MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 80127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_006511	ATTT	2	8	995542	995549	25 %	75 %	0 %	0 %	56413132
18002	NC_006511	CGG	2	6	995657	995662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413132
18003	NC_006511	GC	3	6	995668	995673	0 %	0 %	50 %	50 %	56413132
18004	NC_006511	AG	3	6	995693	995698	50 %	0 %	50 %	0 %	56413132
18005	NC_006511	CAG	2	6	995715	995720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413132
18006	NC_006511	GAA	2	6	995724	995729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56413132
18007	NC_006511	GTC	2	6	995730	995735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413132
18008	NC_006511	CT	3	6	995739	995744	0 %	50 %	0 %	50 %	56413132
18009	NC_006511	GGT	3	9	995747	995755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56413132
18010	NC_006511	ACGC	2	8	995775	995782	25 %	0 %	25 %	50 %	56413132
18011	NC_006511	GCA	2	6	995885	995890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413132
18012	NC_006511	GACGGC	2	12	995915	995926	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	56413132
18013	NC_006511	CTG	2	6	996003	996008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413132
18014	NC_006511	TA	3	6	996040	996045	50 %	50 %	0 %	0 %	56413132
18015	NC_006511	CTG	3	9	996290	996298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413133
18016	NC_006511	GCTG	2	8	996345	996352	0 %	25 %	50 %	25 %	56413133
18017	NC_006511	GC	3	6	996353	996358	0 %	0 %	50 %	50 %	56413133
18018	NC_006511	CGC	2	6	996384	996389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413133
18019	NC_006511	TTAT	2	8	996401	996408	25 %	75 %	0 %	0 %	56413133
18020	NC_006511	CGG	2	6	996456	996461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413133
18021	NC_006511	GAT	2	6	996463	996468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413133
18022	NC_006511	GC	3	6	996511	996516	0 %	0 %	50 %	50 %	56413133
18023	NC_006511	GCG	3	9	996551	996559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413133
18024	NC_006511	CGC	2	6	996590	996595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413133
18025	NC_006511	GGC	2	6	996610	996615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413133
18026	NC_006511	CCG	2	6	996629	996634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413133
18027	NC_006511	TCGC	2	8	996671	996678	0 %	25 %	25 %	50 %	56413133
18028	NC_006511	CGA	2	6	996681	996686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413133
18029	NC_006511	GTT	2	6	996700	996705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56413133
18030	NC_006511	CGT	2	6	996765	996770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413133
18031	NC_006511	GA	4	8	996842	996849	50 %	0 %	50 %	0 %	56413133
18032	NC_006511	A	6	6	996886	996891	100 %	0 %	0 %	0 %	56413134
18033	NC_006511	TGC	2	6	996908	996913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413134
18034	NC_006511	GTC	2	6	996946	996951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413134
18035	NC_006511	TTA	2	6	996988	996993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413134
18036	NC_006511	CTG	2	6	997006	997011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413134
18037	NC_006511	AAC	2	6	997013	997018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56413134
18038	NC_006511	ATC	2	6	997051	997056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413134
18039	NC_006511	CCGC	2	8	997061	997068	0 %	0 %	25 %	75 %	56413134
18040	NC_006511	CAGC	2	8	997074	997081	25 %	0 %	25 %	50 %	56413134
18041	NC_006511	CGC	2	6	997282	997287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413134
18042	NC_006511	CGGG	2	8	997292	997299	0 %	0 %	75 %	25 %	56413134
18043	NC_006511	CAG	2	6	997303	997308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413134
18044	NC_006511	GC	5	10	997321	997330	0 %	0 %	50 %	50 %	56413134
18045	NC_006511	TGA	2	6	997359	997364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413134
18046	NC_006511	TCAC	2	8	997454	997461	25 %	25 %	0 %	50 %	56413134
18047	NC_006511	TCG	2	6	997520	997525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413134
18048	NC_006511	ATA	2	6	997605	997610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56413134
18049	NC_006511	TTC	2	6	997856	997861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56413135
18050	NC_006511	TGT	2	6	997878	997883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56413135
18051	NC_006511	GGC	2	6	997900	997905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413135
18052	NC_006511	ATT	2	6	997959	997964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413135
18053	NC_006511	TG	3	6	997971	997976	0 %	50 %	50 %	0 %	56413135
18054	NC_006511	CGAT	2	8	998073	998080	25 %	25 %	25 %	25 %	56413135
18055	NC_006511	CAGG	2	8	998104	998111	25 %	0 %	50 %	25 %	56413135
18056	NC_006511	GCC	2	6	998165	998170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413135
18057	NC_006511	GT	3	6	998203	998208	0 %	50 %	50 %	0 %	56413135
18058	NC_006511	GCT	2	6	998262	998267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413135
18059	NC_006511	CTG	2	6	998306	998311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413135
18060	NC_006511	GAC	2	6	998348	998353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413135
18061	NC_006511	CGG	2	6	998412	998417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413135
