MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_006576	GGC	2	6	620863	620868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750561
10002	NC_006576	GCA	2	6	620880	620885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750561
10003	NC_006576	AGC	2	6	620892	620897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750561
10004	NC_006576	GCT	2	6	620903	620908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750561
10005	NC_006576	GTCC	2	8	620958	620965	0 %	25 %	25 %	50 %	56750561
10006	NC_006576	GCT	2	6	621170	621175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750562
10007	NC_006576	CT	3	6	621174	621179	0 %	50 %	0 %	50 %	56750562
10008	NC_006576	GCG	2	6	621223	621228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750562
10009	NC_006576	CAG	2	6	621254	621259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750562
10010	NC_006576	GGGATG	2	12	621374	621385	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	56750562
10011	NC_006576	CTC	2	6	621457	621462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56750562
10012	NC_006576	TGA	2	6	621469	621474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750562
10013	NC_006576	TGA	2	6	621483	621488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750562
10014	NC_006576	AAC	2	6	621497	621502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750562
10015	NC_006576	TCCCGA	2	12	621514	621525	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	56750562
10016	NC_006576	TGA	3	9	621529	621537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750562
10017	NC_006576	TCAG	2	8	621546	621553	25 %	25 %	25 %	25 %	56750562
10018	NC_006576	CGAT	2	8	621569	621576	25 %	25 %	25 %	25 %	56750562
10019	NC_006576	CAG	2	6	621602	621607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750562
10020	NC_006576	CTG	2	6	621689	621694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750562
10021	NC_006576	TCAT	2	8	621734	621741	25 %	50 %	0 %	25 %	56750562
10022	NC_006576	TCG	2	6	621753	621758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750562
10023	NC_006576	GAA	3	9	621809	621817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750562
10024	NC_006576	CAG	2	6	621842	621847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750562
10025	NC_006576	AAG	2	6	621873	621878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750562
10026	NC_006576	TGA	2	6	621904	621909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750562
10027	NC_006576	GAA	2	6	621929	621934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750562
10028	NC_006576	GCA	2	6	622001	622006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750562
10029	NC_006576	GAA	2	6	622037	622042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750562
10030	NC_006576	GCT	2	6	622048	622053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750562
10031	NC_006576	TGA	2	6	622066	622071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750562
10032	NC_006576	ATT	2	6	622112	622117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56750562
10033	NC_006576	TTG	2	6	622134	622139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750562
10034	NC_006576	TCAC	2	8	622144	622151	25 %	25 %	0 %	50 %	56750562
10035	NC_006576	GTC	2	6	622361	622366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750563
10036	NC_006576	AGC	2	6	622404	622409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750563
10037	NC_006576	GGA	2	6	622465	622470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56750563
10038	NC_006576	GTG	2	6	622477	622482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750563
10039	NC_006576	GCC	2	6	622509	622514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750563
10040	NC_006576	CAA	2	6	622554	622559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750563
10041	NC_006576	TGC	2	6	622618	622623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750563
10042	NC_006576	T	6	6	622624	622629	0 %	100 %	0 %	0 %	56750563
10043	NC_006576	AGA	2	6	622630	622635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750563
10044	NC_006576	TTA	2	6	622670	622675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56750563
10045	NC_006576	TCA	2	6	622704	622709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750563
10046	NC_006576	TTG	2	6	622710	622715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750563
10047	NC_006576	GAA	2	6	622718	622723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750563
10048	NC_006576	GA	3	6	622941	622946	50 %	0 %	50 %	0 %	56750564
10049	NC_006576	CAA	2	6	622996	623001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750564
10050	NC_006576	GCA	2	6	623004	623009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750564
10051	NC_006576	GCA	2	6	623130	623135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750564
10052	NC_006576	GCT	2	6	623196	623201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750564
10053	NC_006576	GCT	2	6	623234	623239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750564
10054	NC_006576	CTGTC	2	10	623278	623287	0 %	40 %	20 %	40 %	56750564
10055	NC_006576	TGGCC	2	10	623303	623312	0 %	20 %	40 %	40 %	56750564
10056	NC_006576	CGG	2	6	623387	623392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750564
10057	NC_006576	CGC	3	9	623398	623406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750564
10058	NC_006576	AGCGCC	2	12	623608	623619	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	56750565
10059	NC_006576	AGCG	2	8	623693	623700	25 %	0 %	50 %	25 %	56750565
10060	NC_006576	CTG	3	9	623722	623730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750565
10061	NC_006576	CTG	2	6	623815	623820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750565
10062	NC_006576	TGG	2	6	623845	623850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750565
10063	NC_006576	CCTC	2	8	624099	624106	0 %	25 %	0 %	75 %	56750566
