MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 80127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_006511	GCGAC	2	10	664877	664886	20 %	0 %	40 %	40 %	56412827
12002	NC_006511	TTA	2	6	665032	665037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412828
12003	NC_006511	AAG	2	6	665050	665055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412828
12004	NC_006511	GTT	3	9	665122	665130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412828
12005	NC_006511	T	6	6	665129	665134	0 %	100 %	0 %	0 %	56412828
12006	NC_006511	AT	3	6	665177	665182	50 %	50 %	0 %	0 %	56412828
12007	NC_006511	TATT	2	8	665255	665262	25 %	75 %	0 %	0 %	56412828
12008	NC_006511	TGA	2	6	665445	665450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412828
12009	NC_006511	TCG	2	6	665465	665470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412828
12010	NC_006511	A	6	6	665478	665483	100 %	0 %	0 %	0 %	56412828
12011	NC_006511	ATG	2	6	665504	665509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412828
12012	NC_006511	TTAC	2	8	665564	665571	25 %	50 %	0 %	25 %	56412828
12013	NC_006511	ATC	2	6	665636	665641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412828
12014	NC_006511	AGT	2	6	665972	665977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412829
12015	NC_006511	T	6	6	666050	666055	0 %	100 %	0 %	0 %	56412829
12016	NC_006511	TGC	2	6	666085	666090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412829
12017	NC_006511	ATGA	2	8	666098	666105	50 %	25 %	25 %	0 %	56412829
12018	NC_006511	TC	3	6	666107	666112	0 %	50 %	0 %	50 %	56412829
12019	NC_006511	TCT	2	6	666143	666148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412829
12020	NC_006511	TTC	2	6	666152	666157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412829
12021	NC_006511	ATT	2	6	666233	666238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412829
12022	NC_006511	T	8	8	666267	666274	0 %	100 %	0 %	0 %	56412829
12023	NC_006511	T	7	7	666309	666315	0 %	100 %	0 %	0 %	56412829
12024	NC_006511	TAT	2	6	666353	666358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412829
12025	NC_006511	TTC	2	6	666404	666409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412829
12026	NC_006511	ATC	2	6	666461	666466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412829
12027	NC_006511	GCTGGC	2	12	666495	666506	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56412829
12028	NC_006511	TTTA	2	8	666555	666562	25 %	75 %	0 %	0 %	56412829
12029	NC_006511	CAG	2	6	666602	666607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412829
12030	NC_006511	TAA	2	6	666622	666627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412829
12031	NC_006511	TAAA	2	8	666660	666667	75 %	25 %	0 %	0 %	56412829
12032	NC_006511	CTTT	2	8	666682	666689	0 %	75 %	0 %	25 %	56412829
12033	NC_006511	CTTT	2	8	666719	666726	0 %	75 %	0 %	25 %	56412829
12034	NC_006511	GGC	2	6	666745	666750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412829
12035	NC_006511	GGC	2	6	666757	666762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412829
12036	NC_006511	ACT	2	6	666765	666770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412829
12037	NC_006511	TGG	2	6	666872	666877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412829
12038	NC_006511	TGC	2	6	666916	666921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412829
12039	NC_006511	TGA	2	6	666954	666959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412829
12040	NC_006511	ATT	2	6	667060	667065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412829
12041	NC_006511	TTA	2	6	667098	667103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412829
12042	NC_006511	TAA	2	6	667135	667140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412829
12043	NC_006511	A	6	6	667250	667255	100 %	0 %	0 %	0 %	56412829
12044	NC_006511	A	6	6	667257	667262	100 %	0 %	0 %	0 %	56412829
12045	NC_006511	CAA	2	6	667265	667270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412829
12046	NC_006511	TGT	2	6	667276	667281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412829
12047	NC_006511	A	8	8	667347	667354	100 %	0 %	0 %	0 %	56412830
12048	NC_006511	TCC	2	6	667369	667374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56412830
12049	NC_006511	ATC	2	6	667474	667479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412830
12050	NC_006511	ATTG	2	8	667494	667501	25 %	50 %	25 %	0 %	56412830
12051	NC_006511	A	6	6	667526	667531	100 %	0 %	0 %	0 %	56412830
12052	NC_006511	G	6	6	667569	667574	0 %	0 %	100 %	0 %	56412830
12053	NC_006511	T	6	6	667583	667588	0 %	100 %	0 %	0 %	56412830
12054	NC_006511	G	6	6	667724	667729	0 %	0 %	100 %	0 %	56412830
12055	NC_006511	GGC	2	6	667770	667775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412830
12056	NC_006511	ATG	2	6	667799	667804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412830
12057	NC_006511	ATCG	2	8	667828	667835	25 %	25 %	25 %	25 %	56412830
12058	NC_006511	GAT	2	6	667951	667956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412830
12059	NC_006511	TTCTC	2	10	667980	667989	0 %	60 %	0 %	40 %	56412830
12060	NC_006511	GTATC	2	10	668031	668040	20 %	40 %	20 %	20 %	56412830
12061	NC_006511	GAA	2	6	668050	668055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412830
12062	NC_006511	ATA	2	6	668078	668083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412830
12063	NC_006511	CAA	2	6	668102	668107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56412830
