MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_006576	GTT	2	6	1045033	1045038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750945
17002	NC_006576	TGAT	2	8	1045071	1045078	25 %	50 %	25 %	0 %	56750945
17003	NC_006576	AGT	2	6	1045088	1045093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750945
17004	NC_006576	CGAT	2	8	1045350	1045357	25 %	25 %	25 %	25 %	56750945
17005	NC_006576	TCT	2	6	1045399	1045404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750945
17006	NC_006576	TAT	2	6	1045405	1045410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56750945
17007	NC_006576	CAT	2	6	1045478	1045483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750945
17008	NC_006576	GAT	2	6	1045508	1045513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750945
17009	NC_006576	CATCTT	2	12	1045630	1045641	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	56750945
17010	NC_006576	AAC	2	6	1045649	1045654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750945
17011	NC_006576	CCA	2	6	1045784	1045789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750945
17012	NC_006576	GA	3	6	1045798	1045803	50 %	0 %	50 %	0 %	56750945
17013	NC_006576	CTT	2	6	1045876	1045881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750945
17014	NC_006576	AGC	2	6	1045947	1045952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750945
17015	NC_006576	AGC	2	6	1046039	1046044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750945
17016	NC_006576	TCAT	2	8	1046100	1046107	25 %	50 %	0 %	25 %	56750945
17017	NC_006576	TCA	2	6	1046122	1046127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750945
17018	NC_006576	AAT	2	6	1046240	1046245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56750945
17019	NC_006576	TC	3	6	1046251	1046256	0 %	50 %	0 %	50 %	56750945
17020	NC_006576	CAG	2	6	1046329	1046334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750945
17021	NC_006576	AGT	2	6	1046360	1046365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750945
17022	NC_006576	CTTC	2	8	1046431	1046438	0 %	50 %	0 %	50 %	56750945
17023	NC_006576	CTG	2	6	1046461	1046466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750945
17024	NC_006576	ATAA	2	8	1046507	1046514	75 %	25 %	0 %	0 %	56750945
17025	NC_006576	CATC	2	8	1046569	1046576	25 %	25 %	0 %	50 %	56750945
17026	NC_006576	CGC	2	6	1046616	1046621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750945
17027	NC_006576	CAA	2	6	1046629	1046634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750945
17028	NC_006576	ATCA	2	8	1046825	1046832	50 %	25 %	0 %	25 %	56750945
17029	NC_006576	GCG	2	6	1046881	1046886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750945
17030	NC_006576	TCC	2	6	1046946	1046951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56750945
17031	NC_006576	GGT	2	6	1052572	1052577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750946
17032	NC_006576	ACA	2	6	1052675	1052680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750946
17033	NC_006576	CTT	2	6	1052732	1052737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750946
17034	NC_006576	GCTA	2	8	1052771	1052778	25 %	25 %	25 %	25 %	56750946
17035	NC_006576	GAA	2	6	1052801	1052806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750946
17036	NC_006576	TCCA	2	8	1052906	1052913	25 %	25 %	0 %	50 %	56750946
17037	NC_006576	CTGG	2	8	1052989	1052996	0 %	25 %	50 %	25 %	56750946
17038	NC_006576	TGC	2	6	1053036	1053041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750946
17039	NC_006576	ATC	2	6	1053042	1053047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750946
17040	NC_006576	GATG	2	8	1053073	1053080	25 %	25 %	50 %	0 %	56750946
17041	NC_006576	TCA	2	6	1053163	1053168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750946
17042	NC_006576	GCTAGA	2	12	1053265	1053276	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	56750946
17043	NC_006576	ATTCA	2	10	1053321	1053330	40 %	40 %	0 %	20 %	56750946
17044	NC_006576	TCG	2	6	1053499	1053504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750947
17045	NC_006576	AGC	2	6	1053616	1053621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750947
17046	NC_006576	CAG	2	6	1053657	1053662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750947
17047	NC_006576	GCA	3	9	1053692	1053700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750947
17048	NC_006576	CGG	2	6	1053755	1053760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750947
17049	NC_006576	TGA	2	6	1053775	1053780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750947
17050	NC_006576	T	6	6	1053797	1053802	0 %	100 %	0 %	0 %	56750947
17051	NC_006576	T	6	6	1053812	1053817	0 %	100 %	0 %	0 %	56750947
17052	NC_006576	AAG	2	6	1053843	1053848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750947
17053	NC_006576	GCGATC	2	12	1054091	1054102	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56750947
17054	NC_006576	ACA	2	6	1054122	1054127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750947
17055	NC_006576	CAG	2	6	1054147	1054152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750947
17056	NC_006576	GCC	2	6	1054158	1054163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750947
17057	NC_006576	AGC	2	6	1054166	1054171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750947
17058	NC_006576	GGC	2	6	1054241	1054246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750947
17059	NC_006576	GCT	2	6	1054363	1054368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750947
