MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_006576	CGC	3	9	97691	97699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750095
1502	NC_006576	CTC	2	6	97814	97819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56750095
1503	NC_006576	CTG	2	6	98261	98266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750096
1504	NC_006576	GCT	2	6	98419	98424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750096
1505	NC_006576	TGG	2	6	98525	98530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750096
1506	NC_006576	GAT	2	6	98599	98604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750096
1507	NC_006576	GCA	2	6	98635	98640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750096
1508	NC_006576	CTG	2	6	98660	98665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750096
1509	NC_006576	GCT	2	6	98671	98676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750096
1510	NC_006576	TGG	2	6	98679	98684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750096
1511	NC_006576	TGG	2	6	98722	98727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750096
1512	NC_006576	TCC	2	6	98736	98741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56750096
1513	NC_006576	TGGCGC	2	12	98750	98761	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56750096
1514	NC_006576	CTG	2	6	98842	98847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750096
1515	NC_006576	TGA	3	9	98868	98876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750096
1516	NC_006576	TCA	2	6	98892	98897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750096
1517	NC_006576	CAG	2	6	99053	99058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750097
1518	NC_006576	TGAT	2	8	99063	99070	25 %	50 %	25 %	0 %	56750097
1519	NC_006576	TCG	2	6	99088	99093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750097
1520	NC_006576	CTAT	2	8	99564	99571	25 %	50 %	0 %	25 %	56750097
1521	NC_006576	AGC	2	6	99589	99594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750097
1522	NC_006576	AGC	2	6	99971	99976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750098
1523	NC_006576	TGG	2	6	99989	99994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750098
1524	NC_006576	TGC	2	6	100016	100021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750098
1525	NC_006576	TGT	2	6	100043	100048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750098
1526	NC_006576	CAC	2	6	100115	100120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750098
1527	NC_006576	GCA	2	6	100159	100164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750098
1528	NC_006576	GAC	2	6	100176	100181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750098
1529	NC_006576	GCT	2	6	100288	100293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750099
1530	NC_006576	GCC	2	6	100316	100321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750099
1531	NC_006576	GCT	2	6	100410	100415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750099
1532	NC_006576	GAG	2	6	100461	100466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56750099
1533	NC_006576	TAC	2	6	100542	100547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750099
1534	NC_006576	CAG	2	6	100596	100601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750099
1535	NC_006576	TAC	2	6	100623	100628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750099
1536	NC_006576	ACCTCG	2	12	100645	100656	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	56750099
1537	NC_006576	GCT	2	6	100725	100730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750099
1538	NC_006576	AC	3	6	100739	100744	50 %	0 %	0 %	50 %	56750099
1539	NC_006576	CCAGC	2	10	100820	100829	20 %	0 %	20 %	60 %	56750099
1540	NC_006576	CG	3	6	100832	100837	0 %	0 %	50 %	50 %	56750099
1541	NC_006576	TCGA	2	8	100951	100958	25 %	25 %	25 %	25 %	56750099
1542	NC_006576	GCA	2	6	100982	100987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750099
1543	NC_006576	TCG	2	6	100999	101004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750099
1544	NC_006576	CTC	2	6	101011	101016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56750099
1545	NC_006576	CTG	2	6	101108	101113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750099
1546	NC_006576	CAA	2	6	101127	101132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750099
1547	NC_006576	ATG	2	6	101233	101238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750100
1548	NC_006576	GCT	2	6	101299	101304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750100
1549	NC_006576	ATC	2	6	101351	101356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750100
1550	NC_006576	ATC	2	6	101366	101371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750100
1551	NC_006576	ACAAA	2	10	101528	101537	80 %	0 %	0 %	20 %	56750100
1552	NC_006576	TGG	2	6	101648	101653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750100
