MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_006576	CGG	2	6	1138035	1138040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751035
18502	NC_006576	GCCT	2	8	1138055	1138062	0 %	25 %	25 %	50 %	56751035
18503	NC_006576	GCG	2	6	1138439	1138444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751036
18504	NC_006576	TGCC	2	8	1138497	1138504	0 %	25 %	25 %	50 %	56751036
18505	NC_006576	GCA	2	6	1138542	1138547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751036
18506	NC_006576	TTGA	2	8	1138549	1138556	25 %	50 %	25 %	0 %	56751036
18507	NC_006576	CCA	2	6	1138794	1138799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751036
18508	NC_006576	TGC	3	9	1138883	1138891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751036
18509	NC_006576	GCG	2	6	1139017	1139022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751036
18510	NC_006576	GCG	2	6	1139077	1139082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751036
18511	NC_006576	CTCA	2	8	1139095	1139102	25 %	25 %	0 %	50 %	56751036
18512	NC_006576	CGT	2	6	1139182	1139187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751036
18513	NC_006576	CTG	2	6	1139191	1139196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751036
18514	NC_006576	CGT	2	6	1139239	1139244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751036
18515	NC_006576	CCA	2	6	1139283	1139288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751036
18516	NC_006576	TGC	2	6	1139310	1139315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751036
18517	NC_006576	TGC	2	6	1139369	1139374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751036
18518	NC_006576	T	6	6	1139422	1139427	0 %	100 %	0 %	0 %	56751036
18519	NC_006576	TGA	2	6	1139472	1139477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751036
18520	NC_006576	CACCG	2	10	1139479	1139488	20 %	0 %	20 %	60 %	56751036
18521	NC_006576	CTG	2	6	1139521	1139526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751036
18522	NC_006576	AAC	2	6	1139564	1139569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751036
18523	NC_006576	TGC	2	6	1139666	1139671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751036
18524	NC_006576	GGC	2	6	1139684	1139689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751036
18525	NC_006576	CCA	2	6	1139730	1139735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751036
18526	NC_006576	GCC	2	6	1139765	1139770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751036
18527	NC_006576	CAC	2	6	1139782	1139787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751036
18528	NC_006576	TGC	2	6	1139858	1139863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751036
18529	NC_006576	CTT	2	6	1139871	1139876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751036
18530	NC_006576	ACA	2	6	1139920	1139925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751036
18531	NC_006576	TTC	2	6	1139934	1139939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751036
18532	NC_006576	TGA	2	6	1140067	1140072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751037
18533	NC_006576	GGT	2	6	1140199	1140204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751037
18534	NC_006576	ACCCCC	2	12	1140213	1140224	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	56751037
18535	NC_006576	TCT	2	6	1140231	1140236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751037
18536	NC_006576	CTG	2	6	1140284	1140289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751037
18537	NC_006576	TGC	2	6	1140318	1140323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751037
18538	NC_006576	CAC	2	6	1140493	1140498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751037
18539	NC_006576	CAG	2	6	1140535	1140540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751037
18540	NC_006576	TG	3	6	1140623	1140628	0 %	50 %	50 %	0 %	56751037
18541	NC_006576	CAG	2	6	1140638	1140643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751037
18542	NC_006576	GTT	2	6	1140697	1140702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751037
18543	NC_006576	CCG	2	6	1140765	1140770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751037
18544	NC_006576	TCT	2	6	1140832	1140837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751037
18545	NC_006576	GCT	2	6	1140865	1140870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751037
18546	NC_006576	CTG	2	6	1140881	1140886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751037
18547	NC_006576	GCA	2	6	1140934	1140939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751037
18548	NC_006576	GCTTG	2	10	1140993	1141002	0 %	40 %	40 %	20 %	56751037
18549	NC_006576	CGC	2	6	1141491	1141496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751038
18550	NC_006576	ACT	2	6	1141633	1141638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751038
18551	NC_006576	TCA	2	6	1141681	1141686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751038
18552	NC_006576	CCA	2	6	1141687	1141692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751038
18553	NC_006576	TGC	2	6	1141698	1141703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751038
18554	NC_006576	CGA	2	6	1141891	1141896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751038
18555	NC_006576	TCA	2	6	1142008	1142013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751038
18556	NC_006576	CCA	2	6	1142172	1142177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751038
