MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 80127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_006511	CGG	2	6	850634	850639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412995
15502	NC_006511	GCCA	2	8	850653	850660	25 %	0 %	25 %	50 %	56412995
15503	NC_006511	GCCC	2	8	850704	850711	0 %	0 %	25 %	75 %	56412995
15504	NC_006511	GCG	2	6	850717	850722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412995
15505	NC_006511	CCG	2	6	850770	850775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412995
15506	NC_006511	ACG	2	6	850780	850785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412995
15507	NC_006511	CG	3	6	850789	850794	0 %	0 %	50 %	50 %	56412995
15508	NC_006511	ACC	2	6	850834	850839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412995
15509	NC_006511	CGGCG	2	10	850901	850910	0 %	0 %	60 %	40 %	56412995
15510	NC_006511	GC	3	6	850935	850940	0 %	0 %	50 %	50 %	56412995
15511	NC_006511	GC	3	6	850954	850959	0 %	0 %	50 %	50 %	56412995
15512	NC_006511	TCA	2	6	850969	850974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412995
15513	NC_006511	TGC	2	6	851026	851031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412995
15514	NC_006511	CGA	2	6	851042	851047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412995
15515	NC_006511	GCT	2	6	851113	851118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412995
15516	NC_006511	TAC	2	6	851154	851159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412995
15517	NC_006511	TCG	2	6	851161	851166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412995
15518	NC_006511	GCT	2	6	851168	851173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412995
15519	NC_006511	GTG	2	6	851250	851255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412995
15520	NC_006511	CGG	3	9	851257	851265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412995
15521	NC_006511	GGA	2	6	851324	851329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56412995
15522	NC_006511	GC	3	6	851353	851358	0 %	0 %	50 %	50 %	56412995
15523	NC_006511	GAT	2	6	851396	851401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412995
15524	NC_006511	GCT	2	6	851408	851413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412995
15525	NC_006511	GGC	2	6	851474	851479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412995
15526	NC_006511	CAG	2	6	851504	851509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412995
15527	NC_006511	CGG	3	9	851521	851529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412995
15528	NC_006511	CG	3	6	851534	851539	0 %	0 %	50 %	50 %	56412995
15529	NC_006511	GCAG	2	8	851567	851574	25 %	0 %	50 %	25 %	56412995
15530	NC_006511	ACGG	2	8	851583	851590	25 %	0 %	50 %	25 %	56412995
15531	NC_006511	TCG	2	6	851631	851636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412995
15532	NC_006511	GGT	2	6	851648	851653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412995
15533	NC_006511	CTG	2	6	851712	851717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412995
15534	NC_006511	GCT	2	6	851720	851725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412995
15535	NC_006511	A	6	6	853298	853303	100 %	0 %	0 %	0 %	56412996
15536	NC_006511	GCG	2	6	853310	853315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412996
15537	NC_006511	ATC	2	6	853387	853392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412996
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15539	NC_006511	GGT	2	6	853563	853568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412996
15540	NC_006511	GCGAT	2	10	853580	853589	20 %	20 %	40 %	20 %	56412996
15541	NC_006511	GCA	2	6	853668	853673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412996
15542	NC_006511	CG	3	6	853678	853683	0 %	0 %	50 %	50 %	56412996
15543	NC_006511	CAGTG	2	10	853821	853830	20 %	20 %	40 %	20 %	56412996
15544	NC_006511	GCT	2	6	853836	853841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412996
15545	NC_006511	CGG	2	6	853934	853939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412996
15546	NC_006511	TGT	2	6	854043	854048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412996
15547	NC_006511	GCC	2	6	854049	854054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412996
15548	NC_006511	CAT	2	6	854070	854075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412996
15549	NC_006511	GTG	2	6	854158	854163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412996
15550	NC_006511	GTG	2	6	854278	854283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412996
