MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_006576	GCGA	2	8	347954	347961	25 %	0 %	50 %	25 %	56750311
5502	NC_006576	ACTGCC	2	12	347977	347988	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	56750311
5503	NC_006576	GCG	2	6	348066	348071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750311
5504	NC_006576	CAGC	2	8	348107	348114	25 %	0 %	25 %	50 %	56750311
5505	NC_006576	AGC	2	6	348180	348185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750311
5506	NC_006576	GTC	2	6	348246	348251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750311
5507	NC_006576	CCA	2	6	348268	348273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750312
5508	NC_006576	CCCA	2	8	348292	348299	25 %	0 %	0 %	75 %	56750312
5509	NC_006576	GCG	2	6	348355	348360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750312
5510	NC_006576	CAA	3	9	348408	348416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750312
5511	NC_006576	GCG	2	6	348506	348511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750313
5512	NC_006576	ACG	2	6	348646	348651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750313
5513	NC_006576	GCG	2	6	348691	348696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750313
5514	NC_006576	CTT	2	6	348717	348722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750313
5515	NC_006576	GCT	2	6	348736	348741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750313
5516	NC_006576	GCT	2	6	348788	348793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750313
5517	NC_006576	AAT	2	6	348865	348870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56750313
5518	NC_006576	CAG	2	6	348964	348969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750313
5519	NC_006576	TGG	2	6	348974	348979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750313
5520	NC_006576	GCA	2	6	348996	349001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750313
5521	NC_006576	GTT	2	6	349056	349061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750313
5522	NC_006576	TTG	2	6	349087	349092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750313
5523	NC_006576	TTCGC	2	10	349143	349152	0 %	40 %	20 %	40 %	56750313
5524	NC_006576	TGC	3	9	349239	349247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750313
5525	NC_006576	CCA	2	6	349266	349271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750313
5526	NC_006576	CCG	2	6	349316	349321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750313
5527	NC_006576	ATC	2	6	349355	349360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750313
5528	NC_006576	GGCA	2	8	349372	349379	25 %	0 %	50 %	25 %	56750313
5529	NC_006576	CAG	2	6	349388	349393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750313
5530	NC_006576	CAG	2	6	349417	349422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750313
5531	NC_006576	AGT	2	6	349550	349555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750313
5532	NC_006576	TCG	2	6	349592	349597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750313
5533	NC_006576	ACG	2	6	349603	349608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750313
5534	NC_006576	G	6	6	349762	349767	0 %	0 %	100 %	0 %	56750313
5535	NC_006576	GCCAAA	2	12	349795	349806	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	56750313
5536	NC_006576	CGT	2	6	349968	349973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750313
5537	NC_006576	GCA	2	6	349991	349996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750313
5538	NC_006576	AGT	2	6	350555	350560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750314
5539	NC_006576	CTG	2	6	350564	350569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750314
5540	NC_006576	GAG	2	6	350584	350589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56750314
5541	NC_006576	GAA	2	6	350612	350617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750314
5542	NC_006576	TGC	2	6	350665	350670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750314
5543	NC_006576	TGC	2	6	350685	350690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750314
5544	NC_006576	CTT	2	6	350711	350716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750314
5545	NC_006576	GTT	2	6	350730	350735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750314
5546	NC_006576	GCA	2	6	350736	350741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750314
5547	NC_006576	GAA	2	6	351199	351204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750315
5548	NC_006576	ACC	2	6	351268	351273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750315
5549	NC_006576	TCA	2	6	351289	351294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750315
5550	NC_006576	AACTC	2	10	351380	351389	40 %	20 %	0 %	40 %	56750315
5551	NC_006576	CAG	2	6	351401	351406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750315
5552	NC_006576	TTG	2	6	351439	351444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750315
5553	NC_006576	TGA	2	6	351511	351516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750315
5554	NC_006576	GGTCA	2	10	351537	351546	20 %	20 %	40 %	20 %	56750315
5555	NC_006576	TCC	2	6	351709	351714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56750315
5556	NC_006576	GTTG	2	8	351725	351732	0 %	50 %	50 %	0 %	56750315
