MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_006576	GCT	3	9	1013680	1013688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750917
16502	NC_006576	CCGCAC	2	12	1013756	1013767	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	56750917
16503	NC_006576	GCA	2	6	1013800	1013805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750917
16504	NC_006576	CTGG	2	8	1013869	1013876	0 %	25 %	50 %	25 %	56750917
16505	NC_006576	CAA	2	6	1013879	1013884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750917
16506	NC_006576	CAG	2	6	1013903	1013908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750917
16507	NC_006576	GTTG	2	8	1013922	1013929	0 %	50 %	50 %	0 %	56750917
16508	NC_006576	CTG	2	6	1013957	1013962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750917
16509	NC_006576	TTGA	2	8	1014050	1014057	25 %	50 %	25 %	0 %	56750917
16510	NC_006576	AGCAAT	2	12	1014069	1014080	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56750917
16511	NC_006576	ACA	2	6	1014165	1014170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750917
16512	NC_006576	GCG	2	6	1014187	1014192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750917
16513	NC_006576	CCA	2	6	1014199	1014204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750917
16514	NC_006576	AGC	2	6	1014300	1014305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750917
16515	NC_006576	GTT	2	6	1014334	1014339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750917
16516	NC_006576	GTT	2	6	1014346	1014351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750917
16517	NC_006576	GCC	2	6	1014413	1014418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750917
16518	NC_006576	ACCCG	2	10	1014429	1014438	20 %	0 %	20 %	60 %	56750917
16519	NC_006576	GC	3	6	1014468	1014473	0 %	0 %	50 %	50 %	56750917
16520	NC_006576	TCG	2	6	1014499	1014504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750917
16521	NC_006576	CCG	2	6	1014559	1014564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750917
16522	NC_006576	TTG	2	6	1014602	1014607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750917
16523	NC_006576	TAG	2	6	1014693	1014698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750918
16524	NC_006576	GTG	2	6	1014815	1014820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750918
16525	NC_006576	TGC	2	6	1014841	1014846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750918
16526	NC_006576	CTG	2	6	1014880	1014885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750918
16527	NC_006576	ATCA	2	8	1014953	1014960	50 %	25 %	0 %	25 %	56750918
16528	NC_006576	AGC	2	6	1014983	1014988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750918
16529	NC_006576	CTG	2	6	1015245	1015250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750919
16530	NC_006576	TTTG	2	8	1015269	1015276	0 %	75 %	25 %	0 %	56750919
16531	NC_006576	AAGC	2	8	1015353	1015360	50 %	0 %	25 %	25 %	56750919
16532	NC_006576	TGA	2	6	1015366	1015371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750919
16533	NC_006576	GCT	2	6	1015376	1015381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750919
16534	NC_006576	GGT	2	6	1015415	1015420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750919
16535	NC_006576	TTGG	2	8	1015523	1015530	0 %	50 %	50 %	0 %	56750919
16536	NC_006576	CGA	2	6	1015532	1015537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750919
16537	NC_006576	CGATCG	2	12	1015562	1015573	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56750919
16538	NC_006576	CAG	2	6	1015577	1015582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750919
16539	NC_006576	CTG	2	6	1015797	1015802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750919
16540	NC_006576	GCC	2	6	1015803	1015808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750919
16541	NC_006576	TGC	2	6	1015822	1015827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750919
16542	NC_006576	CAA	2	6	1015838	1015843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750919
16543	NC_006576	GCA	2	6	1015868	1015873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750919
16544	NC_006576	CGC	2	6	1015914	1015919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750919
16545	NC_006576	TGAA	2	8	1015963	1015970	50 %	25 %	25 %	0 %	56750919
16546	NC_006576	GAG	2	6	1015992	1015997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56750919
16547	NC_006576	CGC	2	6	1016004	1016009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750919
