MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_006576	AGT	2	6	1197820	1197825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751094
19503	NC_006576	CAG	2	6	1197872	1197877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751094
19504	NC_006576	CGA	2	6	1197892	1197897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751094
19505	NC_006576	GCG	2	6	1197931	1197936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751094
19506	NC_006576	TGGA	2	8	1198003	1198010	25 %	25 %	50 %	0 %	56751094
19507	NC_006576	GT	3	6	1198057	1198062	0 %	50 %	50 %	0 %	56751094
19508	NC_006576	TGC	2	6	1198077	1198082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751094
19509	NC_006576	CAAAG	2	10	1198250	1198259	60 %	0 %	20 %	20 %	56751094
19510	NC_006576	TTC	2	6	1198295	1198300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751094
19511	NC_006576	GCAGCC	2	12	1198361	1198372	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	56751095
19512	NC_006576	TCA	2	6	1198376	1198381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751095
19513	NC_006576	CGG	2	6	1198408	1198413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751095
19514	NC_006576	CAAA	2	8	1198436	1198443	75 %	0 %	0 %	25 %	56751095
19515	NC_006576	GCA	2	6	1198473	1198478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751095
19516	NC_006576	CGAT	2	8	1198492	1198499	25 %	25 %	25 %	25 %	56751095
19517	NC_006576	TTC	2	6	1198525	1198530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751095
19518	NC_006576	CGA	2	6	1198573	1198578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751095
19519	NC_006576	TGT	2	6	1198582	1198587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751095
19520	NC_006576	GA	3	6	1198597	1198602	50 %	0 %	50 %	0 %	56751095
19521	NC_006576	CCG	2	6	1198684	1198689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751095
19522	NC_006576	CGC	2	6	1198760	1198765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751095
19523	NC_006576	GGC	2	6	1198776	1198781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751095
19524	NC_006576	CAG	2	6	1198830	1198835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751095
19525	NC_006576	TGGT	2	8	1198857	1198864	0 %	50 %	50 %	0 %	56751095
19526	NC_006576	CAG	2	6	1198897	1198902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751095
19527	NC_006576	ATG	2	6	1198965	1198970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751095
19528	NC_006576	CCG	2	6	1199075	1199080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751095
19529	NC_006576	GTGG	2	8	1199244	1199251	0 %	25 %	75 %	0 %	56751095
19530	NC_006576	CGC	2	6	1199280	1199285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751095
19531	NC_006576	AC	3	6	1199296	1199301	50 %	0 %	0 %	50 %	56751095
19532	NC_006576	AGCG	3	12	1199305	1199316	25 %	0 %	50 %	25 %	56751095
19533	NC_006576	CCA	2	6	1199425	1199430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751095
19534	NC_006576	GTCC	2	8	1199482	1199489	0 %	25 %	25 %	50 %	56751095
19535	NC_006576	CGA	2	6	1199503	1199508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751095
19536	NC_006576	GCCGG	2	10	1199524	1199533	0 %	0 %	60 %	40 %	56751095
19537	NC_006576	CAA	2	6	1199537	1199542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751095
19538	NC_006576	CGA	2	6	1199543	1199548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751095
19539	NC_006576	AGC	2	6	1199597	1199602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751096
19540	NC_006576	TCA	2	6	1199685	1199690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751096
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19542	NC_006576	GCC	2	6	1199789	1199794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751096
19543	NC_006576	GAC	2	6	1199819	1199824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751096
19544	NC_006576	GC	3	6	1199837	1199842	0 %	0 %	50 %	50 %	56751096
19545	NC_006576	CAG	2	6	1199921	1199926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751096
19546	NC_006576	ATC	2	6	1199981	1199986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751096
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19549	NC_006576	CGT	2	6	1200094	1200099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751096
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19551	NC_006576	CG	3	6	1200236	1200241	0 %	0 %	50 %	50 %	56751096
19552	NC_006576	AGA	3	9	1200250	1200258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56751096
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19555	NC_006576	CAC	2	6	1200374	1200379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751096
19556	NC_006576	GCG	2	6	1200485	1200490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751096
19557	NC_006576	GTC	2	6	1200507	1200512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751096
19558	NC_006576	GGC	2	6	1200543	1200548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751096
