MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_006576	GCA	2	6	407858	407863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750377
6502	NC_006576	GGT	2	6	407900	407905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750377
6503	NC_006576	GA	3	6	407951	407956	50 %	0 %	50 %	0 %	56750377
6504	NC_006576	CCGGC	2	10	407957	407966	0 %	0 %	40 %	60 %	56750377
6505	NC_006576	CCT	2	6	408021	408026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56750378
6506	NC_006576	GCA	2	6	408056	408061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750378
6507	NC_006576	GCA	2	6	408065	408070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750378
6508	NC_006576	CAG	2	6	408121	408126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750378
6509	NC_006576	TGG	2	6	408146	408151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750378
6510	NC_006576	GTA	2	6	408160	408165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750378
6511	NC_006576	GGTT	2	8	408168	408175	0 %	50 %	50 %	0 %	56750378
6512	NC_006576	GCA	2	6	408177	408182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750378
6513	NC_006576	GGGC	2	8	408262	408269	0 %	0 %	75 %	25 %	56750378
6514	NC_006576	GCA	2	6	408294	408299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750378
6515	NC_006576	GTG	3	9	408320	408328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750378
6516	NC_006576	CAA	2	6	408460	408465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750378
6517	NC_006576	CTGC	2	8	408468	408475	0 %	25 %	25 %	50 %	56750378
6518	NC_006576	AGC	2	6	408552	408557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750378
6519	NC_006576	GCCGT	2	10	408560	408569	0 %	20 %	40 %	40 %	56750378
6520	NC_006576	GGT	2	6	408622	408627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750378
6521	NC_006576	CGG	2	6	408690	408695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750378
6522	NC_006576	CAA	2	6	408746	408751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750379
6523	NC_006576	TGA	2	6	408761	408766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750379
6524	NC_006576	GTA	2	6	408876	408881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750379
6525	NC_006576	GTC	2	6	408937	408942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750379
6526	NC_006576	CGC	2	6	408943	408948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750379
6527	NC_006576	CGA	2	6	408958	408963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750379
6528	NC_006576	GCA	2	6	408971	408976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750379
6529	NC_006576	TGA	2	6	409016	409021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750379
6530	NC_006576	AGA	2	6	409330	409335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750380
6531	NC_006576	CGC	2	6	409448	409453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750380
6532	NC_006576	CGC	2	6	409459	409464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750380
6533	NC_006576	GAA	2	6	409478	409483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750380
6534	NC_006576	A	7	7	409620	409626	100 %	0 %	0 %	0 %	56750380
6535	NC_006576	CTG	2	6	409628	409633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750380
6536	NC_006576	GC	3	6	409641	409646	0 %	0 %	50 %	50 %	56750380
6537	NC_006576	CTT	2	6	409663	409668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750380
6538	NC_006576	TGC	3	9	409775	409783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750381
6539	NC_006576	TTG	2	6	409786	409791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750381
6540	NC_006576	GGC	2	6	409815	409820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750381
6541	NC_006576	TGAT	2	8	409856	409863	25 %	50 %	25 %	0 %	56750381
6542	NC_006576	CAA	2	6	409905	409910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750381
6543	NC_006576	GGCT	2	8	409918	409925	0 %	25 %	50 %	25 %	56750381
6544	NC_006576	GTC	2	6	410050	410055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750381
6545	NC_006576	CCCT	2	8	410062	410069	0 %	25 %	0 %	75 %	56750381
6546	NC_006576	TGC	2	6	410072	410077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750381
6547	NC_006576	GGC	2	6	410089	410094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750381
6548	NC_006576	CTG	2	6	410143	410148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750381
6549	NC_006576	TGC	2	6	410250	410255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750381
6550	NC_006576	TAC	2	6	410349	410354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750381
6551	NC_006576	ACGT	2	8	410370	410377	25 %	25 %	25 %	25 %	56750381
6552	NC_006576	TCG	2	6	410382	410387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750381
6553	NC_006576	G	7	7	410438	410444	0 %	0 %	100 %	0 %	56750381
6554	NC_006576	GAA	2	6	410485	410490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750381
6555	NC_006576	GGA	2	6	410496	410501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56750381
6556	NC_006576	AACGC	2	10	410534	410543	40 %	0 %	20 %	40 %	56750381