16548	NC_006576	CGG	2	6	1016131	1016136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750919
16549	NC_006576	CAA	2	6	1016211	1016216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750919
16550	NC_006576	CAA	2	6	1016253	1016258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750919
16551	NC_006576	ATC	2	6	1016307	1016312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750919
16552	NC_006576	GCG	2	6	1016347	1016352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750919
16553	NC_006576	GCA	2	6	1016503	1016508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750919
16554	NC_006576	CGC	2	6	1016511	1016516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750919
16555	NC_006576	CCTC	2	8	1016584	1016591	0 %	25 %	0 %	75 %	56750919
16556	NC_006576	GAC	2	6	1016630	1016635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750919
16557	NC_006576	CCCAA	2	10	1016671	1016680	40 %	0 %	0 %	60 %	56750919
16558	NC_006576	TGCCC	2	10	1016756	1016765	0 %	20 %	20 %	60 %	56750919
16559	NC_006576	GCGATC	2	12	1016793	1016804	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56750919
16560	NC_006576	CTG	2	6	1016859	1016864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750919
16561	NC_006576	CGC	2	6	1016909	1016914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750920
16562	NC_006576	GAT	2	6	1016934	1016939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750920
16563	NC_006576	CGC	2	6	1016970	1016975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750920
16564	NC_006576	CTG	2	6	1016997	1017002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750920
16565	NC_006576	TC	3	6	1017003	1017008	0 %	50 %	0 %	50 %	56750920
16566	NC_006576	CCG	2	6	1017061	1017066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750920
16567	NC_006576	CAA	2	6	1017075	1017080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750920
16568	NC_006576	GGCT	2	8	1017085	1017092	0 %	25 %	50 %	25 %	56750920
16569	NC_006576	CCGC	2	8	1017159	1017166	0 %	0 %	25 %	75 %	56750920
16570	NC_006576	C	7	7	1017346	1017352	0 %	0 %	0 %	100 %	56750920
16571	NC_006576	GGCCT	2	10	1017525	1017534	0 %	20 %	40 %	40 %	56750921
16572	NC_006576	GCG	2	6	1017585	1017590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750921
16573	NC_006576	CAG	2	6	1017686	1017691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750921
16574	NC_006576	ACC	2	6	1017723	1017728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750921
16575	NC_006576	ATG	2	6	1017755	1017760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750921
16576	NC_006576	GTT	2	6	1017823	1017828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750921
16577	NC_006576	GC	3	6	1017838	1017843	0 %	0 %	50 %	50 %	56750921
16578	NC_006576	GAT	2	6	1017848	1017853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750921
16579	NC_006576	GGC	2	6	1017868	1017873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750921
16580	NC_006576	CGA	2	6	1017900	1017905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750921
16581	NC_006576	TGG	2	6	1017906	1017911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750921
16582	NC_006576	CGC	2	6	1017973	1017978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750921
16583	NC_006576	TGGC	2	8	1018155	1018162	0 %	25 %	50 %	25 %	56750921
16584	NC_006576	GGC	2	6	1018172	1018177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750921
16585	NC_006576	GAA	2	6	1018184	1018189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750921
16586	NC_006576	CCA	2	6	1018257	1018262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750921
16587	NC_006576	CTA	2	6	1018372	1018377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750921
16588	NC_006576	GCA	2	6	1018403	1018408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750921
16589	NC_006576	CG	3	6	1018519	1018524	0 %	0 %	50 %	50 %	56750921
16590	NC_006576	GGCT	2	8	1018532	1018539	0 %	25 %	50 %	25 %	56750921
16591	NC_006576	AGC	2	6	1018554	1018559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750921
16592	NC_006576	CTG	2	6	1018760	1018765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750922
16593	NC_006576	GCCATG	2	12	1018790	1018801	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56750922
16594	NC_006576	GAT	2	6	1018802	1018807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750922
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16596	NC_006576	GGGCGG	2	12	1018925	1018936	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	56750922