12064	NC_006511	GCG	2	6	668210	668215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412830
12065	NC_006511	GAAA	2	8	668228	668235	75 %	0 %	25 %	0 %	56412830
12066	NC_006511	GCG	2	6	668285	668290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412830
12067	NC_006511	TAT	2	6	668343	668348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412830
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12073	NC_006511	TCGT	2	8	669186	669193	0 %	50 %	25 %	25 %	56412831
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12089	NC_006511	GC	3	6	669789	669794	0 %	0 %	50 %	50 %	56412831
12090	NC_006511	GGT	2	6	669862	669867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412831
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12105	NC_006511	CTGA	2	8	670268	670275	25 %	25 %	25 %	25 %	56412831
12106	NC_006511	GCA	2	6	670276	670281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412831
12107	NC_006511	CGA	2	6	670345	670350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412831
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12112	NC_006511	CG	3	6	670627	670632	0 %	0 %	50 %	50 %	56412831
12113	NC_006511	AGA	3	9	670639	670647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412831
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12122	NC_006511	CCG	2	6	670923	670928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412831
12123	NC_006511	TAT	2	6	670930	670935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412831
12124	NC_006511	ACG	2	6	670950	670955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412831
12125	NC_006511	CGA	2	6	670957	670962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412831
12126	NC_006511	GTG	2	6	671027	671032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412831
12127	NC_006511	AGA	2	6	671041	671046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412831
12128	NC_006511	CCGT	2	8	671049	671056	0 %	25 %	25 %	50 %	56412831
12129	NC_006511	GTC	2	6	671114	671119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412831
12130	NC_006511	TC	3	6	671118	671123	0 %	50 %	0 %	50 %	56412831
12131	NC_006511	ATC	2	6	671126	671131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412831
12132	NC_006511	ATG	2	6	671306	671311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412831
12133	NC_006511	GT	3	6	671343	671348	0 %	50 %	50 %	0 %	56412831
12134	NC_006511	TTATCC	2	12	671385	671396	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	56412831
12135	NC_006511	CGG	2	6	671400	671405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412831
12136	NC_006511	GAA	2	6	671456	671461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412831
12137	NC_006511	GAC	2	6	671528	671533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412831
12138	NC_006511	AGCGTT	2	12	671731	671742	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	56412832
12139	NC_006511	TGA	2	6	671880	671885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412832
12140	NC_006511	AT	3	6	671896	671901	50 %	50 %	0 %	0 %	56412832
12141	NC_006511	CGG	2	6	671919	671924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412832
12142	NC_006511	GTC	2	6	671938	671943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412832
12143	NC_006511	TGA	2	6	671953	671958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412832
12144	NC_006511	TGG	2	6	671964	671969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412832
12145	NC_006511	GCG	2	6	672008	672013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412832
12146	NC_006511	GAT	2	6	672176	672181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412832
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12148	NC_006511	GAA	2	6	672233	672238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56412832
12149	NC_006511	GCT	2	6	672337	672342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412832
12150	NC_006511	T	6	6	672373	672378	0 %	100 %	0 %	0 %	56412832
12151	NC_006511	ATT	2	6	672410	672415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412832
12152	NC_006511	ATT	2	6	672461	672466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412832
12153	NC_006511	TGGTT	2	10	672500	672509	0 %	60 %	40 %	0 %	56412832
12154	NC_006511	A	7	7	672539	672545	100 %	0 %	0 %	0 %	56412832
12155	NC_006511	GCC	2	6	672550	672555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412832
12156	NC_006511	CGTATT	2	12	672605	672616	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	56412832
12157	NC_006511	CTG	2	6	672635	672640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412832
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12160	NC_006511	CGG	2	6	672705	672710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412832
12161	NC_006511	TCG	2	6	672759	672764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412832
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12163	NC_006511	AGAC	2	8	672865	672872	50 %	0 %	25 %	25 %	56412832
12164	NC_006511	CAG	2	6	672899	672904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412832
12165	NC_006511	TCG	2	6	672912	672917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412832
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12181	NC_006511	CTG	2	6	673795	673800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412832
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12194	NC_006511	GTC	2	6	674369	674374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412832
