MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 80127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_006511	GCC	2	6	1049820	1049825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	459642553
19002	NC_006511	TCGCT	2	10	1049830	1049839	0 %	40 %	20 %	40 %	459642553
19003	NC_006511	ATT	2	6	1049926	1049931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459642553
19004	NC_006511	GTC	2	6	1049976	1049981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459642553
19005	NC_006511	ATA	2	6	1050037	1050042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459642553
19006	NC_006511	GAT	3	9	1050099	1050107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459642553
19007	NC_006511	CATCAC	2	12	1050156	1050167	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	459642553
19008	NC_006511	CGC	2	6	1050343	1050348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	459642553
19009	NC_006511	TAC	2	6	1050390	1050395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459642553
19010	NC_006511	GC	3	6	1050457	1050462	0 %	0 %	50 %	50 %	459642553
19011	NC_006511	GTTG	2	8	1050488	1050495	0 %	50 %	50 %	0 %	459642553
19012	NC_006511	TAA	2	6	1050740	1050745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56413191
19013	NC_006511	GGC	2	6	1050811	1050816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413191
19014	NC_006511	ACC	2	6	1050826	1050831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56413191
19015	NC_006511	CGT	2	6	1050998	1051003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413191
19016	NC_006511	AGC	2	6	1051023	1051028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413191
19017	NC_006511	CCG	2	6	1051135	1051140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413191
19018	NC_006511	CCG	2	6	1051175	1051180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413191
19019	NC_006511	GCA	2	6	1051235	1051240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413191
19020	NC_006511	CTG	2	6	1051260	1051265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413191
19021	NC_006511	CAG	2	6	1051319	1051324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413191
19022	NC_006511	CG	3	6	1051411	1051416	0 %	0 %	50 %	50 %	56413191
19023	NC_006511	GTT	2	6	1051448	1051453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56413191
19024	NC_006511	TAC	2	6	1051485	1051490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413191
19025	NC_006511	GCT	2	6	1051500	1051505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413191
19026	NC_006511	TCC	2	6	1051587	1051592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56413191
19027	NC_006511	CGT	2	6	1051605	1051610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413191
19028	NC_006511	GCG	2	6	1051723	1051728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413191
19029	NC_006511	TAC	2	6	1051737	1051742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413191
19030	NC_006511	GCT	2	6	1051796	1051801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413191
19031	NC_006511	TCG	2	6	1051967	1051972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413191
19032	NC_006511	A	8	8	1052150	1052157	100 %	0 %	0 %	0 %	56413192
19033	NC_006511	CAT	2	6	1052262	1052267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413192
19034	NC_006511	TCG	2	6	1052326	1052331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413192
19035	NC_006511	TAAT	2	8	1052340	1052347	50 %	50 %	0 %	0 %	56413192
19036	NC_006511	CGC	2	6	1052418	1052423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413192
19037	NC_006511	GAT	2	6	1052434	1052439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413192
19038	NC_006511	A	7	7	1052465	1052471	100 %	0 %	0 %	0 %	56413192
19039	NC_006511	GAG	2	6	1052510	1052515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56413192
19040	NC_006511	CGT	2	6	1052519	1052524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413192
19041	NC_006511	ACG	2	6	1052526	1052531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413192
19042	NC_006511	A	6	6	1052604	1052609	100 %	0 %	0 %	0 %	56413192
19043	NC_006511	GGC	2	6	1052611	1052616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413192
19044	NC_006511	GC	3	6	1052696	1052701	0 %	0 %	50 %	50 %	56413192
19045	NC_006511	TAC	2	6	1052753	1052758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413192
19046	NC_006511	CTGC	2	8	1052828	1052835	0 %	25 %	25 %	50 %	56413192
19047	NC_006511	TGA	2	6	1052847	1052852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413192
19048	NC_006511	CCA	2	6	1052930	1052935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56413192
19049	NC_006511	GCT	2	6	1053043	1053048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413192
19050	NC_006511	AAAT	2	8	1053107	1053114	75 %	25 %	0 %	0 %	56413192
19051	NC_006511	GCA	2	6	1053292	1053297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413193
19052	NC_006511	GCGT	2	8	1053388	1053395	0 %	25 %	50 %	25 %	56413193
