MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 80127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_006511	TCA	2	6	83228	83233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412343
1502	NC_006511	AGT	2	6	83259	83264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412343
1503	NC_006511	TAA	2	6	83292	83297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412343
1504	NC_006511	GGT	2	6	83317	83322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412343
1505	NC_006511	CCG	2	6	83343	83348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412343
1506	NC_006511	GCT	2	6	83442	83447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412343
1507	NC_006511	CAGA	2	8	83455	83462	50 %	0 %	25 %	25 %	56412343
1508	NC_006511	CAG	2	6	83533	83538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412343
1509	NC_006511	TTC	2	6	83572	83577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412343
1510	NC_006511	GTC	2	6	83827	83832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412343
1511	NC_006511	GGC	2	6	84012	84017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412344
1512	NC_006511	GTT	2	6	84063	84068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412344
1513	NC_006511	ATG	2	6	84082	84087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412344
1514	NC_006511	TCAGC	2	10	84206	84215	20 %	20 %	20 %	40 %	56412344
1515	NC_006511	GC	3	6	84219	84224	0 %	0 %	50 %	50 %	56412344
1516	NC_006511	GT	4	8	84241	84248	0 %	50 %	50 %	0 %	56412344
1517	NC_006511	GCCA	2	8	84250	84257	25 %	0 %	25 %	50 %	56412344
1518	NC_006511	CGA	2	6	84275	84280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412344
1519	NC_006511	GATG	2	8	84305	84312	25 %	25 %	50 %	0 %	56412344
1520	NC_006511	GGCCA	2	10	84354	84363	20 %	0 %	40 %	40 %	56412344
1521	NC_006511	GTA	2	6	84453	84458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412344
1522	NC_006511	CGC	2	6	84494	84499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412344
1523	NC_006511	AGT	2	6	84506	84511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412344
1524	NC_006511	CAT	2	6	84513	84518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412344
1525	NC_006511	GCA	2	6	84536	84541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412344
1526	NC_006511	GTC	2	6	84619	84624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412344
1527	NC_006511	CGG	2	6	84647	84652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412344
1528	NC_006511	TCA	2	6	84826	84831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412344
1529	NC_006511	CGG	2	6	84841	84846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412344
1530	NC_006511	GGT	2	6	84885	84890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412344
1531	NC_006511	GCG	2	6	84960	84965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412344
1532	NC_006511	A	6	6	85094	85099	100 %	0 %	0 %	0 %	56412344
1533	NC_006511	ACC	2	6	85320	85325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412345
1534	NC_006511	GGT	2	6	85370	85375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412345
1535	NC_006511	CAG	2	6	85512	85517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412345
1536	NC_006511	CGA	2	6	85673	85678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412345
1537	NC_006511	CTT	2	6	85700	85705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412345
1538	NC_006511	CCGA	2	8	85731	85738	25 %	0 %	25 %	50 %	56412345
1539	NC_006511	TCA	2	6	85765	85770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412345
1540	NC_006511	CAG	2	6	85783	85788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412345
1541	NC_006511	TTG	2	6	85819	85824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412345
1542	NC_006511	TC	3	6	85894	85899	0 %	50 %	0 %	50 %	56412345
1543	NC_006511	ACA	2	6	86144	86149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412345
1544	NC_006511	GC	3	6	86159	86164	0 %	0 %	50 %	50 %	56412345
1545	NC_006511	TCCA	2	8	86179	86186	25 %	25 %	0 %	50 %	56412345
1546	NC_006511	CGG	2	6	86189	86194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412345
1547	NC_006511	CCG	2	6	86221	86226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412345
1548	NC_006511	TTC	2	6	86229	86234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412345
1549	NC_006511	CAG	2	6	86241	86246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412345
1550	NC_006511	TAA	2	6	86472	86477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412346
1551	NC_006511	GAA	2	6	86503	86508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412346
1552	NC_006511	TCC	2	6	86518	86523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56412346
1553	NC_006511	ACCC	2	8	86553	86560	25 %	0 %	0 %	75 %	56412346
1554	NC_006511	CAG	2	6	86566	86571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412346
1555	NC_006511	GAT	2	6	86581	86586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412346
1556	NC_006511	GGC	2	6	86624	86629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412346
1557	NC_006511	GAA	2	6	86722	86727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412346
1558	NC_006511	TGG	2	6	86736	86741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412346
1559	NC_006511	GGC	2	6	86758	86763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412346
1560	NC_006511	GC	4	8	86780	86787	0 %	0 %	50 %	50 %	56412346
1561	NC_006511	CAG	3	9	86839	86847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412346
