MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_006576	CAG	2	6	927599	927604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750837
15002	NC_006576	CG	3	6	927641	927646	0 %	0 %	50 %	50 %	56750838
15003	NC_006576	GAA	2	6	927678	927683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750838
15004	NC_006576	GACA	2	8	927749	927756	50 %	0 %	25 %	25 %	56750838
15005	NC_006576	CTA	2	6	927864	927869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750838
15006	NC_006576	CCA	2	6	927891	927896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750838
15007	NC_006576	AGCCA	2	10	927950	927959	40 %	0 %	20 %	40 %	56750838
15008	NC_006576	TGCCA	2	10	927966	927975	20 %	20 %	20 %	40 %	56750838
15009	NC_006576	CAG	2	6	928062	928067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750838
15010	NC_006576	A	6	6	928220	928225	100 %	0 %	0 %	0 %	56750839
15011	NC_006576	AGC	2	6	928271	928276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750839
15012	NC_006576	GAA	2	6	928369	928374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750839
15013	NC_006576	GGC	2	6	928375	928380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750839
15014	NC_006576	CCG	2	6	928394	928399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750839
15015	NC_006576	CCA	2	6	928421	928426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750839
15016	NC_006576	TGTC	2	8	928467	928474	0 %	50 %	25 %	25 %	56750839
15017	NC_006576	ATC	2	6	928504	928509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750839
15018	NC_006576	CG	3	6	928517	928522	0 %	0 %	50 %	50 %	56750839
15019	NC_006576	CAAT	2	8	928537	928544	50 %	25 %	0 %	25 %	56750839
15020	NC_006576	TGT	2	6	928595	928600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750839
15021	NC_006576	CGA	2	6	928608	928613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750839
15022	NC_006576	TGG	2	6	928643	928648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750839
15023	NC_006576	CGAT	2	8	928649	928656	25 %	25 %	25 %	25 %	56750839
15024	NC_006576	AGC	2	6	928665	928670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750839
15025	NC_006576	GCG	2	6	928715	928720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750839
15026	NC_006576	GCT	2	6	928725	928730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750839
15027	NC_006576	CT	3	6	928732	928737	0 %	50 %	0 %	50 %	56750839
15028	NC_006576	GCA	2	6	928756	928761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750839
15029	NC_006576	AGC	2	6	928791	928796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750839
15030	NC_006576	TAA	2	6	928851	928856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56750839
15031	NC_006576	CTG	2	6	928903	928908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750839
15032	NC_006576	CCA	2	6	928934	928939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750839
15033	NC_006576	GGC	2	6	928975	928980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750839
15034	NC_006576	CCG	2	6	929036	929041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750839
15035	NC_006576	TTCGC	2	10	929148	929157	0 %	40 %	20 %	40 %	56750840
15036	NC_006576	CAG	2	6	929213	929218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750840
15037	NC_006576	GGC	2	6	929418	929423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750841
15038	NC_006576	GGGTT	2	10	929487	929496	0 %	40 %	60 %	0 %	56750841
15039	NC_006576	GGCA	2	8	929533	929540	25 %	0 %	50 %	25 %	56750841
15040	NC_006576	CTC	2	6	929576	929581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56750841
15041	NC_006576	GA	3	6	929598	929603	50 %	0 %	50 %	0 %	56750841
15042	NC_006576	CGA	2	6	929626	929631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750841
15043	NC_006576	GCC	2	6	929654	929659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750841
15044	NC_006576	TCA	2	6	929665	929670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750841
15045	NC_006576	GCC	2	6	929675	929680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750841
15046	NC_006576	GTC	2	6	930152	930157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750842
15047	NC_006576	GAC	2	6	930171	930176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750842
15048	NC_006576	GGC	2	6	930288	930293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750842
15049	NC_006576	CCG	2	6	930372	930377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750842
15050	NC_006576	CTG	2	6	930437	930442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750842
15051	NC_006576	GCA	2	6	930449	930454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750842
15052	NC_006576	TCT	2	6	930562	930567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750842
15053	NC_006576	GCTTCG	2	12	930570	930581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750842
15054	NC_006576	CAC	2	6	930722	930727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750842
15055	NC_006576	TCG	2	6	930750	930755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750842
15056	NC_006576	C	6	6	930782	930787	0 %	0 %	0 %	100 %	56750842
15057	NC_006576	GCA	2	6	930848	930853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750842
15058	NC_006576	TCT	2	6	930855	930860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750842
15059	NC_006576	GCT	2	6	930863	930868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750842
15060	NC_006576	CCG	2	6	930976	930981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750842
15061	NC_006576	CTT	2	6	931008	931013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750842
15062	NC_006576	GGCT	2	8	931136	931143	0 %	25 %	50 %	25 %	56750842
15063	NC_006576	CGTC	2	8	931186	931193	0 %	25 %	25 %	50 %	56750842
15064	NC_006576	CTT	2	6	931204	931209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750842
15065	NC_006576	TGAC	2	8	931230	931237	25 %	25 %	25 %	25 %	56750842
15066	NC_006576	CGT	2	6	931271	931276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750842
15067	NC_006576	CGG	2	6	931327	931332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750842
15068	NC_006576	GAA	2	6	931372	931377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750842
15069	NC_006576	GT	3	6	931443	931448	0 %	50 %	50 %	0 %	56750842
15070	NC_006576	CGC	2	6	931458	931463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750842
