MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 80127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_006511	ATGG	2	8	690559	690566	25 %	25 %	50 %	0 %	56412846
12502	NC_006511	TGG	2	6	690579	690584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412846
12503	NC_006511	GTG	2	6	690588	690593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412846
12504	NC_006511	GGC	2	6	690601	690606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412846
12505	NC_006511	GCC	2	6	690712	690717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412846
12506	NC_006511	GAT	2	6	690718	690723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412846
12507	NC_006511	GAC	2	6	690751	690756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412846
12508	NC_006511	ACG	2	6	690803	690808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412846
12509	NC_006511	GC	3	6	690810	690815	0 %	0 %	50 %	50 %	56412846
12510	NC_006511	CGC	2	6	690873	690878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412846
12511	NC_006511	CTGC	2	8	690889	690896	0 %	25 %	25 %	50 %	56412846
12512	NC_006511	TGG	2	6	691031	691036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412847
12513	NC_006511	GCC	2	6	691047	691052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412847
12514	NC_006511	TGT	2	6	691068	691073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412847
12515	NC_006511	CGG	2	6	691087	691092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412847
12516	NC_006511	CAT	2	6	691093	691098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412847
12517	NC_006511	GAG	2	6	691187	691192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56412847
12518	NC_006511	ACA	2	6	691212	691217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412847
12519	NC_006511	GAT	2	6	691279	691284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412847
12520	NC_006511	GATA	2	8	691333	691340	50 %	25 %	25 %	0 %	56412847
12521	NC_006511	GGC	2	6	691389	691394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412847
12522	NC_006511	ACA	2	6	691404	691409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412847
12523	NC_006511	CGG	2	6	691704	691709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412848
12524	NC_006511	ACC	2	6	691726	691731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412848
12525	NC_006511	CTG	2	6	691732	691737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412848
12526	NC_006511	CTG	2	6	691741	691746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412848
12527	NC_006511	GC	3	6	691756	691761	0 %	0 %	50 %	50 %	56412848
12528	NC_006511	CGG	2	6	691767	691772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412848
12529	NC_006511	CTG	2	6	691831	691836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412848
12530	NC_006511	GC	4	8	691913	691920	0 %	0 %	50 %	50 %	56412848
12531	NC_006511	GCA	2	6	691992	691997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412848
12532	NC_006511	CGCGC	2	10	692032	692041	0 %	0 %	40 %	60 %	56412848
12533	NC_006511	CGA	2	6	692052	692057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412848
12534	NC_006511	GC	3	6	692089	692094	0 %	0 %	50 %	50 %	56412848
12535	NC_006511	CGG	2	6	692101	692106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412848
12536	NC_006511	GGC	2	6	692109	692114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412848
12537	NC_006511	CAC	2	6	692145	692150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412848
12538	NC_006511	CCA	2	6	692151	692156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412848
12539	NC_006511	CCG	2	6	692184	692189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412848
12540	NC_006511	CGG	2	6	692202	692207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412848
12541	NC_006511	TCT	2	6	692233	692238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412849
12542	NC_006511	TTC	2	6	692295	692300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412849
12543	NC_006511	TCA	2	6	692308	692313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412849
12544	NC_006511	GCCGCA	2	12	692336	692347	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	56412849
12545	NC_006511	GCT	2	6	692348	692353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412849
12546	NC_006511	CAT	2	6	692372	692377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412849
12547	NC_006511	GGC	2	6	692384	692389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412849
12548	NC_006511	GCT	2	6	692390	692395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412849
12549	NC_006511	GCT	2	6	692402	692407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412849
12550	NC_006511	CGA	2	6	692429	692434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412849
12551	NC_006511	AGC	2	6	692455	692460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412849
12552	NC_006511	TGC	3	9	692464	692472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412849
12553	NC_006511	CGG	2	6	692485	692490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412849
12554	NC_006511	TGA	2	6	692539	692544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412849
12555	NC_006511	TGG	2	6	692557	692562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412849
12556	NC_006511	GCT	3	9	692564	692572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412849
12557	NC_006511	GCT	3	9	692612	692620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412849
12558	NC_006511	CGC	2	6	692645	692650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412849
12559	NC_006511	GCG	2	6	692678	692683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412849
12560	NC_006511	CGG	2	6	692684	692689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412849
12561	NC_006511	CTG	2	6	692694	692699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412849
12562	NC_006511	TGC	2	6	692710	692715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412849
12563	NC_006511	GCT	2	6	692810	692815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412849
12564	NC_006511	CGG	2	6	692851	692856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412849
12565	NC_006511	TCA	2	6	692945	692950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412850