1562	NC_006511	TGC	2	6	86853	86858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412346
1563	NC_006511	GTACG	2	10	86925	86934	20 %	20 %	40 %	20 %	56412346
1564	NC_006511	CAC	2	6	86987	86992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412346
1565	NC_006511	GCC	2	6	87025	87030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412346
1566	NC_006511	AGT	2	6	87102	87107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412346
1567	NC_006511	ATG	2	6	87110	87115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412346
1568	NC_006511	CAG	2	6	87242	87247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412346
1569	NC_006511	ATG	3	9	87251	87259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412346
1570	NC_006511	CCA	2	6	87363	87368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412346
1571	NC_006511	CGA	2	6	87381	87386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412346
1572	NC_006511	AAC	2	6	87395	87400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412346
1573	NC_006511	CGA	2	6	87420	87425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412346
1574	NC_006511	CATC	2	8	87456	87463	25 %	25 %	0 %	50 %	56412346
1575	NC_006511	AGA	2	6	87474	87479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412346
1576	NC_006511	CGG	2	6	87598	87603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412346
1577	NC_006511	TAG	3	9	87614	87622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412346
1578	NC_006511	CAGAA	2	10	87638	87647	60 %	0 %	20 %	20 %	56412346
1579	NC_006511	AGG	2	6	87663	87668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56412346
1580	NC_006511	CAT	2	6	87673	87678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412346
1581	NC_006511	CCAG	2	8	87750	87757	25 %	0 %	25 %	50 %	56412346
1582	NC_006511	TAA	2	6	87837	87842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412346
1583	NC_006511	ATT	2	6	87896	87901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412346
1584	NC_006511	A	8	8	87910	87917	100 %	0 %	0 %	0 %	56412346
1585	NC_006511	T	6	6	87937	87942	0 %	100 %	0 %	0 %	56412346
1586	NC_006511	TGA	2	6	88479	88484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412347
1587	NC_006511	TAA	2	6	88500	88505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412347
1588	NC_006511	GCT	2	6	88576	88581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412347
1589	NC_006511	CAG	2	6	88594	88599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412347
1590	NC_006511	GGC	2	6	88633	88638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412347
1591	NC_006511	CT	3	6	88675	88680	0 %	50 %	0 %	50 %	56412347
1592	NC_006511	TGA	2	6	88689	88694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412347
1593	NC_006511	AC	3	6	88740	88745	50 %	0 %	0 %	50 %	56412347
1594	NC_006511	GCC	2	6	88759	88764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412347
1595	NC_006511	GCG	2	6	88765	88770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412347
1596	NC_006511	TTC	2	6	88809	88814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412347
1597	NC_006511	CAG	2	6	88828	88833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412347
1598	NC_006511	TGG	2	6	88844	88849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412347
1599	NC_006511	CT	4	8	88894	88901	0 %	50 %	0 %	50 %	56412347
1600	NC_006511	CGG	2	6	88970	88975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412347
1601	NC_006511	GCG	2	6	89038	89043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412347
1602	NC_006511	A	6	6	89044	89049	100 %	0 %	0 %	0 %	56412347
1603	NC_006511	CA	3	6	89106	89111	50 %	0 %	0 %	50 %	56412347
1604	NC_006511	AGC	2	6	89129	89134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412347
1605	NC_006511	GTG	2	6	89149	89154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412347
1606	NC_006511	GAA	2	6	89170	89175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412347
1607	NC_006511	CGC	2	6	89181	89186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412347
1608	NC_006511	TGA	2	6	89291	89296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412348
1609	NC_006511	GTG	2	6	89297	89302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412348
1610	NC_006511	GCT	2	6	89391	89396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412348
1611	NC_006511	AGA	2	6	89409	89414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412348
1612	NC_006511	GCT	2	6	89434	89439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412348
1613	NC_006511	GCG	2	6	89474	89479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412348
1614	NC_006511	TGC	3	9	89483	89491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412348
1615	NC_006511	GGC	2	6	89517	89522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412348
1616	NC_006511	ACG	2	6	89558	89563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412348
1617	NC_006511	GCG	2	6	89593	89598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412348
1618	NC_006511	CGG	2	6	89616	89621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412348
1619	NC_006511	CAG	2	6	89673	89678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412348
1620	NC_006511	CAA	2	6	89695	89700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412348
1621	NC_006511	GCG	2	6	89717	89722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412348
1622	NC_006511	CCGCA	2	10	89766	89775	20 %	0 %	20 %	60 %	56412348
1623	NC_006511	TGG	2	6	89822	89827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412348