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12202	NC_006511	GCT	2	6	674723	674728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412833
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12212	NC_006511	GGT	2	6	675238	675243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412833
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12214	NC_006511	AT	3	6	675328	675333	50 %	50 %	0 %	0 %	56412834
12215	NC_006511	GCC	2	6	675475	675480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412834
12216	NC_006511	CAT	2	6	675500	675505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412834
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12218	NC_006511	CCG	2	6	675568	675573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56412834
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12220	NC_006511	GTA	2	6	675623	675628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412834
12221	NC_006511	TCA	2	6	675703	675708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56412834
12222	NC_006511	AAGC	2	8	675717	675724	50 %	0 %	25 %	25 %	56412834
12223	NC_006511	GCA	2	6	675833	675838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412834
12224	NC_006511	CG	3	6	675843	675848	0 %	0 %	50 %	50 %	56412834
12225	NC_006511	CGT	2	6	675884	675889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412834
12226	NC_006511	CAG	2	6	675891	675896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412834
12227	NC_006511	GC	3	6	676005	676010	0 %	0 %	50 %	50 %	56412834
12228	NC_006511	TCAT	2	8	676072	676079	25 %	50 %	0 %	25 %	56412834
12229	NC_006511	AT	3	6	676078	676083	50 %	50 %	0 %	0 %	56412834
12230	NC_006511	GTC	2	6	676207	676212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412834
12231	NC_006511	CAG	2	6	676233	676238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412834
12232	NC_006511	TTA	2	6	676297	676302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412834
12233	NC_006511	CAG	2	6	676305	676310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412834
12234	NC_006511	GCA	2	6	676337	676342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412834
12235	NC_006511	GTG	2	6	676495	676500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56412834
12236	NC_006511	GGC	2	6	676569	676574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412834
12237	NC_006511	CTG	2	6	676581	676586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412834
12238	NC_006511	TTC	2	6	676588	676593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412834
12239	NC_006511	CTT	2	6	676620	676625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412834
12240	NC_006511	AAT	2	6	676656	676661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56412834
12241	NC_006511	G	6	6	676676	676681	0 %	0 %	100 %	0 %	56412834
12242	NC_006511	GTT	2	6	676719	676724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56412834
12243	NC_006511	GAT	2	6	676799	676804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412834
12244	NC_006511	CAG	2	6	676854	676859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412834
12245	NC_006511	GCA	2	6	676868	676873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412834
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12323	NC_006511	GCA	2	6	681246	681251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56412837
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12352	NC_006511	CAGT	2	8	682259	682266	25 %	25 %	25 %	25 %	56412838
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12359	NC_006511	GC	4	8	682553	682560	0 %	0 %	50 %	50 %	56412838
12360	NC_006511	TAT	2	6	682562	682567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412838
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12364	NC_006511	GGC	2	6	682769	682774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412838
12365	NC_006511	CTT	2	6	682869	682874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56412839
12366	NC_006511	GGC	2	6	682885	682890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412839
12367	NC_006511	TTA	2	6	682906	682911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56412839
12368	NC_006511	GCG	2	6	682938	682943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412839
12369	NC_006511	ATCA	2	8	682968	682975	50 %	25 %	0 %	25 %	56412839
12370	NC_006511	ACC	2	6	682998	683003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56412839
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12430	NC_006511	CGG	2	6	686908	686913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56412843
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12474	NC_006511	CG	4	8	688970	688977	0 %	0 %	50 %	50 %	56412844
12475	NC_006511	GC	3	6	689005	689010	0 %	0 %	50 %	50 %	56412844
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12477	NC_006511	TG	3	6	689037	689042	0 %	50 %	50 %	0 %	56412844
12478	NC_006511	TCG	2	6	689131	689136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412844
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12480	NC_006511	TGA	2	6	689225	689230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56412844
12481	NC_006511	TGC	2	6	689251	689256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56412844
12482	NC_006511	GCTGC	2	10	689288	689297	0 %	20 %	40 %	40 %	56412844
12483	NC_006511	GCTGGA	2	12	689342	689353	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56412844
12484	NC_006511	GC	3	6	689379	689384	0 %	0 %	50 %	50 %	56412844
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