MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 44464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_006576	CGA	2	6	317125	317130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750281
5002	NC_006576	TGT	2	6	317188	317193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750281
5003	NC_006576	AGCC	2	8	317211	317218	25 %	0 %	25 %	50 %	56750281
5004	NC_006576	ATCC	2	8	317259	317266	25 %	25 %	0 %	50 %	56750281
5005	NC_006576	GGC	2	6	317272	317277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750281
5006	NC_006576	AGC	2	6	317325	317330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750281
5007	NC_006576	GCGG	2	8	317394	317401	0 %	0 %	75 %	25 %	56750281
5008	NC_006576	T	6	6	317464	317469	0 %	100 %	0 %	0 %	56750281
5009	NC_006576	GCGA	2	8	317484	317491	25 %	0 %	50 %	25 %	56750281
5010	NC_006576	AGC	2	6	317497	317502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750281
5011	NC_006576	GTC	2	6	317507	317512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750281
5012	NC_006576	ATCG	2	8	317513	317520	25 %	25 %	25 %	25 %	56750281
5013	NC_006576	GGC	2	6	317571	317576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750281
5014	NC_006576	CAG	2	6	317610	317615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750281
5015	NC_006576	T	6	6	317618	317623	0 %	100 %	0 %	0 %	56750281
5016	NC_006576	GTG	2	6	317734	317739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750282
5017	NC_006576	GCGATC	2	12	317740	317751	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56750282
5018	NC_006576	G	6	6	317847	317852	0 %	0 %	100 %	0 %	56750282
5019	NC_006576	GTC	2	6	317873	317878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750282
5020	NC_006576	GGA	2	6	317896	317901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56750282
5021	NC_006576	GCA	2	6	317906	317911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750282
5022	NC_006576	TGC	2	6	317924	317929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750282
5023	NC_006576	TC	3	6	317967	317972	0 %	50 %	0 %	50 %	56750282
5024	NC_006576	CTG	2	6	317979	317984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750282
5025	NC_006576	ATG	2	6	318002	318007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750282
5026	NC_006576	AGC	2	6	318046	318051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750282
5027	NC_006576	GTCA	2	8	318064	318071	25 %	25 %	25 %	25 %	56750282
5028	NC_006576	TTGG	3	12	318075	318086	0 %	50 %	50 %	0 %	56750282
5029	NC_006576	ATC	2	6	318133	318138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750282
5030	NC_006576	GCT	3	9	318141	318149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750282
5031	NC_006576	CAGC	2	8	318157	318164	25 %	0 %	25 %	50 %	56750282
5032	NC_006576	GCC	2	6	318208	318213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750282
5033	NC_006576	CGT	2	6	318367	318372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750282
5034	NC_006576	AGCC	2	8	318373	318380	25 %	0 %	25 %	50 %	56750282
5035	NC_006576	TGG	2	6	318431	318436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750282
5036	NC_006576	GCC	2	6	318459	318464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750282
5037	NC_006576	TGC	2	6	318490	318495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750282
5038	NC_006576	CTGC	2	8	318535	318542	0 %	25 %	25 %	50 %	56750282
5039	NC_006576	CGC	2	6	318610	318615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750282
5040	NC_006576	TGA	2	6	318630	318635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750282
5041	NC_006576	TCGG	2	8	318683	318690	0 %	25 %	50 %	25 %	56750282
5042	NC_006576	ATC	2	6	318722	318727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750282
5043	NC_006576	GCT	2	6	318745	318750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750282
5044	NC_006576	AGC	2	6	319057	319062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750283
5045	NC_006576	CCG	2	6	319102	319107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750283
5046	NC_006576	ACC	2	6	319122	319127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750283
5047	NC_006576	AGCC	2	8	319166	319173	25 %	0 %	25 %	50 %	56750283
5048	NC_006576	GACC	2	8	319189	319196	25 %	0 %	25 %	50 %	56750283
5049	NC_006576	TGC	2	6	319215	319220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750283
5050	NC_006576	CGT	2	6	319315	319320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750284
5051	NC_006576	CCAA	2	8	319382	319389	50 %	0 %	0 %	50 %	56750284
5052	NC_006576	CGT	3	9	319426	319434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750284
5053	NC_006576	CGC	2	6	319476	319481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750284
5054	NC_006576	AAG	2	6	319528	319533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750284
5055	NC_006576	GCTC	2	8	319560	319567	0 %	25 %	25 %	50 %	56750284
5056	NC_006576	AGCC	2	8	319648	319655	25 %	0 %	25 %	50 %	56750285
5057	NC_006576	GACC	2	8	319656	319663	25 %	0 %	25 %	50 %	56750285
5058	NC_006576	CTT	2	6	319682	319687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750285
5059	NC_006576	T	7	7	319709	319715	0 %	100 %	0 %	0 %	56750285
5060	NC_006576	GGC	2	6	319873	319878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750285
5061	NC_006576	TTA	2	6	319883	319888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56750285
