MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26502	NC_006576	TGG	2	6	1617390	1617395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751503
26503	NC_006576	CAG	2	6	1617443	1617448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751503
26504	NC_006576	CAG	2	6	1617452	1617457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751503
26505	NC_006576	CAC	2	6	1617478	1617483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751503
26506	NC_006576	TCG	2	6	1617555	1617560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751503
26507	NC_006576	GAT	2	6	1617662	1617667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751503
26508	NC_006576	CGA	2	6	1617676	1617681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751503
26509	NC_006576	ACC	2	6	1617845	1617850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751503
26510	NC_006576	GCC	2	6	1617855	1617860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751503
26511	NC_006576	CGC	2	6	1617887	1617892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751503
26512	NC_006576	GCA	2	6	1617906	1617911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751503
26513	NC_006576	ACA	2	6	1617912	1617917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751503
26514	NC_006576	AAGC	2	8	1617939	1617946	50 %	0 %	25 %	25 %	56751503
26515	NC_006576	ATC	2	6	1617998	1618003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751503
26516	NC_006576	GCTCA	2	10	1618016	1618025	20 %	20 %	20 %	40 %	56751503
26517	NC_006576	C	8	8	1618042	1618049	0 %	0 %	0 %	100 %	56751503
26518	NC_006576	TCG	2	6	1618125	1618130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751503
26519	NC_006576	CAC	2	6	1618201	1618206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751503
26520	NC_006576	CGC	2	6	1618272	1618277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751503
26521	NC_006576	TGC	2	6	1618379	1618384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751503
26522	NC_006576	CAG	2	6	1618402	1618407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751503
26523	NC_006576	ACA	2	6	1618464	1618469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751503
26524	NC_006576	AGC	2	6	1618527	1618532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751503
26525	NC_006576	CAA	2	6	1618551	1618556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751503
26526	NC_006576	TTG	2	6	1618596	1618601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751503
26527	NC_006576	CGA	2	6	1618621	1618626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751503
26528	NC_006576	CTC	2	6	1618637	1618642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56751503
26529	NC_006576	GTC	4	12	1618761	1618772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751504
26530	NC_006576	CCG	2	6	1618862	1618867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751504
26531	NC_006576	TCC	2	6	1618921	1618926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56751504
26532	NC_006576	GCT	2	6	1618937	1618942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751504
26533	NC_006576	CTT	2	6	1618958	1618963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751504
26534	NC_006576	GC	3	6	1619037	1619042	0 %	0 %	50 %	50 %	56751504
26535	NC_006576	CCA	2	6	1619150	1619155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751504
26536	NC_006576	GCCA	2	8	1619211	1619218	25 %	0 %	25 %	50 %	56751504
26537	NC_006576	CAA	2	6	1619288	1619293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751504
26538	NC_006576	GGA	2	6	1619336	1619341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56751504
26539	NC_006576	GCT	2	6	1619386	1619391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751504
26540	NC_006576	CTTG	2	8	1619468	1619475	0 %	50 %	25 %	25 %	56751504
26541	NC_006576	CGAT	2	8	1619521	1619528	25 %	25 %	25 %	25 %	56751504
26542	NC_006576	TTC	2	6	1619595	1619600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751504
26543	NC_006576	CTGAAT	2	12	1619736	1619747	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	56751505
26544	NC_006576	GTG	2	6	1619752	1619757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751505
26545	NC_006576	GAT	2	6	1619820	1619825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751505
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26547	NC_006576	CAG	2	6	1619967	1619972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751505
26548	NC_006576	ATC	2	6	1620145	1620150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751505
26549	NC_006576	TGC	2	6	1620210	1620215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751505
26550	NC_006576	CCGT	2	8	1620250	1620257	0 %	25 %	25 %	50 %	56751505
26551	NC_006576	CTT	2	6	1620392	1620397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751505
26552	NC_006576	CGC	2	6	1620480	1620485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751505
26553	NC_006576	AGC	2	6	1620547	1620552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751505
26554	NC_006576	GAT	2	6	1620692	1620697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751505
26555	NC_006576	CGGG	2	8	1620699	1620706	0 %	0 %	75 %	25 %	56751505
