MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
20001	NC_006576	ATC	2	6	1229788	1229793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751128
20002	NC_006576	CCG	2	6	1229813	1229818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751128
20003	NC_006576	CGAT	2	8	1229820	1229827	25 %	25 %	25 %	25 %	56751128
20004	NC_006576	TGC	2	6	1229837	1229842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751128
20005	NC_006576	GCT	2	6	1229909	1229914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751128
20006	NC_006576	CAA	2	6	1229931	1229936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751128
20007	NC_006576	ATCG	2	8	1229980	1229987	25 %	25 %	25 %	25 %	56751128
20008	NC_006576	CCG	2	6	1230083	1230088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751128
20009	NC_006576	ATT	2	6	1230091	1230096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56751128
20010	NC_006576	GCA	2	6	1230113	1230118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751128
20011	NC_006576	CCG	2	6	1230129	1230134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751128
20012	NC_006576	AAT	2	6	1230145	1230150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56751128
20013	NC_006576	TGC	2	6	1230157	1230162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751128
20014	NC_006576	GTT	2	6	1230178	1230183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751128
20015	NC_006576	AGCTC	2	10	1230186	1230195	20 %	20 %	20 %	40 %	56751128
20016	NC_006576	TGC	2	6	1230209	1230214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751128
20017	NC_006576	CGC	2	6	1230259	1230264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751128
20018	NC_006576	TGG	2	6	1230266	1230271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751128
20019	NC_006576	CGC	2	6	1230367	1230372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751128
20020	NC_006576	AGC	2	6	1230379	1230384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751128
20021	NC_006576	CTG	2	6	1230412	1230417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751128
20022	NC_006576	CTGG	2	8	1230478	1230485	0 %	25 %	50 %	25 %	56751128
20023	NC_006576	CCG	2	6	1230545	1230550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751128
20024	NC_006576	GAC	3	9	1230625	1230633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751128
20025	NC_006576	TGT	2	6	1230651	1230656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751128
20026	NC_006576	GC	3	6	1230694	1230699	0 %	0 %	50 %	50 %	56751128
20027	NC_006576	GCC	2	6	1230706	1230711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751128
20028	NC_006576	GT	3	6	1230767	1230772	0 %	50 %	50 %	0 %	56751128
20029	NC_006576	CTGAAA	2	12	1230841	1230852	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56751128
20030	NC_006576	ATCA	2	8	1231289	1231296	50 %	25 %	0 %	25 %	56751129
20031	NC_006576	CAGC	2	8	1231322	1231329	25 %	0 %	25 %	50 %	56751129
20032	NC_006576	CGC	2	6	1231577	1231582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751129
20033	NC_006576	TCG	2	6	1231626	1231631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751129
20034	NC_006576	TCA	2	6	1231656	1231661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751129
20035	NC_006576	GCA	2	6	1231689	1231694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751129
20036	NC_006576	ATC	2	6	1231709	1231714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751129
20037	NC_006576	ATCG	2	8	1231730	1231737	25 %	25 %	25 %	25 %	56751129
20038	NC_006576	GCA	2	6	1231761	1231766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751129
20039	NC_006576	CGC	2	6	1231811	1231816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751129
20040	NC_006576	G	6	6	1231886	1231891	0 %	0 %	100 %	0 %	56751129
20041	NC_006576	A	7	7	1231946	1231952	100 %	0 %	0 %	0 %	56751129
20042	NC_006576	ACG	3	9	1232036	1232044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751129
20043	NC_006576	GCG	2	6	1232045	1232050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751129
20044	NC_006576	CCA	2	6	1232055	1232060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751129
20045	NC_006576	CTGG	2	8	1232061	1232068	0 %	25 %	50 %	25 %	56751129
20046	NC_006576	CTG	2	6	1232092	1232097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751129
20047	NC_006576	TAC	2	6	1232144	1232149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751129
20048	NC_006576	GCG	2	6	1232210	1232215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751129
20049	NC_006576	CTG	2	6	1232250	1232255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751129
20050	NC_006576	ACTGAC	2	12	1232276	1232287	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	56751129
20051	NC_006576	AGC	2	6	1232306	1232311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751129
20052	NC_006576	GCTT	2	8	1232349	1232356	0 %	50 %	25 %	25 %	56751129
20053	NC_006576	CAG	2	6	1232359	1232364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751129
20054	NC_006576	GCGATC	2	12	1232693	1232704	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56751130
20055	NC_006576	GGC	2	6	1232726	1232731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751130
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20058	NC_006576	CGG	2	6	1232817	1232822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751130
20059	NC_006576	GAC	2	6	1232827	1232832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751130