18557	NC_006576	TCA	2	6	1142179	1142184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751038
18558	NC_006576	GCT	2	6	1142324	1142329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751038
18559	NC_006576	TGT	2	6	1142356	1142361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751038
18560	NC_006576	TGTA	2	8	1142515	1142522	25 %	50 %	25 %	0 %	56751038
18561	NC_006576	ATCA	2	8	1142697	1142704	50 %	25 %	0 %	25 %	56751038
18562	NC_006576	GCTC	2	8	1142731	1142738	0 %	25 %	25 %	50 %	56751038
18563	NC_006576	CT	3	6	1142739	1142744	0 %	50 %	0 %	50 %	56751038
18564	NC_006576	TTG	2	6	1142751	1142756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751038
18565	NC_006576	TTC	2	6	1142910	1142915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751038
18566	NC_006576	AAG	2	6	1143032	1143037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56751038
18567	NC_006576	T	7	7	1143127	1143133	0 %	100 %	0 %	0 %	56751038
18568	NC_006576	ACA	2	6	1143187	1143192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751038
18569	NC_006576	ACA	2	6	1143205	1143210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751038
18570	NC_006576	CAG	2	6	1143221	1143226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751038
18571	NC_006576	GAAAGC	2	12	1143264	1143275	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	56751038
18572	NC_006576	A	7	7	1143289	1143295	100 %	0 %	0 %	0 %	56751038
18573	NC_006576	TAG	2	6	1143343	1143348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751038
18574	NC_006576	AGC	2	6	1143363	1143368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751038
18575	NC_006576	AGTA	2	8	1143421	1143428	50 %	25 %	25 %	0 %	56751038
18576	NC_006576	GAA	2	6	1143452	1143457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56751038
18577	NC_006576	CTG	2	6	1143840	1143845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751039
18578	NC_006576	CTG	2	6	1143855	1143860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751039
18579	NC_006576	GCTG	2	8	1143871	1143878	0 %	25 %	50 %	25 %	56751039
18580	NC_006576	G	6	6	1143900	1143905	0 %	0 %	100 %	0 %	56751039
18581	NC_006576	ACGC	2	8	1143910	1143917	25 %	0 %	25 %	50 %	56751039
18582	NC_006576	ATTT	2	8	1144040	1144047	25 %	75 %	0 %	0 %	56751039
18583	NC_006576	GCG	2	6	1144084	1144089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751039
18584	NC_006576	GCA	2	6	1144126	1144131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751039
18585	NC_006576	GCT	2	6	1144207	1144212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751039
18586	NC_006576	CGG	2	6	1144239	1144244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751039
18587	NC_006576	TCT	2	6	1144401	1144406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751039
18588	NC_006576	GGC	2	6	1144412	1144417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751039
18589	NC_006576	GCT	2	6	1144442	1144447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751039
18590	NC_006576	TTG	2	6	1144503	1144508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751039
18591	NC_006576	GCC	2	6	1144532	1144537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751039
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18593	NC_006576	TTG	2	6	1144598	1144603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56751039
18594	NC_006576	ACA	2	6	1144647	1144652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751039
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18596	NC_006576	GTTG	2	8	1144741	1144748	0 %	50 %	50 %	0 %	56751039
18597	NC_006576	TGG	2	6	1144765	1144770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751039
18598	NC_006576	GCCCA	2	10	1144919	1144928	20 %	0 %	20 %	60 %	56751039
18599	NC_006576	CTAT	2	8	1144942	1144949	25 %	50 %	0 %	25 %	56751039
18600	NC_006576	TGC	2	6	1145047	1145052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751039
18601	NC_006576	TGG	2	6	1145056	1145061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56751039
18602	NC_006576	GGC	2	6	1145081	1145086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751039
18603	NC_006576	TCG	2	6	1145249	1145254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751040
18604	NC_006576	TCT	2	6	1145393	1145398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751040
18605	NC_006576	CGC	2	6	1145399	1145404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751040
18606	NC_006576	GATCGA	2	12	1145418	1145429	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	56751040
18607	NC_006576	CAT	2	6	1145445	1145450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751040
18608	NC_006576	TTTG	2	8	1145470	1145477	0 %	75 %	25 %	0 %	56751040
18609	NC_006576	GGGCT	2	10	1145617	1145626	0 %	20 %	60 %	20 %	56751040
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18612	NC_006576	AGC	2	6	1145780	1145785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751040
18613	NC_006576	CGT	2	6	1145806	1145811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751040
18614	NC_006576	AGC	3	9	1145837	1145845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751040
18615	NC_006576	GGA	2	6	1145868	1145873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56751040
18616	NC_006576	GCC	2	6	1145880	1145885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751040
18617	NC_006576	TTC	2	6	1145894	1145899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751040