5557	NC_006576	GCC	2	6	351777	351782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750315
5558	NC_006576	CAG	2	6	351786	351791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750315
5559	NC_006576	TCA	2	6	351799	351804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750315
5560	NC_006576	CGT	2	6	351827	351832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750315
5561	NC_006576	GTG	2	6	351850	351855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750315
5562	NC_006576	TCA	2	6	351928	351933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750315
5563	NC_006576	CAA	2	6	351939	351944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750315
5564	NC_006576	CAT	2	6	351987	351992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750315
5565	NC_006576	GCT	2	6	351993	351998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750315
5566	NC_006576	G	6	6	352082	352087	0 %	0 %	100 %	0 %	56750315
5567	NC_006576	GGC	2	6	352124	352129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750315
5568	NC_006576	GCT	2	6	352171	352176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750315
5569	NC_006576	ACT	2	6	352203	352208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750315
5570	NC_006576	CAA	2	6	352268	352273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750315
5571	NC_006576	TGGCA	2	10	352683	352692	20 %	20 %	40 %	20 %	56750316
5572	NC_006576	TTC	2	6	352695	352700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750316
5573	NC_006576	CAG	2	6	352708	352713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750316
5574	NC_006576	CT	3	6	352718	352723	0 %	50 %	0 %	50 %	56750316
5575	NC_006576	TC	3	6	352731	352736	0 %	50 %	0 %	50 %	56750316
5576	NC_006576	AAC	2	6	352742	352747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750316
5577	NC_006576	CAG	2	6	352787	352792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750316
5578	NC_006576	TAC	2	6	352831	352836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750316
5579	NC_006576	CAG	2	6	352844	352849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750316
5580	NC_006576	TCGCGA	2	12	352862	352873	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56750316
5581	NC_006576	CGG	2	6	352878	352883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750316
5582	NC_006576	ACT	2	6	352902	352907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750316
5583	NC_006576	GTT	2	6	352920	352925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750316
5584	NC_006576	ACG	2	6	353076	353081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750316
5585	NC_006576	TCG	2	6	353097	353102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750316
5586	NC_006576	AGC	2	6	353169	353174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750316
5587	NC_006576	GAC	2	6	353184	353189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750316
5588	NC_006576	TTG	2	6	353228	353233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750316
5589	NC_006576	CTGT	2	8	353329	353336	0 %	50 %	25 %	25 %	56750316
5590	NC_006576	CG	3	6	353362	353367	0 %	0 %	50 %	50 %	56750316
5591	NC_006576	CGG	2	6	353828	353833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750317
5592	NC_006576	CTC	2	6	353846	353851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56750317
5593	NC_006576	CGA	2	6	353871	353876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750317
5594	NC_006576	GGC	2	6	353939	353944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750317
5595	NC_006576	GCCA	2	8	353958	353965	25 %	0 %	25 %	50 %	56750317
5596	NC_006576	CAC	2	6	353978	353983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750317
5597	NC_006576	C	6	6	353983	353988	0 %	0 %	0 %	100 %	56750317
5598	NC_006576	GAGTT	2	10	354003	354012	20 %	40 %	40 %	0 %	56750317
5599	NC_006576	GCT	2	6	354052	354057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750317
5600	NC_006576	GAT	2	6	354151	354156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750317
5601	NC_006576	AGC	2	6	354189	354194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750317
5602	NC_006576	CCA	2	6	354199	354204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750317
5603	NC_006576	ATCA	2	8	354254	354261	50 %	25 %	0 %	25 %	56750317
5604	NC_006576	GCA	2	6	354271	354276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750317
5605	NC_006576	GC	3	6	354283	354288	0 %	0 %	50 %	50 %	56750317
5606	NC_006576	AATG	2	8	354316	354323	50 %	25 %	25 %	0 %	56750317
5607	NC_006576	CTG	3	9	354332	354340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750317
5608	NC_006576	AGC	2	6	354367	354372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750317
5609	NC_006576	CTG	2	6	354499	354504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750317
5610	NC_006576	GATT	2	8	354588	354595	25 %	50 %	25 %	0 %	56750317
5611	NC_006576	GCT	2	6	354612	354617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750317
5612	NC_006576	CCG	2	6	354711	354716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750318
5613	NC_006576	CAG	2	6	354718	354723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750318
5614	NC_006576	CAG	2	6	354745	354750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750318
