MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_006576	AGT	2	6	1167942	1167947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751061
19003	NC_006576	ACC	2	6	1167973	1167978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751061
19004	NC_006576	GGC	2	6	1167996	1168001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751061
19005	NC_006576	CAA	2	6	1168005	1168010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751061
19006	NC_006576	AGG	2	6	1168011	1168016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56751061
19007	NC_006576	ACA	2	6	1168028	1168033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751061
19008	NC_006576	GAA	2	6	1168183	1168188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56751061
19009	NC_006576	CCA	2	6	1168245	1168250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751061
19010	NC_006576	GGC	2	6	1168399	1168404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751061
19011	NC_006576	CGA	2	6	1168425	1168430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751061
19012	NC_006576	CGTC	2	8	1168432	1168439	0 %	25 %	25 %	50 %	56751061
19013	NC_006576	CAA	2	6	1168567	1168572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751061
19014	NC_006576	CAG	2	6	1168597	1168602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751061
19015	NC_006576	CAG	2	6	1168696	1168701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751061
19016	NC_006576	ACCA	2	8	1168711	1168718	50 %	0 %	0 %	50 %	56751061
19017	NC_006576	GGGTC	2	10	1168741	1168750	0 %	20 %	60 %	20 %	56751061
19018	NC_006576	CAG	3	9	1168780	1168788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751061
19019	NC_006576	GCG	2	6	1168839	1168844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751061
19020	NC_006576	GTT	2	6	1168848	1168853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751061
19021	NC_006576	CGAT	2	8	1168859	1168866	25 %	25 %	25 %	25 %	56751061
19022	NC_006576	A	6	6	1168873	1168878	100 %	0 %	0 %	0 %	56751061
19023	NC_006576	GAA	2	6	1168951	1168956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56751061
19024	NC_006576	TTG	2	6	1169017	1169022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751061
19025	NC_006576	CTG	2	6	1169024	1169029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751061
19026	NC_006576	TGG	2	6	1169148	1169153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751062
19027	NC_006576	GTT	2	6	1169178	1169183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751062
19028	NC_006576	CGC	2	6	1169238	1169243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751062
19029	NC_006576	GTT	3	9	1169328	1169336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751062
19030	NC_006576	GCT	2	6	1169342	1169347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751062
19031	NC_006576	AGGC	2	8	1169383	1169390	25 %	0 %	50 %	25 %	56751062
19032	NC_006576	CGG	2	6	1169405	1169410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751062
19033	NC_006576	TGC	2	6	1169479	1169484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751062
19034	NC_006576	TGGTG	2	10	1169546	1169555	0 %	40 %	60 %	0 %	56751062
19035	NC_006576	ACA	2	6	1169564	1169569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751062
19036	NC_006576	TAC	2	6	1169616	1169621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751062
19037	NC_006576	TGA	2	6	1169641	1169646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751062
19038	NC_006576	CCA	2	6	1169800	1169805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751062
19039	NC_006576	A	6	6	1170061	1170066	100 %	0 %	0 %	0 %	56751063
19040	NC_006576	GCA	2	6	1170069	1170074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751063
19041	NC_006576	AAG	2	6	1170080	1170085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56751063
19042	NC_006576	AAG	2	6	1170101	1170106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56751063
19043	NC_006576	CAA	2	6	1170111	1170116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751063
19044	NC_006576	TGAA	2	8	1170212	1170219	50 %	25 %	25 %	0 %	56751063
19045	NC_006576	GCA	2	6	1170250	1170255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751063
19046	NC_006576	CTG	2	6	1170281	1170286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751063
19047	NC_006576	CTG	2	6	1170314	1170319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751063
19048	NC_006576	GGTT	2	8	1170403	1170410	0 %	50 %	50 %	0 %	56751064
19049	NC_006576	GTCT	2	8	1170454	1170461	0 %	50 %	25 %	25 %	56751064
19050	NC_006576	CAT	2	6	1170495	1170500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751064
19051	NC_006576	CTG	2	6	1170551	1170556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751064
19052	NC_006576	CGC	2	6	1170592	1170597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751064
19053	NC_006576	GCT	2	6	1170604	1170609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751064
19054	NC_006576	GAC	2	6	1170697	1170702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751064
19055	NC_006576	GCG	2	6	1170759	1170764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751064