17060	NC_006576	CCTA	2	8	1054392	1054399	25 %	25 %	0 %	50 %	56750947
17061	NC_006576	GCT	2	6	1054408	1054413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750947
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17063	NC_006576	GCT	2	6	1054523	1054528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750947
17064	NC_006576	GAC	2	6	1054582	1054587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750947
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17066	NC_006576	TGT	2	6	1054801	1054806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750948
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17069	NC_006576	GGGCT	2	10	1054902	1054911	0 %	20 %	60 %	20 %	56750948
17070	NC_006576	CAG	2	6	1054921	1054926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750948
17071	NC_006576	GAAT	2	8	1055021	1055028	50 %	25 %	25 %	0 %	56750948
17072	NC_006576	GAC	2	6	1055042	1055047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750948
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17077	NC_006576	TGC	2	6	1055248	1055253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750948
17078	NC_006576	A	6	6	1055325	1055330	100 %	0 %	0 %	0 %	56750948
17079	NC_006576	TGAC	2	8	1055344	1055351	25 %	25 %	25 %	25 %	56750948
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17083	NC_006576	GTCG	2	8	1055689	1055696	0 %	25 %	50 %	25 %	56750949
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17086	NC_006576	GCA	2	6	1055967	1055972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750949
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17088	NC_006576	AACC	2	8	1056180	1056187	50 %	0 %	0 %	50 %	56750949
17089	NC_006576	GCC	2	6	1056251	1056256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750949
17090	NC_006576	CAG	2	6	1056262	1056267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750949
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17098	NC_006576	CAG	3	9	1056664	1056672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750949
17099	NC_006576	TCC	2	6	1056686	1056691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56750949
17100	NC_006576	CGA	2	6	1056696	1056701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750949
17101	NC_006576	GCG	2	6	1056724	1056729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750949
17102	NC_006576	CGTT	2	8	1056886	1056893	0 %	50 %	25 %	25 %	56750950
17103	NC_006576	CGC	2	6	1056920	1056925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750950
17104	NC_006576	TAGC	2	8	1056931	1056938	25 %	25 %	25 %	25 %	56750950
17105	NC_006576	CGCC	2	8	1056942	1056949	0 %	0 %	25 %	75 %	56750950
17106	NC_006576	GAT	2	6	1056996	1057001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750950
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17108	NC_006576	CAA	2	6	1057030	1057035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750950
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17111	NC_006576	GC	3	6	1057157	1057162	0 %	0 %	50 %	50 %	56750950
17112	NC_006576	GAT	2	6	1057221	1057226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750950
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17114	NC_006576	CGG	2	6	1057298	1057303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750950
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17117	NC_006576	AGC	2	6	1057355	1057360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750950
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17119	NC_006576	AGC	2	6	1057441	1057446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750950
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17222	NC_006576	CCCG	2	8	1062622	1062629	0 %	0 %	25 %	75 %	56750955
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17231	NC_006576	GAT	2	6	1063089	1063094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750956
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17233	NC_006576	CCG	2	6	1063250	1063255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750956
17234	NC_006576	GATCG	2	10	1063269	1063278	20 %	20 %	40 %	20 %	56750956
17235	NC_006576	GCA	2	6	1063280	1063285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750956
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17238	NC_006576	GGCG	2	8	1063367	1063374	0 %	0 %	75 %	25 %	56750956
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17337	NC_006576	A	7	7	1069712	1069718	100 %	0 %	0 %	0 %	56750962
17338	NC_006576	TCA	2	6	1069735	1069740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750962
17339	NC_006576	TGC	2	6	1069809	1069814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750962
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17342	NC_006576	TTGG	2	8	1069963	1069970	0 %	50 %	50 %	0 %	56750962
17343	NC_006576	AGC	2	6	1069989	1069994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750962
17344	NC_006576	ACG	2	6	1070022	1070027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750962
17345	NC_006576	AC	3	6	1070035	1070040	50 %	0 %	0 %	50 %	56750962
17346	NC_006576	CGG	2	6	1070057	1070062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750962
17347	NC_006576	CAA	2	6	1070132	1070137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750962
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17350	NC_006576	GCA	2	6	1070236	1070241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750963
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