16597	NC_006576	GTT	2	6	1018941	1018946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750922
16598	NC_006576	GGCGGG	2	12	1018953	1018964	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	56750922
16599	NC_006576	CTG	2	6	1019234	1019239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750922
16600	NC_006576	CGC	2	6	1019244	1019249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750922
16601	NC_006576	ACC	2	6	1019250	1019255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750922
16602	NC_006576	CTT	2	6	1019302	1019307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750922
16603	NC_006576	GCT	2	6	1019308	1019313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750922
16604	NC_006576	CAA	2	6	1019390	1019395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750922
16605	NC_006576	AGC	2	6	1019399	1019404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750922
16606	NC_006576	GGC	2	6	1019405	1019410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750922
16607	NC_006576	CTTCT	2	10	1019414	1019423	0 %	60 %	0 %	40 %	56750922
16608	NC_006576	ATCGCG	2	12	1019468	1019479	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56750922
16609	NC_006576	CTG	2	6	1019515	1019520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750922
16610	NC_006576	GA	3	6	1019596	1019601	50 %	0 %	50 %	0 %	56750922
16611	NC_006576	CGT	2	6	1019681	1019686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750922
16612	NC_006576	CGA	2	6	1019838	1019843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750922
16613	NC_006576	TGC	2	6	1019871	1019876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750922
16614	NC_006576	CGGG	2	8	1019940	1019947	0 %	0 %	75 %	25 %	56750922
16615	NC_006576	GC	4	8	1019961	1019968	0 %	0 %	50 %	50 %	56750922
16616	NC_006576	CCG	2	6	1020012	1020017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750922
16617	NC_006576	CCA	2	6	1020037	1020042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750922
16618	NC_006576	CAC	2	6	1020077	1020082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750922
16619	NC_006576	AGC	2	6	1020114	1020119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750922
16620	NC_006576	GCT	2	6	1020155	1020160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750922
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16623	NC_006576	CTCA	2	8	1020284	1020291	25 %	25 %	0 %	50 %	56750922
16624	NC_006576	GCC	2	6	1020295	1020300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750922
16625	NC_006576	CTT	2	6	1020319	1020324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750922
16626	NC_006576	TCG	2	6	1020326	1020331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750922
16627	NC_006576	CG	3	6	1020370	1020375	0 %	0 %	50 %	50 %	56750922
16628	NC_006576	GCA	2	6	1020457	1020462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750922
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16630	NC_006576	GCA	2	6	1020520	1020525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750922
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16632	NC_006576	CTG	2	6	1020644	1020649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750922
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16648	NC_006576	ATTA	2	8	1021583	1021590	50 %	50 %	0 %	0 %	56750923
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16719	NC_006576	A	7	7	1025231	1025237	100 %	0 %	0 %	0 %	56750926
16720	NC_006576	GAAT	2	8	1025374	1025381	50 %	25 %	25 %	0 %	56750926
16721	NC_006576	TGCAG	2	10	1025400	1025409	20 %	20 %	40 %	20 %	56750926
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16724	NC_006576	TGAT	2	8	1025572	1025579	25 %	50 %	25 %	0 %	56750927
16725	NC_006576	GCG	2	6	1025699	1025704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750927
16726	NC_006576	T	6	6	1025747	1025752	0 %	100 %	0 %	0 %	56750927
16727	NC_006576	GCTG	2	8	1025763	1025770	0 %	25 %	50 %	25 %	56750927
16728	NC_006576	TGG	2	6	1025878	1025883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750927
16729	NC_006576	TTAT	2	8	1025913	1025920	25 %	75 %	0 %	0 %	56750927
16730	NC_006576	GCA	2	6	1025990	1025995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750927
16731	NC_006576	GCCA	2	8	1026147	1026154	25 %	0 %	25 %	50 %	56750927
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16733	NC_006576	GCA	2	6	1026168	1026173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750927
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