MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9002	NC_006576	TGCG	2	8	557324	557331	0 %	25 %	50 %	25 %	56750506
9003	NC_006576	TTGAA	2	10	557341	557350	40 %	40 %	20 %	0 %	56750506
9004	NC_006576	TGA	2	6	557401	557406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750506
9005	NC_006576	CAC	2	6	557447	557452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750506
9006	NC_006576	ACA	2	6	557603	557608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750507
9007	NC_006576	CCG	2	6	557612	557617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750507
9008	NC_006576	GTT	2	6	557641	557646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750507
9009	NC_006576	GAGC	2	8	557668	557675	25 %	0 %	50 %	25 %	56750507
9010	NC_006576	GCG	2	6	557683	557688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750507
9011	NC_006576	CGC	2	6	557716	557721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750507
9012	NC_006576	GCC	2	6	557861	557866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750507
9013	NC_006576	AGG	2	6	557901	557906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56750507
9014	NC_006576	CTG	2	6	557965	557970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750507
9015	NC_006576	GTA	2	6	557995	558000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750507
9016	NC_006576	GAA	2	6	558038	558043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750507
9017	NC_006576	CGT	2	6	558066	558071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750507
9018	NC_006576	GTT	2	6	558178	558183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750507
9019	NC_006576	AGA	2	6	558186	558191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750507
9020	NC_006576	ATG	2	6	558299	558304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750507
9021	NC_006576	CG	3	6	558334	558339	0 %	0 %	50 %	50 %	56750507
9022	NC_006576	GCA	2	6	558392	558397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750507
9023	NC_006576	CGAGA	2	10	558417	558426	40 %	0 %	40 %	20 %	56750507
9024	NC_006576	GTAG	2	8	558579	558586	25 %	25 %	50 %	0 %	56750508
9025	NC_006576	ACG	2	6	558594	558599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750508
9026	NC_006576	TGC	2	6	558631	558636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750508
9027	NC_006576	CTT	2	6	558740	558745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750508
9028	NC_006576	GCTG	2	8	558761	558768	0 %	25 %	50 %	25 %	56750508
9029	NC_006576	T	6	6	558833	558838	0 %	100 %	0 %	0 %	56750508
9030	NC_006576	CAG	2	6	558905	558910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750508
9031	NC_006576	GCA	2	6	558961	558966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750508
9032	NC_006576	GCA	2	6	558970	558975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750508
9033	NC_006576	CAG	2	6	559005	559010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750508
9034	NC_006576	GAA	2	6	559056	559061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750508
9035	NC_006576	CAC	2	6	559121	559126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750508
9036	NC_006576	GCA	2	6	559130	559135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750508
9037	NC_006576	ATG	2	6	559210	559215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750508
9038	NC_006576	GAC	2	6	559289	559294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750508
9039	NC_006576	GCT	2	6	559297	559302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750508
9040	NC_006576	TGA	2	6	559436	559441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750509
9041	NC_006576	CAC	2	6	559478	559483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750509
9042	NC_006576	TTG	2	6	559552	559557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750509
9043	NC_006576	TCA	2	6	559561	559566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750509
9044	NC_006576	TCA	2	6	559585	559590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750509
9045	NC_006576	GTT	2	6	559692	559697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750509
9046	NC_006576	TGG	2	6	559709	559714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750509
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9050	NC_006576	GCA	3	9	559975	559983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750510
9051	NC_006576	GTC	2	6	560163	560168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750510
9052	NC_006576	GCC	2	6	560242	560247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750510
9053	NC_006576	GCC	2	6	560271	560276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750510
9054	NC_006576	CGA	2	6	560327	560332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750510
9055	NC_006576	CGA	2	6	560334	560339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750510
9056	NC_006576	TTG	2	6	560377	560382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750510
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9058	NC_006576	A	6	6	561143	561148	100 %	0 %	0 %	0 %	56750511
9059	NC_006576	GTTG	2	8	561229	561236	0 %	50 %	50 %	0 %	56750511
9060	NC_006576	GCT	2	6	561319	561324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750511
9061	NC_006576	CAG	2	6	561466	561471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750511
9062	NC_006576	CAA	2	6	561558	561563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750511