5615	NC_006576	GCT	2	6	354786	354791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750318
5616	NC_006576	ACC	2	6	354834	354839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750318
5617	NC_006576	GCA	3	9	354840	354848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750318
5618	NC_006576	TGC	2	6	354875	354880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750318
5619	NC_006576	GTC	2	6	354929	354934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750318
5620	NC_006576	TGT	2	6	354961	354966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750318
5621	NC_006576	GGC	2	6	354982	354987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750318
5622	NC_006576	CGACCC	2	12	355001	355012	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	56750318
5623	NC_006576	TCC	2	6	355109	355114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56750318
5624	NC_006576	AAT	2	6	355154	355159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56750318
5625	NC_006576	CG	3	6	355186	355191	0 %	0 %	50 %	50 %	56750318
5626	NC_006576	CGC	2	6	355255	355260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750318
5627	NC_006576	CTGC	2	8	355275	355282	0 %	25 %	25 %	50 %	56750318
5628	NC_006576	AGGATC	2	12	355294	355305	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	56750318
5629	NC_006576	CTG	2	6	355349	355354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750318
5630	NC_006576	GTA	2	6	355365	355370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750318
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5633	NC_006576	TGC	2	6	355523	355528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750318
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5636	NC_006576	CT	3	6	355691	355696	0 %	50 %	0 %	50 %	56750318
5637	NC_006576	CTA	2	6	356019	356024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750319
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5642	NC_006576	TGC	2	6	356449	356454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750319
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5655	NC_006576	TTG	2	6	356967	356972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750319
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5660	NC_006576	C	6	6	357162	357167	0 %	0 %	0 %	100 %	56750319
5661	NC_006576	GCGATC	2	12	357239	357250	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56750319
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5730	NC_006576	GCA	2	6	360646	360651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750322
5731	NC_006576	GCA	2	6	360675	360680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750322
5732	NC_006576	TCCT	2	8	360787	360794	0 %	50 %	0 %	50 %	56750322
5733	NC_006576	TGA	2	6	360848	360853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750322
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5735	NC_006576	G	6	6	360888	360893	0 %	0 %	100 %	0 %	56750322
5736	NC_006576	TGCCA	2	10	361059	361068	20 %	20 %	20 %	40 %	56750322
5737	NC_006576	CTG	3	9	361072	361080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750322
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5739	NC_006576	TGG	2	6	361130	361135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750322
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5741	NC_006576	GCG	2	6	361192	361197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750322
5742	NC_006576	GCC	2	6	361234	361239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750322
5743	NC_006576	CGA	2	6	361377	361382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750322
5744	NC_006576	CAA	2	6	361417	361422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750322
5745	NC_006576	CTG	2	6	361439	361444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750322
5746	NC_006576	ACTTTG	2	12	361466	361477	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	56750322
5747	NC_006576	ACCC	2	8	361491	361498	25 %	0 %	0 %	75 %	56750322
5748	NC_006576	GCT	2	6	361566	361571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750322
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5753	NC_006576	TG	3	6	361984	361989	0 %	50 %	50 %	0 %	56750323
5754	NC_006576	CGA	2	6	362051	362056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750323
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5756	NC_006576	TCTA	2	8	362066	362073	25 %	50 %	0 %	25 %	56750323
5757	NC_006576	TGG	2	6	362111	362116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750323
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5851	NC_006576	GCA	2	6	368214	368219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750328
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5856	NC_006576	CAT	2	6	368356	368361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750328
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5859	NC_006576	CGG	2	6	368473	368478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750328
5860	NC_006576	CCGTGG	2	12	368482	368493	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56750328
5861	NC_006576	CTACC	2	10	368500	368509	20 %	20 %	0 %	60 %	56750328
5862	NC_006576	TGC	2	6	368748	368753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750328
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