MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 80127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_006511	TCC	2	6	189253	189258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56412432
3502	NC_006511	GCT	2	6	189299	189304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412432
3503	NC_006511	ACC	2	6	189320	189325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412432
3504	NC_006511	CTG	2	6	189359	189364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412432
3505	NC_006511	ACA	2	6	189384	189389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412432
3506	NC_006511	TGAT	2	8	189399	189406	25 %	50 %	25 %	0 %	56412432
3507	NC_006511	CTG	2	6	189461	189466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412432
3508	NC_006511	ACG	2	6	189483	189488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412432
3509	NC_006511	AGA	2	6	189490	189495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412432
3510	NC_006511	CCG	2	6	189572	189577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412432
3511	NC_006511	A	6	6	189585	189590	100 %	0 %	0 %	0 %	56412432
3512	NC_006511	TCACCG	2	12	189591	189602	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	56412432
3513	NC_006511	CGA	2	6	189631	189636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412432
3514	NC_006511	TC	4	8	189637	189644	0 %	50 %	0 %	50 %	56412432
3515	NC_006511	CAAA	2	8	189754	189761	75 %	0 %	0 %	25 %	56412432
3516	NC_006511	A	6	6	189776	189781	100 %	0 %	0 %	0 %	56412432
3517	NC_006511	GTG	2	6	189809	189814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412432
3518	NC_006511	TTC	2	6	189823	189828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412432
3519	NC_006511	GCG	3	9	189897	189905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412432
3520	NC_006511	CGG	2	6	189916	189921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412432
3521	NC_006511	TCT	2	6	189936	189941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412432
3522	NC_006511	GC	3	6	189963	189968	0 %	0 %	50 %	50 %	56412432
3523	NC_006511	CTG	2	6	190064	190069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412432
3524	NC_006511	GTGC	2	8	190109	190116	0 %	25 %	50 %	25 %	56412432
3525	NC_006511	GGT	2	6	190118	190123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412432
3526	NC_006511	ACC	2	6	190154	190159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412432
3527	NC_006511	AGC	2	6	190226	190231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412432
3528	NC_006511	GGTC	2	8	190258	190265	0 %	25 %	50 %	25 %	56412432
3529	NC_006511	TCCG	2	8	190287	190294	0 %	25 %	25 %	50 %	56412432
3530	NC_006511	CGA	2	6	190360	190365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412432
3531	NC_006511	CCG	2	6	190395	190400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412432
3532	NC_006511	CAC	2	6	190456	190461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412432
3533	NC_006511	CAC	2	6	190463	190468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412432
3534	NC_006511	CGG	2	6	190495	190500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412432
3535	NC_006511	TC	3	6	190503	190508	0 %	50 %	0 %	50 %	56412432
3536	NC_006511	TGC	3	9	190551	190559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412432
3537	NC_006511	CGG	2	6	190576	190581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412432
3538	NC_006511	CGG	2	6	190620	190625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412432
3539	NC_006511	TCTGG	2	10	190628	190637	0 %	40 %	40 %	20 %	56412432
3540	NC_006511	GCC	2	6	190646	190651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412432
3541	NC_006511	CTG	2	6	190778	190783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412432
3542	NC_006511	GAA	2	6	190792	190797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412432
3543	NC_006511	TCT	2	6	190812	190817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412432
3544	NC_006511	CCG	2	6	190890	190895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412432
3545	NC_006511	CTG	2	6	190970	190975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412432
3546	NC_006511	GAT	2	6	190981	190986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412432
3547	NC_006511	CGT	2	6	191006	191011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412432
3548	NC_006511	CGT	2	6	191021	191026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412432
3549	NC_006511	TGGC	2	8	191045	191052	0 %	25 %	50 %	25 %	56412432
3550	NC_006511	GCT	2	6	191062	191067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412432
3551	NC_006511	CGG	2	6	191094	191099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412432
3552	NC_006511	GAC	2	6	191159	191164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412432
3553	NC_006511	CTG	2	6	191171	191176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412432
3554	NC_006511	CGA	2	6	191200	191205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412432