19056	NC_006576	TCGCGA	2	12	1170789	1170800	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56751064
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19058	NC_006576	GGT	2	6	1170820	1170825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751064
19059	NC_006576	CTG	2	6	1170853	1170858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751064
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19061	NC_006576	TC	3	6	1170948	1170953	0 %	50 %	0 %	50 %	56751065
19062	NC_006576	CTT	2	6	1171055	1171060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751065
19063	NC_006576	CAG	2	6	1171119	1171124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751065
19064	NC_006576	TGT	2	6	1171141	1171146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751065
19065	NC_006576	CTG	2	6	1171257	1171262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751065
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19067	NC_006576	CAC	2	6	1171398	1171403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751065
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19072	NC_006576	CCCT	2	8	1171677	1171684	0 %	25 %	0 %	75 %	56751066
19073	NC_006576	CGC	2	6	1171738	1171743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751066
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19076	NC_006576	TGC	2	6	1171852	1171857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751066
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19083	NC_006576	GAGG	2	8	1172366	1172373	25 %	0 %	75 %	0 %	56751067
19084	NC_006576	ACG	2	6	1172374	1172379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751067
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19091	NC_006576	CAC	2	6	1173227	1173232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751068
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19093	NC_006576	CGAT	2	8	1173361	1173368	25 %	25 %	25 %	25 %	56751068
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19098	NC_006576	GC	3	6	1173524	1173529	0 %	0 %	50 %	50 %	56751068
19099	NC_006576	CGA	2	6	1173565	1173570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751068
19100	NC_006576	TGG	2	6	1173656	1173661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751068
19101	NC_006576	TCA	2	6	1173811	1173816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751068
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19103	NC_006576	GGC	2	6	1173860	1173865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751069
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19111	NC_006576	AAC	2	6	1174304	1174309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751069
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19114	NC_006576	TGG	2	6	1174476	1174481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751069
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19116	NC_006576	AGC	2	6	1174549	1174554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751069
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19118	NC_006576	AGC	2	6	1174650	1174655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751069
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19232	NC_006576	GCT	2	6	1181982	1181987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161621818
19233	NC_006576	GCGCG	2	10	1182008	1182017	0 %	0 %	60 %	40 %	161621818
19234	NC_006576	AAG	2	6	1182033	1182038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161621818
19235	NC_006576	GCA	2	6	1182107	1182112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161621818
19236	NC_006576	CAG	2	6	1182128	1182133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161621818
19237	NC_006576	GCA	2	6	1182321	1182326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751079
19238	NC_006576	GAAA	2	8	1182395	1182402	75 %	0 %	25 %	0 %	56751079
19239	NC_006576	GGC	2	6	1182432	1182437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751079
19240	NC_006576	CTG	2	6	1182495	1182500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751079
19241	NC_006576	CAT	2	6	1182635	1182640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751079
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19243	NC_006576	CAT	2	6	1182701	1182706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751079
19244	NC_006576	GCA	2	6	1182820	1182825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751079
19245	NC_006576	CGA	2	6	1182915	1182920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751079
19246	NC_006576	TGC	2	6	1182940	1182945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751079
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19250	NC_006576	CTT	3	9	1183103	1183111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751079
19251	NC_006576	TGC	2	6	1183112	1183117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751079
19252	NC_006576	CGG	2	6	1183172	1183177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751079
19253	NC_006576	CTT	2	6	1183184	1183189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751079
19254	NC_006576	TGC	2	6	1183264	1183269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751079
