MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006576	GCG	2	6	38299	38304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750041
502	NC_006576	CAAGC	2	10	38335	38344	40 %	0 %	20 %	40 %	56750041
503	NC_006576	CAA	2	6	38347	38352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750041
504	NC_006576	GGCA	2	8	38354	38361	25 %	0 %	50 %	25 %	56750041
505	NC_006576	GGC	2	6	38415	38420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750041
506	NC_006576	ATC	2	6	38453	38458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750041
507	NC_006576	GAT	2	6	38517	38522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750041
508	NC_006576	ACA	2	6	38663	38668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750041
509	NC_006576	TGC	2	6	38759	38764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750041
510	NC_006576	CAT	2	6	38769	38774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750041
511	NC_006576	TGGC	2	8	38775	38782	0 %	25 %	50 %	25 %	56750041
512	NC_006576	CTG	2	6	38830	38835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750041
513	NC_006576	AGC	2	6	38844	38849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750041
514	NC_006576	TGGA	2	8	38866	38873	25 %	25 %	50 %	0 %	56750041
515	NC_006576	GCC	2	6	38944	38949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750041
516	NC_006576	GCGATC	2	12	39146	39157	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56750041
517	NC_006576	ACT	2	6	39165	39170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750041
518	NC_006576	CAA	2	6	39184	39189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750041
519	NC_006576	GGT	2	6	39192	39197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750041
520	NC_006576	CAG	2	6	39211	39216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750041
521	NC_006576	TTA	2	6	39217	39222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56750041
522	NC_006576	CGG	2	6	39279	39284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750041
523	NC_006576	GGCTC	2	10	39330	39339	0 %	20 %	40 %	40 %	56750041
524	NC_006576	GCC	2	6	39367	39372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750041
525	NC_006576	CG	3	6	39485	39490	0 %	0 %	50 %	50 %	56750041
526	NC_006576	GC	3	6	39528	39533	0 %	0 %	50 %	50 %	56750041
527	NC_006576	CTG	2	6	39572	39577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750041
528	NC_006576	CTC	2	6	39670	39675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56750042
529	NC_006576	TGC	2	6	39731	39736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750042
530	NC_006576	TGG	2	6	39770	39775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750042
531	NC_006576	CTG	2	6	39871	39876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750042
532	NC_006576	GGCT	2	8	39961	39968	0 %	25 %	50 %	25 %	56750042
533	NC_006576	T	6	6	39975	39980	0 %	100 %	0 %	0 %	56750042
534	NC_006576	TGG	2	6	39991	39996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750042
535	NC_006576	CGA	2	6	40070	40075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750042
536	NC_006576	TGG	2	6	40148	40153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750042
537	NC_006576	GAA	2	6	40222	40227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750042
538	NC_006576	CGA	2	6	40292	40297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750042
539	NC_006576	GCC	2	6	40356	40361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750042
540	NC_006576	CCTCT	2	10	40362	40371	0 %	40 %	0 %	60 %	56750042
541	NC_006576	CT	4	8	40368	40375	0 %	50 %	0 %	50 %	56750042
542	NC_006576	TGC	2	6	40385	40390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750042
543	NC_006576	GGCT	2	8	40394	40401	0 %	25 %	50 %	25 %	56750042
544	NC_006576	GCT	2	6	40431	40436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750042
545	NC_006576	TGG	2	6	40503	40508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750042
546	NC_006576	TCC	2	6	40536	40541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56750042
547	NC_006576	CAAC	2	8	40544	40551	50 %	0 %	0 %	50 %	56750042
548	NC_006576	CA	3	6	40600	40605	50 %	0 %	0 %	50 %	56750042
549	NC_006576	CTC	2	6	40642	40647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56750042
550	NC_006576	CGGG	2	8	40667	40674	0 %	0 %	75 %	25 %	56750042
551	NC_006576	ATT	2	6	40752	40757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56750042
552	NC_006576	GCC	2	6	40761	40766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750042
553	NC_006576	CCA	2	6	40808	40813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750042
554	NC_006576	GCA	2	6	40900	40905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750042
555	NC_006576	GCC	2	6	40931	40936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750042
556	NC_006576	CGAT	2	8	41015	41022	25 %	25 %	25 %	25 %	56750042
557	NC_006576	CAG	2	6	41257	41262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750043
558	NC_006576	TTC	2	6	41329	41334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750043
559	NC_006576	GCA	2	6	41415	41420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750043
560	NC_006576	CAG	2	6	41739	41744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750043
561	NC_006576	GTC	2	6	41753	41758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750043
562	NC_006576	TCT	2	6	41846	41851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750043
563	NC_006576	CAAC	2	8	41899	41906	50 %	0 %	0 %	50 %	56750043
564	NC_006576	TGC	2	6	42013	42018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750043
565	NC_006576	CGT	2	6	42025	42030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750043
566	NC_006576	CTT	2	6	42084	42089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750043
567	NC_006576	CCA	2	6	42135	42140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750043