20060	NC_006576	GTC	2	6	1232837	1232842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751130
20061	NC_006576	AAGCCC	2	12	1232939	1232950	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	56751130
20062	NC_006576	GCC	2	6	1232969	1232974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751130
20063	NC_006576	AGT	2	6	1233050	1233055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751130
20064	NC_006576	CGG	2	6	1233067	1233072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751130
20065	NC_006576	TGG	2	6	1233188	1233193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751130
20066	NC_006576	AAG	2	6	1233224	1233229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56751130
20067	NC_006576	GCA	2	6	1233261	1233266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751130
20068	NC_006576	GGCTTG	2	12	1233323	1233334	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	56751130
20069	NC_006576	ATC	2	6	1233341	1233346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751130
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20072	NC_006576	GAT	2	6	1233481	1233486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751130
20073	NC_006576	TAC	2	6	1233488	1233493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751130
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20076	NC_006576	CAG	2	6	1233751	1233756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751131
20077	NC_006576	GCT	2	6	1233801	1233806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751131
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20079	NC_006576	TGAG	2	8	1233879	1233886	25 %	25 %	50 %	0 %	56751131
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20082	NC_006576	GAC	2	6	1234089	1234094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751131
20083	NC_006576	TGC	2	6	1234095	1234100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751131
20084	NC_006576	TGGCT	2	10	1234131	1234140	0 %	40 %	40 %	20 %	56751131
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20088	NC_006576	CA	3	6	1234426	1234431	50 %	0 %	0 %	50 %	56751132
20089	NC_006576	GCC	2	6	1234604	1234609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751132
20090	NC_006576	CCAA	2	8	1234635	1234642	50 %	0 %	0 %	50 %	56751132
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20101	NC_006576	CGG	2	6	1235368	1235373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751132
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20103	NC_006576	CTG	3	9	1235513	1235521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751132
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20105	NC_006576	GCC	2	6	1235827	1235832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751133
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20107	NC_006576	TTCG	2	8	1235987	1235994	0 %	50 %	25 %	25 %	56751133
20108	NC_006576	CAG	2	6	1236034	1236039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751133
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20114	NC_006576	GCA	2	6	1236336	1236341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751133
20115	NC_006576	GTG	2	6	1236469	1236474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751133
20116	NC_006576	ACC	2	6	1236571	1236576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751133
20117	NC_006576	CAG	2	6	1236612	1236617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751133
20118	NC_006576	TTGA	2	8	1236637	1236644	25 %	50 %	25 %	0 %	56751133
20119	NC_006576	GCC	2	6	1236694	1236699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751133
20120	NC_006576	GGCG	2	8	1236768	1236775	0 %	0 %	75 %	25 %	56751133
20121	NC_006576	TTG	2	6	1236847	1236852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751133
20122	NC_006576	TGC	2	6	1236921	1236926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751133
20123	NC_006576	GCC	2	6	1236955	1236960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751133
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20229	NC_006576	CGA	2	6	1242563	1242568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751138
20230	NC_006576	CG	3	6	1242618	1242623	0 %	0 %	50 %	50 %	56751138
20231	NC_006576	GCGATC	2	12	1242682	1242693	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56751138
20232	NC_006576	TGC	2	6	1242700	1242705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751138
20233	NC_006576	CGAT	2	8	1242808	1242815	25 %	25 %	25 %	25 %	56751138
20234	NC_006576	TAC	2	6	1242882	1242887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751138
20235	NC_006576	CAAC	2	8	1242995	1243002	50 %	0 %	0 %	50 %	56751138
20236	NC_006576	AAG	2	6	1243011	1243016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56751138
20237	NC_006576	GGC	2	6	1243059	1243064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751138
20238	NC_006576	ATC	2	6	1243068	1243073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751138
20239	NC_006576	TCCGCG	2	12	1243103	1243114	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	56751138
20240	NC_006576	GTT	2	6	1243119	1243124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751138
20241	NC_006576	GCA	2	6	1243131	1243136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751138
20242	NC_006576	CGGC	2	8	1243150	1243157	0 %	0 %	50 %	50 %	56751138
20243	NC_006576	TG	3	6	1243213	1243218	0 %	50 %	50 %	0 %	56751138
20244	NC_006576	TCG	2	6	1243228	1243233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751138