18062	NC_006511	ATT	2	6	998444	998449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413135
18063	NC_006511	AGA	2	6	998496	998501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56413135
18064	NC_006511	GCG	2	6	998543	998548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413135
18065	NC_006511	ACT	2	6	998629	998634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413136
18066	NC_006511	CCG	2	6	998677	998682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413136
18067	NC_006511	TCA	2	6	998691	998696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413136
18068	NC_006511	GCA	2	6	998764	998769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413136
18069	NC_006511	ATT	2	6	998819	998824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413136
18070	NC_006511	ATTT	2	8	998853	998860	25 %	75 %	0 %	0 %	56413136
18071	NC_006511	GGC	2	6	998904	998909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413137
18072	NC_006511	GTT	2	6	998945	998950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56413137
18073	NC_006511	T	6	6	998949	998954	0 %	100 %	0 %	0 %	56413137
18074	NC_006511	AT	3	6	999005	999010	50 %	50 %	0 %	0 %	56413137
18075	NC_006511	TTC	2	6	999328	999333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56413138
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18077	NC_006511	GC	3	6	999356	999361	0 %	0 %	50 %	50 %	56413138
18078	NC_006511	ACG	2	6	999368	999373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413138
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18080	NC_006511	CGT	2	6	999464	999469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413138
18081	NC_006511	GGC	2	6	999498	999503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413138
18082	NC_006511	AGG	2	6	999643	999648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56413138
18083	NC_006511	TTCG	2	8	999661	999668	0 %	50 %	25 %	25 %	56413138
18084	NC_006511	TCAG	2	8	999721	999728	25 %	25 %	25 %	25 %	56413138
18085	NC_006511	TGA	2	6	999793	999798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413138
18086	NC_006511	GCTATC	2	12	999865	999876	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	56413138
18087	NC_006511	AGTG	2	8	999970	999977	25 %	25 %	50 %	0 %	56413138
18088	NC_006511	GTAT	2	8	1000035	1000042	25 %	50 %	25 %	0 %	56413139
18089	NC_006511	CGG	2	6	1000048	1000053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413139
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18091	NC_006511	GCT	3	9	1000201	1000209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413139
18092	NC_006511	GTT	2	6	1000252	1000257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56413139
18093	NC_006511	TGA	2	6	1000261	1000266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413139
18094	NC_006511	ATCCT	2	10	1000270	1000279	20 %	40 %	0 %	40 %	56413139
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18099	NC_006511	GAC	2	6	1000577	1000582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413139
18100	NC_006511	GCCA	2	8	1000619	1000626	25 %	0 %	25 %	50 %	56413139
18101	NC_006511	GGC	2	6	1000645	1000650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413139
18102	NC_006511	CGA	2	6	1000717	1000722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413139
18103	NC_006511	TG	3	6	1000763	1000768	0 %	50 %	50 %	0 %	56413139
18104	NC_006511	GTG	2	6	1000853	1000858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56413139
18105	NC_006511	GCT	2	6	1000951	1000956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413139
18106	NC_006511	CG	3	6	1001010	1001015	0 %	0 %	50 %	50 %	56413139
18107	NC_006511	GCA	2	6	1001083	1001088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413139
18108	NC_006511	CCA	2	6	1001091	1001096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56413139
18109	NC_006511	GGC	2	6	1001119	1001124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413139
18110	NC_006511	TG	3	6	1001204	1001209	0 %	50 %	50 %	0 %	56413139
18111	NC_006511	TCG	2	6	1001245	1001250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413139
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18117	NC_006511	GCC	2	6	1001530	1001535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413139
18118	NC_006511	CGG	2	6	1001596	1001601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413139
18119	NC_006511	A	6	6	1001609	1001614	100 %	0 %	0 %	0 %	56413139
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18121	NC_006511	TGC	2	6	1001682	1001687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413139
18122	NC_006511	AT	3	6	1001692	1001697	50 %	50 %	0 %	0 %	56413139
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18127	NC_006511	TGG	2	6	1002124	1002129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56413140
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18151	NC_006511	G	6	6	1004043	1004048	0 %	0 %	100 %	0 %	56413142
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18162	NC_006511	CTG	2	6	1004778	1004783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413142
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18241	NC_006511	CTG	3	9	1009855	1009863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413149
18242	NC_006511	CAT	2	6	1009902	1009907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413149
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18326	NC_006511	CG	3	6	1014334	1014339	0 %	0 %	50 %	50 %	56413154
