MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_006576	CGA	2	6	679648	679653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750617
11002	NC_006576	A	6	6	679669	679674	100 %	0 %	0 %	0 %	56750617
11003	NC_006576	CGG	2	6	679727	679732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750617
11004	NC_006576	TCGC	2	8	679800	679807	0 %	25 %	25 %	50 %	56750617
11005	NC_006576	T	6	6	679932	679937	0 %	100 %	0 %	0 %	56750618
11006	NC_006576	TCAAGC	2	12	680014	680025	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	56750618
11007	NC_006576	TC	3	6	680042	680047	0 %	50 %	0 %	50 %	56750618
11008	NC_006576	CAA	2	6	680061	680066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750618
11009	NC_006576	GCGATC	2	12	680089	680100	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56750618
11010	NC_006576	GCA	2	6	680114	680119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750618
11011	NC_006576	G	6	6	680146	680151	0 %	0 %	100 %	0 %	56750618
11012	NC_006576	GCC	2	6	680223	680228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750618
11013	NC_006576	TGC	2	6	680236	680241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750618
11014	NC_006576	TCAGTC	2	12	680245	680256	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	56750618
11015	NC_006576	TGA	2	6	680258	680263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750618
11016	NC_006576	CTGA	2	8	680389	680396	25 %	25 %	25 %	25 %	56750618
11017	NC_006576	CGC	2	6	680537	680542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750619
11018	NC_006576	CCG	2	6	680578	680583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750619
11019	NC_006576	GCA	2	6	680799	680804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750619
11020	NC_006576	GTT	2	6	680820	680825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750619
11021	NC_006576	CGC	2	6	680827	680832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750619
11022	NC_006576	GCT	2	6	680865	680870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750619
11023	NC_006576	TCG	2	6	680878	680883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750619
11024	NC_006576	GA	3	6	680899	680904	50 %	0 %	50 %	0 %	56750619
11025	NC_006576	AAG	2	6	680913	680918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750619
11026	NC_006576	GCC	3	9	680952	680960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750619
11027	NC_006576	GCC	2	6	681120	681125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750619
11028	NC_006576	GTA	2	6	681137	681142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750619
11029	NC_006576	GTC	2	6	681198	681203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750619
11030	NC_006576	GTA	2	6	681245	681250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750619
11031	NC_006576	A	6	6	681250	681255	100 %	0 %	0 %	0 %	56750619
11032	NC_006576	C	7	7	681288	681294	0 %	0 %	0 %	100 %	56750619
11033	NC_006576	CGC	2	6	681329	681334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750619
11034	NC_006576	TGC	2	6	681372	681377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750619
11035	NC_006576	CAG	2	6	681449	681454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750619
11036	NC_006576	GCC	3	9	681465	681473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750619
11037	NC_006576	ACTT	2	8	681612	681619	25 %	50 %	0 %	25 %	56750619
11038	NC_006576	CGCT	2	8	681642	681649	0 %	25 %	25 %	50 %	56750620
11039	NC_006576	TGC	2	6	681681	681686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750620
11040	NC_006576	AGC	2	6	681756	681761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750620
11041	NC_006576	GCT	2	6	681778	681783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750620
11042	NC_006576	CCT	2	6	681796	681801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56750620
11043	NC_006576	CAAC	2	8	681871	681878	50 %	0 %	0 %	50 %	56750620
11044	NC_006576	GCC	2	6	681914	681919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750620
11045	NC_006576	GCC	2	6	681968	681973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750620
11046	NC_006576	GCCA	2	8	682004	682011	25 %	0 %	25 %	50 %	56750620
11047	NC_006576	TGG	2	6	682123	682128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750620
11048	NC_006576	T	7	7	682201	682207	0 %	100 %	0 %	0 %	56750620
11049	NC_006576	TTC	2	6	682253	682258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750620
11050	NC_006576	CGAG	2	8	682435	682442	25 %	0 %	50 %	25 %	56750621
11051	NC_006576	GCTG	2	8	682457	682464	0 %	25 %	50 %	25 %	56750621
11052	NC_006576	CGC	2	6	682512	682517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750621
11053	NC_006576	C	6	6	682650	682655	0 %	0 %	0 %	100 %	56750621
11054	NC_006576	CCGC	2	8	682759	682766	0 %	0 %	25 %	75 %	56750621
11055	NC_006576	AAT	2	6	682784	682789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56750621
11056	NC_006576	GAA	2	6	682822	682827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750621
11057	NC_006576	GCG	2	6	683086	683091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750622
11058	NC_006576	GCGATC	2	12	683102	683113	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56750622
11059	NC_006576	C	7	7	683139	683145	0 %	0 %	0 %	100 %	56750622
11060	NC_006576	CTG	2	6	683156	683161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750622
11061	NC_006576	CCAAA	2	10	683185	683194	60 %	0 %	0 %	40 %	56750622
11062	NC_006576	CAC	2	6	683207	683212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750622
11063	NC_006576	GCC	2	6	683233	683238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750622
11064	NC_006576	ATTG	2	8	683254	683261	25 %	50 %	25 %	0 %	56750622
11065	NC_006576	CAG	2	6	683311	683316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750622
11066	NC_006576	AAG	2	6	683390	683395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750622