6557	NC_006576	GTGGCA	2	12	410600	410611	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56750381
6558	NC_006576	T	6	6	410698	410703	0 %	100 %	0 %	0 %	56750381
6559	NC_006576	CAAG	2	8	410709	410716	50 %	0 %	25 %	25 %	56750381
6560	NC_006576	CTG	2	6	410743	410748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750381
6561	NC_006576	CAT	2	6	410878	410883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750382
6562	NC_006576	ATG	2	6	410973	410978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750382
6563	NC_006576	CGC	2	6	410988	410993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750382
6564	NC_006576	CGGA	2	8	411020	411027	25 %	0 %	50 %	25 %	56750382
6565	NC_006576	AGT	2	6	411087	411092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750382
6566	NC_006576	CAA	2	6	411121	411126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750383
6567	NC_006576	CTGT	2	8	411170	411177	0 %	50 %	25 %	25 %	56750383
6568	NC_006576	TTC	2	6	411203	411208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750383
6569	NC_006576	ATTC	2	8	411232	411239	25 %	50 %	0 %	25 %	56750383
6570	NC_006576	AGC	2	6	411288	411293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750384
6571	NC_006576	TGC	2	6	411330	411335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750384
6572	NC_006576	TTCT	2	8	411354	411361	0 %	75 %	0 %	25 %	56750384
6573	NC_006576	CTT	2	6	411369	411374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750384
6574	NC_006576	CTAG	2	8	411378	411385	25 %	25 %	25 %	25 %	56750384
6575	NC_006576	TGG	3	9	411467	411475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750385
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6581	NC_006576	CGT	2	6	411765	411770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750386
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6587	NC_006576	G	7	7	412078	412084	0 %	0 %	100 %	0 %	56750386
6588	NC_006576	GCT	2	6	412128	412133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750386
6589	NC_006576	CAG	2	6	412165	412170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750386
6590	NC_006576	CCA	2	6	412230	412235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750386
6591	NC_006576	CGA	2	6	412237	412242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750386
6592	NC_006576	TGC	2	6	412295	412300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750386
6593	NC_006576	GTG	2	6	412311	412316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750386
6594	NC_006576	GA	4	8	412380	412387	50 %	0 %	50 %	0 %	56750386
6595	NC_006576	AGC	2	6	412421	412426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750386
6596	NC_006576	GTTGGG	2	12	412480	412491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750386
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6601	NC_006576	GCC	2	6	412748	412753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750386
6602	NC_006576	TGG	2	6	412756	412761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750386
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6604	NC_006576	GGC	3	9	413211	413219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750387
6605	NC_006576	CAA	2	6	413314	413319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750387
6606	NC_006576	GCG	3	9	413332	413340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750387
6607	NC_006576	GCT	2	6	413432	413437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750387
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6609	NC_006576	GTCTGG	2	12	413476	413487	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	56750387
6610	NC_006576	GGC	2	6	413530	413535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750387
6611	NC_006576	TGG	2	6	413552	413557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750387
6612	NC_006576	GCA	2	6	413568	413573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750387
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6746	NC_006576	TGC	2	6	421025	421030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750393
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6992	NC_006576	CCG	2	6	434661	434666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750402
6993	NC_006576	CTG	2	6	434682	434687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750402
6994	NC_006576	GTT	2	6	434703	434708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750402
6995	NC_006576	TCAG	2	8	434711	434718	25 %	25 %	25 %	25 %	56750402
6996	NC_006576	CCT	2	6	434731	434736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56750403
6997	NC_006576	GCT	2	6	434844	434849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750403
6998	NC_006576	CCG	2	6	434872	434877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750403
6999	NC_006576	CGC	2	6	434951	434956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750403
7000	NC_006576	CGT	2	6	435029	435034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750403

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