18327	NC_006511	TCC	2	6	1014344	1014349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56413154
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18329	NC_006511	GCTTTA	2	12	1014545	1014556	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	56413155
18330	NC_006511	CAT	2	6	1014608	1014613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413155
18331	NC_006511	ATTA	2	8	1014622	1014629	50 %	50 %	0 %	0 %	56413155
18332	NC_006511	AC	3	6	1015436	1015441	50 %	0 %	0 %	50 %	56413156
18333	NC_006511	AGTT	2	8	1015490	1015497	25 %	50 %	25 %	0 %	56413156
18334	NC_006511	ATC	2	6	1015517	1015522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413156
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18338	NC_006511	CA	3	6	1015576	1015581	50 %	0 %	0 %	50 %	56413156
18339	NC_006511	A	6	6	1015657	1015662	100 %	0 %	0 %	0 %	56413157
18340	NC_006511	TCA	2	6	1015768	1015773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413157
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18342	NC_006511	TGC	2	6	1015816	1015821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413157
18343	NC_006511	GTT	2	6	1015988	1015993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56413157
18344	NC_006511	TTG	2	6	1016026	1016031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56413157
18345	NC_006511	CTG	2	6	1016063	1016068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413157
18346	NC_006511	TTA	2	6	1016080	1016085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413157
18347	NC_006511	GCC	2	6	1016132	1016137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413157
18348	NC_006511	TGC	2	6	1016174	1016179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413157
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18350	NC_006511	CTG	2	6	1016196	1016201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413157
18351	NC_006511	CTTAT	2	10	1016357	1016366	20 %	60 %	0 %	20 %	56413158
18352	NC_006511	TGG	2	6	1016376	1016381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56413158
18353	NC_006511	CGG	2	6	1016398	1016403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413158
18354	NC_006511	CGG	2	6	1016416	1016421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413158
18355	NC_006511	CTG	2	6	1016445	1016450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413158
18356	NC_006511	TCA	2	6	1016457	1016462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413158
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18358	NC_006511	CAA	2	6	1016497	1016502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56413158
18359	NC_006511	GTT	2	6	1016539	1016544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56413158
18360	NC_006511	TCG	2	6	1016548	1016553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413158
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18474	NC_006511	GGC	2	6	1023758	1023763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413163
18475	NC_006511	GCT	2	6	1023788	1023793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413163
18476	NC_006511	TGC	2	6	1023856	1023861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413163
18477	NC_006511	ATT	2	6	1023891	1023896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413163
18478	NC_006511	GCA	2	6	1023899	1023904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413163
18479	NC_006511	GCC	2	6	1023908	1023913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413163
18480	NC_006511	AGG	2	6	1023970	1023975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56413163
18481	NC_006511	GGA	2	6	1023977	1023982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56413163
18482	NC_006511	ATCAA	2	10	1024063	1024072	60 %	20 %	0 %	20 %	56413163
18483	NC_006511	ATG	2	6	1024078	1024083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413163
18484	NC_006511	CCG	2	6	1024086	1024091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413163
18485	NC_006511	TG	3	6	1024260	1024265	0 %	50 %	50 %	0 %	56413163
18486	NC_006511	CG	3	6	1024279	1024284	0 %	0 %	50 %	50 %	56413163
18487	NC_006511	CAG	2	6	1024338	1024343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413163
18488	NC_006511	CGT	2	6	1024454	1024459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413164
18489	NC_006511	GGCG	2	8	1024543	1024550	0 %	0 %	75 %	25 %	56413164
18490	NC_006511	TAT	2	6	1024561	1024566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56413164
18491	NC_006511	ATGG	2	8	1024589	1024596	25 %	25 %	50 %	0 %	56413164
18492	NC_006511	GCT	2	6	1024603	1024608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413164
18493	NC_006511	CGG	2	6	1024662	1024667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56413164
18494	NC_006511	AAGA	2	8	1024673	1024680	75 %	0 %	25 %	0 %	56413164
18495	NC_006511	CGC	3	9	1024690	1024698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56413164
18496	NC_006511	CAA	2	6	1024762	1024767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56413164
18497	NC_006511	GAT	3	9	1024799	1024807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413165
18498	NC_006511	CTG	2	6	1024825	1024830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56413165
18499	NC_006511	CAG	2	6	1024840	1024845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413165
18500	NC_006511	CAT	2	6	1024850	1024855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413165

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