MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_006576	CGT	2	6	801961	801966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750724
13002	NC_006576	GGT	2	6	801982	801987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750724
13003	NC_006576	A	6	6	802113	802118	100 %	0 %	0 %	0 %	56750724
13004	NC_006576	AGT	2	6	802166	802171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750724
13005	NC_006576	CAG	2	6	802218	802223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750724
13006	NC_006576	GC	3	6	802272	802277	0 %	0 %	50 %	50 %	56750724
13007	NC_006576	TGG	2	6	802345	802350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750724
13008	NC_006576	GA	3	6	802375	802380	50 %	0 %	50 %	0 %	56750724
13009	NC_006576	AGC	2	6	802387	802392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750724
13010	NC_006576	CAG	2	6	802398	802403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750724
13011	NC_006576	GCG	2	6	802419	802424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750724
13012	NC_006576	CAGCA	2	10	802590	802599	40 %	0 %	20 %	40 %	56750724
13013	NC_006576	CCG	2	6	802736	802741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750725
13014	NC_006576	CAG	2	6	802850	802855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750725
13015	NC_006576	CCA	2	6	802931	802936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750725
13016	NC_006576	AACAA	2	10	803003	803012	80 %	0 %	0 %	20 %	56750725
13017	NC_006576	CGC	2	6	803151	803156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750725
13018	NC_006576	AATA	2	8	803162	803169	75 %	25 %	0 %	0 %	56750725
13019	NC_006576	CAC	2	6	803205	803210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750725
13020	NC_006576	GGC	2	6	803271	803276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750725
13021	NC_006576	AAG	2	6	803324	803329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750725
13022	NC_006576	GTT	2	6	803334	803339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750725
13023	NC_006576	CTG	2	6	803353	803358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750725
13024	NC_006576	CAT	2	6	803364	803369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750725
13025	NC_006576	CGTCAC	2	12	803431	803442	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	56750725
13026	NC_006576	AGC	3	9	803444	803452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750725
13027	NC_006576	ACA	2	6	803456	803461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750725
13028	NC_006576	AAT	2	6	803473	803478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56750725
13029	NC_006576	CAG	2	6	803488	803493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750725
13030	NC_006576	TGC	2	6	803554	803559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750725
13031	NC_006576	GA	3	6	803561	803566	50 %	0 %	50 %	0 %	56750725
13032	NC_006576	CAG	2	6	803602	803607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750725
13033	NC_006576	CA	3	6	803608	803613	50 %	0 %	0 %	50 %	56750725
13034	NC_006576	AAG	2	6	803644	803649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750725
13035	NC_006576	ATG	2	6	803666	803671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750725
13036	NC_006576	TCA	2	6	803694	803699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750725
13037	NC_006576	TAG	2	6	803780	803785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750726
13038	NC_006576	TGA	2	6	803811	803816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750726
13039	NC_006576	CAC	2	6	803839	803844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750726
13040	NC_006576	AAC	2	6	803847	803852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750726
13041	NC_006576	GAT	2	6	803863	803868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750726
13042	NC_006576	CAG	2	6	803953	803958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750726
13043	NC_006576	GCC	2	6	804045	804050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750726
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13045	NC_006576	CGGT	2	8	804246	804253	0 %	25 %	50 %	25 %	56750726
13046	NC_006576	CGC	2	6	804418	804423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750726
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13048	NC_006576	GAT	2	6	804511	804516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750726
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13050	NC_006576	TGC	2	6	804596	804601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750726
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13052	NC_006576	ATCG	2	8	804679	804686	25 %	25 %	25 %	25 %	56750726
13053	NC_006576	GCA	2	6	804705	804710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750726
13054	NC_006576	GCA	2	6	804750	804755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750726
13055	NC_006576	CAG	2	6	804769	804774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750726
13056	NC_006576	GC	3	6	804794	804799	0 %	0 %	50 %	50 %	56750726
13057	NC_006576	CTGA	2	8	804875	804882	25 %	25 %	25 %	25 %	56750727
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13059	NC_006576	GTTG	2	8	805006	805013	0 %	50 %	50 %	0 %	56750727
13060	NC_006576	GTA	2	6	805025	805030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750727
13061	NC_006576	TAG	2	6	805044	805049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750727
13062	NC_006576	CTG	2	6	805050	805055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750727
13063	NC_006576	CTG	2	6	805070	805075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750727
13064	NC_006576	AGT	2	6	805111	805116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750727
13065	NC_006576	CTGCAG	2	12	805211	805222	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56750727
13066	NC_006576	TCAA	2	8	805224	805231	50 %	25 %	0 %	25 %	56750727
13067	NC_006576	TGC	2	6	805242	805247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750727