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9065	NC_006576	ACCT	2	8	562096	562103	25 %	25 %	0 %	50 %	56750512
9066	NC_006576	GCC	2	6	562107	562112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750512
9067	NC_006576	TGC	2	6	562123	562128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750512
9068	NC_006576	TCTGC	2	10	562155	562164	0 %	40 %	20 %	40 %	56750512
9069	NC_006576	CGC	2	6	562415	562420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750512
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9073	NC_006576	TCAA	2	8	562738	562745	50 %	25 %	0 %	25 %	56750512
9074	NC_006576	CGC	2	6	562875	562880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750512
9075	NC_006576	CAG	2	6	562899	562904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750512
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9078	NC_006576	TCAG	2	8	563125	563132	25 %	25 %	25 %	25 %	56750512
9079	NC_006576	CTA	2	6	563189	563194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750512
9080	NC_006576	TCCA	2	8	563218	563225	25 %	25 %	0 %	50 %	56750512
9081	NC_006576	TGC	2	6	563230	563235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750512
9082	NC_006576	AGTC	2	8	563236	563243	25 %	25 %	25 %	25 %	56750512
9083	NC_006576	CAG	2	6	563387	563392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750513
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9088	NC_006576	GC	3	6	563591	563596	0 %	0 %	50 %	50 %	56750513
9089	NC_006576	TCT	2	6	563694	563699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750513
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9091	NC_006576	TACACC	2	12	563744	563755	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	56750513
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9093	NC_006576	TTG	2	6	563816	563821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750513
9094	NC_006576	GGCT	2	8	563824	563831	0 %	25 %	50 %	25 %	56750513
9095	NC_006576	GTC	2	6	563885	563890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750513
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9098	NC_006576	TGGC	2	8	564236	564243	0 %	25 %	50 %	25 %	56750514
9099	NC_006576	GTC	2	6	564246	564251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750514
9100	NC_006576	AATG	2	8	564266	564273	50 %	25 %	25 %	0 %	56750514
9101	NC_006576	GCA	2	6	564356	564361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750514
9102	NC_006576	GCC	2	6	564432	564437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750514
9103	NC_006576	T	7	7	564452	564458	0 %	100 %	0 %	0 %	56750514
9104	NC_006576	TGA	2	6	564534	564539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750514
9105	NC_006576	TGC	2	6	564556	564561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750514
9106	NC_006576	TGG	2	6	564564	564569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750514
9107	NC_006576	GCA	2	6	564571	564576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750514
9108	NC_006576	GAT	2	6	564640	564645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750514
9109	NC_006576	TTG	2	6	564740	564745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750514
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9111	NC_006576	TCCCG	2	10	564897	564906	0 %	20 %	20 %	60 %	56750515
9112	NC_006576	CAA	2	6	564911	564916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750515
9113	NC_006576	TGC	2	6	564921	564926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750515
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9115	NC_006576	GC	3	6	565019	565024	0 %	0 %	50 %	50 %	56750515
9116	NC_006576	A	6	6	565032	565037	100 %	0 %	0 %	0 %	56750515
9117	NC_006576	TGC	2	6	565086	565091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750515
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9119	NC_006576	CAGT	2	8	565629	565636	25 %	25 %	25 %	25 %	56750516
9120	NC_006576	CAA	2	6	565642	565647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750516
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9122	NC_006576	GCT	2	6	565670	565675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750516
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9368	NC_006576	CGAT	2	8	582657	582664	25 %	25 %	25 %	25 %	56750531
9369	NC_006576	TGAT	2	8	582720	582727	25 %	50 %	25 %	0 %	56750532
9370	NC_006576	AG	3	6	582820	582825	50 %	0 %	50 %	0 %	56750532
9371	NC_006576	TGG	2	6	582914	582919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750532
9372	NC_006576	GAG	2	6	582953	582958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56750532
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9375	NC_006576	CGC	2	6	583088	583093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750533
9376	NC_006576	TTG	2	6	583094	583099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750533
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9401	NC_006576	GCT	2	6	584414	584419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750534
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9485	NC_006576	TGGTT	2	10	589698	589707	0 %	60 %	40 %	0 %	56750539
9486	NC_006576	GGGC	2	8	589790	589797	0 %	0 %	75 %	25 %	56750539
9487	NC_006576	AGC	2	6	589948	589953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750540
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