19255	NC_006576	TTGGGT	2	12	1183272	1183283	0 %	50 %	50 %	0 %	56751079
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19259	NC_006576	AGC	2	6	1183401	1183406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751080
19260	NC_006576	CTG	2	6	1183454	1183459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751080
19261	NC_006576	CGA	2	6	1183464	1183469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751080
19262	NC_006576	GC	3	6	1183526	1183531	0 %	0 %	50 %	50 %	56751080
19263	NC_006576	GCG	2	6	1183556	1183561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751080
19264	NC_006576	CAA	2	6	1183609	1183614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751080
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19266	NC_006576	CGC	2	6	1183640	1183645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751080
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19269	NC_006576	CTG	2	6	1183859	1183864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751080
19270	NC_006576	GCA	2	6	1183971	1183976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751080
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19273	NC_006576	A	6	6	1184098	1184103	100 %	0 %	0 %	0 %	56751081
19274	NC_006576	CAA	2	6	1184200	1184205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751081
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19285	NC_006576	CGA	2	6	1184825	1184830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751082
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19333	NC_006576	TGC	2	6	1187940	1187945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751085
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19345	NC_006576	ACCA	2	8	1188361	1188368	50 %	0 %	0 %	50 %	56751085
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19465	NC_006576	C	8	8	1195667	1195674	0 %	0 %	0 %	100 %	56751092
19466	NC_006576	GCA	2	6	1195697	1195702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751092
19467	NC_006576	AGC	2	6	1195726	1195731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751092
19468	NC_006576	GA	3	6	1195738	1195743	50 %	0 %	50 %	0 %	56751092
19469	NC_006576	CAA	2	6	1195755	1195760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751092
19470	NC_006576	CAA	2	6	1195779	1195784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751092
19471	NC_006576	CTA	2	6	1196037	1196042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751093
19472	NC_006576	GA	3	6	1196065	1196070	50 %	0 %	50 %	0 %	56751093
19473	NC_006576	GGC	2	6	1196139	1196144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751093
19474	NC_006576	TGA	2	6	1196165	1196170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751093
19475	NC_006576	CATC	2	8	1196180	1196187	25 %	25 %	0 %	50 %	56751093
19476	NC_006576	TTTG	2	8	1196190	1196197	0 %	75 %	25 %	0 %	56751093
19477	NC_006576	TTGC	2	8	1196198	1196205	0 %	50 %	25 %	25 %	56751093
19478	NC_006576	ATCG	2	8	1196247	1196254	25 %	25 %	25 %	25 %	56751093
19479	NC_006576	GCA	2	6	1196323	1196328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751093
19480	NC_006576	CTG	2	6	1196346	1196351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751093
19481	NC_006576	AGCA	2	8	1196515	1196522	50 %	0 %	25 %	25 %	56751093
19482	NC_006576	GCA	2	6	1196555	1196560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751093
19483	NC_006576	CGATCG	2	12	1196594	1196605	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56751093
19484	NC_006576	TCA	2	6	1196642	1196647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751093
19485	NC_006576	AGG	2	6	1196691	1196696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56751093
19486	NC_006576	GCGAT	2	10	1196721	1196730	20 %	20 %	40 %	20 %	56751093
19487	NC_006576	CCA	2	6	1196771	1196776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751093
19488	NC_006576	GGC	2	6	1196794	1196799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751093
19489	NC_006576	TTC	2	6	1196820	1196825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751093
19490	NC_006576	AG	3	6	1196851	1196856	50 %	0 %	50 %	0 %	56751093
19491	NC_006576	AAC	2	6	1196865	1196870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751093
19492	NC_006576	GGT	2	6	1196901	1196906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751093
19493	NC_006576	GCT	2	6	1197000	1197005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751093
19494	NC_006576	TCA	2	6	1197088	1197093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751093
19495	NC_006576	TGT	2	6	1197098	1197103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751093
19496	NC_006576	GCT	2	6	1197233	1197238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751093
19497	NC_006576	TCAT	2	8	1197241	1197248	25 %	50 %	0 %	25 %	56751093
19498	NC_006576	CGGC	2	8	1197673	1197680	0 %	0 %	50 %	50 %	56751094
19499	NC_006576	CCA	2	6	1197725	1197730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751094
19500	NC_006576	CAG	3	9	1197754	1197762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751094

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