MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 80127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_006511	CGG	2	6	714571	714576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412872
13002	NC_006511	ATA	2	6	714605	714610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412872
13003	NC_006511	TCA	2	6	714621	714626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412872
13004	NC_006511	GGT	2	6	714632	714637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412872
13005	NC_006511	GTAC	2	8	714663	714670	25 %	25 %	25 %	25 %	56412872
13006	NC_006511	ACC	2	6	714740	714745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412872
13007	NC_006511	GCA	2	6	714753	714758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412872
13008	NC_006511	CTTT	2	8	714828	714835	0 %	75 %	0 %	25 %	56412872
13009	NC_006511	CCTGGG	2	12	714841	714852	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56412872
13010	NC_006511	CG	3	6	714889	714894	0 %	0 %	50 %	50 %	56412872
13011	NC_006511	ATC	2	6	714897	714902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412872
13012	NC_006511	CGAT	2	8	715246	715253	25 %	25 %	25 %	25 %	56412873
13013	NC_006511	ATC	2	6	715314	715319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412873
13014	NC_006511	CGG	2	6	715337	715342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412873
13015	NC_006511	CTG	2	6	715377	715382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412873
13016	NC_006511	TGC	2	6	715576	715581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412873
13017	NC_006511	TGC	2	6	715600	715605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412873
13018	NC_006511	CGG	2	6	715632	715637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412873
13019	NC_006511	CGA	2	6	715709	715714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412873
13020	NC_006511	GGA	2	6	715784	715789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56412873
13021	NC_006511	CAGT	2	8	715955	715962	25 %	25 %	25 %	25 %	56412873
13022	NC_006511	GAA	2	6	715969	715974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412873
13023	NC_006511	ATC	2	6	716022	716027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412873
13024	NC_006511	AGTA	2	8	716044	716051	50 %	25 %	25 %	0 %	56412873
13025	NC_006511	CGC	2	6	716084	716089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412873
13026	NC_006511	TAA	2	6	716097	716102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412873
13027	NC_006511	CAT	2	6	716142	716147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412873
13028	NC_006511	T	6	6	716256	716261	0 %	100 %	0 %	0 %	56412873
13029	NC_006511	AAG	2	6	716275	716280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412873
13030	NC_006511	CTG	2	6	716331	716336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412873
13031	NC_006511	GAA	2	6	716360	716365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412873
13032	NC_006511	GGT	2	6	716370	716375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412873
13033	NC_006511	TGT	2	6	716410	716415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412873
13034	NC_006511	GTATT	2	10	716431	716440	20 %	60 %	20 %	0 %	56412873
13035	NC_006511	TGC	2	6	716493	716498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412873
13036	NC_006511	T	6	6	716929	716934	0 %	100 %	0 %	0 %	56412874
13037	NC_006511	GTTC	2	8	716943	716950	0 %	50 %	25 %	25 %	56412874
13038	NC_006511	CGC	2	6	716967	716972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412874
13039	NC_006511	GAC	2	6	717024	717029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412874
13040	NC_006511	CTG	2	6	717103	717108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412874
13041	NC_006511	TGC	2	6	717195	717200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412874
13042	NC_006511	ACGC	2	8	717214	717221	25 %	0 %	25 %	50 %	56412874
13043	NC_006511	TGG	2	6	717369	717374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412874
13044	NC_006511	AT	3	6	717431	717436	50 %	50 %	0 %	0 %	56412874
13045	NC_006511	TGT	2	6	717462	717467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412874
13046	NC_006511	TTTG	2	8	717879	717886	0 %	75 %	25 %	0 %	56412875
13047	NC_006511	TCA	2	6	717953	717958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412875
13048	NC_006511	CCA	2	6	717960	717965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412875
13049	NC_006511	CG	3	6	718037	718042	0 %	0 %	50 %	50 %	56412875
13050	NC_006511	ATA	2	6	718063	718068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412875
13051	NC_006511	GAT	2	6	718074	718079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412875
13052	NC_006511	CCG	2	6	718082	718087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412875
13053	NC_006511	GCA	2	6	718103	718108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412875
13054	NC_006511	CAG	2	6	718125	718130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412875
13055	NC_006511	CAT	2	6	718131	718136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412875
13056	NC_006511	GCA	2	6	718187	718192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412875
13057	NC_006511	AG	3	6	718221	718226	50 %	0 %	50 %	0 %	56412875
13058	NC_006511	GC	3	6	718237	718242	0 %	0 %	50 %	50 %	56412875
13059	NC_006511	CAC	2	6	718278	718283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412875
13060	NC_006511	AGC	2	6	718291	718296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412875
13061	NC_006511	GCC	2	6	718322	718327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412875
13062	NC_006511	TCT	2	6	718339	718344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412875