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13071	NC_006576	TAA	2	6	805557	805562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56750727
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13074	NC_006576	AGT	2	6	805753	805758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750727
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13078	NC_006576	CAG	2	6	805901	805906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750727
13079	NC_006576	GGC	2	6	806005	806010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750727
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13087	NC_006576	CCA	2	6	806329	806334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750727
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13090	NC_006576	GACGCA	2	12	806380	806391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750727
13091	NC_006576	CGCTG	2	10	806504	806513	0 %	20 %	40 %	40 %	56750728
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13101	NC_006576	TTGC	2	8	807434	807441	0 %	50 %	25 %	25 %	56750729
13102	NC_006576	CGC	2	6	807467	807472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750729
13103	NC_006576	GA	3	6	807529	807534	50 %	0 %	50 %	0 %	56750729
13104	NC_006576	CTC	2	6	807540	807545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56750729
13105	NC_006576	GCT	2	6	807648	807653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750730
13106	NC_006576	TGC	2	6	807825	807830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750730
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13109	NC_006576	ATCG	2	8	808278	808285	25 %	25 %	25 %	25 %	56750731
13110	NC_006576	CT	3	6	808301	808306	0 %	50 %	0 %	50 %	56750731
13111	NC_006576	CAT	2	6	808373	808378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750731
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13117	NC_006576	TCT	2	6	808881	808886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750732
13118	NC_006576	CAG	2	6	808911	808916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750732
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13120	NC_006576	TGA	2	6	809060	809065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750732
13121	NC_006576	TAA	2	6	809073	809078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56750732
13122	NC_006576	AAAT	2	8	809124	809131	75 %	25 %	0 %	0 %	56750732
13123	NC_006576	TTG	2	6	809144	809149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750732
13124	NC_006576	CAGA	2	8	809248	809255	50 %	0 %	25 %	25 %	56750732
13125	NC_006576	CTG	2	6	809287	809292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750732
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13131	NC_006576	AC	3	6	809470	809475	50 %	0 %	0 %	50 %	56750732
13132	NC_006576	TGC	2	6	809532	809537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750732
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13226	NC_006576	CCACC	2	10	814620	814629	20 %	0 %	0 %	80 %	56750737
13227	NC_006576	CAAC	2	8	814636	814643	50 %	0 %	0 %	50 %	56750737
13228	NC_006576	AGCC	2	8	814683	814690	25 %	0 %	25 %	50 %	56750737
13229	NC_006576	TGC	2	6	814715	814720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750737
13230	NC_006576	A	7	7	814820	814826	100 %	0 %	0 %	0 %	56750737
13231	NC_006576	CAC	2	6	814919	814924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750737
13232	NC_006576	CTCA	2	8	814952	814959	25 %	25 %	0 %	50 %	56750737
13233	NC_006576	GGC	2	6	814976	814981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750737
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13235	NC_006576	GAAAC	2	10	815032	815041	60 %	0 %	20 %	20 %	56750737
13236	NC_006576	CAG	2	6	815102	815107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750737
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13238	NC_006576	AAC	2	6	815165	815170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750737
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13479	NC_006576	ATC	2	6	832488	832493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750754
13480	NC_006576	GGCT	2	8	832500	832507	0 %	25 %	50 %	25 %	56750754
13481	NC_006576	CAG	2	6	832524	832529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750754
13482	NC_006576	TTGC	2	8	832552	832559	0 %	50 %	25 %	25 %	56750754
13483	NC_006576	T	6	6	832669	832674	0 %	100 %	0 %	0 %	56750754
13484	NC_006576	CGG	2	6	832733	832738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750754
13485	NC_006576	CCA	2	6	832878	832883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750754
13486	NC_006576	G	7	7	832886	832892	0 %	0 %	100 %	0 %	56750754
13487	NC_006576	TCC	2	6	832906	832911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56750754
13488	NC_006576	CTT	2	6	832915	832920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750754
13489	NC_006576	CGT	2	6	832964	832969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750754
13490	NC_006576	CAG	2	6	832999	833004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750754
13491	NC_006576	AGC	2	6	833008	833013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750754
13492	NC_006576	GCA	2	6	833015	833020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750754
13493	NC_006576	GCA	2	6	833068	833073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750754
13494	NC_006576	GCA	2	6	833203	833208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750754
13495	NC_006576	CCG	2	6	833212	833217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750754
13496	NC_006576	TCGG	2	8	833251	833258	0 %	25 %	50 %	25 %	56750754
13497	NC_006576	CT	3	6	833341	833346	0 %	50 %	0 %	50 %	56750754
13498	NC_006576	GCC	2	6	833352	833357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750754
13499	NC_006576	CTG	2	6	833382	833387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750754
13500	NC_006576	CAT	2	6	833399	833404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750754

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