19053	NC_006511	TGA	2	6	1053478	1053483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413193
19054	NC_006511	CTT	2	6	1053538	1053543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56413193
19055	NC_006511	T	6	6	1053598	1053603	0 %	100 %	0 %	0 %	56413193
19056	NC_006511	ATC	2	6	1053756	1053761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413193
19057	NC_006511	CAT	2	6	1053767	1053772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413193
19058	NC_006511	TTGCG	2	10	1053773	1053782	0 %	40 %	40 %	20 %	56413193
19059	NC_006511	TGA	2	6	1053784	1053789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413193
19060	NC_006511	ACCA	2	8	1053836	1053843	50 %	0 %	0 %	50 %	56413193
19061	NC_006511	CG	3	6	1053991	1053996	0 %	0 %	50 %	50 %	56413193
19062	NC_006511	GGC	2	6	1054000	1054005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413193
19063	NC_006511	CGC	2	6	1054024	1054029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413193
19064	NC_006511	CAGCG	2	10	1054067	1054076	20 %	0 %	40 %	40 %	56413193
19065	NC_006511	CAG	2	6	1054114	1054119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413193
19066	NC_006511	CGC	2	6	1054126	1054131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413193
19067	NC_006511	GCC	2	6	1054166	1054171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413193
19068	NC_006511	AGC	2	6	1054242	1054247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413193
19069	NC_006511	ACG	2	6	1054263	1054268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413193
19070	NC_006511	TCGCCT	2	12	1054311	1054322	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	56413193
19071	NC_006511	CTT	2	6	1054378	1054383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56413193
19072	NC_006511	GGC	2	6	1054451	1054456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413193
19073	NC_006511	GA	3	6	1054507	1054512	50 %	0 %	50 %	0 %	56413193
19074	NC_006511	TACG	2	8	1054519	1054526	25 %	25 %	25 %	25 %	56413193
19075	NC_006511	GCG	2	6	1054539	1054544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413193
19076	NC_006511	GTT	2	6	1054559	1054564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56413193
19077	NC_006511	TCA	2	6	1054758	1054763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413194
19078	NC_006511	TGA	2	6	1054768	1054773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413194
19079	NC_006511	GA	3	6	1054903	1054908	50 %	0 %	50 %	0 %	56413194
19080	NC_006511	CG	3	6	1054969	1054974	0 %	0 %	50 %	50 %	56413194
19081	NC_006511	GCG	2	6	1054978	1054983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413194
19082	NC_006511	CATCG	2	10	1055009	1055018	20 %	20 %	20 %	40 %	56413194
19083	NC_006511	CCA	2	6	1055044	1055049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56413194
19084	NC_006511	ACG	3	9	1055082	1055090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413194
19085	NC_006511	TCA	2	6	1055091	1055096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413194
19086	NC_006511	GCA	2	6	1055125	1055130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413194
19087	NC_006511	TCG	2	6	1055136	1055141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413194
19088	NC_006511	A	6	6	1055168	1055173	100 %	0 %	0 %	0 %	56413194
19089	NC_006511	CGG	2	6	1055200	1055205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413194
19090	NC_006511	A	6	6	1055219	1055224	100 %	0 %	0 %	0 %	56413194
19091	NC_006511	T	8	8	1055230	1055237	0 %	100 %	0 %	0 %	56413194
19092	NC_006511	TGC	2	6	1055449	1055454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413194
19093	NC_006511	GGC	2	6	1055537	1055542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413194
19094	NC_006511	GC	3	6	1056025	1056030	0 %	0 %	50 %	50 %	56413195
19095	NC_006511	CTG	2	6	1056037	1056042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413195
19096	NC_006511	ATCC	2	8	1056076	1056083	25 %	25 %	0 %	50 %	56413195
19097	NC_006511	TGGGG	2	10	1056099	1056108	0 %	20 %	80 %	0 %	56413195
19098	NC_006511	CG	3	6	1056109	1056114	0 %	0 %	50 %	50 %	56413195
19099	NC_006511	AAG	2	6	1056125	1056130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56413195
19100	NC_006511	CGT	2	6	1056141	1056146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413195
19101	NC_006511	A	6	6	1056176	1056181	100 %	0 %	0 %	0 %	56413195
19102	NC_006511	TGA	2	6	1056183	1056188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413195
19103	NC_006511	A	7	7	1056284	1056290	100 %	0 %	0 %	0 %	56413195
19104	NC_006511	ACC	2	6	1056295	1056300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56413195
19105	NC_006511	GCC	2	6	1056318	1056323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413195
19106	NC_006511	TATCG	2	10	1056478	1056487	20 %	40 %	20 %	20 %	56413195
19107	NC_006511	TAA	2	6	1056555	1056560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56413195
19108	NC_006511	TGC	2	6	1056680	1056685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413195
19109	NC_006511	CCG	2	6	1056712	1056717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413195