13063	NC_006511	CAG	2	6	718380	718385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412875
13064	NC_006511	ATT	2	6	718407	718412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412875
13065	NC_006511	CCA	2	6	718425	718430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412875
13066	NC_006511	CCA	2	6	718448	718453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412875
13067	NC_006511	AAG	2	6	718465	718470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412875
13068	NC_006511	CGG	2	6	718547	718552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412875
13069	NC_006511	CAA	2	6	718652	718657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412876
13070	NC_006511	CGG	2	6	718718	718723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412876
13071	NC_006511	GAG	2	6	718841	718846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56412876
13072	NC_006511	TGA	2	6	718896	718901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412876
13073	NC_006511	GCT	2	6	718933	718938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412876
13074	NC_006511	GCG	2	6	718956	718961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412876
13075	NC_006511	T	6	6	718967	718972	0 %	100 %	0 %	0 %	56412876
13076	NC_006511	GCG	2	6	718995	719000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412876
13077	NC_006511	ATCT	2	8	719051	719058	25 %	50 %	0 %	25 %	56412876
13078	NC_006511	CGT	2	6	719092	719097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412876
13079	NC_006511	CCA	2	6	719105	719110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412876
13080	NC_006511	GGC	2	6	719120	719125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412876
13081	NC_006511	CGGT	2	8	719145	719152	0 %	25 %	50 %	25 %	56412876
13082	NC_006511	GAT	2	6	719162	719167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412876
13083	NC_006511	AATC	2	8	719266	719273	50 %	25 %	0 %	25 %	56412876
13084	NC_006511	TAA	2	6	719297	719302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412876
13085	NC_006511	GGTT	2	8	719333	719340	0 %	50 %	50 %	0 %	56412876
13086	NC_006511	GCA	2	6	719371	719376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412876
13087	NC_006511	GCA	2	6	719414	719419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412876
13088	NC_006511	GCC	2	6	719426	719431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412876
13089	NC_006511	AGC	2	6	719466	719471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412876
13090	NC_006511	GC	3	6	719470	719475	0 %	0 %	50 %	50 %	56412876
13091	NC_006511	TAA	2	6	719543	719548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412876
13092	NC_006511	GGT	2	6	719561	719566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412876
13093	NC_006511	TAA	2	6	719590	719595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412876
13094	NC_006511	CG	3	6	719829	719834	0 %	0 %	50 %	50 %	459642549
13095	NC_006511	CGA	2	6	719981	719986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459642549
13096	NC_006511	CAG	2	6	720021	720026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459642549
13097	NC_006511	ACA	2	6	720080	720085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459642549
13098	NC_006511	CTT	2	6	720089	720094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459642549
13099	NC_006511	TCT	2	6	720130	720135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459642549
13100	NC_006511	CGC	2	6	720182	720187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	459642549
13101	NC_006511	TCG	2	6	720217	720222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459642549
13102	NC_006511	TTC	2	6	720234	720239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459642549
13103	NC_006511	GGC	2	6	720288	720293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459642549
13104	NC_006511	T	6	6	720369	720374	0 %	100 %	0 %	0 %	459642549
13105	NC_006511	TTCG	2	8	720378	720385	0 %	50 %	25 %	25 %	459642549
13106	NC_006511	GAG	2	6	720397	720402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	459642549
13107	NC_006511	TGT	2	6	720407	720412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459642549
13108	NC_006511	ACT	2	6	720439	720444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459642549
13109	NC_006511	A	6	6	720491	720496	100 %	0 %	0 %	0 %	459642549
13110	NC_006511	TCCGC	2	10	720518	720527	0 %	20 %	20 %	60 %	459642549
13111	NC_006511	G	6	6	720563	720568	0 %	0 %	100 %	0 %	459642549
13112	NC_006511	TGT	2	6	720579	720584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459642549
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13115	NC_006511	ATT	2	6	720933	720938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412878
13116	NC_006511	TG	3	6	721514	721519	0 %	50 %	50 %	0 %	56412879
13117	NC_006511	GAA	2	6	721533	721538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412879
13118	NC_006511	GCA	2	6	721759	721764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412880
13119	NC_006511	AAC	2	6	721858	721863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412880
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13121	NC_006511	A	6	6	721931	721936	100 %	0 %	0 %	0 %	56412880
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13488	NC_006511	GTG	2	6	743768	743773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412897
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13491	NC_006511	GC	3	6	743951	743956	0 %	0 %	50 %	50 %	56412897
13492	NC_006511	GGT	2	6	743971	743976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412897
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