19559	NC_006576	TCT	2	6	1200621	1200626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751096
19560	NC_006576	GT	3	6	1200684	1200689	0 %	50 %	50 %	0 %	56751096
19561	NC_006576	TTC	2	6	1200719	1200724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751096
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19566	NC_006576	GCA	2	6	1201134	1201139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751096
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19588	NC_006576	TGTCGC	2	12	1202343	1202354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751098
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19602	NC_006576	AAC	2	6	1203096	1203101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751098
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19613	NC_006576	TGG	2	6	1203747	1203752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751098
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19618	NC_006576	ACC	2	6	1204058	1204063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751099
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19621	NC_006576	TGC	2	6	1204170	1204175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751099
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19729	NC_006576	CAT	2	6	1210701	1210706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751106
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19851	NC_006576	AGC	3	9	1218083	1218091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751115
19852	NC_006576	GAT	2	6	1218123	1218128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751115
19853	NC_006576	CTT	2	6	1218224	1218229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751115
19854	NC_006576	TGGTT	2	10	1218257	1218266	0 %	60 %	40 %	0 %	56751115
19855	NC_006576	TC	3	6	1218299	1218304	0 %	50 %	0 %	50 %	56751115
19856	NC_006576	TTGAT	2	10	1218328	1218337	20 %	60 %	20 %	0 %	56751115
19857	NC_006576	CTG	2	6	1218339	1218344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751115
19858	NC_006576	CGA	2	6	1218352	1218357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751115
19859	NC_006576	GAGCA	2	10	1218532	1218541	40 %	0 %	40 %	20 %	56751115
19860	NC_006576	CGAT	2	8	1218661	1218668	25 %	25 %	25 %	25 %	56751115
19861	NC_006576	GTCCT	2	10	1218678	1218687	0 %	40 %	20 %	40 %	56751115
19862	NC_006576	GTG	2	6	1218910	1218915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751116
19863	NC_006576	AGT	2	6	1218929	1218934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751116
19864	NC_006576	CTT	2	6	1218957	1218962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751116
19865	NC_006576	TTC	2	6	1218967	1218972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751116
19866	NC_006576	CAA	2	6	1219025	1219030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751116
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19868	NC_006576	GA	3	6	1219550	1219555	50 %	0 %	50 %	0 %	56751117
19869	NC_006576	ACC	2	6	1219612	1219617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751117
19870	NC_006576	AGC	2	6	1219622	1219627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751117
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19872	NC_006576	TCCC	2	8	1219683	1219690	0 %	25 %	0 %	75 %	56751117
19873	NC_006576	GGT	2	6	1219701	1219706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751117
19874	NC_006576	AGC	3	9	1219715	1219723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751117
19875	NC_006576	TTC	2	6	1219900	1219905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751117
19876	NC_006576	AC	3	6	1219923	1219928	50 %	0 %	0 %	50 %	56751117
19877	NC_006576	TCT	2	6	1219953	1219958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751117
19878	NC_006576	GCGATC	2	12	1220054	1220065	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56751117
19879	NC_006576	TTG	2	6	1220068	1220073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751117
19880	NC_006576	TGGAA	2	10	1220225	1220234	40 %	20 %	40 %	0 %	56751118
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19882	NC_006576	GCGATC	2	12	1220275	1220286	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56751118
19883	NC_006576	GCTCG	2	10	1220685	1220694	0 %	20 %	40 %	40 %	56751119
19884	NC_006576	CTG	2	6	1220697	1220702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751119
19885	NC_006576	TGA	2	6	1220716	1220721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751119
19886	NC_006576	AGGG	2	8	1220728	1220735	25 %	0 %	75 %	0 %	56751119
19887	NC_006576	TGTC	2	8	1220778	1220785	0 %	50 %	25 %	25 %	56751119
19888	NC_006576	ATC	2	6	1220847	1220852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751119
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19924	NC_006576	GCCT	2	8	1223622	1223629	0 %	25 %	25 %	50 %	56751122