11067	NC_006576	ACCG	2	8	683405	683412	25 %	0 %	25 %	50 %	56750622
11068	NC_006576	CGC	2	6	683420	683425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750622
11069	NC_006576	CAG	2	6	683450	683455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750622
11070	NC_006576	ATCG	2	8	683471	683478	25 %	25 %	25 %	25 %	56750622
11071	NC_006576	AGC	2	6	683574	683579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750622
11072	NC_006576	CCG	2	6	683920	683925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750623
11073	NC_006576	CCA	2	6	683985	683990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750623
11074	NC_006576	TGA	2	6	684001	684006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750623
11075	NC_006576	ACA	2	6	684033	684038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750623
11076	NC_006576	TTC	2	6	684065	684070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750623
11077	NC_006576	GGT	2	6	684117	684122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750623
11078	NC_006576	TGCC	2	8	684139	684146	0 %	25 %	25 %	50 %	56750623
11079	NC_006576	TTC	2	6	684176	684181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750623
11080	NC_006576	GCA	2	6	684220	684225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750623
11081	NC_006576	GGA	2	6	684295	684300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56750623
11082	NC_006576	C	6	6	684407	684412	0 %	0 %	0 %	100 %	56750623
11083	NC_006576	ACG	2	6	684480	684485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750623
11084	NC_006576	GT	3	6	684523	684528	0 %	50 %	50 %	0 %	56750623
11085	NC_006576	TGA	2	6	684580	684585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750623
11086	NC_006576	ATCG	2	8	684611	684618	25 %	25 %	25 %	25 %	56750623
11087	NC_006576	AGG	2	6	684673	684678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56750623
11088	NC_006576	GTT	2	6	684773	684778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750623
11089	NC_006576	GCC	2	6	684779	684784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750623
11090	NC_006576	CAG	2	6	684847	684852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750623
11091	NC_006576	GAC	2	6	684887	684892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750623
11092	NC_006576	GGTCG	2	10	684902	684911	0 %	20 %	60 %	20 %	56750623
11093	NC_006576	CCTT	2	8	685011	685018	0 %	50 %	0 %	50 %	56750623
11094	NC_006576	ACGA	2	8	685112	685119	50 %	0 %	25 %	25 %	56750623
11095	NC_006576	CCA	2	6	685189	685194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750623
11096	NC_006576	ATC	2	6	685286	685291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750623
11097	NC_006576	GAG	2	6	685532	685537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56750623
11098	NC_006576	CTG	2	6	686177	686182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750624
11099	NC_006576	GGC	2	6	686191	686196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750624
11100	NC_006576	GCA	2	6	686305	686310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750624
11101	NC_006576	AGC	2	6	686327	686332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750624
11102	NC_006576	CAG	2	6	686396	686401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750624
11103	NC_006576	CAT	2	6	686416	686421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750624
11104	NC_006576	TTGC	2	8	686480	686487	0 %	50 %	25 %	25 %	56750624
11105	NC_006576	CGG	2	6	686497	686502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750624
11106	NC_006576	CAC	3	9	686513	686521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750624
11107	NC_006576	CCTG	2	8	686598	686605	0 %	25 %	25 %	50 %	56750624
11108	NC_006576	ATC	2	6	686732	686737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750624
11109	NC_006576	GTC	2	6	686853	686858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750625
11110	NC_006576	CCG	3	9	686920	686928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750625
11111	NC_006576	CG	3	6	686964	686969	0 %	0 %	50 %	50 %	56750625
11112	NC_006576	GC	3	6	687005	687010	0 %	0 %	50 %	50 %	56750625
11113	NC_006576	AGC	2	6	687018	687023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750625
11114	NC_006576	GTTCT	2	10	687056	687065	0 %	60 %	20 %	20 %	56750625
11115	NC_006576	TGCC	2	8	687128	687135	0 %	25 %	25 %	50 %	56750625
11116	NC_006576	CGC	2	6	687194	687199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750625
11117	NC_006576	TGC	2	6	687309	687314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750625
11118	NC_006576	AGA	2	6	687420	687425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750625
11119	NC_006576	GCG	3	9	687453	687461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750625
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11121	NC_006576	TGC	2	6	687612	687617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750625
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11230	NC_006576	CT	5	10	693436	693445	0 %	50 %	0 %	50 %	56750630
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11236	NC_006576	CAA	3	9	694303	694311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750632
11237	NC_006576	GCA	2	6	694321	694326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750632
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11358	NC_006576	GGC	2	6	701741	701746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750640
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11482	NC_006576	ATG	2	6	709740	709745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750647
11483	NC_006576	CTT	2	6	709748	709753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750647
11484	NC_006576	TGA	2	6	709792	709797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750647
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11487	NC_006576	ATCA	2	8	709997	710004	50 %	25 %	0 %	25 %	56750647
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