12566	NC_006511	GGC	2	6	692954	692959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412850
12567	NC_006511	GCC	2	6	692960	692965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412850
12568	NC_006511	TGGC	2	8	693000	693007	0 %	25 %	50 %	25 %	56412850
12569	NC_006511	CAT	2	6	693017	693022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412850
12570	NC_006511	CGG	2	6	693064	693069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412850
12571	NC_006511	CAG	2	6	693075	693080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412850
12572	NC_006511	CGG	2	6	693115	693120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412850
12573	NC_006511	GCG	2	6	693144	693149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412850
12574	NC_006511	TGGCGG	2	12	693151	693162	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	56412850
12575	NC_006511	CGGCG	2	10	693260	693269	0 %	0 %	60 %	40 %	56412850
12576	NC_006511	TGG	2	6	693294	693299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412850
12577	NC_006511	CG	3	6	693308	693313	0 %	0 %	50 %	50 %	56412850
12578	NC_006511	TGC	2	6	693331	693336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412850
12579	NC_006511	GAC	2	6	693378	693383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412850
12580	NC_006511	GC	3	6	693398	693403	0 %	0 %	50 %	50 %	56412850
12581	NC_006511	GTG	2	6	693429	693434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412850
12582	NC_006511	GTG	2	6	693464	693469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412850
12583	NC_006511	GCA	2	6	693500	693505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412850
12584	NC_006511	CGC	2	6	693529	693534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412850
12585	NC_006511	CTG	2	6	693558	693563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412850
12586	NC_006511	GATGCG	2	12	693584	693595	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56412850
12587	NC_006511	CGC	2	6	693621	693626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412850
12588	NC_006511	T	6	6	693694	693699	0 %	100 %	0 %	0 %	56412851
12589	NC_006511	T	6	6	693719	693724	0 %	100 %	0 %	0 %	56412851
12590	NC_006511	CTGG	2	8	693727	693734	0 %	25 %	50 %	25 %	56412851
12591	NC_006511	GCT	2	6	693763	693768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412851
12592	NC_006511	TGC	2	6	693783	693788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412851
12593	NC_006511	GCG	2	6	693807	693812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412851
12594	NC_006511	GCA	2	6	693817	693822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412851
12595	NC_006511	GC	3	6	693827	693832	0 %	0 %	50 %	50 %	56412851
12596	NC_006511	AGG	2	6	693864	693869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56412851
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12598	NC_006511	ACC	2	6	693937	693942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412852
12599	NC_006511	GC	3	6	693963	693968	0 %	0 %	50 %	50 %	56412852
12600	NC_006511	GCA	2	6	694023	694028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412852
12601	NC_006511	CGG	2	6	694034	694039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412852
12602	NC_006511	CGG	2	6	694059	694064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412852
12603	NC_006511	ACG	2	6	694127	694132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412852
12604	NC_006511	CGGTGA	2	12	694142	694153	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56412852
12605	NC_006511	GTG	3	9	694198	694206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412852
12606	NC_006511	CCG	2	6	694279	694284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412852
12607	NC_006511	ACC	2	6	694310	694315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412852
12608	NC_006511	GCC	2	6	694316	694321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412852
12609	NC_006511	TCA	2	6	694345	694350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412852
12610	NC_006511	CTG	2	6	694374	694379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412853
12611	NC_006511	GCT	3	9	694400	694408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412853
12612	NC_006511	GC	3	6	694434	694439	0 %	0 %	50 %	50 %	56412853
12613	NC_006511	CG	3	6	694445	694450	0 %	0 %	50 %	50 %	56412853
12614	NC_006511	GAT	2	6	694451	694456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412853
12615	NC_006511	GCT	2	6	694481	694486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412853
12616	NC_006511	GGCG	2	8	694499	694506	0 %	0 %	75 %	25 %	56412853
12617	NC_006511	GCC	2	6	694605	694610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412853
12618	NC_006511	GCT	3	9	694634	694642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412853
12619	NC_006511	TGC	2	6	694648	694653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412853
12620	NC_006511	TGA	2	6	694654	694659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412853
12621	NC_006511	TGGCGG	2	12	694672	694683	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	56412853
12622	NC_006511	CGG	2	6	694692	694697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412853
12623	NC_006511	CGG	2	6	694702	694707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412853
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12639	NC_006511	CTG	2	6	695124	695129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412853
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12644	NC_006511	CGG	2	6	695318	695323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412853
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12648	NC_006511	GCT	3	9	695399	695407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412853
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12983	NC_006511	CGG	2	6	713729	713734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412872
12984	NC_006511	AGG	2	6	713759	713764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56412872
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12986	NC_006511	TCG	2	6	713799	713804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412872
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