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19945	NC_006576	TGC	2	6	1226036	1226041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751124
19946	NC_006576	CAATC	2	10	1226073	1226082	40 %	20 %	0 %	40 %	56751124
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19949	NC_006576	CAT	2	6	1226169	1226174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751124
19950	NC_006576	CGT	2	6	1226341	1226346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751125
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19954	NC_006576	AGT	2	6	1226572	1226577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751125
19955	NC_006576	CGC	2	6	1226707	1226712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751125
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19958	NC_006576	GATT	2	8	1226909	1226916	25 %	50 %	25 %	0 %	56751125
19959	NC_006576	GCGA	2	8	1227438	1227445	25 %	0 %	50 %	25 %	56751126
19960	NC_006576	CAA	2	6	1227497	1227502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751126
19961	NC_006576	CAA	2	6	1227626	1227631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751126
19962	NC_006576	GCC	2	6	1227666	1227671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751126
19963	NC_006576	TGAG	2	8	1227701	1227708	25 %	25 %	50 %	0 %	56751126
19964	NC_006576	CAG	2	6	1227978	1227983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751127
19965	NC_006576	CAG	2	6	1228020	1228025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751127
19966	NC_006576	GTA	2	6	1228095	1228100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751127
19967	NC_006576	CTG	2	6	1228134	1228139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751127
19968	NC_006576	CCG	2	6	1228217	1228222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751127
19969	NC_006576	ACC	2	6	1228254	1228259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751127
19970	NC_006576	CTG	2	6	1228407	1228412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751127
19971	NC_006576	A	6	6	1228461	1228466	100 %	0 %	0 %	0 %	56751127
19972	NC_006576	TGT	2	6	1228565	1228570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751127
19973	NC_006576	TTC	2	6	1228596	1228601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751127
19974	NC_006576	CTG	2	6	1228611	1228616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751127
19975	NC_006576	AGT	2	6	1228646	1228651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751127
19976	NC_006576	CAG	2	6	1228654	1228659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751127
19977	NC_006576	GCA	2	6	1228693	1228698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751127
19978	NC_006576	GCA	2	6	1228718	1228723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751127
19979	NC_006576	GAC	2	6	1228796	1228801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751127
19980	NC_006576	GCA	2	6	1228859	1228864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751127
19981	NC_006576	CTG	2	6	1228890	1228895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751127
19982	NC_006576	CAT	3	9	1228919	1228927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751127
19983	NC_006576	CCG	2	6	1228935	1228940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751127
19984	NC_006576	AGC	2	6	1228951	1228956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751127
19985	NC_006576	CCA	2	6	1228962	1228967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751127
19986	NC_006576	CAG	2	6	1228979	1228984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751127
19987	NC_006576	ACC	2	6	1228987	1228992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751127
19988	NC_006576	GA	3	6	1229091	1229096	50 %	0 %	50 %	0 %	56751127
19989	NC_006576	AAG	2	6	1229110	1229115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56751127
19990	NC_006576	CAG	2	6	1229145	1229150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751127
19991	NC_006576	GCC	2	6	1229203	1229208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751127
19992	NC_006576	GCA	2	6	1229327	1229332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751127
19993	NC_006576	GGA	2	6	1229391	1229396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56751128
19994	NC_006576	GTTC	2	8	1229433	1229440	0 %	50 %	25 %	25 %	56751128
19995	NC_006576	CCG	2	6	1229474	1229479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751128
19996	NC_006576	TCA	2	6	1229528	1229533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751128
19997	NC_006576	GAAA	2	8	1229538	1229545	75 %	0 %	25 %	0 %	56751128
19998	NC_006576	ACC	2	6	1229696	1229701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751128
19999	NC_006576	GCT	2	6	1229742	1229747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751128
20000	NC_006576	GAC	2	6	1229755	1229760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751128

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