MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 80127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_006511	GCG	2	6	771486	771491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412922
14002	NC_006511	AGG	2	6	771505	771510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56412922
14003	NC_006511	TGG	2	6	771546	771551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412922
14004	NC_006511	TGC	2	6	771568	771573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412922
14005	NC_006511	GCGAT	2	10	771583	771592	20 %	20 %	40 %	20 %	56412922
14006	NC_006511	CCG	2	6	771593	771598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412922
14007	NC_006511	TGC	2	6	771628	771633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412922
14008	NC_006511	ATTGTC	2	12	771642	771653	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	56412922
14009	NC_006511	GCT	2	6	771662	771667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412922
14010	NC_006511	TGC	2	6	771775	771780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412922
14011	NC_006511	GTT	2	6	771890	771895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412922
14012	NC_006511	CTG	2	6	771900	771905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412922
14013	NC_006511	GCG	2	6	772027	772032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412922
14014	NC_006511	CG	3	6	772057	772062	0 %	0 %	50 %	50 %	56412922
14015	NC_006511	CGT	2	6	772193	772198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412922
14016	NC_006511	CGC	2	6	772199	772204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412922
14017	NC_006511	GC	3	6	772228	772233	0 %	0 %	50 %	50 %	56412922
14018	NC_006511	GAT	2	6	772362	772367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412922
14019	NC_006511	GAT	2	6	772497	772502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412923
14020	NC_006511	TGA	2	6	772704	772709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412923
14021	NC_006511	ATT	2	6	772719	772724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412923
14022	NC_006511	GC	3	6	772736	772741	0 %	0 %	50 %	50 %	56412923
14023	NC_006511	CGG	2	6	772770	772775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412923
14024	NC_006511	CAG	2	6	772780	772785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412923
14025	NC_006511	GCTG	2	8	772806	772813	0 %	25 %	50 %	25 %	56412923
14026	NC_006511	GC	3	6	772850	772855	0 %	0 %	50 %	50 %	56412923
14027	NC_006511	CG	3	6	772868	772873	0 %	0 %	50 %	50 %	56412923
14028	NC_006511	GCA	2	6	772881	772886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412923
14029	NC_006511	TCA	2	6	772902	772907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412923
14030	NC_006511	CGC	2	6	773015	773020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412923
14031	NC_006511	T	6	6	773062	773067	0 %	100 %	0 %	0 %	56412923
14032	NC_006511	GCT	2	6	773091	773096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412923
14033	NC_006511	GCG	2	6	773144	773149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412923
14034	NC_006511	TGG	2	6	773156	773161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412923
14035	NC_006511	CGCC	2	8	773199	773206	0 %	0 %	25 %	75 %	56412923
14036	NC_006511	CAG	2	6	773233	773238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412923
14037	NC_006511	C	6	6	773288	773293	0 %	0 %	0 %	100 %	56412923
14038	NC_006511	TG	3	6	773304	773309	0 %	50 %	50 %	0 %	56412923
14039	NC_006511	TGTTC	2	10	773329	773338	0 %	60 %	20 %	20 %	56412924
14040	NC_006511	CTG	2	6	773345	773350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412924
14041	NC_006511	AGCC	2	8	773366	773373	25 %	0 %	25 %	50 %	56412924
14042	NC_006511	TTC	2	6	773375	773380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412924
14043	NC_006511	GCC	2	6	773432	773437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412924
14044	NC_006511	TGGT	2	8	773456	773463	0 %	50 %	50 %	0 %	56412924
14045	NC_006511	CGT	2	6	773485	773490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412924
14046	NC_006511	TGG	2	6	773550	773555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412924
14047	NC_006511	CGT	2	6	773566	773571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412924
14048	NC_006511	TGCC	2	8	773712	773719	0 %	25 %	25 %	50 %	56412924
14049	NC_006511	TGA	2	6	773724	773729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412924
14050	NC_006511	CTG	2	6	773945	773950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412924
14051	NC_006511	GGC	2	6	773959	773964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412924
14052	NC_006511	ATC	3	9	773966	773974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412924
14053	NC_006511	CG	4	8	773997	774004	0 %	0 %	50 %	50 %	56412924
14054	NC_006511	CGC	2	6	774047	774052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412925
14055	NC_006511	CAG	2	6	774072	774077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412925
14056	NC_006511	GC	3	6	774207	774212	0 %	0 %	50 %	50 %	56412926
14057	NC_006511	TGC	4	12	774225	774236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412926
14058	NC_006511	TGGC	2	8	774345	774352	0 %	25 %	50 %	25 %	56412926