18618	NC_006576	GC	3	6	1146001	1146006	0 %	0 %	50 %	50 %	56751040
18619	NC_006576	TCC	2	6	1146023	1146028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56751040
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18621	NC_006576	GAT	2	6	1146165	1146170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751040
18622	NC_006576	GAA	2	6	1146190	1146195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56751040
18623	NC_006576	CTG	2	6	1146219	1146224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751040
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18718	NC_006576	GCGCG	2	10	1151250	1151259	0 %	0 %	60 %	40 %	56751044
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18724	NC_006576	A	6	6	1151791	1151796	100 %	0 %	0 %	0 %	56751045
18725	NC_006576	AGCC	2	8	1151813	1151820	25 %	0 %	25 %	50 %	56751045
18726	NC_006576	ACA	2	6	1151909	1151914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56751045
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18733	NC_006576	CT	3	6	1152234	1152239	0 %	50 %	0 %	50 %	56751046
18734	NC_006576	CAG	2	6	1152305	1152310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751046
18735	NC_006576	CGG	2	6	1152338	1152343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751046
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18833	NC_006576	GCC	3	9	1158315	1158323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751049
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18836	NC_006576	CGT	2	6	1158418	1158423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751049
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18840	NC_006576	CGA	2	6	1158635	1158640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751049
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18850	NC_006576	GCA	2	6	1158989	1158994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751050
18851	NC_006576	TGC	2	6	1159018	1159023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751050
18852	NC_006576	TGC	2	6	1159093	1159098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751050
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18854	NC_006576	C	6	6	1159156	1159161	0 %	0 %	0 %	100 %	56751050
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18862	NC_006576	TGA	3	9	1159585	1159593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751051
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18865	NC_006576	ATC	2	6	1159659	1159664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56751051
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18955	NC_006576	CCGAGA	2	12	1165196	1165207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751058
18956	NC_006576	CTT	2	6	1165227	1165232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751058
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18961	NC_006576	GGTC	2	8	1165413	1165420	0 %	25 %	50 %	25 %	56751058
18962	NC_006576	CGG	2	6	1165506	1165511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56751058
18963	NC_006576	CAC	2	6	1165587	1165592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751058
18964	NC_006576	GCGA	2	8	1165622	1165629	25 %	0 %	50 %	25 %	56751058
18965	NC_006576	CGA	2	6	1165697	1165702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751058
18966	NC_006576	CGAT	2	8	1165747	1165754	25 %	25 %	25 %	25 %	56751058
18967	NC_006576	CGC	2	6	1165764	1165769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56751058
18968	NC_006576	CAAG	2	8	1165779	1165786	50 %	0 %	25 %	25 %	56751058
18969	NC_006576	TGC	2	6	1165837	1165842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751059
18970	NC_006576	GGTCAA	2	12	1165941	1165952	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	56751059
18971	NC_006576	GGCT	2	8	1166049	1166056	0 %	25 %	50 %	25 %	56751059
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18981	NC_006576	TCT	2	6	1166597	1166602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56751060
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18985	NC_006576	AGC	2	6	1166894	1166899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751061
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18989	NC_006576	ACC	2	6	1167282	1167287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56751061
18990	NC_006576	CTG	2	6	1167328	1167333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56751061
18991	NC_006576	GCA	2	6	1167383	1167388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751061
18992	NC_006576	CAG	2	6	1167397	1167402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751061
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18994	NC_006576	CAGC	2	8	1167522	1167529	25 %	0 %	25 %	50 %	56751061
18995	NC_006576	AGT	2	6	1167551	1167556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751061
18996	NC_006576	CGATCG	2	12	1167559	1167570	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56751061
18997	NC_006576	GCA	2	6	1167615	1167620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751061
18998	NC_006576	AGC	2	6	1167629	1167634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56751061
18999	NC_006576	ATG	2	6	1167659	1167664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56751061
19000	NC_006576	AAG	2	6	1167800	1167805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56751061

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