5062	NC_006576	CCT	2	6	319945	319950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56750285
5063	NC_006576	CTA	2	6	320029	320034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750285
5064	NC_006576	ACA	2	6	320236	320241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750285
5065	NC_006576	ATCG	2	8	320351	320358	25 %	25 %	25 %	25 %	56750285
5066	NC_006576	ATT	2	6	320464	320469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56750286
5067	NC_006576	CGC	2	6	320475	320480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750286
5068	NC_006576	AG	3	6	320510	320515	50 %	0 %	50 %	0 %	56750286
5069	NC_006576	GTC	2	6	320570	320575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750286
5070	NC_006576	ATC	2	6	320627	320632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750286
5071	NC_006576	GCTG	2	8	320680	320687	0 %	25 %	50 %	25 %	56750286
5072	NC_006576	GTC	2	6	320783	320788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750286
5073	NC_006576	GCGAT	2	10	320907	320916	20 %	20 %	40 %	20 %	56750286
5074	NC_006576	GCC	2	6	320947	320952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750286
5075	NC_006576	TGC	2	6	321012	321017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750286
5076	NC_006576	GTG	2	6	321032	321037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750286
5077	NC_006576	ATT	2	6	321041	321046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56750286
5078	NC_006576	GCC	2	6	321084	321089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750286
5079	NC_006576	CCTCA	2	10	321124	321133	20 %	20 %	0 %	60 %	56750286
5080	NC_006576	GGC	2	6	321237	321242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750286
5081	NC_006576	TCT	2	6	321393	321398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750286
5082	NC_006576	CCTGCT	2	12	321476	321487	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	56750286
5083	NC_006576	GCG	2	6	321524	321529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750286
5084	NC_006576	CAGC	2	8	321536	321543	25 %	0 %	25 %	50 %	56750286
5085	NC_006576	CT	3	6	321662	321667	0 %	50 %	0 %	50 %	56750287
5086	NC_006576	GCC	2	6	321758	321763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750287
5087	NC_006576	CAG	3	9	321766	321774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750287
5088	NC_006576	TGC	2	6	321792	321797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750287
5089	NC_006576	A	6	6	321835	321840	100 %	0 %	0 %	0 %	56750287
5090	NC_006576	GCTCT	2	10	321913	321922	0 %	40 %	20 %	40 %	56750287
5091	NC_006576	CTATGC	2	12	321936	321947	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	56750287
5092	NC_006576	AGC	3	9	321998	322006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750287
5093	NC_006576	GAA	2	6	322050	322055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56750287
5094	NC_006576	AAT	2	6	322111	322116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56750287
5095	NC_006576	GCA	2	6	322146	322151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750287
5096	NC_006576	GCA	2	6	322521	322526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750288
5097	NC_006576	CCA	2	6	322592	322597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750288
5098	NC_006576	CGG	2	6	322612	322617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750288
5099	NC_006576	GCC	2	6	322676	322681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750288
5100	NC_006576	CAC	2	6	322736	322741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750288
5101	NC_006576	AG	3	6	322796	322801	50 %	0 %	50 %	0 %	56750288
5102	NC_006576	CCG	2	6	322876	322881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750288
5103	NC_006576	TGC	2	6	322956	322961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750288
5104	NC_006576	TTG	2	6	322987	322992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750288
5105	NC_006576	CAGCT	2	10	323051	323060	20 %	20 %	20 %	40 %	56750288
5106	NC_006576	CGA	3	9	323089	323097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750288
5107	NC_006576	GCGATC	2	12	323115	323126	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56750288
5108	NC_006576	GGCA	2	8	323138	323145	25 %	0 %	50 %	25 %	56750288
5109	NC_006576	TCA	2	6	323155	323160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750288
5110	NC_006576	GCC	2	6	323181	323186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750288
5111	NC_006576	CCG	2	6	323269	323274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750288
5112	NC_006576	CGC	2	6	323300	323305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750288
5113	NC_006576	CAA	2	6	323350	323355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750288
5114	NC_006576	CCA	2	6	323413	323418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750288
5115	NC_006576	CGTT	2	8	323456	323463	0 %	50 %	25 %	25 %	56750288
5116	NC_006576	TGC	2	6	323474	323479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750288
5117	NC_006576	TTCA	2	8	323582	323589	25 %	50 %	0 %	25 %	56750288
5118	NC_006576	CCAG	2	8	323623	323630	25 %	0 %	25 %	50 %	56750288
5119	NC_006576	GCG	2	6	323714	323719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750288
5120	NC_006576	ACT	2	6	323775	323780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56750288
5121	NC_006576	CCG	2	6	323790	323795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56750288