568	NC_006576	CGC	2	6	42152	42157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750043
569	NC_006576	TTC	2	6	42208	42213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750043
570	NC_006576	CGC	2	6	42254	42259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750043
571	NC_006576	GC	3	6	42367	42372	0 %	0 %	50 %	50 %	56750043
572	NC_006576	CTGA	2	8	42424	42431	25 %	25 %	25 %	25 %	56750043
573	NC_006576	GCA	2	6	42510	42515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750043
574	NC_006576	AAT	2	6	42559	42564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56750043
575	NC_006576	CGA	2	6	42621	42626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750043
576	NC_006576	GTT	2	6	42681	42686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750043
577	NC_006576	TGA	2	6	42726	42731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750043
578	NC_006576	GGT	2	6	42812	42817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750043
579	NC_006576	TGG	2	6	42879	42884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750043
580	NC_006576	CTT	3	9	43158	43166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750044
581	NC_006576	CAAA	2	8	43206	43213	75 %	0 %	0 %	25 %	56750044
582	NC_006576	CAG	2	6	43293	43298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750044
583	NC_006576	CAG	2	6	43300	43305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750044
584	NC_006576	CAC	2	6	43372	43377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750044
585	NC_006576	AAC	2	6	43406	43411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750044
586	NC_006576	TCGA	2	8	43439	43446	25 %	25 %	25 %	25 %	56750044
587	NC_006576	CGA	2	6	43458	43463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750044
588	NC_006576	A	6	6	43483	43488	100 %	0 %	0 %	0 %	56750044
589	NC_006576	TGC	2	6	43495	43500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750044
590	NC_006576	GAG	2	6	43550	43555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56750044
591	NC_006576	CGT	2	6	43580	43585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750044
592	NC_006576	GAT	2	6	43633	43638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750044
593	NC_006576	CAA	2	6	43648	43653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750044
594	NC_006576	AGA	2	6	43689	43694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750044
595	NC_006576	GGGCG	2	10	43731	43740	0 %	0 %	80 %	20 %	56750044
596	NC_006576	CCA	2	6	43752	43757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750044
597	NC_006576	ACGC	2	8	43762	43769	25 %	0 %	25 %	50 %	56750044
598	NC_006576	CGA	2	6	43770	43775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750044
599	NC_006576	CACCGC	2	12	43792	43803	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	56750044
600	NC_006576	TTC	2	6	43834	43839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750044
601	NC_006576	AAC	2	6	43850	43855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750044
602	NC_006576	TGCCTC	2	12	43882	43893	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	56750044
603	NC_006576	GGA	2	6	43963	43968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56750044
604	NC_006576	CCCA	2	8	44398	44405	25 %	0 %	0 %	75 %	56750045
605	NC_006576	TCC	2	6	44423	44428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56750045
606	NC_006576	TAG	2	6	44429	44434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750045
607	NC_006576	GCA	2	6	44633	44638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750045
608	NC_006576	GACT	2	8	44684	44691	25 %	25 %	25 %	25 %	56750045
609	NC_006576	TCG	2	6	45009	45014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750046
610	NC_006576	GGA	2	6	45037	45042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56750046
611	NC_006576	GGAG	2	8	45076	45083	25 %	0 %	75 %	0 %	56750046
612	NC_006576	AG	3	6	45082	45087	50 %	0 %	50 %	0 %	56750046
613	NC_006576	GCA	2	6	45169	45174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750046
614	NC_006576	ATC	2	6	45258	45263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750046
615	NC_006576	TTGC	2	8	46122	46129	0 %	50 %	25 %	25 %	56750047
616	NC_006576	GCT	2	6	46246	46251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750047
617	NC_006576	GAT	2	6	46277	46282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750047
618	NC_006576	AGC	2	6	46333	46338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750047
619	NC_006576	GTT	2	6	46369	46374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750047
620	NC_006576	ATTT	2	8	46430	46437	25 %	75 %	0 %	0 %	56750047
621	NC_006576	AAG	2	6	46551	46556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750047
622	NC_006576	TGATGG	2	12	46564	46575	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	56750047
623	NC_006576	TCG	2	6	46651	46656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750047
624	NC_006576	TGC	2	6	46692	46697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750047
625	NC_006576	GATT	2	8	46704	46711	25 %	50 %	25 %	0 %	56750047
626	NC_006576	ACG	2	6	46719	46724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750047
627	NC_006576	CAG	2	6	46751	46756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750047
628	NC_006576	CGAT	2	8	46782	46789	25 %	25 %	25 %	25 %	56750047
629	NC_006576	GTC	2	6	46856	46861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750047
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654	NC_006576	CTG	2	6	48117	48122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750048
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751	NC_006576	AAC	2	6	53035	53040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750052
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753	NC_006576	CTG	2	6	53100	53105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750052
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