3555	NC_006511	TGC	2	6	191248	191253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412432
3556	NC_006511	GCC	2	6	191308	191313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412432
3557	NC_006511	CGC	2	6	191326	191331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412432
3558	NC_006511	CTA	2	6	191350	191355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412432
3559	NC_006511	GGT	2	6	191446	191451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412432
3560	NC_006511	GGC	2	6	191524	191529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412432
3561	NC_006511	TACC	2	8	191611	191618	25 %	25 %	0 %	50 %	56412432
3562	NC_006511	GGT	2	6	191945	191950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412433
3563	NC_006511	CG	3	6	192014	192019	0 %	0 %	50 %	50 %	56412433
3564	NC_006511	GAA	2	6	192087	192092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412433
3565	NC_006511	TGA	2	6	192094	192099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412433
3566	NC_006511	TTA	2	6	192152	192157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412433
3567	NC_006511	AG	3	6	192164	192169	50 %	0 %	50 %	0 %	56412433
3568	NC_006511	GGA	2	6	192188	192193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56412433
3569	NC_006511	GTC	2	6	192204	192209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412433
3570	NC_006511	A	6	6	192486	192491	100 %	0 %	0 %	0 %	56412434
3571	NC_006511	CGG	2	6	192509	192514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412434
3572	NC_006511	ATG	2	6	192516	192521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412434
3573	NC_006511	CGG	2	6	192581	192586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412434
3574	NC_006511	ACC	2	6	192591	192596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412434
3575	NC_006511	CGGCG	2	10	192611	192620	0 %	0 %	60 %	40 %	56412434
3576	NC_006511	CTG	2	6	192639	192644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412434
3577	NC_006511	GCG	2	6	192790	192795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412434
3578	NC_006511	TGC	2	6	192839	192844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412434
3579	NC_006511	ATG	2	6	192904	192909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412434
3580	NC_006511	CTTT	2	8	192913	192920	0 %	75 %	0 %	25 %	56412434
3581	NC_006511	GAT	2	6	192923	192928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412434
3582	NC_006511	TGG	2	6	192973	192978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412434
3583	NC_006511	T	6	6	193040	193045	0 %	100 %	0 %	0 %	56412434
3584	NC_006511	GGC	2	6	193053	193058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412434
3585	NC_006511	GCT	2	6	193061	193066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412434
3586	NC_006511	CTTT	2	8	193072	193079	0 %	75 %	0 %	25 %	56412434
3587	NC_006511	GGGC	2	8	193093	193100	0 %	0 %	75 %	25 %	56412434
3588	NC_006511	TAC	2	6	193117	193122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412434
3589	NC_006511	CGTT	2	8	193162	193169	0 %	50 %	25 %	25 %	56412434
3590	NC_006511	GCG	2	6	193227	193232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412434
3591	NC_006511	CGC	2	6	193264	193269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412434
3592	NC_006511	TCGC	2	8	193293	193300	0 %	25 %	25 %	50 %	56412434
3593	NC_006511	GCT	2	6	193311	193316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412434
3594	NC_006511	CCGCT	2	10	193318	193327	0 %	20 %	20 %	60 %	56412434
3595	NC_006511	GCC	2	6	193332	193337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412434
3596	NC_006511	CAC	2	6	193346	193351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412434
3597	NC_006511	CCT	2	6	193375	193380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56412434
3598	NC_006511	A	6	6	193389	193394	100 %	0 %	0 %	0 %	56412434
3599	NC_006511	CTT	2	6	193408	193413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412434
3600	NC_006511	GAT	2	6	193448	193453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412435
3601	NC_006511	GAA	2	6	193489	193494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412435
3602	NC_006511	CGC	2	6	193541	193546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412435
3603	NC_006511	GGC	2	6	193597	193602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412435
3604	NC_006511	GTG	2	6	193630	193635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412435
3605	NC_006511	A	7	7	193664	193670	100 %	0 %	0 %	0 %	56412435
3606	NC_006511	CGG	2	6	193710	193715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412435
3607	NC_006511	GC	3	6	193720	193725	0 %	0 %	50 %	50 %	56412435
3608	NC_006511	CGC	3	9	193750	193758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412435
3609	NC_006511	ACG	2	6	193778	193783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412435
3610	NC_006511	CGG	2	6	193939	193944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412435
