MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_006576	CTA	2	6	469718	469723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750428
7502	NC_006576	CGGTGG	2	12	469751	469762	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	56750428
7503	NC_006576	TGG	2	6	469779	469784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750428
7504	NC_006576	TGC	2	6	469839	469844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750428
7505	NC_006576	GGCG	2	8	469874	469881	0 %	0 %	75 %	25 %	56750428
7506	NC_006576	CGAT	2	8	469882	469889	25 %	25 %	25 %	25 %	56750428
7507	NC_006576	AGCAC	2	10	469930	469939	40 %	0 %	20 %	40 %	56750428
7508	NC_006576	GAGCA	2	10	469993	470002	40 %	0 %	40 %	20 %	56750428
7509	NC_006576	TTG	2	6	470313	470318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750428
7510	NC_006576	TGGC	2	8	470458	470465	0 %	25 %	50 %	25 %	56750428
7511	NC_006576	CCCA	2	8	470472	470479	25 %	0 %	0 %	75 %	56750428
7512	NC_006576	ACC	2	6	470484	470489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750428
7513	NC_006576	CAATC	2	10	470507	470516	40 %	20 %	0 %	40 %	56750428
7514	NC_006576	CGC	3	9	470573	470581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750428
7515	NC_006576	GTCA	2	8	470592	470599	25 %	25 %	25 %	25 %	56750428
7516	NC_006576	CTG	3	9	470625	470633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750428
7517	NC_006576	TGC	2	6	470641	470646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750428
7518	NC_006576	GGA	2	6	470657	470662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56750428
7519	NC_006576	CTGG	2	8	470791	470798	0 %	25 %	50 %	25 %	56750428
7520	NC_006576	GTC	2	6	470841	470846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750428
7521	NC_006576	CAG	2	6	470856	470861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750428
7522	NC_006576	TCA	2	6	470891	470896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750428
7523	NC_006576	ACT	2	6	470907	470912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750428
7524	NC_006576	CAG	2	6	470946	470951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750428
7525	NC_006576	AG	3	6	471098	471103	50 %	0 %	50 %	0 %	56750428
7526	NC_006576	GGCG	2	8	471178	471185	0 %	0 %	75 %	25 %	56750428
7527	NC_006576	TGC	2	6	471264	471269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750428
7528	NC_006576	ATCA	2	8	471458	471465	50 %	25 %	0 %	25 %	56750429
7529	NC_006576	ACCG	2	8	471563	471570	25 %	0 %	25 %	50 %	56750429
7530	NC_006576	CAG	2	6	471601	471606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750429
7531	NC_006576	TGC	2	6	471621	471626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750429
7532	NC_006576	TGGA	2	8	471636	471643	25 %	25 %	50 %	0 %	56750429
7533	NC_006576	CTG	2	6	471653	471658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750429
7534	NC_006576	GAT	2	6	471691	471696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750429
7535	NC_006576	CCA	2	6	471728	471733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750429
7536	NC_006576	GCC	2	6	471750	471755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750429
7537	NC_006576	CTG	3	9	471791	471799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750429
7538	NC_006576	G	6	6	471835	471840	0 %	0 %	100 %	0 %	56750429
7539	NC_006576	CAG	2	6	471860	471865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750429
7540	NC_006576	TTG	2	6	471866	471871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750429
7541	NC_006576	TTG	2	6	471935	471940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750429
7542	NC_006576	CGC	2	6	471941	471946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750429
7543	NC_006576	GTT	2	6	472058	472063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750429
7544	NC_006576	G	6	6	472096	472101	0 %	0 %	100 %	0 %	56750429
7545	NC_006576	GTT	2	6	472105	472110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750429
7546	NC_006576	TGCC	2	8	472129	472136	0 %	25 %	25 %	50 %	56750429
7547	NC_006576	TGC	3	9	472170	472178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750429
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7551	NC_006576	GCT	2	6	472559	472564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750430
7552	NC_006576	CCAA	2	8	472611	472618	50 %	0 %	0 %	50 %	56750430
7553	NC_006576	CCA	2	6	472713	472718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750430
7554	NC_006576	CAG	2	6	472768	472773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750430
7555	NC_006576	CTA	2	6	472818	472823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750430
7556	NC_006576	ATC	2	6	472835	472840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750430
7557	NC_006576	GATCGC	2	12	472871	472882	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56750430
7558	NC_006576	CTG	2	6	472913	472918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750430
7559	NC_006576	ATC	2	6	472958	472963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750430
7560	NC_006576	AGCA	2	8	472976	472983	50 %	0 %	25 %	25 %	56750430
7561	NC_006576	CAA	2	6	473134	473139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750430
7562	NC_006576	AAGA	2	8	473286	473293	75 %	0 %	25 %	0 %	56750430
7563	NC_006576	CTG	2	6	473392	473397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750430
7564	NC_006576	GCT	2	6	473422	473427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750430
7565	NC_006576	ATA	2	6	473454	473459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56750430
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7567	NC_006576	CTGA	2	8	474032	474039	25 %	25 %	25 %	25 %	56750431
7568	NC_006576	TCAA	2	8	474158	474165	50 %	25 %	0 %	25 %	56750431
7569	NC_006576	TCA	2	6	474173	474178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750431
7570	NC_006576	TCT	2	6	474225	474230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750431
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7572	NC_006576	CG	3	6	474385	474390	0 %	0 %	50 %	50 %	56750431
7573	NC_006576	CTG	2	6	474518	474523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750431
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7581	NC_006576	CAC	2	6	475206	475211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750431
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7593	NC_006576	TTG	2	6	475960	475965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750432
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7595	NC_006576	CTG	2	6	476088	476093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750432
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7609	NC_006576	CAG	2	6	476946	476951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750433
7610	NC_006576	CG	3	6	476969	476974	0 %	0 %	50 %	50 %	56750433
7611	NC_006576	CAG	2	6	476996	477001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750433
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7614	NC_006576	GCGGA	2	10	477268	477277	20 %	0 %	60 %	20 %	56750433
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7620	NC_006576	CAGC	2	8	477681	477688	25 %	0 %	25 %	50 %	56750434
7621	NC_006576	GAC	2	6	477700	477705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750434
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7991	NC_006576	GGC	2	6	498500	498505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750454
7992	NC_006576	GCA	2	6	498516	498521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750454
7993	NC_006576	CCAA	2	8	498528	498535	50 %	0 %	0 %	50 %	56750454
7994	NC_006576	TGG	2	6	498548	498553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750454
7995	NC_006576	CTGGCG	2	12	498587	498598	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56750454
7996	NC_006576	TCGC	2	8	498600	498607	0 %	25 %	25 %	50 %	56750454
7997	NC_006576	TGG	2	6	498638	498643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750454
7998	NC_006576	TC	3	6	498661	498666	0 %	50 %	0 %	50 %	56750454
7999	NC_006576	CAC	2	6	498691	498696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750454
8000	NC_006576	GGC	2	6	498728	498733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750454

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