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20252	NC_006576	CGAT	2	8	1243543	1243550	25 %	25 %	25 %	25 %	56751138
20253	NC_006576	TGGC	2	8	1243778	1243785	0 %	25 %	50 %	25 %	56751139
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20255	NC_006576	GCGATC	2	12	1243848	1243859	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56751139
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20258	NC_006576	GCGATC	2	12	1244021	1244032	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56751139
20259	NC_006576	GTA	2	6	1244034	1244039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751139
20260	NC_006576	TGG	2	6	1244088	1244093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751139
20261	NC_006576	AGTC	2	8	1244155	1244162	25 %	25 %	25 %	25 %	56751139
20262	NC_006576	CTG	2	6	1244168	1244173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751139
20263	NC_006576	CGC	2	6	1244191	1244196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751139
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20346	NC_006576	TGA	2	6	1249159	1249164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751147
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20348	NC_006576	GTGG	2	8	1249247	1249254	0 %	25 %	75 %	0 %	56751147
20349	NC_006576	AAC	2	6	1249263	1249268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751147
20350	NC_006576	CAC	2	6	1249318	1249323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751147
20351	NC_006576	CAAGCC	2	12	1249457	1249468	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	56751147
20352	NC_006576	CCA	2	6	1249536	1249541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751147
20353	NC_006576	ACC	2	6	1249556	1249561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751147
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20355	NC_006576	AGCGG	2	10	1249612	1249621	20 %	0 %	60 %	20 %	56751147
20356	NC_006576	CAGC	2	8	1249708	1249715	25 %	0 %	25 %	50 %	56751147
20357	NC_006576	GCC	2	6	1249761	1249766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751147
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20360	NC_006576	CAG	2	6	1249829	1249834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751147
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20370	NC_006576	CTG	2	6	1250577	1250582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751148
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20372	NC_006576	GTC	2	6	1250645	1250650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751148
20373	NC_006576	CTG	2	6	1250674	1250679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751148
20374	NC_006576	CTG	2	6	1250744	1250749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751148
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20430	NC_006576	GTTG	2	8	1255533	1255540	0 %	50 %	50 %	0 %	56751151
20431	NC_006576	TAGC	2	8	1255542	1255549	25 %	25 %	25 %	25 %	56751151
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20443	NC_006576	GC	3	6	1256110	1256115	0 %	0 %	50 %	50 %	56751152
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20460	NC_006576	A	6	6	1256851	1256856	100 %	0 %	0 %	0 %	56751152
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20463	NC_006576	GCT	2	6	1256917	1256922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751152
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20465	NC_006576	GGC	2	6	1256993	1256998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751152
20466	NC_006576	CCGC	2	8	1257046	1257053	0 %	0 %	25 %	75 %	56751152
20467	NC_006576	GCC	2	6	1257305	1257310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751153
20468	NC_006576	CGAA	2	8	1257319	1257326	50 %	0 %	25 %	25 %	56751153
20469	NC_006576	GATCG	2	10	1257391	1257400	20 %	20 %	40 %	20 %	56751153
20470	NC_006576	AGGT	2	8	1257419	1257426	25 %	25 %	50 %	0 %	56751153
20471	NC_006576	AAC	2	6	1257453	1257458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751153
20472	NC_006576	AGA	2	6	1257498	1257503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56751153
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20474	NC_006576	TTG	2	6	1257553	1257558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751153
20475	NC_006576	CG	3	6	1257593	1257598	0 %	0 %	50 %	50 %	56751153
20476	NC_006576	CGGG	2	8	1257645	1257652	0 %	0 %	75 %	25 %	56751153
20477	NC_006576	CTG	2	6	1257656	1257661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751153
20478	NC_006576	CA	3	6	1257760	1257765	50 %	0 %	0 %	50 %	56751153
20479	NC_006576	TGC	2	6	1257828	1257833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751153
20480	NC_006576	CAGC	2	8	1257834	1257841	25 %	0 %	25 %	50 %	56751153
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20493	NC_006576	GTA	2	6	1258345	1258350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751153
20494	NC_006576	CTG	2	6	1258355	1258360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751153
20495	NC_006576	GGC	2	6	1258432	1258437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751153
20496	NC_006576	AGCC	2	8	1258481	1258488	25 %	0 %	25 %	50 %	56751153
20497	NC_006576	TCGA	2	8	1258502	1258509	25 %	25 %	25 %	25 %	56751153
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20499	NC_006576	ACA	2	6	1258613	1258618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751153
20500	NC_006576	AC	3	6	1258674	1258679	50 %	0 %	0 %	50 %	56751153

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