3611	NC_006511	CTTA	2	8	193954	193961	25 %	50 %	0 %	25 %	56412435
3612	NC_006511	TCG	2	6	193992	193997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412435
3613	NC_006511	AGA	2	6	194008	194013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412435
3614	NC_006511	GCG	2	6	194039	194044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412435
3615	NC_006511	AAC	2	6	194049	194054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412435
3616	NC_006511	GCT	2	6	194065	194070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412435
3617	NC_006511	TGG	2	6	194145	194150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412435
3618	NC_006511	CG	3	6	194236	194241	0 %	0 %	50 %	50 %	56412435
3619	NC_006511	GC	3	6	194295	194300	0 %	0 %	50 %	50 %	56412435
3620	NC_006511	AGA	2	6	194347	194352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412435
3621	NC_006511	GCGA	2	8	194409	194416	25 %	0 %	50 %	25 %	56412435
3622	NC_006511	CGT	2	6	194434	194439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412435
3623	NC_006511	CGG	2	6	194488	194493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412435
3624	NC_006511	CCG	2	6	194505	194510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412435
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3743	NC_006511	GA	3	6	201257	201262	50 %	0 %	50 %	0 %	56412442
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3745	NC_006511	GTA	2	6	201437	201442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412442
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3859	NC_006511	ATC	2	6	207281	207286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412448
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3868	NC_006511	T	6	6	207666	207671	0 %	100 %	0 %	0 %	56412448
3869	NC_006511	CGC	2	6	207691	207696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412448
3870	NC_006511	TA	3	6	207704	207709	50 %	50 %	0 %	0 %	56412448
3871	NC_006511	ATA	2	6	207722	207727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412448
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3873	NC_006511	CA	3	6	207762	207767	50 %	0 %	0 %	50 %	56412448
3874	NC_006511	TCTT	2	8	207789	207796	0 %	75 %	0 %	25 %	56412448
3875	NC_006511	GGC	2	6	207805	207810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412448
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3882	NC_006511	GGT	2	6	208334	208339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412449
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3971	NC_006511	TCATA	2	10	212925	212934	40 %	40 %	0 %	20 %	56412453
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3974	NC_006511	T	7	7	213079	213085	0 %	100 %	0 %	0 %	56412453
3975	NC_006511	GTG	2	6	213098	213103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412453
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3978	NC_006511	CCTG	2	8	213149	213156	0 %	25 %	25 %	50 %	56412453
3979	NC_006511	GCG	2	6	213168	213173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412453
3980	NC_006511	GCT	2	6	213322	213327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412453
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3982	NC_006511	T	6	6	213381	213386	0 %	100 %	0 %	0 %	56412453
3983	NC_006511	CTG	3	9	213387	213395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412453
3984	NC_006511	GCA	2	6	213401	213406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412453
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3986	NC_006511	CCA	2	6	213567	213572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412454
3987	NC_006511	ATT	2	6	213611	213616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412454
3988	NC_006511	TCT	2	6	213768	213773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412454
3989	NC_006511	T	6	6	213773	213778	0 %	100 %	0 %	0 %	56412454
3990	NC_006511	AAT	2	6	213843	213848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412454
3991	NC_006511	AGTTGA	2	12	213870	213881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412454
3992	NC_006511	CTT	2	6	213895	213900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412454
3993	NC_006511	CCAG	2	8	214090	214097	25 %	0 %	25 %	50 %	56412454
3994	NC_006511	TGA	2	6	214154	214159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412454
3995	NC_006511	GGT	2	6	214250	214255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412454
3996	NC_006511	TAA	2	6	214270	214275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412454
3997	NC_006511	GTT	2	6	214525	214530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412455
3998	NC_006511	GTT	2	6	214570	214575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412455
3999	NC_006511	CTG	2	6	214599	214604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412455
4000	NC_006511	GGT	2	6	214622	214627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412455

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