15551	NC_006511	TCGG	2	8	854296	854303	0 %	25 %	50 %	25 %	56412996
15552	NC_006511	GCT	2	6	854319	854324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412996
15553	NC_006511	GC	3	6	854335	854340	0 %	0 %	50 %	50 %	56412996
15554	NC_006511	GGC	2	6	854404	854409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412996
15555	NC_006511	TGG	2	6	854447	854452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412996
15556	NC_006511	ATC	2	6	854458	854463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412996
15557	NC_006511	TGA	2	6	854486	854491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412996
15558	NC_006511	TC	3	6	854553	854558	0 %	50 %	0 %	50 %	56412996
15559	NC_006511	TTA	2	6	854570	854575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412996
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15561	NC_006511	ATT	2	6	854674	854679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412996
15562	NC_006511	T	6	6	854678	854683	0 %	100 %	0 %	0 %	56412996
15563	NC_006511	A	6	6	854709	854714	100 %	0 %	0 %	0 %	56412996
15564	NC_006511	TTG	2	6	854720	854725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412996
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15570	NC_006511	CTG	2	6	856263	856268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412997
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15573	NC_006511	CGG	2	6	856444	856449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412997
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15580	NC_006511	GGCGT	2	10	856731	856740	0 %	20 %	60 %	20 %	56412997
15581	NC_006511	TGAAG	2	10	856850	856859	40 %	20 %	40 %	0 %	56412997
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15587	NC_006511	CG	3	6	857119	857124	0 %	0 %	50 %	50 %	56412997
15588	NC_006511	CAG	2	6	857154	857159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412997
15589	NC_006511	AGCC	2	8	857177	857184	25 %	0 %	25 %	50 %	56412997
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15593	NC_006511	CGG	2	6	857342	857347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412998
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15601	NC_006511	GC	3	6	857753	857758	0 %	0 %	50 %	50 %	56412998
15602	NC_006511	ATTG	2	8	857863	857870	25 %	50 %	25 %	0 %	56412998
15603	NC_006511	A	6	6	857955	857960	100 %	0 %	0 %	0 %	56412998
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15607	NC_006511	TTAAA	2	10	858221	858230	60 %	40 %	0 %	0 %	56412998
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15618	NC_006511	A	8	8	860426	860433	100 %	0 %	0 %	0 %	56412999
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15622	NC_006511	ACG	2	6	860534	860539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412999
15623	NC_006511	GGC	2	6	860604	860609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412999
15624	NC_006511	TAA	2	6	860647	860652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412999
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15628	NC_006511	AAGGC	2	10	860808	860817	40 %	0 %	40 %	20 %	56412999
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15642	NC_006511	GC	3	6	861847	861852	0 %	0 %	50 %	50 %	56413000
15643	NC_006511	CTGA	2	8	861874	861881	25 %	25 %	25 %	25 %	56413000
15644	NC_006511	CTGA	2	8	862015	862022	25 %	25 %	25 %	25 %	56413000
15645	NC_006511	ACG	3	9	862030	862038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56413000
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15648	NC_006511	GTAA	2	8	862164	862171	50 %	25 %	25 %	0 %	56413001
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15650	NC_006511	GGCA	2	8	862232	862239	25 %	0 %	50 %	25 %	56413001
15651	NC_006511	ATC	2	6	862254	862259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56413001
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15742	NC_006511	ACTG	2	8	866683	866690	25 %	25 %	25 %	25 %	56413006
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15993	NC_006511	TAA	2	6	877725	877730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56413014
15994	NC_006511	A	8	8	877729	877736	100 %	0 %	0 %	0 %	56413014
15995	NC_006511	AAT	2	6	878423	878428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56413015
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15997	NC_006511	AGT	2	6	878474	878479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56413015
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15999	NC_006511	TA	3	6	878545	878550	50 %	50 %	0 %	0 %	56413015
16000	NC_006511	TTAA	2	8	878574	878581	50 %	50 %	0 %	0 %	56413015

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