1624	NC_006511	GCA	2	6	89849	89854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412348
1625	NC_006511	CCCG	2	8	89915	89922	0 %	0 %	25 %	75 %	56412348
1626	NC_006511	TGGA	2	8	89941	89948	25 %	25 %	50 %	0 %	56412348
1627	NC_006511	GC	3	6	90050	90055	0 %	0 %	50 %	50 %	56412348
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1742	NC_006511	GAT	2	6	97284	97289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412356
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1753	NC_006511	GGC	3	9	98935	98943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412357
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1755	NC_006511	GCG	2	6	98963	98968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412357
1756	NC_006511	AATG	2	8	99072	99079	50 %	25 %	25 %	0 %	56412357
1757	NC_006511	TGG	2	6	99158	99163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412357
1758	NC_006511	GAT	2	6	99165	99170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412357
1759	NC_006511	GCT	2	6	99174	99179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412357
1760	NC_006511	GCC	2	6	99181	99186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412357
1761	NC_006511	GCG	2	6	99188	99193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412357
1762	NC_006511	CCA	2	6	99197	99202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412357
1763	NC_006511	TGG	2	6	99254	99259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412357
1764	NC_006511	GCGCT	2	10	99289	99298	0 %	20 %	40 %	40 %	56412357
1765	NC_006511	CG	3	6	99303	99308	0 %	0 %	50 %	50 %	56412357
1766	NC_006511	GGCG	2	8	99414	99421	0 %	0 %	75 %	25 %	56412357
1767	NC_006511	CTG	2	6	99424	99429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412357
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1769	NC_006511	GATT	2	8	99522	99529	25 %	50 %	25 %	0 %	56412357
1770	NC_006511	CTG	2	6	99562	99567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412357
1771	NC_006511	TTG	2	6	99568	99573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412357
1772	NC_006511	TGT	2	6	99602	99607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412357
1773	NC_006511	TTA	2	6	99664	99669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412357
1774	NC_006511	GGCGC	2	10	99703	99712	0 %	0 %	60 %	40 %	56412357
1775	NC_006511	GGC	2	6	99777	99782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412357
1776	NC_006511	TGC	2	6	99800	99805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412357
1777	NC_006511	GC	3	6	99838	99843	0 %	0 %	50 %	50 %	56412357
1778	NC_006511	CGA	2	6	99858	99863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412357
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1783	NC_006511	GCGAC	2	10	100016	100025	20 %	0 %	40 %	40 %	56412357
1784	NC_006511	GCG	2	6	100054	100059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412357
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1786	NC_006511	GC	3	6	100235	100240	0 %	0 %	50 %	50 %	56412357
1787	NC_006511	GCTGGG	2	12	100269	100280	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	56412357
1788	NC_006511	GC	3	6	100299	100304	0 %	0 %	50 %	50 %	56412357
1789	NC_006511	TGG	2	6	100334	100339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412357
1790	NC_006511	CGC	3	9	100377	100385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412357
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1794	NC_006511	GCG	2	6	100750	100755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412358
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1796	NC_006511	TAAA	2	8	100841	100848	75 %	25 %	0 %	0 %	56412358
1797	NC_006511	GTC	2	6	100852	100857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412358
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1826	NC_006511	TCATGG	2	12	103095	103106	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	56412361
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1851	NC_006511	GC	3	6	104397	104402	0 %	0 %	50 %	50 %	56412363
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1863	NC_006511	CTT	2	6	105037	105042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412363
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1865	NC_006511	CGT	2	6	105070	105075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412363
1866	NC_006511	CTT	2	6	105184	105189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412363
1867	NC_006511	CGA	2	6	105210	105215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412363
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1869	NC_006511	ATC	2	6	105243	105248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412363
1870	NC_006511	TTGTT	2	10	105330	105339	0 %	80 %	20 %	0 %	56412363
1871	NC_006511	TCT	2	6	105394	105399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412363
1872	NC_006511	CGT	2	6	105463	105468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412363
1873	NC_006511	GCT	2	6	105475	105480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412363
1874	NC_006511	CCTG	2	8	105483	105490	0 %	25 %	25 %	50 %	56412363
1875	NC_006511	TGAC	2	8	105505	105512	25 %	25 %	25 %	25 %	56412363
1876	NC_006511	ACG	2	6	105543	105548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412363
1877	NC_006511	ATT	2	6	105551	105556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412363
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1879	NC_006511	G	6	6	105586	105591	0 %	0 %	100 %	0 %	56412363
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