10064	NC_006576	CGAG	2	8	624121	624128	25 %	0 %	50 %	25 %	56750566
10065	NC_006576	GAA	2	6	624152	624157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750566
10066	NC_006576	CAG	2	6	624183	624188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750566
10067	NC_006576	CTAT	2	8	624258	624265	25 %	50 %	0 %	25 %	56750566
10068	NC_006576	TCAA	2	8	624342	624349	50 %	25 %	0 %	25 %	56750566
10069	NC_006576	CATCAC	2	12	624359	624370	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	56750566
10070	NC_006576	GCA	2	6	624387	624392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750566
10071	NC_006576	AGG	2	6	624450	624455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56750566
10072	NC_006576	ACC	2	6	624459	624464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750566
10073	NC_006576	GC	3	6	624683	624688	0 %	0 %	50 %	50 %	56750567
10074	NC_006576	GCC	2	6	624791	624796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750567
10075	NC_006576	GCA	2	6	624922	624927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750567
10076	NC_006576	CAC	2	6	624963	624968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750567
10077	NC_006576	AGC	2	6	625002	625007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750567
10078	NC_006576	CAA	2	6	625027	625032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750567
10079	NC_006576	CAA	2	6	625034	625039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750567
10080	NC_006576	GTT	2	6	625147	625152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750567
10081	NC_006576	CGAT	2	8	625182	625189	25 %	25 %	25 %	25 %	56750567
10082	NC_006576	TGC	2	6	625326	625331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750567
10083	NC_006576	GAA	2	6	625338	625343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750567
10084	NC_006576	TTC	2	6	625403	625408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750567
10085	NC_006576	GCA	2	6	625420	625425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750567
10086	NC_006576	GCG	2	6	625435	625440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750567
10087	NC_006576	TTC	2	6	625478	625483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750567
10088	NC_006576	GGCAG	2	10	625549	625558	20 %	0 %	60 %	20 %	56750567
10089	NC_006576	TCA	2	6	625584	625589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750567
10090	NC_006576	GCTTCA	2	12	625593	625604	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	56750567
10091	NC_006576	CTT	2	6	625700	625705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750567
10092	NC_006576	CAGC	2	8	625848	625855	25 %	0 %	25 %	50 %	56750568
10093	NC_006576	T	6	6	625952	625957	0 %	100 %	0 %	0 %	56750568
10094	NC_006576	TGCCA	2	10	626076	626085	20 %	20 %	20 %	40 %	56750568
10095	NC_006576	CGA	2	6	626138	626143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750568
10096	NC_006576	GCA	2	6	626254	626259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750568
10097	NC_006576	TGC	2	6	626292	626297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750568
10098	NC_006576	CAG	2	6	626478	626483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750568
10099	NC_006576	GTG	2	6	626551	626556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750568
10100	NC_006576	AGC	2	6	626568	626573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750568
10101	NC_006576	CGC	2	6	626587	626592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750568
10102	NC_006576	GAA	2	6	626628	626633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750568
10103	NC_006576	TTGA	2	8	626634	626641	25 %	50 %	25 %	0 %	56750568
10104	NC_006576	CAG	2	6	626840	626845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750568
10105	NC_006576	ATG	2	6	626863	626868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750568
10106	NC_006576	GCT	2	6	626913	626918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750568
10107	NC_006576	ATC	2	6	626929	626934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750568
10108	NC_006576	A	6	6	626966	626971	100 %	0 %	0 %	0 %	56750568
10109	NC_006576	TCA	2	6	627064	627069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750568
10110	NC_006576	AGG	3	9	627078	627086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56750568
10111	NC_006576	CAGA	2	8	627137	627144	50 %	0 %	25 %	25 %	56750568
10112	NC_006576	GAT	2	6	627207	627212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750569
10113	NC_006576	GCTC	2	8	627233	627240	0 %	25 %	25 %	50 %	56750569
10114	NC_006576	TGG	2	6	627294	627299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750569
10115	NC_006576	CAA	3	9	627334	627342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750569
10116	NC_006576	GCA	2	6	627371	627376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750569
10117	NC_006576	AC	3	6	627387	627392	50 %	0 %	0 %	50 %	56750569
10118	NC_006576	GCA	2	6	627466	627471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750569
10119	NC_006576	AGCCC	2	10	627487	627496	20 %	0 %	20 %	60 %	56750569
10120	NC_006576	GGA	2	6	627525	627530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56750569
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10133	NC_006576	CAGC	2	8	628308	628315	25 %	0 %	25 %	50 %	56750570
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10229	NC_006576	AGGTG	2	10	633956	633965	20 %	20 %	60 %	0 %	56750575
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10241	NC_006576	CGG	2	6	634270	634275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750575
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10481	NC_006576	GCG	2	6	647660	647665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750586
10482	NC_006576	CCCG	2	8	647769	647776	0 %	0 %	25 %	75 %	56750586
10483	NC_006576	GCA	3	9	647841	647849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750586
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