5122	NC_006576	CCCA	2	8	323808	323815	25 %	0 %	0 %	75 %	56750288
5123	NC_006576	GCG	2	6	323895	323900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750288
5124	NC_006576	CAG	2	6	323911	323916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750288
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5128	NC_006576	GCG	2	6	324091	324096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750289
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5131	NC_006576	T	6	6	324295	324300	0 %	100 %	0 %	0 %	56750289
5132	NC_006576	TGG	2	6	324322	324327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56750289
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5245	NC_006576	GTC	2	6	330908	330913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750295
5246	NC_006576	CGA	2	6	330915	330920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750295
5247	NC_006576	CAGT	2	8	331006	331013	25 %	25 %	25 %	25 %	56750295
5248	NC_006576	TCG	2	6	331070	331075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750295
5249	NC_006576	CTG	2	6	331160	331165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750295
5250	NC_006576	GC	3	6	331302	331307	0 %	0 %	50 %	50 %	56750296
5251	NC_006576	T	7	7	331324	331330	0 %	100 %	0 %	0 %	56750296
5252	NC_006576	CCA	2	6	331331	331336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750296
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5254	NC_006576	GC	3	6	331455	331460	0 %	0 %	50 %	50 %	56750296
5255	NC_006576	TTC	2	6	331467	331472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56750296
5256	NC_006576	GTT	2	6	331559	331564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750296
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5258	NC_006576	ACC	2	6	331657	331662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750296
5259	NC_006576	ACA	2	6	331760	331765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56750296
5260	NC_006576	TGC	2	6	331768	331773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750296
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5266	NC_006576	CAG	2	6	332193	332198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750296
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5268	NC_006576	C	6	6	332203	332208	0 %	0 %	0 %	100 %	56750296
5269	NC_006576	ACC	2	6	332212	332217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750296
5270	NC_006576	A	6	6	332220	332225	100 %	0 %	0 %	0 %	56750296
5271	NC_006576	ACTGC	2	10	332228	332237	20 %	20 %	20 %	40 %	56750296
5272	NC_006576	CGA	2	6	332273	332278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750296
5273	NC_006576	TGC	2	6	332411	332416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750296
5274	NC_006576	GGC	2	6	332562	332567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56750296
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5276	NC_006576	CAG	2	6	332727	332732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750296
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5278	NC_006576	AG	4	8	332794	332801	50 %	0 %	50 %	0 %	56750296
5279	NC_006576	GCA	2	6	332819	332824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750296
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5282	NC_006576	CGAT	2	8	333354	333361	25 %	25 %	25 %	25 %	56750297
5283	NC_006576	CT	3	6	333681	333686	0 %	50 %	0 %	50 %	56750297
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5352	NC_006576	CATC	2	8	338244	338251	25 %	25 %	0 %	50 %	56750301
5353	NC_006576	CGCAG	2	10	338393	338402	20 %	0 %	40 %	40 %	56750301
5354	NC_006576	GAT	2	6	338422	338427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750301
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5356	NC_006576	GCA	2	6	338547	338552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750301
5357	NC_006576	GA	3	6	338683	338688	50 %	0 %	50 %	0 %	56750301
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5360	NC_006576	GCT	2	6	338940	338945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750302
5361	NC_006576	GCCAAG	2	12	339005	339016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750302
5362	NC_006576	CGAT	2	8	339106	339113	25 %	25 %	25 %	25 %	56750302
5363	NC_006576	A	6	6	339171	339176	100 %	0 %	0 %	0 %	56750302
5364	NC_006576	CAGT	2	8	339298	339305	25 %	25 %	25 %	25 %	56750303
5365	NC_006576	C	6	6	339426	339431	0 %	0 %	0 %	100 %	56750303
5366	NC_006576	TGC	2	6	339447	339452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750303
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5492	NC_006576	A	8	8	347627	347634	100 %	0 %	0 %	0 %	56750311
5493	NC_006576	ACC	2	6	347724	347729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56750311
5494	NC_006576	AGC	3	9	347748	347756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750311
5495	NC_006576	AAT	2	6	347771	347776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56750311
5496	NC_006576	GTT	2	6	347823	347828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56750311
5497	NC_006576	GCA	2	6	347836	347841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56750311
5498	NC_006576	GCCTTG	2	12	347888	347899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56750311
5499	NC_006576	ATCA	2	8	347903	347910	50 %	25 %	0 %	25 %	56750311
5500	NC_006576	GTA	2	6	347912	347917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56750311

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