1553	NC_006576	GCT	2	6	102352	102357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750101
1554	NC_006576	GCT	2	6	102390	102395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750101
1555	NC_006576	TGG	2	6	102402	102407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750101
1556	NC_006576	GAAA	2	8	102464	102471	75 %	0 %	25 %	0 %	56750101
1557	NC_006576	GCT	2	6	102494	102499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750101
1558	NC_006576	CTG	2	6	102525	102530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750101
1559	NC_006576	CT	3	6	102554	102559	0 %	50 %	0 %	50 %	56750101
1560	NC_006576	AGTC	2	8	102571	102578	25 %	25 %	25 %	25 %	56750101
1561	NC_006576	CT	3	6	102623	102628	0 %	50 %	0 %	50 %	56750101
1562	NC_006576	TGC	2	6	102638	102643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750101
1563	NC_006576	GAT	2	6	102654	102659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750101
1564	NC_006576	T	6	6	102663	102668	0 %	100 %	0 %	0 %	56750101
1565	NC_006576	TCAG	2	8	102688	102695	25 %	25 %	25 %	25 %	56750101
1566	NC_006576	AAG	2	6	102714	102719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750101
1567	NC_006576	GTC	2	6	102853	102858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750101
1568	NC_006576	ATG	2	6	102883	102888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750101
1569	NC_006576	GAA	2	6	102971	102976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750101
1570	NC_006576	TAG	2	6	103015	103020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750101
1571	NC_006576	AT	4	8	103035	103042	50 %	50 %	0 %	0 %	56750101
1572	NC_006576	TCA	2	6	103096	103101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750102
1573	NC_006576	TTG	2	6	103140	103145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750102
1574	NC_006576	TGG	2	6	103222	103227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750102
1575	NC_006576	TAAA	2	8	103265	103272	75 %	25 %	0 %	0 %	56750102
1576	NC_006576	CCA	2	6	103335	103340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750102
1577	NC_006576	AAT	2	6	103431	103436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56750102
1578	NC_006576	GCC	2	6	103555	103560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750102
1579	NC_006576	CCG	2	6	103585	103590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750102
1580	NC_006576	GTCA	2	8	103913	103920	25 %	25 %	25 %	25 %	56750103
1581	NC_006576	CTG	2	6	104095	104100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750103
1582	NC_006576	ACTG	2	8	104150	104157	25 %	25 %	25 %	25 %	56750103
1583	NC_006576	TGT	2	6	104179	104184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750103
1584	NC_006576	ATAGGC	2	12	104318	104329	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	56750103
1585	NC_006576	CAT	3	9	104350	104358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750103
1586	NC_006576	GTTG	2	8	104452	104459	0 %	50 %	50 %	0 %	56750103
1587	NC_006576	GATT	2	8	104488	104495	25 %	50 %	25 %	0 %	56750103
1588	NC_006576	AGCC	2	8	104506	104513	25 %	0 %	25 %	50 %	56750103
1589	NC_006576	CAG	2	6	104515	104520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750103
1590	NC_006576	TTG	2	6	104562	104567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750103
1591	NC_006576	AAG	2	6	104568	104573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750103
1592	NC_006576	TGG	2	6	104605	104610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750103
1593	NC_006576	CAT	2	6	104617	104622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750103
1594	NC_006576	GCA	2	6	104772	104777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750103
1595	NC_006576	TCT	2	6	105090	105095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750103
1596	NC_006576	GGC	2	6	105101	105106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750103
1597	NC_006576	CCAA	2	8	105382	105389	50 %	0 %	0 %	50 %	56750103
1598	NC_006576	ACTC	2	8	105428	105435	25 %	25 %	0 %	50 %	56750103
1599	NC_006576	TCAGG	2	10	105672	105681	20 %	20 %	40 %	20 %	56750104
1600	NC_006576	TGC	2	6	105852	105857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750104
1601	NC_006576	CAG	2	6	105895	105900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750104
1602	NC_006576	CTG	2	6	105908	105913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750104
1603	NC_006576	GGC	2	6	105924	105929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750104
1604	NC_006576	ATCG	2	8	106036	106043	25 %	25 %	25 %	25 %	56750104
1605	NC_006576	GAG	2	6	106117	106122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56750104
1606	NC_006576	TTG	2	6	106123	106128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750104
1607	NC_006576	CAAG	2	8	106194	106201	50 %	0 %	25 %	25 %	56750104