14059	NC_006511	GGT	2	6	774377	774382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412926
14060	NC_006511	AGC	2	6	774489	774494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412926
14061	NC_006511	GTT	2	6	774508	774513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412926
14062	NC_006511	TCG	2	6	774524	774529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412926
14063	NC_006511	GCA	2	6	774637	774642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412926
14064	NC_006511	CTG	2	6	774650	774655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412926
14065	NC_006511	GTT	2	6	774673	774678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412926
14066	NC_006511	AGC	2	6	774696	774701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412926
14067	NC_006511	ACTTTG	2	12	774702	774713	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	56412926
14068	NC_006511	TATC	2	8	774730	774737	25 %	50 %	0 %	25 %	56412926
14069	NC_006511	CG	3	6	774839	774844	0 %	0 %	50 %	50 %	56412926
14070	NC_006511	CAAAG	2	10	774867	774876	60 %	0 %	20 %	20 %	56412926
14071	NC_006511	TGC	3	9	775149	775157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412927
14072	NC_006511	CAG	2	6	775160	775165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412927
14073	NC_006511	TCT	2	6	775281	775286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412927
14074	NC_006511	CG	3	6	775340	775345	0 %	0 %	50 %	50 %	56412927
14075	NC_006511	TGA	2	6	775356	775361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412927
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14077	NC_006511	GTC	2	6	775382	775387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412927
14078	NC_006511	GGC	2	6	775433	775438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412927
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14080	NC_006511	TCG	2	6	775470	775475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412927
14081	NC_006511	GCT	2	6	775480	775485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412927
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14086	NC_006511	GC	3	6	775717	775722	0 %	0 %	50 %	50 %	56412927
14087	NC_006511	CGC	2	6	775771	775776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412927
14088	NC_006511	CTG	2	6	775892	775897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412927
14089	NC_006511	CGA	2	6	775915	775920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412927
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14093	NC_006511	GCCA	2	8	776330	776337	25 %	0 %	25 %	50 %	56412927
14094	NC_006511	T	6	6	776360	776365	0 %	100 %	0 %	0 %	56412927
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14100	NC_006511	GAT	2	6	776729	776734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412927
14101	NC_006511	ATTAC	2	10	776777	776786	40 %	40 %	0 %	20 %	56412927
14102	NC_006511	GGA	3	9	776797	776805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56412927
14103	NC_006511	GAT	2	6	776830	776835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412928
14104	NC_006511	T	7	7	777041	777047	0 %	100 %	0 %	0 %	56412928
14105	NC_006511	GAA	2	6	777082	777087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412928
14106	NC_006511	A	6	6	777134	777139	100 %	0 %	0 %	0 %	56412928
14107	NC_006511	TGC	2	6	777185	777190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412928
14108	NC_006511	CAG	2	6	777199	777204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412928
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14120	NC_006511	CGG	2	6	777810	777815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412929
14121	NC_006511	CGT	2	6	777818	777823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412929
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14125	NC_006511	GAT	2	6	777940	777945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412929
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14149	NC_006511	CTG	2	6	779509	779514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412932
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14152	NC_006511	GGC	2	6	779646	779651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412932
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14239	NC_006511	GGT	2	6	785281	785286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412937
14240	NC_006511	CTA	2	6	785425	785430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412937
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14243	NC_006511	TGC	2	6	785712	785717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412937
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14486	NC_006511	TCG	2	6	799453	799458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412951
14487	NC_006511	CAG	2	6	799521	799526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412951
14488	NC_006511	CGG	2	6	799550	799555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412951
14489	NC_006511	CGT	2	6	799556	799561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412951
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14492	NC_006511	GC	3	6	799787	799792	0 %	0 %	50 %	50 %	56412951
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