MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 80127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_006511	TGT	2	6	1085833	1085838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56413222
19502	NC_006511	CGT	2	6	1086098	1086103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413223
19503	NC_006511	TTTC	2	8	1086104	1086111	0 %	75 %	0 %	25 %	56413223
19504	NC_006511	TGC	2	6	1086112	1086117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413223
19505	NC_006511	TAA	2	6	1086158	1086163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56413223
19506	NC_006511	ACC	2	6	1086178	1086183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56413223
19507	NC_006511	AGA	2	6	1086770	1086775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56413224
19508	NC_006511	AAG	2	6	1086791	1086796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56413224
19509	NC_006511	TCG	2	6	1086811	1086816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413224
19510	NC_006511	GCG	2	6	1086862	1086867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413224
19511	NC_006511	AAG	2	6	1086988	1086993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56413224
19512	NC_006511	TA	3	6	1087071	1087076	50 %	50 %	0 %	0 %	56413224
19513	NC_006511	ATT	2	6	1087123	1087128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413224
19514	NC_006511	CTG	2	6	1087535	1087540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413225
19515	NC_006511	TCG	2	6	1087550	1087555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413225
19516	NC_006511	CGC	2	6	1087556	1087561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413225
19517	NC_006511	CCG	2	6	1087586	1087591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413225
19518	NC_006511	AG	3	6	1087954	1087959	50 %	0 %	50 %	0 %	56413225
19519	NC_006511	TAT	2	6	1088311	1088316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413226
19520	NC_006511	TA	4	8	1088352	1088359	50 %	50 %	0 %	0 %	56413226
19521	NC_006511	T	6	6	1088393	1088398	0 %	100 %	0 %	0 %	56413226
19522	NC_006511	CAA	2	6	1088408	1088413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56413226
19523	NC_006511	TTA	2	6	1088501	1088506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413226
19524	NC_006511	CAA	2	6	1088606	1088611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56413226
19525	NC_006511	TAA	2	6	1088620	1088625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56413226
19526	NC_006511	ATT	2	6	1088631	1088636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413226
19527	NC_006511	TAACA	2	10	1089411	1089420	60 %	20 %	0 %	20 %	56413227
19528	NC_006511	A	6	6	1089473	1089478	100 %	0 %	0 %	0 %	56413227
19529	NC_006511	CGA	2	6	1089542	1089547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413227
19530	NC_006511	GAGGG	2	10	1089622	1089631	20 %	0 %	80 %	0 %	56413227
19531	NC_006511	TGC	2	6	1089665	1089670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413227
19532	NC_006511	TAA	3	9	1089765	1089773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56413227
19533	NC_006511	TGT	2	6	1089781	1089786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56413227
19534	NC_006511	TCA	2	6	1089794	1089799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413227
19535	NC_006511	A	6	6	1089876	1089881	100 %	0 %	0 %	0 %	56413227
19536	NC_006511	GTC	2	6	1089922	1089927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413227
19537	NC_006511	TGC	2	6	1089936	1089941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413227
19538	NC_006511	CAG	2	6	1089982	1089987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413227
19539	NC_006511	CGC	2	6	1090034	1090039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413227
19540	NC_006511	TAA	2	6	1090044	1090049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56413227
19541	NC_006511	CAA	2	6	1090069	1090074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56413227
19542	NC_006511	CCT	2	6	1090121	1090126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56413227
19543	NC_006511	GCC	2	6	1090415	1090420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413228
19544	NC_006511	A	8	8	1090424	1090431	100 %	0 %	0 %	0 %	56413228
19545	NC_006511	TGC	2	6	1090435	1090440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413228
19546	NC_006511	ACTC	2	8	1090506	1090513	25 %	25 %	0 %	50 %	56413228
19547	NC_006511	AGG	2	6	1090577	1090582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56413228
19548	NC_006511	ATG	2	6	1090801	1090806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413229
19549	NC_006511	GGC	2	6	1090847	1090852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413229
19550	NC_006511	GGT	2	6	1090860	1090865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56413229
19551	NC_006511	CAA	2	6	1090930	1090935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56413229
19552	NC_006511	CGG	2	6	1091021	1091026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413229