19110	NC_006511	TGA	2	6	1056744	1056749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413195
19111	NC_006511	AAAAGT	2	12	1056750	1056761	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	56413195
19112	NC_006511	CGTG	2	8	1056795	1056802	0 %	25 %	50 %	25 %	56413195
19113	NC_006511	A	6	6	1056803	1056808	100 %	0 %	0 %	0 %	56413195
19114	NC_006511	GAA	2	6	1056868	1056873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56413195
19115	NC_006511	AGC	2	6	1056889	1056894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413195
19116	NC_006511	TCG	2	6	1056908	1056913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413195
19117	NC_006511	GGGC	2	8	1056944	1056951	0 %	0 %	75 %	25 %	56413195
19118	NC_006511	CCAA	2	8	1056985	1056992	50 %	0 %	0 %	50 %	56413195
19119	NC_006511	CTGAA	2	10	1057025	1057034	40 %	20 %	20 %	20 %	56413195
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19121	NC_006511	CCG	2	6	1057272	1057277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413195
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19216	NC_006511	A	7	7	1062113	1062119	100 %	0 %	0 %	0 %	56413199
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19220	NC_006511	CTG	2	6	1062463	1062468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413200
19221	NC_006511	GC	3	6	1062476	1062481	0 %	0 %	50 %	50 %	56413200
19222	NC_006511	CTGG	2	8	1062490	1062497	0 %	25 %	50 %	25 %	56413200
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19224	NC_006511	TGG	2	6	1062560	1062565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56413200
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19227	NC_006511	TGC	2	6	1062708	1062713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413200
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19229	NC_006511	GT	3	6	1062797	1062802	0 %	50 %	50 %	0 %	56413200
19230	NC_006511	AGC	2	6	1062821	1062826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413200
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19233	NC_006511	AGG	2	6	1062974	1062979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56413200
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19235	NC_006511	ATT	2	6	1063313	1063318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413201
19236	NC_006511	CTCG	2	8	1063337	1063344	0 %	25 %	25 %	50 %	56413201
19237	NC_006511	CAG	2	6	1063408	1063413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413201
19238	NC_006511	ATCG	2	8	1063444	1063451	25 %	25 %	25 %	25 %	56413201
19239	NC_006511	TG	3	6	1063575	1063580	0 %	50 %	50 %	0 %	56413201
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19337	NC_006511	CGT	2	6	1068930	1068935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413208
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19341	NC_006511	TCT	2	6	1071244	1071249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56413209
19342	NC_006511	GTCA	2	8	1071251	1071258	25 %	25 %	25 %	25 %	56413209
19343	NC_006511	GCC	2	6	1071260	1071265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413209
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19345	NC_006511	A	6	6	1071330	1071335	100 %	0 %	0 %	0 %	56413209
19346	NC_006511	GC	3	6	1071376	1071381	0 %	0 %	50 %	50 %	56413209
19347	NC_006511	GGC	2	6	1072287	1072292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413210
19348	NC_006511	TCA	2	6	1072338	1072343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413210
19349	NC_006511	AAG	2	6	1072367	1072372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56413210
19350	NC_006511	CAT	2	6	1072391	1072396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413210
19351	NC_006511	TTA	2	6	1072404	1072409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413210
19352	NC_006511	GGA	2	6	1072423	1072428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56413210
19353	NC_006511	AGA	2	6	1072447	1072452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56413210
19354	NC_006511	TAA	2	6	1072473	1072478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56413210
19355	NC_006511	CAT	2	6	1072543	1072548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413210
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19365	NC_006511	CTTT	2	8	1072971	1072978	0 %	75 %	0 %	25 %	56413210
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19373	NC_006511	TA	3	6	1073794	1073799	50 %	50 %	0 %	0 %	56413211
19374	NC_006511	AT	3	6	1073861	1073866	50 %	50 %	0 %	0 %	56413211
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19376	NC_006511	TA	3	6	1073941	1073946	50 %	50 %	0 %	0 %	56413211
19377	NC_006511	A	7	7	1073978	1073984	100 %	0 %	0 %	0 %	56413211
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19381	NC_006511	TA	3	6	1074091	1074096	50 %	50 %	0 %	0 %	56413211
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19472	NC_006511	ATT	2	6	1081746	1081751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413220
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