15071	NC_006576	TGCTC	2	10	931495	931504	0 %	40 %	20 %	40 %	56750842
15072	NC_006576	TTC	2	6	931505	931510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750842
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15074	NC_006576	TTC	2	6	931776	931781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750843
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15077	NC_006576	GCG	2	6	932104	932109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750844
15078	NC_006576	ACC	2	6	932144	932149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750844
15079	NC_006576	TGC	2	6	932226	932231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750844
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15081	NC_006576	TCAGC	2	10	932267	932276	20 %	20 %	20 %	40 %	56750844
15082	NC_006576	TCG	2	6	932289	932294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750844
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15085	NC_006576	TGA	2	6	932485	932490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750844
15086	NC_006576	CAG	2	6	932505	932510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750844
15087	NC_006576	CA	3	6	932819	932824	50 %	0 %	0 %	50 %	56750845
15088	NC_006576	GCC	2	6	932868	932873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750845
15089	NC_006576	CGT	2	6	932915	932920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750845
15090	NC_006576	GCA	2	6	932979	932984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750845
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15092	NC_006576	TTC	2	6	933037	933042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750845
15093	NC_006576	CCG	2	6	933113	933118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750845
15094	NC_006576	CCA	2	6	933196	933201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750845
15095	NC_006576	CGG	2	6	933206	933211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750845
15096	NC_006576	TGG	2	6	933289	933294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750845
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15098	NC_006576	GTC	3	9	933408	933416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750845
15099	NC_006576	CA	3	6	933520	933525	50 %	0 %	0 %	50 %	56750845
15100	NC_006576	TCAATG	2	12	933532	933543	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	56750845
15101	NC_006576	AAGTCA	2	12	933547	933558	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56750845
15102	NC_006576	GAA	2	6	933669	933674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750845
15103	NC_006576	GCT	2	6	933678	933683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750845
15104	NC_006576	CAGCG	2	10	933862	933871	20 %	0 %	40 %	40 %	56750846
15105	NC_006576	CGAC	2	8	934004	934011	25 %	0 %	25 %	50 %	56750846
15106	NC_006576	TGC	2	6	934095	934100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750846
15107	NC_006576	TCG	2	6	934167	934172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750846
15108	NC_006576	GCT	2	6	934198	934203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750846
15109	NC_006576	GCT	2	6	934233	934238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750846
15110	NC_006576	TCA	2	6	934320	934325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750846
15111	NC_006576	TCG	2	6	934362	934367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750846
15112	NC_006576	GCT	2	6	934387	934392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750846
15113	NC_006576	CTGT	2	8	934400	934407	0 %	50 %	25 %	25 %	56750846
15114	NC_006576	CAG	2	6	934408	934413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750846
15115	NC_006576	CCG	2	6	934433	934438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750846
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15118	NC_006576	GCT	2	6	934855	934860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750847
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15120	NC_006576	ACG	2	6	934891	934896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750847
15121	NC_006576	CTT	2	6	934897	934902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750847
15122	NC_006576	CTC	2	6	934943	934948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56750847
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15124	NC_006576	AAT	2	6	935036	935041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56750847
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15149	NC_006576	AGTT	2	8	937122	937129	25 %	50 %	25 %	0 %	56750850
15150	NC_006576	TCA	2	6	937146	937151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750850
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15152	NC_006576	CCCG	2	8	937206	937213	0 %	0 %	25 %	75 %	56750851
15153	NC_006576	TGC	2	6	937352	937357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750851
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15234	NC_006576	TGGCC	2	10	942378	942387	0 %	20 %	40 %	40 %	56750854
15235	NC_006576	ACCA	2	8	942403	942410	50 %	0 %	0 %	50 %	56750854
15236	NC_006576	TGA	2	6	942423	942428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750854
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15238	NC_006576	GT	3	6	942546	942551	0 %	50 %	50 %	0 %	56750854
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15241	NC_006576	GCC	2	6	942680	942685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750854
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15361	NC_006576	AGC	2	6	949710	949715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750862
15362	NC_006576	ACC	2	6	949769	949774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750862
15363	NC_006576	CGA	2	6	949840	949845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750862
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15462	NC_006576	CGAT	2	8	955952	955959	25 %	25 %	25 %	25 %	56750869
15463	NC_006576	CTG	2	6	956055	956060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750869
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15468	NC_006576	CGC	2	6	956332	956337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750869
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15472	NC_006576	TCT	2	6	956738	956743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750870
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