19553	NC_006511	TGA	2	6	1091090	1091095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413229
19554	NC_006511	TGG	2	6	1091097	1091102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56413229
19555	NC_006511	GCC	2	6	1091198	1091203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413229
19556	NC_006511	A	9	9	1091258	1091266	100 %	0 %	0 %	0 %	56413229
19557	NC_006511	ATAA	2	8	1091305	1091312	75 %	25 %	0 %	0 %	56413229
19558	NC_006511	GCG	2	6	1091315	1091320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413229
19559	NC_006511	TTTGG	2	10	1091342	1091351	0 %	60 %	40 %	0 %	56413229
19560	NC_006511	TGC	2	6	1091486	1091491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413230
19561	NC_006511	GCC	2	6	1091496	1091501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413230
19562	NC_006511	GCC	2	6	1091536	1091541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413230
19563	NC_006511	TGC	2	6	1091579	1091584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413230
19564	NC_006511	TCC	2	6	1091620	1091625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56413230
19565	NC_006511	CATA	2	8	1091892	1091899	50 %	25 %	0 %	25 %	56413231
19566	NC_006511	CGGAT	2	10	1091904	1091913	20 %	20 %	40 %	20 %	56413231
19567	NC_006511	TCG	2	6	1091968	1091973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413231
19568	NC_006511	TCA	2	6	1092005	1092010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413231
19569	NC_006511	CAT	2	6	1092244	1092249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413232
19570	NC_006511	CTC	2	6	1092296	1092301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56413232
19571	NC_006511	GGCA	2	8	1092343	1092350	25 %	0 %	50 %	25 %	56413232
19572	NC_006511	TCG	2	6	1092358	1092363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413232
19573	NC_006511	TAT	2	6	1092388	1092393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413232
19574	NC_006511	GCC	2	6	1092534	1092539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413232
19575	NC_006511	G	6	6	1092571	1092576	0 %	0 %	100 %	0 %	56413232
19576	NC_006511	CGA	2	6	1092649	1092654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413232
19577	NC_006511	CGGCGT	2	12	1092760	1092771	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56413232
19578	NC_006511	GCC	2	6	1092845	1092850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413232
19579	NC_006511	CGC	2	6	1092896	1092901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413232
19580	NC_006511	T	6	6	1092930	1092935	0 %	100 %	0 %	0 %	56413232
19581	NC_006511	TAC	2	6	1092956	1092961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413232
19582	NC_006511	CAG	2	6	1092986	1092991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413232
19583	NC_006511	GAT	2	6	1093213	1093218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413232
19584	NC_006511	ATC	2	6	1093220	1093225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413232
19585	NC_006511	GCA	2	6	1093246	1093251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413232
19586	NC_006511	CCT	2	6	1093261	1093266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56413232
19587	NC_006511	TCA	2	6	1093323	1093328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413232
19588	NC_006511	GCG	2	6	1093448	1093453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413232
19589	NC_006511	AAAT	2	8	1093474	1093481	75 %	25 %	0 %	0 %	56413232
19590	NC_006511	TCA	2	6	1093482	1093487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413232
19591	NC_006511	AG	3	6	1093490	1093495	50 %	0 %	50 %	0 %	56413232
19592	NC_006511	CT	3	6	1093688	1093693	0 %	50 %	0 %	50 %	56413233
19593	NC_006511	GCG	2	6	1093734	1093739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413233
19594	NC_006511	TGG	2	6	1093744	1093749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56413233
19595	NC_006511	CAC	2	6	1093801	1093806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56413233
19596	NC_006511	GCC	2	6	1093807	1093812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413233
19597	NC_006511	TTA	2	6	1093862	1093867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413233
19598	NC_006511	ATC	2	6	1093907	1093912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413233
19599	NC_006511	ACG	2	6	1094021	1094026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413233
19600	NC_006511	GCCGC	2	10	1094093	1094102	0 %	0 %	40 %	60 %	56413233
19601	NC_006511	CGCC	2	8	1094154	1094161	0 %	0 %	25 %	75 %	56413233
19602	NC_006511	TAA	2	6	1094178	1094183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56413233
19603	NC_006511	GTAC	2	8	1094217	1094224	25 %	25 %	25 %	25 %	56413233
19604	NC_006511	CG	3	6	1094380	1094385	0 %	0 %	50 %	50 %	56413233
19605	NC_006511	CTGGCG	2	12	1094435	1094446	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56413233
19606	NC_006511	GC	3	6	1094481	1094486	0 %	0 %	50 %	50 %	56413233
