %	56751548
27234	NC_006576	CAT	2	6	1665071	1665076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751548
27235	NC_006576	GCG	2	6	1665238	1665243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751548
27236	NC_006576	AG	3	6	1665267	1665272	50 %	0 %	50 %	0 %	56751548
27237	NC_006576	CTA	2	6	1665291	1665296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751548
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27242	NC_006576	TGA	2	6	1665625	1665630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751548
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27244	NC_006576	CCT	2	6	1665771	1665776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56751548
27245	NC_006576	CACTG	2	10	1665782	1665791	20 %	20 %	20 %	40 %	56751548
27246	NC_006576	GCT	2	6	1665845	1665850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751548
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27255	NC_006576	CTG	2	6	1666409	1666414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751548
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27261	NC_006576	CTG	2	6	1666605	1666610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751548
27262	NC_006576	CGC	2	6	1666638	1666643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751548
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27340	NC_006576	GAA	4	12	1670338	1670349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56751553
27341	NC_006576	ACC	2	6	1670359	1670364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751553
27342	NC_006576	CCCAA	2	10	1670388	1670397	40 %	0 %	0 %	60 %	56751553
27343	NC_006576	TCC	2	6	1670450	1670455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56751553
27344	NC_006576	CTTG	2	8	1670520	1670527	0 %	50 %	25 %	25 %	56751553
27345	NC_006576	GCA	2	6	1670577	1670582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751553
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27347	NC_006576	CAA	2	6	1670643	1670648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751553
27348	NC_006576	CGAGG	2	10	1670739	1670748	20 %	0 %	60 %	20 %	56751553
27349	NC_006576	TTC	2	6	1670800	1670805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751553
27350	NC_006576	CACC	2	8	1670811	1670818	25 %	0 %	0 %	75 %	56751553
27351	NC_006576	GCT	2	6	1670840	1670845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751553
27352	NC_006576	TTC	2	6	1670861	1670866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751553
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27450	NC_006576	GCTG	2	8	1674982	1674989	0 %	25 %	50 %	25 %	56751556
27451	NC_006576	CCCAG	2	10	1675056	1675065	20 %	0 %	20 %	60 %	56751556
27452	NC_006576	AGCTGG	2	12	1675151	1675162	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56751556
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27455	NC_006576	CTG	2	6	1675213	1675218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751556
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27461	NC_006576	TGC	2	6	1675609	1675614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751557
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27464	NC_006576	CAG	2	6	1675901	1675906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751557
27465	NC_006576	GCC	2	6	1675928	1675933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751557
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