1608	NC_006576	CAA	2	6	106225	106230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750104
1609	NC_006576	GCCT	2	8	106242	106249	0 %	25 %	25 %	50 %	56750104
1610	NC_006576	TGC	2	6	106305	106310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750104
1611	NC_006576	CGG	2	6	106371	106376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750104
1612	NC_006576	CAA	2	6	106446	106451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750104
1613	NC_006576	CAA	2	6	106531	106536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750104
1614	NC_006576	AACC	2	8	106617	106624	50 %	0 %	0 %	50 %	56750104
1615	NC_006576	GCA	2	6	106675	106680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750104
1616	NC_006576	GCC	2	6	107197	107202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750105
1617	NC_006576	GGA	2	6	107227	107232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56750105
1618	NC_006576	GCG	2	6	107272	107277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750105
1619	NC_006576	GCT	2	6	107290	107295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750105
1620	NC_006576	AGG	2	6	107391	107396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56750105
1621	NC_006576	GTC	2	6	107448	107453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750105
1622	NC_006576	CAA	2	6	107477	107482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750105
1623	NC_006576	CAG	2	6	107531	107536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750105
1624	NC_006576	GCTG	2	8	107726	107733	0 %	25 %	50 %	25 %	56750105
1625	NC_006576	CCT	2	6	107818	107823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56750105
1626	NC_006576	GGGACT	2	12	107908	107919	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56750105
1627	NC_006576	CGG	2	6	107998	108003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750105
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1631	NC_006576	CAG	2	6	108688	108693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750107
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1643	NC_006576	CAG	3	9	109575	109583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750108
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1729	NC_006576	TGA	2	6	114269	114274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750113
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1731	NC_006576	ATC	2	6	114316	114321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750113
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1735	NC_006576	CCCCA	2	10	114787	114796	20 %	0 %	0 %	80 %	56750114
1736	NC_006576	TGC	2	6	114803	114808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750114
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1738	NC_006576	G	6	6	114888	114893	0 %	0 %	100 %	0 %	56750114
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1740	NC_006576	CTG	3	9	114951	114959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750114
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1742	NC_006576	CAG	2	6	114984	114989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750114
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1744	NC_006576	CAG	2	6	115083	115088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750114
1745	NC_006576	CAT	2	6	115160	115165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750114
1746	NC_006576	CAGCC	2	10	115187	115196	20 %	0 %	20 %	60 %	56750114
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1986	NC_006576	GCGATC	2	12	129445	129456	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	109150054
1987	NC_006576	TGC	2	6	129621	129626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750129
1988	NC_006576	TGG	2	6	129668	129673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750129
1989	NC_006576	AAG	2	6	129753	129758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750129
1990	NC_006576	TTGA	2	8	129770	129777	25 %	50 %	25 %	0 %	56750129
1991	NC_006576	GTG	2	6	129800	129805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750129
1992	NC_006576	AAG	2	6	129843	129848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750129
1993	NC_006576	GGAAG	2	10	129859	129868	40 %	0 %	60 %	0 %	56750129
1994	NC_006576	GGC	2	6	129989	129994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750129
1995	NC_006576	GGTT	2	8	130010	130017	0 %	50 %	50 %	0 %	56750129
1996	NC_006576	TCGC	2	8	130029	130036	0 %	25 %	25 %	50 %	56750129
1997	NC_006576	TCT	2	6	130135	130140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750130
1998	NC_006576	GTG	2	6	130180	130185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750130
1999	NC_006576	TTC	2	6	130282	130287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750130
2000	NC_006576	AG	3	6	130386	130391	50 %	0 %	50 %	0 %	56750130

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