19607	NC_006511	CGC	2	6	1094541	1094546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413233
19608	NC_006511	TGA	2	6	1094643	1094648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413233
19609	NC_006511	ACG	2	6	1094678	1094683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413233
19610	NC_006511	CCTG	2	8	1094687	1094694	0 %	25 %	25 %	50 %	56413233
19611	NC_006511	GGT	2	6	1094728	1094733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56413233
19612	NC_006511	CCG	2	6	1094837	1094842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413233
19613	NC_006511	CGCTGG	2	12	1094853	1094864	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56413233
19614	NC_006511	TGC	2	6	1094954	1094959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413233
19615	NC_006511	CGTCAG	2	12	1095082	1095093	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56413233
19616	NC_006511	GCA	2	6	1095114	1095119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413233
19617	NC_006511	CAC	3	9	1095136	1095144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56413233
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19733	NC_006511	AAAG	2	8	1102731	1102738	75 %	0 %	25 %	0 %	56413238
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19959	NC_006511	CT	3	6	1115050	1115055	0 %	50 %	0 %	50 %	56413253
19960	NC_006511	TGG	2	6	1115132	1115137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56413253
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19963	NC_006511	CG	5	10	1115239	1115248	0 %	0 %	50 %	50 %	56413253
19964	NC_006511	GTG	2	6	1115281	1115286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56413253
19965	NC_006511	CGC	2	6	1115300	1115305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413253
19966	NC_006511	TGCCGA	2	12	1115367	1115378	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56413253
19967	NC_006511	GGC	2	6	1115395	1115400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413253
19968	NC_006511	CAG	2	6	1115419	1115424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413253
19969	NC_006511	CGC	2	6	1115490	1115495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413253
19970	NC_006511	ACG	2	6	1115615	1115620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413253
19971	NC_006511	CGGG	2	8	1115693	1115700	0 %	0 %	75 %	25 %	459642555
19972	NC_006511	CGG	2	6	1115701	1115706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459642555
19973	NC_006511	GCCA	2	8	1115717	1115724	25 %	0 %	25 %	50 %	459642555
19974	NC_006511	CCA	2	6	1115835	1115840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459642555
19975	NC_006511	ATA	3	9	1115870	1115878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459642555
19976	NC_006511	GGC	2	6	1115914	1115919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459642555
19977	NC_006511	CCAG	2	8	1115964	1115971	25 %	0 %	25 %	50 %	459642555
19978	NC_006511	GAGC	2	8	1115974	1115981	25 %	0 %	50 %	25 %	459642555
19979	NC_006511	ATC	2	6	1115998	1116003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459642555
19980	NC_006511	CGCGT	2	10	1116067	1116076	0 %	20 %	40 %	40 %	459642555
19981	NC_006511	AGT	2	6	1116213	1116218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459642555
19982	NC_006511	GCG	2	6	1116258	1116263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459642555
19983	NC_006511	GTT	2	6	1116328	1116333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459642555
19984	NC_006511	TGC	2	6	1116365	1116370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459642555
19985	NC_006511	CTG	2	6	1116455	1116460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459642555
19986	NC_006511	GCCA	2	8	1116467	1116474	25 %	0 %	25 %	50 %	459642555
19987	NC_006511	CGCTGA	2	12	1116564	1116575	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	459642555
19988	NC_006511	T	7	7	1116622	1116628	0 %	100 %	0 %	0 %	459642555
19989	NC_006511	GCT	2	6	1116711	1116716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459642555
19990	NC_006511	GTC	2	6	1116734	1116739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459642555
19991	NC_006511	AGC	2	6	1116851	1116856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459642555
19992	NC_006511	GAAC	2	8	1116962	1116969	50 %	0 %	25 %	25 %	459642555
19993	NC_006511	GCTT	2	8	1116986	1116993	0 %	50 %	25 %	25 %	459642555
19994	NC_006511	CAAG	2	8	1117029	1117036	50 %	0 %	25 %	25 %	459642555
19995	NC_006511	AAAT	2	8	1117146	1117153	75 %	25 %	0 %	0 %	459642555
19996	NC_006511	TGAT	2	8	1117226	1117233	25 %	50 %	25 %	0 %	459642555
19997	NC_006511	GCC	2	6	1117259	1117264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	459642555
19998	NC_006511	CGA	2	6	1117327	1117332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459642555
19999	NC_006511	CGC	2	6	1117421	1117426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413255
20000	NC_006511	CG	3	6	1117502	1117507	0 %	0 %	50 %	50 %	56413255

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