26556	NC_006576	G	6	6	1620774	1620779	0 %	0 %	100 %	0 %	56751505
26557	NC_006576	G	6	6	1621009	1621014	0 %	0 %	100 %	0 %	56751506
26558	NC_006576	G	6	6	1621020	1621025	0 %	0 %	100 %	0 %	56751506
26559	NC_006576	ATT	2	6	1621108	1621113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56751506
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26562	NC_006576	CGAT	2	8	1621199	1621206	25 %	25 %	25 %	25 %	56751506
26563	NC_006576	GCG	2	6	1621254	1621259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751506
26564	NC_006576	GCA	2	6	1621278	1621283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751506
26565	NC_006576	GCGATC	2	12	1621377	1621388	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56751506
26566	NC_006576	TCAG	2	8	1621517	1621524	25 %	25 %	25 %	25 %	56751506
26567	NC_006576	TGG	2	6	1621526	1621531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751506
26568	NC_006576	CAGC	2	8	1621546	1621553	25 %	0 %	25 %	50 %	56751506
26569	NC_006576	ATGT	2	8	1621561	1621568	25 %	50 %	25 %	0 %	56751506
26570	NC_006576	GCT	2	6	1621594	1621599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751506
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26573	NC_006576	CTG	2	6	1621940	1621945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751507
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26576	NC_006576	CGC	2	6	1622251	1622256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751507
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26580	NC_006576	TCGA	2	8	1622503	1622510	25 %	25 %	25 %	25 %	56751507
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26586	NC_006576	CAT	2	6	1622754	1622759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751507
26587	NC_006576	CGC	2	6	1622778	1622783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751507
26588	NC_006576	TCG	2	6	1622802	1622807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751507
26589	NC_006576	CGT	2	6	1622854	1622859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751507
26590	NC_006576	CTC	2	6	1623056	1623061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56751508
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26592	NC_006576	GCA	2	6	1623142	1623147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751508
26593	NC_006576	T	6	6	1623196	1623201	0 %	100 %	0 %	0 %	56751508
26594	NC_006576	CAG	2	6	1623248	1623253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751508
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26599	NC_006576	GGC	2	6	1623511	1623516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751508
26600	NC_006576	GCT	2	6	1623556	1623561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751508
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26602	NC_006576	TGCT	2	8	1623670	1623677	0 %	50 %	25 %	25 %	56751508
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26609	NC_006576	G	7	7	1624143	1624149	0 %	0 %	100 %	0 %	56751509
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26732	NC_006576	GTG	2	6	1632402	1632407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751517
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26734	NC_006576	TCCAG	2	10	1632458	1632467	20 %	20 %	20 %	40 %	56751517
26735	NC_006576	ATGG	2	8	1632491	1632498	25 %	25 %	50 %	0 %	56751517
26736	NC_006576	GCG	2	6	1632501	1632506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751517
26737	NC_006576	AAG	2	6	1632573	1632578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56751517
26738	NC_006576	TCA	2	6	1632595	1632600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751517
26739	NC_006576	AAGC	2	8	1632653	1632660	50 %	0 %	25 %	25 %	56751517
26740	NC_006576	GAG	2	6	1632966	1632971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56751518
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26747	NC_006576	TGT	2	6	1633277	1633282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751518
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26749	NC_006576	CTG	2	6	1633327	1633332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751518
26750	NC_006576	CTG	2	6	1633369	1633374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751518
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26754	NC_006576	GCT	2	6	1633452	1633457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751518
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26840	NC_006576	CCG	2	6	1638263	1638268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751524
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26842	NC_006576	CTG	2	6	1638477	1638482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751524
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26845	NC_006576	TCT	3	9	1638627	1638635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751524
26846	NC_006576	TTC	2	6	1638719	1638724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751524
26847	NC_006576	CTC	2	6	1638773	1638778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56751524
26848	NC_006576	GCT	2	6	1638788	1638793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751524
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